Baumannia cicadellinicola Hc (Homalodisca coagulata): BCI_0538
Help
Entry
BCI_0538 CDS
T00349
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bci
Baumannia cicadellinicola Hc (Homalodisca coagulata)
Pathway
bci03030
DNA replication
bci03430
Mismatch repair
bci03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bci00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BCI_0538 (dnaE)
03430 Mismatch repair
BCI_0538 (dnaE)
03440 Homologous recombination
BCI_0538 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bci03032
]
BCI_0538 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bci03400
]
BCI_0538 (dnaE)
Enzymes [BR:
bci01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BCI_0538 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
bci03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BCI_0538 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bci03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BCI_0538 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DNA_pol_IIIA_C
tRNA_anti-codon
HROB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABF13776
UniProt:
Q1LSU6
LinkDB
All DBs
Position
558257..561748
Genome browser
AA seq
1163 aa
AA seq
DB search
MIEPSFIHLRIHSDYSIIDGLIKVSSLVKKAVSLNMPALALTDVTNLYGIIKFYKAANSV
GIKPIIGADFLMYNPILGGELTELTILATNYIGYQCLTMLISQAYRRGYGAAGPVIDRDW
LIQHNQGLIILSGARKGDVGKLLLNDKMQQVKKCLAFYHRYFPDRYYLELIRTGRLNEEK
YLNLAVLLAKKNGLPVVATNDVRFISSDDFQAHNIRVAIHNGCLLDNVKQSYDYSSQQYI
RSEQEMCELFKDIPEALANSVEIAIRCNVTIRLGEYFLPQFYTGNISTNSYLIKCARQGL
EERLAFLFPDLIQLKDNRLPYDQRLDQELQVINGMGFPGYFLIVMEFIQWSKDNSIPVGP
GRGSGAGSLVAYALKITDINPLPFDLLFERFLNPERISMPDFDIDFCMEKRDLVINHVAE
TYGRDAVSQIITFGTMAAKAVIRDVGRVLGYPYSFVNKISKLVPHDPGITLDKALAIAPQ
LRQIYNVDENVTLLIDLARKLEGVTRNVGKHAGGVVIAPTKITDFAPLYYDSEGKCPLTQ
FDKNDIEYAGLVKFDFLGLRTLTIINRALEMINKHIHSKLNPIEITTIPLDDKKSFDMLL
CADTTAIFQLESRGIKELIRRLQPDCFEDIIALIALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGRETI
CYPDIQWQHPSLQPILEPTYGIILYQEQVMQIARILAGYTLGEADLLRRAMGKKEPKEMV
KQRAIFKIGAEKMGIESKLAMKIFDLVEKFAGYGFNKSHSTAYALVSYQTLWLKAHYPSQ
FMASAMTADIDNIDKLAILVYECLRMGITVLPPNINISHYYFHVNKNSQIIYGLGAIKGL
GEGPITTILEARNTGGKFSNLLDLCIRTCTKKLNRRILEKLIISGACDQLGSHRAALMNE
LETALKTADQYTKLNMIGQIDMFSTQADKQCILDYSHKSKNIQPWSKQVILKGEQETLGL
YLTSHPIIEYLYEIKFYTKGLRLKDIPLITCSKKITVVGLLLSIRNIITNNNQSLSICTI
DDMTGHLDIAISSDMLDQYKSFLKVDNILLVEGEVRFSNTQSTLKVIAHKIMDINTARNK
YAAGIAIFLTAQQINESFLKNLDLSLKSHALEAGAIPVHLYYNKNNTRVQLHYNITWKVK
LTDYLLNDLRNLVGNEGIKIEFN
NT seq
3492 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcgaacctagttttattcatttacgtattcatagcgactattctattattgatgga
ttaatcaaagttagttcattagtaaaaaaagcagtttctttaaatatgccagcattagct
cttactgatgtgactaatctttatggtattattaagttttataaagcagctaatagtgta
ggtattaagcctattataggtgctgatttcttaatgtacaaccctatattaggtggggaa
cttactgaattaactattctagcgactaactatattggttatcaatgtttaactatgcta
atttcccaagcatatcggcgaggttacggcgctgctggtccagttattgatcgagactgg
ctaattcaacataatcaaggtttaattatcctttctggggcacgtaaaggtgatgtaggc
aaattattacttaatgataaaatgcaacaagtaaaaaaatgtctagccttttatcatcgt
tattttccagatcgatattatctagaattaatccgtactggtagattaaatgaagaaaaa
tatttaaatcttgctgttttgcttgcgaaaaaaaatggactaccagtagtagctactaat
gatgtccgttttattagttctgatgatttccaagcacataatattagagtggcgatccat
aatggatgtttattggataatgttaaacagtcgtatgattatagttcacaacaatatatt
cgcagcgaacaggagatgtgcgaattatttaaagatattccagaagcattagctaatagt
gtagaaattgctattcgttgtaatgtaactatccgccttggtgaatattttttaccgcag
ttttatactggtaatatatcaactaatagctatttaatcaaatgtgcacgtcaaggttta
gaggaacggctggcgtttctttttccagatttaatacagctcaaagataatcgattacct
tatgatcagaggttagatcaagagttacaggtaattaacggtatgggctttccaggttac
tttcttatcgttatggaatttatacaatggtctaaagataatagtattccagtaggacca
ggacgtggatctggtgcaggttctttagtagcttatgctcttaaaatcacagatattaac
ccacttcctttcgatctgctatttgagagatttcttaatcctgagcgtatatcaatgcct
gactttgatattgatttctgtatggaaaaaagagatttagtaattaatcacgtagcagaa
acttatggtcgtgatgctgtatcacaaataattacttttgggacgatggcagctaaagca
gtaatccgcgatgttggacgagtattaggttatccttatagttttgttaataaaatatct
aaattagtaccacatgatccaggaattacgttagataaagctttagctatagcaccacag
ctaaggcaaatatataatgttgatgaaaatgtaacattgttaatagatctagcacgtaag
ttagagggagtaacccgtaacgtaggtaaacacgctggcggagtagtaattgcacctaca
aaaattactgactttgcaccgctatactatgattctgaaggtaagtgtcctctaacacaa
tttgataaaaatgatatcgaatatgctggtttagtaaaatttgattttctcggtttacgt
actttaactattattaaccgagcactagaaatgattaataagcatatacacagcaaactc
aatcctattgagatcacaactattccattagatgataaaaaaagcttcgatatgttgtta
tgtgcagatactacagctatatttcagctagaatcacgtggtattaaagaattaattagg
cgtctgcaaccagactgctttgaggatataattgcattaatagcactatttcgtccaggt
ccacttcagtctgggatggtagataattttattaaccgcaaacatggtagggaaacaatt
tgttatcctgatatacagtggcaacacccgtccttacagcctattctagaaccaacttac
ggtattattctttatcaagaacaagtaatgcaaatagcgcgaattcttgcaggatatacg
cttggtgaagcagatctactacgtagagctatgggcaaaaaggaacctaaagaaatggta
aaacagcgtgctatttttaagattggtgcagaaaaaatgggtatcgagagtaaactcgca
atgaagatatttgatttagtagaaaagtttgctggatacggttttaataaatcccactct
actgcctatgctcttgtttcttaccaaacattatggctaaaagcgcactatccatctcaa
tttatggcatctgctatgactgcagatatagataatattgataagctagcaatactagta
tacgaatgcttacgtatgggtattacagtattaccaccaaatattaatataagtcattat
tattttcatgttaataaaaatagtcagattatttatggtcttggtgctattaaaggctta
ggtgagggaccaataacaactattcttgaagcaagaaatacaggaggaaaattttctaat
ttattagatttatgtatacgtacatgtactaaaaagctaaatcgccgcatactagaaaag
ctgattatatctggtgcctgtgatcaattaggttcacatcgtgcagccctaatgaacgaa
ctagagaccgcgctaaaaacggcagatcaatatactaaattaaacatgatcggtcaaata
gatatgtttagtacacaagcagataagcaatgtatattagactattctcataagagtaaa
aatattcaaccttggtcaaaacaagtaattcttaagggtgaacaagagactttaggactt
tatttaacaagtcatcctattatagaatatttatatgaaattaaattttatactaaaggt
ttacgattaaaagatatacctctcataacatgtagtaaaaaaataacggtcgttggatta
ttattgtcaataaggaacataataactaacaataatcagagtcttagtatttgtactata
gatgatatgactggacatttagatatagcaatatcatccgatatgctagatcaatacaag
tctttcttaaaagtagataacattctgcttgtagaaggagaagttcgcttctctaatact
cagagcaccttgaaggtaattgcacataagatcatggatattaataccgcacgcaataag
tacgctgctggaattgctatattcctcacagctcagcaaataaatgaatcttttttaaag
aatctagatttatctttgaaatcacatgcattagaagctggagcaataccagtgcacctt
tattataataagaacaatacacgtgtacagttgcattataatataacctggaaggtaaaa
ctaactgactatttactgaatgatttacgtaatttagtaggaaatgaagggattaaaata
gaatttaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
