KEGG   Buchnera aphidicola BCc: BCc_282
Entry
BCc_282           CDS       T00423                                 
Symbol
recB
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V, b chain
  KO
K03582  exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
bcc  Buchnera aphidicola BCc
Pathway
bcc03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bcc00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    BCc_282 (recB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bcc03400]
    BCc_282 (recB)
Enzymes [BR:bcc01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     BCc_282 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:bcc03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     BCc_282 (recB)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase AAA_19 UvrD_C UvrD_C_2 Viral_helicase1 AAA_30
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABJ90744
UniProt: Q057F5
LinkDB
Position
319605..323108
AA seq 1167 aa
MQYIPLNTKEIPHFGITLIEASAGTGKTFSIIIFYLRLILNIGIKKSYSSPIPIKKILIV
TFTETAKNELKERLYKKICQLYYMSINKNYYVKDLKDFKKEIKDFKKISKLLKKAKKNID
QINIYTIHSFFRKILIEQKFLCKKKIYQNIITNIKKIQFEATKDFWRKYVYYQNIEIIKL
IFKKWKNPLELFKHIYIWISQIKIKIKHDFKKKSSLIKKYNLIIKLINKAKKTWKIDKKK
IKFLIKKIYLNKKKNNKKKIKIWCKKIQIWSEKKTIKYSVPKILKHFILKKIKKKKEYLF
FLYIKKIFFYYKLFFKYFIYLALKKIPKLIKKKKKMKKGLEFNDLNTIMWKEIKKKKINY
KKNILKKYTISMIDECQDIDNYQFNIFYKIYKKKKKKSLILIGDPKQSIYSFRNSNIFLY
LKYKKKIQKCFFLKKNFRSSINMTKSINTLFSKTKNPFIFKKINFQPSLANKKNNKNKLV
INNITQPALKFIFKNKKTINKNEYFTWISKMCAYSINNLLSNKSTKKSFIIFKNKKKRSI
KNTDIAILVKNKYEANIIKKEFKKYGIKTIYTSEKKNIFQTKEAKEILFIIESLSDLSNI
LKLQKLLMTKIFSKNIYDIYSINNKKKTYSSLIKKLKKYYLIWKKKNIFFMFKKIIFDFC
FQKKNIKLKINNINIYNIIQLCEILEEKNKSIKNKFLLTIWLRKKILKKNIEKNKSKNLI
QNKNINDKKFIKIITIYKSKGLEYPIIWIPFFSSFQKKKNQIIYCKKTLKKIVNLKNEKK
NIISLEKERLSEDIRLLYVAITRSIIHCCIGLAVIKNKKNEKYTNFHKNCLGYLIQKGKK
KKFKNFKKNLYDLQIPGLIEIKKSNKVKKKFFKKKKRKKKNIFFFNKKIKQYSWTNTSFS
KIIKYNQLKKNIINIKKENFINKINYNKKTSQINLHSFPLGKEFGIYLHDVFKKIKFFKT
KKTKKILKKTNFLSFSNILIKKLYLWINIFLKFPLNNENLSLEKIRKKEHQKETKFIIPI
KKKINIKKFNLIIKKFDPISKKCSNIFYKNFFGILNGSIDLIFLWKKKYYIIEYKSNWLG
PDSSYYNSKNIKKEIIKYRYDIQYQIYSLVLHCYLKKKLKNYNYNTHFGGIFYLFLRAFD
NKNNTGTYFIKPSYLLIKNLENLIYGN
NT seq 3504 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaatatatacctttaaacacaaaagaaatacctcattttggtattactttaattgaa
gcatcagcaggaactggaaaaaccttttcaataattattttttatttacgtttaatttta
aacattggtataaaaaaatcatattcttctcctataccaataaaaaaaatattaattgtt
acatttacagaaaccgcaaaaaatgaattaaaagaacgattatataaaaaaatttgtcaa
ttatattacatgagtattaataaaaattattatgttaaagatctaaaagattttaaaaaa
gaaataaaagattttaaaaaaatttcaaaattacttaaaaaagctaaaaaaaacatagat
caaattaatatatatactatacatagtttttttcgaaaaattttaatagaacaaaaattt
ttatgtaaaaaaaaaatatatcaaaatattattacaaatataaaaaaaatacaatttgaa
gcaactaaagatttctggagaaagtatgtttattatcaaaatatagaaattattaaatta
atctttaaaaaatggaaaaatcctttagaactatttaaacatatatatatatggattagt
caaataaaaataaaaataaaacacgattttaaaaaaaaaagttcattaataaaaaaatat
aatttaattattaagttaattaataaagctaaaaaaacatggaaaatagataaaaaaaaa
ataaaatttttgataaaaaaaatatatttaaataaaaaaaaaaataataaaaaaaaaata
aaaatatggtgtaaaaaaatacaaatttggtcagaaaaaaaaactataaaatattcagta
ccaaaaatattaaaacattttattttaaaaaaaatcaaaaaaaaaaaagaatatctattt
tttttatatattaaaaaaatttttttttattataaattattttttaaatattttatttat
ctagcattaaaaaaaatacctaaattaataaaaaagaaaaaaaaaatgaaaaaaggatta
gaatttaatgatttaaatacaattatgtggaaagaaataaaaaaaaaaaaaatcaattat
aaaaaaaacattctaaaaaaatatacaatttcaatgattgatgaatgtcaagatattgat
aattatcaatttaatattttttataaaatatataaaaaaaaaaaaaaaaaatcattaata
cttattggtgatcctaaacaatctatatatagttttagaaattcaaatatatttttatat
ttaaaatataaaaaaaaaatacaaaaatgtttttttttaaaaaaaaattttcgttcatca
attaatatgactaaaagtattaatacacttttttcaaaaacaaaaaatccatttattttt
aaaaaaattaattttcaaccatcattagcaaacaaaaaaaataataaaaataaacttgtt
attaacaatattacacaaccagctttaaaatttatttttaaaaataaaaaaacaataaat
aaaaatgaatattttacttggatttctaaaatgtgtgcatattctattaataatttgtta
tctaataaatctactaaaaaatcttttattatttttaaaaacaaaaaaaaacgtagtatt
aaaaatacagatatagctattttagtaaaaaataaatatgaagctaatattattaaaaaa
gaatttaaaaaatatggaattaaaacaatttatacatcagaaaaaaaaaatatttttcaa
acaaaagaagctaaagaaattttatttattattgaatcactttctgatttatctaatata
ttaaaattacaaaaattacttatgactaaaatatttagtaaaaatatatatgatatttat
tcaattaataataaaaaaaaaacatattcttctttaataaaaaaactaaaaaaatattat
ctaatctggaaaaaaaaaaatatattttttatgtttaaaaaaataatattcgatttctgt
tttcaaaaaaaaaacataaaattaaaaattaataatattaatatatataatatcattcaa
ttatgtgaaattttagaagaaaaaaacaaaagtattaaaaataaatttttattaacaatt
tggcttagaaaaaaaattctaaaaaaaaatattgaaaaaaataaatcaaaaaatttaatt
caaaacaaaaatataaatgataaaaaatttattaaaataattactatttataaatctaaa
ggactagagtatcctataatttggattccattttttagtagttttcaaaaaaaaaaaaat
caaattatctattgtaaaaaaacactaaaaaaaatagtaaatttaaaaaatgaaaaaaaa
aatataatatctttagaaaaagaaagattatctgaagatatacgtttattatatgttgct
attactagaagtataatacactgttgtattggattagcagtaattaaaaacaaaaaaaat
gaaaaatatacaaattttcataaaaattgcttaggatatttaatacaaaaaggaaaaaaa
aaaaaatttaaaaatttcaaaaaaaatttatatgatttacaaatacctggattaattgaa
ataaaaaaatcaaataaagtaaaaaaaaaattttttaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaa
aacatatttttttttaataaaaaaatcaaacaatattcctggacaaatactagtttttct
aaaattataaaatataatcaattaaaaaaaaatataattaatataaaaaaagaaaatttt
ataaataaaattaattataataaaaaaacttctcagattaatctccactcttttccatta
ggaaaagaatttggaatctatttacatgatgtttttaaaaaaataaaatttttcaaaaca
aaaaaaacaaaaaaaatattaaaaaaaacaaattttttatcattttcaaatatattaata
aaaaaattatatttatggataaatattttcttaaaatttccattaaataatgaaaacctt
tctttagaaaaaataagaaaaaaagaacatcaaaaagaaacaaaatttattataccaata
aaaaaaaaaataaatattaaaaaatttaatttaataattaaaaaatttgatcctatatca
aaaaaatgtagtaatattttttataaaaatttttttggaatattaaatggaagcatagat
ttaatatttttatggaaaaaaaaatactatatcatagaatacaaatctaattggttagga
ccagatagtagttattataattcaaaaaatataaaaaaagaaataattaaatatcgttat
gatatacaataccaaatttatagcttagtattacattgttatttaaaaaaaaaactaaaa
aattataattataatacccattttggcggaattttttatttatttcttagagcatttgat
aataaaaataacactggaacatattttattaaaccttcatatttattaattaaaaattta
gaaaatcttatatatggaaattaa

DBGET integrated database retrieval system