Buchnera aphidicola BCc: BCc_283
Help
Entry
BCc_283 CDS
T00423
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V, a chain
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
bcc
Buchnera aphidicola BCc
Pathway
bcc03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bcc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BCc_283 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bcc03400
]
BCc_283 (recD)
Enzymes [BR:
bcc01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BCc_283 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bcc03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BCc_283 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
AAA_11
Helicase_RecD
UvrD_C_2
Viral_helicase1
SLFN-g3_helicase
RecD_N
PhoH
SH3_13
UvrD-helicase
PIF1
DEAD
AAA_22
DO-GTPase1
Mg_chelatase
CLIP_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABJ90745
UniProt:
Q057F4
LinkDB
All DBs
Position
323110..324891
Genome browser
AA seq
593 aa
AA seq
DB search
MLSKNIKKFFKIIKIAKKKKEINCIDYYTCINKKISNYSPEVILVILYLIYSARHGHSCI
PKKHFVKKKIKRKNVFIKLLNIVSKNNINWFNTVISSMLCSNGTQKTPLVIDKKYIYLYK
YWYSENKIIELLYQKKSKKKKNKIEYKKLIKKYCSNYIDKNQKNAVKKALIHNLFFLLGG
PGTGKTNIIAYLILILIKISKKKIKIQLTAPTGKAVNKLTQSIYKILKKKNIQKNEKKMI
PKEGITLHKLFKIQKETNKNNAKYIKRKKKIDILIIDESSMISLNIMEIILTCIKKKTKI
IFVGDVYQLPSVETGSILKKICNFKKKKKEKKKIFFVLKKNYRFNKNSGINFLINQLKKK
KIKDINKIYKKKYKDIIWKNLNTSNDYLNMLKKIKLYYKKYWNYVNKKKNPKKIIHKFNK
YRILCIINKGIFGTKKINQYLDNYFIKINNKKKKKEFWYHGKPIIIKKNNIFLKLMNGDI
GICLYKKKKKKIYFLLSTGKIKKFNPEILFHYKTAWSTTIHKSQGSEFLSVNIIIPNYFS
NKFSKELFYTAISRAQKKVTIYANKKILNKIINNNKERYSGLKKKIEELNIFS
NT seq
1782 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
