Brevibacillus choshinensis: JNE38_19190
Help
Entry
JNE38_19190 CDS
T07271
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
bchs
Brevibacillus choshinensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRG70680
LinkDB
All DBs
Position
complement(3812327..3814750)
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MIFPGPIPTVSPCHPCPTGATGATGATGATGAAGATGATGVTGATGTTGTTGAAGASGTT
GATGETGTTGATGATGATGTTGETGATGPTGATGATGTTGETGATGATGVTGETGATGAT
GVTGETGATGTTGATGATGTTGETGATGTTGATGATGETGTTGTTGTTGITGVTGATGAT
GPTGVTGATGATGPTGATGATGETGATGPTGATGATGTTGETGATGATGTTGATGATGTT
GTTGTTGITGVTGETGETGATGPTGATGATGTTGSTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPT
GPTGSTGATGSTGATGTTGSTGATGTTGSTGATGSTGATGSTGATGTTGSTGATGTTGST
GATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGATGETGPTGTTGATGSTGTTGSTGATGSTGTTGAT
GATGATGATGATGATGTTGSTGTSGATGATGPTGATGPTGATGPTGTTGATSATGATGAT
GATGSTGTTGATGPTGTTGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGSTGATGATGPSGTT
GATGPTGTTGATGATGATGSTGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGPTGTTGATGAT
GSTGATGTTGSTGTTGATGSTGATGATGATGTTGATGATGTTGTTGTTGTTGTTGSTGPT
GPTVTTAYGYFFNRGAQTVNAGTDVSFSTNGPSSGGVTHVAGTAPVTVAVAGDYLVLFEV
TTGMQPSTDSIAYGVVVNGVVQASTIFGQQSVGNEIALTLVGSAILTLPAAATLTLRNVG
ATPDILVTTLDGQTIVNASIRLVKVSP
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttccccggaccgataccaactgtatctccttgccatccttgcccgacgggagcc
acaggggccaccggagcaactggagcaacgggagcagcgggagccacaggggccaccgga
gtaactggagccacaggtaccacaggaaccacgggagcagcaggagcatcaggaaccacg
ggagccaccggagagacgggaaccacaggagccacaggagccactggggcaacgggaaca
acgggagagacgggagccaccggaccaaccggagccactggggcaacgggaacaacggga
gagacgggagccaccggggcaacgggagtaacgggagagacgggagccactggggcaacg
ggagtaacgggagagacgggagccaccggaacaacgggagccactggggcaactggaaca
actggagagacgggagccaccggaacaaccggagccactggagccaccggagagacggga
accaccggaaccaccggaaccaccggaataaccggagtcactggagcgacgggagccacc
ggaccaaccggagtcactggagccacgggagccaccggaccaaccggagccactggagcc
acgggagagacgggagccaccggaccaaccggagccactggggcaacgggaacaacggga
gagacgggagccaccggagcgacaggaactactggggcaacgggagccaccggaaccacc
ggaaccaccggaaccaccggaataaccggagtcactggagagacgggagagacgggagcc
accggaccaaccggagccactggggcaacgggaacgacgggatcaacgggaaccaccgga
ccaaccggaccaaccggaccaaccggaccaaccggaccaaccggaccaaccggaccaacc
ggaccaactggatcaacgggagccaccggatcgacaggagccaccggaacaactgggtca
acaggagccaccggaacaactgggtcaacgggagccaccggatcaacgggagccaccgga
tcgacaggagccaccggaacaactgggtcaacaggagccaccggaacaactgggtcaacg
ggagccaccggatcaacgggagccaccggatcgacaggagccaccggaccaaccggagct
accggatcaactggagcaacgggagagacgggaccgacgggaacaaccggagccaccgga
tcaacaggaaccactggatcgacaggagccaccggatcaacaggaaccacgggagcaacg
ggagcaacgggagcaacaggcgccacaggcgccacaggcgcgacaggaaccaccggatcg
acgggaacctcaggagccaccggagcgaccggaccaacaggcgcaacaggaccgacaggc
gcgacaggaccaacaggaacaacgggagcaacaagcgcaacaggcgcgacaggcgcgaca
ggagccaccggatcgacggggaccacgggagccaccggaccaacaggaaccactggagcg
acgggagcaacaggcgcgacaggcgcgacaggaaccaccggagcaacaggagcaacaggc
gcgacaggagccaccggatcgacgggagccaccggagccaccggaccatcaggaaccacg
ggagcgacgggaccaacaggaaccacgggagcgacgggagcaacgggagcaacgggctcc
acaggcgcgacaggcgcgacaggaactaccggagcaacaggagcaacaggcgcgacagga
gccaccggagccaccggagcgacgggaccaacaggaaccacgggagcaacgggagcaacg
ggctccacaggcgcgacaggaaccaccggatcaacaggaaccacgggagcaacaggatca
acaggagcaacaggagcaacaggagcgacgggaaccacgggagcaacgggagcaacggga
accactggcacgactggcacgactggaaccactggcaccacaggtagcactggtccgact
ggtccgactgtcactactgcatatgggtatttctttaatagaggagcacagactgtcaac
gcaggcacagatgttagtttcagtacgaatggcccaagttcgggaggggtcacacatgtt
gctggaacggctccagttactgtggcagttgcaggcgattatttggttttatttgaagtt
acaaccggtatgcagcccagcacggattctatcgcttatggagtggttgtaaatggagtc
gtgcaggcctctaccattttcggacagcaaagcgttggaaacgaaatagccctaaccctt
gttggttcggctattctcactctcccagcggcagctacgcttactttacgaaatgtgggt
gcaactcctgatatcctggttactacgctggatggccaaaccatcgttaatgcttcgatc
aggcttgttaaagtgagcccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
