Bartonella clarridgeiae: BARCL_0834
Help
Entry
BARCL_0834 CDS
T01394
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function
Organism
bcd
Bartonella clarridgeiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
ATG17_like
TBCC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBI76515
UniProt:
E6YI27
LinkDB
All DBs
Position
923586..928163
Genome browser
AA seq
1525 aa
AA seq
DB search
MARRTKLQTFEIEVEEALEKAMNFDFNNANNTEIEKIISNDSENLINVDDLIQKIATSEE
EILSENEASAITSNIHDNAVVDESVVELLFGQKPIHELSGGTVRDTLLPTQPLPANDDIT
VPFNFRSLKQNAVSRIYWSTTALSALWATGGAFIAHKLAPSGLNSLANIINFVTSPLGLA
VAAGTTIPILMSWGFAQLIKRSNELHNIAVLMTNAAQRLSEPQNISEKQAIAIGQTIRKE
VAAMNEGIERTLGRAVELEAIIQSEVHNLERAYSENETRIYTLIKELNNERTAILNHADR
VQTVIKGTQEQLSDEFDLVTSKIATNVEQLAQTLSQTLQKQGEDLIKKLSCAGDGVTNQL
FEKFNETTIQVQQKNTEFFHVLGKTFDTFAERFDNNEKQLEKTFNETAVKAETHIAKLAT
CIQTATDQTLSNIDEKFRTLDEAIIDRNNQSLKDFNEKIMQLDQQAYKLSSKFDNITSEA
IEAFGNRLVNVDLSLKEHSDTIIESFIARSKELENNAEKLGGFLEAHASQINVNLKEITT
DIANVFTNGHDHILSAVNESKKVLQEEIKNVDNAIIDIIDERSQDFKAQIAGQRDIIASM
LDNEKNKMADTLKDQIDVLTKNVSDVEKMLSQNIQVVDQHAKDHAADIVQCTEKLQEVIT
QSCEITKNALEEQTKNIDIRADALRDSLAINSFSLNEVLADQARTLDQRMETIHNLIAKS
DIHIDMALKQQVDLVENAIINNNKAITETVQNHMKNLEGHTDLLKNTLSQSNDVFLDTLQ
TRVGLFDENLESRARQVFERAATLEETLSEKLEKVCETIDMQTSTFEERSDNLKTSIVLN
NEHSQAVQEALEESVGNIRISLENSVNTVTDSVQEKFINISEKLASIMANETEKSEASLV
AAGNQFISSFADVAVKATNIISESSNRIVSNVEQTVHETSEKVISALTEQTAHTAEAFAT
ASNNAQTLINETVHASTEAIDQLLSERSNILHQSMLDFENNLSHQLADVSNRLEEAKNQT
STTISGHMEQLTELTDYLNQAAYNTTESIGNLTQQIGEQLSLSTQEAEQKIYAQNESLVN
TLAQKNSETIQTMATVQEDLINNVSAVLEQLNHSIYNIHENSNMLISTVQSLDGQLNETA
SNFFHNTNQVAEYLSTSNQVLNNNVETLQGLSQNTFEQISYITNNFGEHAKTLSEAIRVL
EQSENTLNITLQEKQNALSVLSNALVSKSDEVNQLIKHYENVLSLIFERADKDTRNSTDS
LKQTLHELINEASTRFSEAAENIRFSANEIRLELSKINNDIDESVQKLPEKAKETTQTIR
HALSEQITVLKDLTSVMQNTEKDQLVPKTPALLKPNNAAPEVNKKIIPPQPIAQPEQHNT
KQKKWVSDLLERASREENNNSASSPEQEKSDSINGSLDSLVSDIVQTINHTAAVELWNRY
KRGQKNIVIEHLYTPNGKLIFETIRKKYLNDVNFKDSINQYISDFEKLLRDISRSSGDIR
LARQYLTSDTGKIYTMLAHASGRIQ
NT seq
4578 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacgcagaaccaaattgcaaacatttgaaattgaagtagaagaagcccttgaaaag
gcaatgaactttgactttaataacgcaaataacacagagattgaaaaaataatatcaaat
gactccgaaaatctaattaatgtagatgatttgattcaaaaaattgctacttcagaagaa
gaaattctttctgaaaatgaagcttcagctattacctctaatattcatgacaatgctgtt
gttgatgaatcagttgttgaattgctttttggtcaaaaacccatccatgaactttcaggt
ggaaccgtacgtgatacattattacctactcaacctctccctgctaatgatgatataaca
gttcctttcaatttcagatcactaaaacaaaatgctgtttctcgaatttattggagtaca
acagctctcagcgctttatgggcaacaggaggtgcttttattgctcataaactagctcct
tctggactaaactctttagcaaatatcattaactttgttacatctccccttggattagct
gtagcagcaggtactacaattcctatccttatgtcttggggttttgctcaactgataaaa
cgttcaaatgaattgcataatattgccgttctcatgacaaatgccgcacaacgccttagc
gaaccccagaacatttctgaaaagcaagctattgctataggtcaaaccattcgtaaagaa
gtggctgcaatgaatgaaggaatcgaacgcaccctcggtcgtgctgttgaactcgaagcc
attatccaaagcgaagttcataatcttgaacgagcctattctgaaaatgaaacacgtatt
tataccttaattaaggaattaaataatgaacgcacagcgattttaaatcatgctgatcgc
gtacaaacagtaataaaaggaacacaagagcaactaagtgatgaatttgacttagttact
tctaaaattgcaaccaatgttgaacagcttgcgcaaactctttctcaaactttacaaaaa
caaggggaagatcttattaaaaagctttcttgtgcaggcgacggggtaacaaaccagctc
tttgaaaaatttaatgaaacgacgatacaagttcagcagaaaaatacagaattttttcat
gtattaggaaaaacctttgatacttttgcagagcgttttgataataatgaaaaacaatta
gaaaaaaccttcaatgaaacagccgttaaagctgaaacgcacattgccaagcttgcaaca
tgtatacaaactgcaacagatcaaactttatctaatattgatgagaaatttagaacattg
gatgaagcgattattgaccgtaataatcaatcattaaaagatttcaatgaaaaaattatg
caacttgatcaacaggcatataaactctcttctaaatttgataatataacctcagaagca
attgaagcgtttggaaatcgtctggtaaatgttgacttatctcttaaagaacacagtgat
actattatcgaatcctttattgcacgtagtaaagaattagaaaataatgccgaaaagctt
ggcggctttctggaagctcatgcttctcaaatcaatgtaaatcttaaagaaataactact
gatattgccaatgtatttacaaatggacatgatcacattctttctgccgttaatgaaagc
aaaaaagtcctgcaagaagaaatcaaaaatgttgataatgcaattatcgatattatagat
gagcgctcacaagacttcaaagcacaaatcgccggtcaaagagatataatagcaagtatg
cttgacaacgaaaaaaataaaatggctgacacattaaaagatcaaattgacgtattaaca
aaaaatgtttcagacgttgaaaaaatgttgagtcagaatattcaagttgttgatcaacat
gctaaagatcatgctgccgacatagttcaatgtacagaaaaactacaagaagtcatcaca
caaagctgcgaaataactaaaaatgctctagaagaacaaactaaaaatattgatatacgt
gccgatgctcttcgtgattccttagctatcaatagtttttctcttaatgaagttcttgca
gatcaagcacgcacgctcgatcaacgtatggaaacaatccataatctcatcgctaaaagc
gatatacacattgatatggcattaaaacaacaagtagacttggtcgaaaatgcaattatt
aataataacaaagccattacagaaactgttcaaaaccatatgaaaaatcttgagggacat
actgatctccttaagaatactctctctcaatcaaatgatgtattccttgatactcttcag
acacgtgtaggattattcgacgaaaatttggaaagccgtgcacgtcaagtttttgaacgt
gcagccacattggaagaaacattatctgaaaaactcgagaaagtatgtgaaactattgac
atgcaaacatccacttttgaggaacgatccgataacttaaaaacatctatcgtccttaat
aatgaacatagtcaagcagtccaagaagcgctagaagagagcgtgggtaatatacgtatc
tcattagaaaattctgttaatacagtcacagatagcgtacaagaaaagttcataaacatt
tctgaaaaattagcatcaataatggctaatgaaacagaaaaatcagaagcttctcttgtt
gctgctggtaatcaatttatttcatcttttgctgatgttgctgtaaaagcgacaaatatt
atttcggaatctagcaaccgtattgtgtcaaatgttgaacaaacagttcatgaaactagt
gaaaaggtcatttctgccttgactgaacagacagctcatactgcagaggctttcgcaaca
gcaagtaacaatgcgcaaacattgattaatgaaacagttcacgcttcaacagaagcaatt
gatcaattactcagcgaacgttcgaatattcttcatcaatctatgttagattttgaaaat
aatttaagtcatcaactagctgatgtaagcaatcgcttagaagaggcaaaaaaccaaaca
tccactacaatttcaggacatatggagcaattaacagaattaacggattatttgaatcaa
gctgcatacaatacaactgaatcgattggtaatctaacacagcaaattggtgaacagctt
tctctttcaacacaagaagctgaacaaaaaatttacgcacaaaatgaatccttagtgaat
actcttgcacaaaagaattccgaaactattcaaaccatggccactgtgcaagaagatctt
atcaacaatgtttcagctgtccttgaacaattgaaccattcaatttataatattcatgaa
aatagtaacatgttgatatcaacggttcaaagtcttgatggtcagcttaatgaaactgca
agtaatttcttccataataccaatcaagtagcagaatacttgtcaacatcaaatcaagtg
ctcaataacaatgtagagactttgcaagggctttctcaaaatacatttgagcaaattagc
tatataacaaataattttggcgaacatgctaaaacgctttctgaagctattcgcgttctt
gaacaatcagaaaacacccttaatataacactccaagaaaaacagaatgctctttctgta
ttaagcaatgctcttgtttcaaaatctgatgaagttaatcagcttatcaaacattacgaa
aatgttcttagcttaatatttgagcgtgctgataaagatacacgcaactctacagattca
ctgaaacaaacacttcatgaattaattaatgaggcctcaacacgtttttcagaagctgca
gaaaatatacgcttctcagccaatgaaattcgtttagagctttcaaaaattaataatgat
attgatgaaagtgttcaaaaattaccagaaaaagcaaaagaaacaacacagacaattcga
catgccttaagtgaacaaattacagtactaaaagacttgacgagtgttatgcaaaatact
gaaaaagaccaattagtaccaaaaacccctgcgttgttaaaaccaaataatgcagctccc
gaagtcaataaaaagataataccaccacaacctattgcacaaccagaacaacacaacaca
aaacaaaaaaaatgggtatcagaccttttagaaagagcttcacgtgaagaaaataacaat
tctgcttcttcaccagaacaagaaaaatctgattctataaatggatctcttgactcatta
gtaagtgatattgttcaaaccattaatcacactgctgctgtcgagttatggaatcgttat
aaacgtggacaaaaaaatatcgtaattgaacatctgtatacaccgaacggaaaactaata
tttgaaacaattagaaaaaaatatttaaatgatgtaaactttaaagattcaattaatcaa
tatatttcagactttgaaaaattattacgtgatatatctcgcagttctggagatatccgt
ttggcccgacaatatcttacatcagacactggaaaaatttatactatgcttgctcatgca
agtggacgaattcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
