Borrelia coriaceae: bcCo53_000409
Help
Entry
bcCo53_000409 CDS
T08173
Name
(GenBank) transporter substrate-binding domain-containing protein
KO
K02489
two-component system, glycerol uptake and utilization sensor kinase [EC:
2.7.13.3
]
Organism
bcoi
Borrelia coriaceae
Pathway
bcoi02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bcoi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
bcCo53_000409
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01001 Protein kinases [BR:
bcoi01001
]
bcCo53_000409
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02022 Two-component system [BR:
bcoi02022
]
bcCo53_000409
Enzymes [BR:
bcoi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.13 Protein-histidine kinases
2.7.13.3 histidine kinase
bcCo53_000409
Protein kinases [BR:
bcoi01001
]
Histidine kinases
Cell cycle family [OT]
bcCo53_000409
Two-component system [BR:
bcoi02022
]
Cell cycle family
Hk1-Rrp1 (glycerol uptake and utilization)
bcCo53_000409
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
SBP_bac_3
Hpt
PDE8A_N
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA16278
LinkDB
All DBs
Position
complement(431965..436401)
Genome browser
AA seq
1478 aa
AA seq
DB search
MRGLSIFLFVFFFSNISLPAKQTLKFKLVDQYYPLYYKNQENKIVGIIFDLLHKWAQDHD
YDIGIETVDYLDKNGIEDDVIYLGLTYSSSLNEYLYFKNEIGKCVTALVYDSRTGDKPFN
LFLSNELRIGVVKNTIYEDILKFHGHIDNVFFFTDTEKLLLALRDNKVDLVYGSYKSLSR
IWHSSFESSFIKVFDFEYFYSFGIRTAISKNAVSQLRALDVDLLSYMQSLSLGEHASFKE
LKSLFTLDVGIYDDYPPLSFINSNGQFSGILVDLWNSLAREYGFLVKFIGFPKESIKKSI
DDKDVSVWGGIIEDENVLTSKKYKSTAPICSLNFNLYFTNAKNSNKIINSQIIDFNLNNI
QIDKNTDIVSNFTDIVKHSYGFVENSITTRYLVNLYGYNNILKFQDMSLTKRKFLVLAVN
SKRLQLFAYMLNALTTNILFDTLLHIDKNWLEQDEIEDYHKNFYGDVNSCNFNIEEKIWL
ESNKRLNLAVKDWYPIDYSDSGRYKGVNEWLINKIKRLTNLDFNVVSVYEKDIRELIKLG
KIDVLSVNLDDSNSGYVFNIKTVSGIPLYLFSNKPRLFTSKSSDRIAVLKFLYTKKLDTQ
IGAQLVQVDSFKEALDLIYRGKVSGIISDEYTATINFEDLNIRDIKKVFTAPDLTFDLNI
AVHNQDYILRRIIQKTLFREKVNNNLYFDDWVFNVHESFKDIRIKKSGIAVLSISVFVFT
IFIFVLFNLLKEIGFRKKMYSSALSEKKVIEDAIAAKTVFLASMSHDIRTPINGIIAATE
LLENTDLLGVQKEYVQMINYSSVSLLSLIDEILYISKIDMNEVYIENNEIDLLREIEGVL
KGFQSQSAKQNLDLIFYSKSDLENYLIGDRSRLKRILINLIGNSFKFTTDGIIVLNYEMV
CIKEDNDSNKIVTIEFKVTDTGKGIKKSDIPIIFELFKQGDDSESKKYEGTGLGLAISRK
LVSLMGGPGITVESEVGKRTTFSFMLPFVLGNKIKDQELNKLELVNDKKILSLFLNKKTV
EVLREITEIFDYKDNIHYFCSYEDAYKAFYRNPYYDFVFINVDDFSLQEGLKFAFRVESL
NANVRIVFVFYYLKSDELVDFKYEYMQKPFKRWDFYSDWIRNGSNLDVSIISEPSTLKLK
NNLNILIAEDNEINQKILKNILLVIGVRESSIDIVDDGIKAIEFLKTNRYDMAFIDIRMP
SCDGFRVSKEIRKFESQNHLTPCVLVAVTAHALKEYKDRCLANGMNDYLAKPIHISSIRY
ILKKYLHVEIEDNKLMEDKELSKFSDLPNLNINNALIDLNISYYMYVDLCRGFVDMSNEL
IRNLDEAFNLNDLELVKRLAHSIAGALGNMRSNLFKNFRQIESNTGSIRELKILYFEARK
DLIILIKNIKEQILDVVEAGYQKKLEFKNNDEFLGLLKELLNGIEDRNPKKYKEVLKVIK
GYSLDDNNAILFDSLEKYLRVYNFEESVNIVKRMMNVR
NT seq
4437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcgggttgagtatttttttatttgtattttttttctctaatatcagtttacccgct
aaacaaactcttaaatttaaacttgtcgatcaatattatccactttattataaaaatcaa
gagaataagatagttggaataatttttgatctcctccataagtgggcacaagatcatgat
tatgacattggtatcgaaactgttgattatcttgataaaaatggcattgaagatgatgtg
atttatttaggcttaacttatagttcaagtttaaatgaatacctttattttaagaatgag
attggcaaatgtgtaaccgcattggtttatgattcaagaacaggagataaacctttcaat
ttatttctttcaaatgaattacgcataggcgttgtaaagaatactatatatgaagatatt
ttaaaatttcatggtcatattgataatgttttcttttttacagataccgaaaaattactc
ttggcattaagagataataaggttgatttggtatatgggagttataaatcattgtctcgt
atatggcatagttcttttgagtcatcttttatcaaagtttttgattttgagtatttttat
agttttggtataagaactgctattagtaaaaatgccgtcagtcaattaagggctttagat
gttgatcttttaagttatatgcagtctttgtctttaggggagcatgcttcttttaaagaa
ttaaaatctttatttacacttgatgttggcatatatgatgattatccccctttgagtttt
attaattctaatggtcaattttcaggaattttagttgacttatggaatagccttgctaga
gaatatgggtttttagttaaatttataggatttccaaaggagagcattaaaaaaagcata
gatgataaggatgtgtctgtttggggtggaattattgaagatgagaatgttttaacttct
aaaaagtataaatcaactgctccaatatgctcacttaattttaatttatattttacaaat
gctaaaaatagcaataagatcataaattcacaaattattgatttcaatttaaataatatt
caaatagataagaatacagacatagtaagtaattttacagatatagttaagcattcatat
ggatttgtagagaactcgatcactacaagatatttagtaaatttgtatggatataataat
atattgaaattccaagatatgagtttaactaaaaggaaatttttggtattagctgttaat
agtaaaagattgcagttgtttgcatatatgcttaatgctttaaccacaaacattttgttt
gatactttgttacacatagataaaaattggcttgagcaagatgagattgaagattatcat
aaaaatttttatggtgacgtaaatagctgcaactttaatattgaggaaaaaatttggtta
gaaagcaataaaagactaaatcttgctgttaaagattggtatcctattgattattctgat
tctggtcgttataaaggggtaaatgagtggttaattaataagataaaaagattaacaaat
ttagattttaatgttgtaagtgtatatgagaaagatattagggaattaattaaattaggt
aaaatagatgtattatctgttaatttagatgattcaaattcaggttatgtttttaacatt
aaaacagtttcaggaattccattatatcttttttcaaataagcccagactatttacttct
aaatcatctgatcgcattgcagtacttaagtttttatatacaaaaaaattagatactcaa
ataggagcgcaacttgtccaagtagatagttttaaagaagctttggaccttatttacagg
ggtaaggttagtggaattattagtgatgagtatactgctaccattaattttgaagactta
aatattagggatattaaaaaagtttttactgctccggatttaacctttgatttaaatatt
gcagtccataaccaagattatattctaagaagaattatacaaaagactttatttcgtgag
aaagttaataataacttgtattttgatgactgggtttttaatgttcatgaaagttttaaa
gatataagaattaaaaagtctggcatagcagtattaagcattagcgtgtttgtttttact
atttttatatttgtcctatttaatttgcttaaggagataggatttaggaaaaaaatgtat
tcttctgcactcagtgagaaaaaggttattgaagatgctattgctgctaaaactgttttt
ctggcaagtatgagccatgatattcgtactcctattaatggcataatagcagctactgag
cttttggaaaatactgatcttttaggggtgcaaaaagagtatgttcaaatgatcaattat
tcatctgtctcattactgtctttgattgatgagatattatatatctctaaaatagatatg
aatgaggtatatattgaaaataatgaaatagatttgctgcgtgaaattgaaggtgttttg
aaaggttttcagtctcagagtgcgaaacaaaatcttgatttaattttttattcaaagtcg
gatttagaaaattatttaataggtgataggtctagacttaagagaatacttattaattta
ataggaaattcttttaaatttactacagatggaatcatagtgttaaactatgaaatggta
tgtattaaagaagataatgatagtaataaaatagttacgattgagtttaaagtgactgat
actggtaaagggattaaaaagagtgatatacctataatatttgaattatttaaacaagga
gatgattctgagtcaaagaagtatgagggaactggtcttggccttgcaatatctagaaag
cttgttagtttaatgggagggcctggtattacagttgagagtgaagtaggcaagagaaca
actttttcatttatgttgccttttgttttaggtaacaagattaaagatcaagaattaaat
aaattggaattggtaaatgataaaaagattttgagcttatttttaaataaaaagactgtt
gaagtattaagggaaataactgaaatatttgattataaggataatatacattatttttgt
tcctacgaagatgcttataaggcattttataggaatccttattatgattttgtttttata
aatgttgacgattttagtttacaggaaggtcttaagtttgcttttagagttgaaagttta
aatgctaatgtaagaatagtatttgtattctattatttaaagagtgatgagcttgtcgat
tttaaatatgaatacatgcaaaaaccttttaaaaggtgggatttttattctgattggatt
agaaacggttcaaatttagatgtttcaataataagtgaacctagtactcttaagcttaaa
aataatcttaacatcttaatagctgaggataatgaaattaatcagaaaattttaaaaaat
attttgcttgttataggtgttagagaaagttctattgatattgtggatgatggtataaag
gctattgagtttttgaaaaccaatagatatgatatggcttttattgatataagaatgcca
agttgtgacggatttagagtgtctaaagaaatacgcaagtttgaaagtcagaatcactta
actccatgtgttttagtagctgttaccgcacatgcattaaaagaatataaagataggtgt
ttagcaaatggaatgaatgattatcttgcaaaaccaatacatattagttcaattaggtat
atattaaaaaaatatttgcatgttgagattgaagataataagcttatggaagataaggag
ttaagtaagttttcagatttgcctaatttaaatattaataatgctttaatagatttgaat
atatcatattatatgtatgttgatttgtgtagaggatttgttgatatgagtaatgagctg
atacgtaatttggatgaggcttttaatttgaatgatttagaattagtaaaaagattggcg
cattcaattgctggagcacttggtaatatgcgtagtaatttatttaaaaattttagacag
attgagagcaatacaggttcaatacgtgaattaaaaattttatattttgaggcacgtaag
gatttgattatactcattaagaacataaaggaacagatcttggatgttgttgaggctggc
tatcagaaaaaattagaatttaaaaataatgatgaatttttgggtcttctgaaagagctt
ttaaatggtatagaggatagaaatccaaaaaaatataaggaagtgcttaaagtcattaaa
gggtatagtttagatgataataatgctatattatttgattctcttgagaaatatttaagg
gtatataatttcgaggagagtgttaatattgttaaacgtatgatgaatgttaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system