Burkholderia cenocepacia H111: I35_6317
Help
Entry
I35_6317 CDS
T03804
Name
(GenBank) hemagglutinin domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
bceo
Burkholderia cenocepacia H111
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bceo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bceo02000
]
I35_6317
Transporters [BR:
bceo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
I35_6317
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_anchor
Baculo_PEP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDN64153
LinkDB
All DBs
Position
2:2635255..2641392
Genome browser
AA seq
2045 aa
AA seq
DB search
MRQRRRPAAPPRSAAPRSAVRRSATSPAPIRRAVSSASGSRARNAVSRTSRRASSRPPAP
TRSTAASSIRLRARRRRASRACRRRLRRVCRRLIARSRRCRLRLRPASIRCPPASARQTA
PLRRCRLPRRRVSPRLIARSAPCRPRLRPASTRCPPASARQTARLRRFRLPRRRVSPRLI
ARSAPCRPRLRRVSIRCRRASARQTARLRRCRLPRRRVSRRPTARSRRCPRRPRPASIRC
PPASARQTAPLRRFRLPRRRVSRRPTARSRRCPRRPRPASTRCPPASARQTAPLRRFRLP
RRRVSRRPTARSRRCPRRPRPASTRCPPPQLGKSSVTSLSTSTSTGLSSANSSISSLSTS
TSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSTSTSTGLSSANSSISSLSTSTSTGINSLSTGLSSANS
SITSLSSSTSTGLSSANSSISSLSTSTSTGINSLSTGLSTVSTKTDNLGSSTASALGGGS
TYDPTTGKVSAPSYTTYNANGTTSTANSVGSAINNINSQGIKYFHANSTGADSTATGTDA
VAIGSGAVASTINSVAIGLGAVASTDDSVALGADSKTVAATPTSSATVNGVTFSGFAGAK
PVGVVSVGDAGKERQVTNVAAGQVTSTSTDAINGSQLYSVAQQVGTATSAISSLSTSTST
GLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSAN
SSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSL
STSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTST
GLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSAN
SSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSL
STSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTST
GLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSAN
SSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSL
STSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTST
GLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSAN
SSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGLSSANSSITSL
STSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGISSLSTGLSSTNSSVSSLSTSTSTGLSSANSSITS
LSTSTSTGISSLSTGLSSTNSSVSSLSTSTSTGLSSANSSISSLSTSTSTGLSSATSSIT
SLSTSTSTGISSLSTGLSSTDSTILSLSTSTSTGIGSLSTGLSSTNSSVSSLSTSTSTAI
NAAKTHYYSVNDNGVQQANYDNTGATGTNALAAGVNASAAGASSVAVGDGSNAQTAGAVA
IGQNASATGGKAVSIGSGNTASGDGAVAIGDPNVATGTGAVAMGANNTATGDGAVSLGNQ
NTATGASALALGSSNQATADNTIALGSQATASATGAQAYGSAAKATAADALAFGTNAQAN
VANSIALGANSVTAAAVGTSSATIGGVTYPFAGGSPVGVVSVGAPGQERQITNVAAGRIS
ATSTDAINGSQLNATNNAINALSTSTASNVASLSTGINSLSTGLSTTNSNVASLSTSTST
AINSLSTGLSTTNSNVNSLSTSTSTGIGSLSTGLSTTNSNVASLSTGVTNINNQLNQLST
SINNNTTRAANNNGIAADMNGKGTDVPVVTAGSNSVAIGAGSNDGGRSNVVSVGSDQQQR
QITNVAPGTQGTDAVNVNQLTQVQTTLSTALSGQQAQINSLGSQLQQTDQMAKQGIAAVG
AMASIPQLDRDANFGMGVGTSTFLGQKAMAVNMQARITENLKASINGGFSGGQKVIGAGM
LYQWK
NT seq
6138 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcggcaacggcgacgtccggcggcaccaccacggtcagcagcgccacgatcggcggtc
agacgttcggcaacttcgccggcgccaattcggcgggcggtgtcgtcagcgtcgggcagt
cgggctcggaacgccgtatccagaacgtcgcggcgggcctcgtcacggccaccagcaccg
acgcgatcaacggcagccagctctattcggttgcgagcacgacgacgtcgagcatcacga
gcctgtcgacgtcggcttcgacgggtctgtcgtcggctaatagctcgatcacgtcgctgt
cgacttcgacttcgaccggcatcaattcgctgtccaccggcctcagctcggcaaacagct
ccgttacgtcgctgtcgacttccacgtcgacgggtctctcctcggctaatagctcgatcg
gctccctgtcgacctcgacttcgaccggcatcaactcgctgtccaccggcctcagctcga
caaacagctcggttacgtcgctttcggcttccacgtcgacgggtctctcctcggctaata
gctcgatcggctccctgtcgacctcgacttcgacgggtatcaattcgctgtcgacgggcc
tcagctcggcaaacagctcggttacgtcgctgtcgacttccacgtcgacgggtctctcgt
cggccaacagctcgatctcgtcgctgtccacgtcgacctcgaccggcatcaattcgctgt
ccaccggcctcagctcggcaaacagctccgttacgtcgctttcgacttccacgtcgacgg
gtctctcgtcggccaacagctcgatctcgtcgctgtccacgtcgacctcgaccggcatca
actcgctgtccaccggcctcagctcggcaaacagctccgttacgtcgctttcgacttcca
cgtcgacgggtctctcgtcggccaacagctcgatctcgtcgctgtccacgtcgacctcga
ccggcatcaactcgctgtccaccgcctcagctcggcaaaagctcggttacgtcgctttcg
acttccacgtcgaccggcctctcctcggctaacagctcgatctcgtcgctgtccacgtcg
acctcgaccggcatcaactcgctgtcgacgggcctcagctcgacaaacagctcggttacg
tcgctttcgacttccacgtcgaccggcctctcgtcggctaatagctcgatctcgtcgctg
tccacgtcgacctcgaccggcatcaattcgctgtccaccggcctcagctcggcaaacagc
tcgatcacgtcgttgtcgtcttccacgtcgaccggcctctcatcggctaacagctcgatc
tcgtcgctgtcgacttcgacctcgaccggcatcaactcgctgtccaccggcctgagcacg
gtctcgacgaagacggacaacctcggcagcagcaccgcctcggcacttggcggcggttcg
acgtacgacccgacgacaggcaaggtttcggccccgtcgtacaccacatacaacgcgaac
ggcacgacgtcgaccgccaacagcgtcggctcggcgatcaacaacatcaacagccagggc
atcaagtacttccacgcgaactcgaccggcgccgacagcaccgcaacgggcaccgacgct
gtcgccattggctcgggcgccgtcgccagcacgatcaactccgtcgccatcggcctcggc
gcggtcgccagcacagacgactccgtcgcacttggcgccgactcgaagaccgtcgcggca
acgcccacgagcagcgcgaccgtcaacggcgtgacgttcagcggattcgctggcgccaag
ccagtcggcgtcgtcagcgtgggtgatgccggcaaggaacgacaagtcaccaatgtcgcc
gcgggtcaagtgacctccaccagtaccgacgcgatcaacggcagccaactgtattcggtc
gcccagcaagtcggtactgcgaccagcgccatttcgtcgctgtccacttcgacctcgacc
ggtctgtcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctctcgacctcgacctcgaccggcctg
tcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctctcgacttcgacttcgactggcctgtcgtcg
gctaacagctcgatcacgtcgctctcgacctcgacgtcgaccggcctgtcgtcggctaac
agctcgatcacgtcgttgtcgacttcgacctcgacgggtctgtcgtcggccaacagctcg
atcacttcgctctcgacctcgacgtcgaccggcctgtcatcggctaacagctcgatcacg
tcgctctcgacttcgacttcgactggcctgtcgtcggctaacagttcgatcacctcgctg
tcgacttcgacctcgaccggcctgtcgtccgcaaatagctcgatcacttcgctctcgacc
tcgacgtcgaccggcctgtcatcggctaacagctcgatcacgtcgctctcgacttcgact
tcgactggcctgtcgtcggctaacagttcgatcacctcgctgtcgacttcgacctcgacc
ggcctgtcgtccgcaaatagctcgatcacttcgctctcgacttcgacttcgacgggcttg
tcctcggctaacagctcgatcacctcgctgtcgacctcgacttcgaccggcttgtcgtcc
gctaacagctcgatcacctcgctctcgacttcgacttcgacgggcttgtcctcggctaac
agctcgatcacctcgctgtcgacctcgacctcgacgggtctttcgtcggccaacagctcg
atcacctcgctctcgacctcgacttcgaccggcttgtcgtccgcgaacagctcgatcacc
tcgctgtcgacttcgacctcgaccggcctgtcgtcggccaacagctcgatcacgtcgctg
tcgacctcgacctcgaccggcttgtcgtcggccaatagctccatcacgtcgctgtcgacc
tcgacctcgacgggtctttcgtcggctaacagttcgatcacctcgctgtcgacttcgacc
tcgaccggcctgtcgtccgcaaatagctcgatcacgtcgctctcgacttcgacttcgacg
ggcctgtcgtccgcgaatagctcgatcacctcgttgtcgacctcgacttcgacgggcttg
tcgtccgctaacagctcgatcacctcgctctcgacttcgacctcgactggcctttcgtcc
gcgaacagctcgatcacctcgctgtcgacctcgacctcgaccggtctgtcgtcggctaac
agttcgatcacctcgctgtcgacctcgacttcgacgggtctttcgtcggctaacagttcg
atcacgtcgctctcgacttcgacctcgactggcctttcgtccgcgaacagctcgatcacc
tcactgtcgacctcgacctcgacgggtctgtcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctc
tcgacttcgacctcgaccggcctctcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctctcgact
tcgacctcgaccggcctctcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctgtcgacttcgacc
tcgaccggtctgtcgtcggctaacagctcgatcacctcgctgtcgacttcgacctcgacc
ggtctgtcgtcggctaacagctcgatcacttcgctctcgacctcgacgtcgaccggcctg
tcgtcggctaacagctcgatcacctcgctgtcgacttcgacctcgacgggtctgtcgtcg
gcaaacagctccatcacgtcgctgtcgacttcgacgtcgaccggcctctcgtcggcaaac
agctccatcacgtcgctctcgacctcgacttcgacgggtctgtcctcggcgaatagctcg
atcacgtcgctctcgacctcgacttcgaccggcttgtcgtcggccaatagctccatcacg
tcgctgtcgacttcgacttcgacggggctgtcgtcggctaacagctcgatcacctcgctg
tcgacttcgacttcgaccggtctgtcgtcggctaacagctcgatcacgtcgctctcgacc
tcgacttcgaccggtatcagctcgctgtccactggcctgagctcgaccaacagctcggtg
tcgtccctgtcgacctccacctcgaccggcctgtcgtccgccaacagctcgatcacgtcc
ctgtcaacctcgacttcgaccggcatcagctcgctgtccactggcctgagctcgaccaac
agctcggtgtcgtccctgtcgacctcgacgtcgaccggcctgtcctcggccaacagctcg
atcagctccctgtcgacctccacctcgacgggtctgtcgtcggccaccagctcgatcacg
tccctgtcgacttcgacctcgaccggcatcagctcgctgtccaccggcctgagcagcacg
gacagcacgatcctgtcgctgtccacctcgacgtcgaccggcatcggctcgctgtccacc
ggcctgagcagcacgaacagctcggtgtcgtcgctgtcgacctcgacctcgaccgcgatc
aacgccgcgaagacgcactactacagcgtcaacgacaacggcgtgcagcaagccaactac
gacaacaccggtgcaaccggcaccaatgctctcgccgccggcgtgaacgccagcgcggcg
ggcgcgagcagcgtggcagtcggcgacggctcgaacgcgcagacggcaggcgcggtcgcg
atcggccagaacgcatcggcaacgggcggcaaggcggtatcgatcggctccggcaacacc
gcatccggcgatggcgcggtcgcgatcggcgatccgaacgtggcgacgggtaccggcgcc
gtggcgatgggtgcgaacaatacggcgaccggcgacggcgcggtgtccctcggcaaccag
aacacggcaaccggcgccagcgcgctcgccctcggcagctcgaaccaggccaccgcggac
aacacgatcgcgctgggcagccaggccacggccagcgccaccggcgcacaggcctacggc
tcggccgccaaggccacggccgccgacgcgctcgccttcggcacgaacgcgcaagcgaac
gtcgcgaactcgatcgcactcggcgcgaactcggtcacggccgcggcggtcggcacctcg
agcgccacgatcggcggcgtcacgtacccgttcgcgggcggctcgccggtcggcgtggtg
agcgtcggcgcaccgggccaggaacgccagatcacgaacgtcgccgcgggtcggatctcg
gccacgagcacggacgcgatcaacggcagccagctgaacgcgacgaacaacgcgatcaac
gcgctgtcgacgtccaccgcgtcgaacgtcgcatccctgtcgaccggcatcaactcgctg
tcgaccggcctgagcacgacgaacagcaacgtggcatcgctgtccacgtcgacctcgacc
gcgatcaactcgctgtcgacgggcctcagcacgacgaacagcaacgtcaactcgctgtcg
acgtcgacttcgaccggcatcggttcgctgtccaccggcctgagcacgacgaacagcaac
gtggcatcgctgtcgaccggcgtgacgaacatcaacaaccagttgaaccagttgtcgacg
tcgatcaacaacaacacgacgcgtgcagcgaacaacaacggcatcgcggccgacatgaac
ggcaagggcaccgacgtcccggtcgtcaccgccggctcgaactcggtggcgatcggcgcg
ggttcgaacgacggcggtcgctcgaacgtggtgtcggtcggcagcgaccagcagcagcgc
cagatcacgaacgtcgcgccgggtacgcaaggcaccgacgcggtgaacgtgaaccagctg
acgcaggtgcagacgacgctgtcgacggcactgtcgggccagcaggcgcagatcaactcg
ctgggttcgcaactgcagcagaccgaccagatggcgaagcagggtatcgcggccgtcggc
gcgatggcgtcgatcccgcaactcgatcgcgacgccaacttcgggatgggcgtgggcaca
tcgaccttcctcggccagaaggcgatggcggtcaacatgcaggcgcgcatcacggagaac
ctgaaggcgtcgatcaacggcggcttcagcggcggtcagaaggtgatcggcgccggcatg
ctgtatcagtggaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
