Borrelia crocidurae: Q7M_846
Help
Entry
Q7M_846 CDS
T02051
Name
(GenBank) Exonuclease SbcC
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
bcw
Borrelia crocidurae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bcw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bcw03400
]
Q7M_846
DNA repair and recombination proteins [BR:
bcw03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
Q7M_846
Archaeal homologous recombinant proteins
Q7M_846
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SbcC_Walker_B
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
T2SSE
Zeta_toxin
AAA_16
nSTAND_NTPase5
AAA_22
DUF6985
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI31625
LinkDB
All DBs
Position
887103..889958
Genome browser
AA seq
951 aa
AA seq
DB search
MRINKLIFKNIASYKGEYEINFDVSVLRRSGIFLISGNTGAGKSTILDCITLALYARVYR
LDKNISDSISKGFDSAYVRLTFTVSEKRYESFIELHIRQKETPKSMVLNCLSDGNFIENR
DDVLVYIKSLCRLDFEQFCQTVILPQGNFQEFLTSNPKSKAAIIDNIFNLKKYDNIEIFL
KKELDLTKFNREKLIFLDTEEKNRVSINKKKINELKEILSLIDIESLKKNLDNVYKLIVI
CEKIIKFNRNYLNIQCRIDNLKLDLSFKIESRKKLKHEHHLQSKIKSQLDQRLAFYHSND
FLDLKNFVRRHIELLNDKSQFVYEFSRVQKDLEELKYLDLDNFNFDYVKELYYENAIFCE
IGFDEKAYNVLLVKERQLEIQRKKLLEKQRKKNVEIKSIALKEVTFDFDKYVYYEALKLL
KGFYEELILKYKNGLSLLLNLDNENNDFSQIVNMNIKIDFYEKFLEHLIKNKELVERDIE
NLKFLEDAYRAYQGKEKLKISNLNDLLELNSKLQVLQSELDILRLDILRNKENKIKWEGC
VANFKKNDSEILKRVGQNLFHKYIDYSDKNKMLVFESKFKKVSELKLILNDLNSKISLND
VKIKDNLDKIKNLLSNINLNINFSDPTLLEEEFEKFLISQRNIENDRMKFNVCLDNINNE
KLKLESQIEFIKQTMLNFKIELKDELDNFTSNFLNFKVAMRGNTCDTDPIVFLDSLTPSK
NSLEHFLKLKSNFMSQIEVFSKEISKYDAAFSSVQNLQLELNEQEINLRNINSKLININE
RNDKLEILKKIITVSPSLKYYVQSFLIDEILSIANKKYLSIILPDFELEINTGSRDFNFL
VRSKRDGNMTRNVKTLSGGERFLVSLSLSLAFSDMIRDSDLKIEAFFLDEGFGSLDEDTL
KVVIPRISDLQRIDGRQIGIISHVSYLKEEIKTQIVVEKVSTVSKITIESF
NT seq
2856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggataaataaattaatatttaaaaatattgcgtcttataaaggtgagtatgaaatt
aattttgatgtgtctgttttaagaaggtctggaatttttttaatttctgggaatacagga
gctggaaagagtacaattttagattgtattacgcttgctctttatgcacgtgtttatagg
cttgataaaaatatttcagattctatctcaaaaggttttgatagtgcttatgtgagactt
acttttactgtttctgagaagagatatgaatcgtttattgaacttcatataagacaaaaa
gaaacgccaaagagtatggtgctaaattgtcttagtgatggaaactttattgaaaacaga
gatgatgttttggtttatattaagagtctttgtagattagattttgagcagttttgccaa
actgttatcttgccccaaggaaattttcaggaatttttaacttcaaatccaaagagtaaa
gcagctataattgataatatttttaatttaaaaaaatatgataatatagagatcttttta
aagaaagaattagatcttacaaaatttaatcgggaaaaattgatatttttagatactgag
gaaaaaaatagagttagtattaataaaaagaaaatcaatgaattaaaagagattttgagt
ttaattgatatagaatctttgaaaaaaaatcttgataatgtttataagttaatagttatc
tgtgaaaagataataaaatttaatagaaattatttaaatattcagtgtagaattgataat
ctaaaattagacttgtcttttaagattgagagtcgaaaaaaattaaagcatgagcatcat
ttgcagtcaaagatcaaatctcagttggatcaaagacttgcattttatcattctaatgat
tttttggatttaaaaaactttgttagaaggcatattgaattattaaatgataagagtcag
tttgtttatgaattttcaagagttcaaaaagatttagaagaattaaaatatttggattta
gataattttaattttgattatgtaaaagaattatattatgaaaatgctattttttgtgaa
ataggatttgatgagaaagcttataatgtattgcttgtaaaagagagacagttggaaatt
caaaggaagaaattgttagaaaaacaaaggaaaaagaatgttgaaattaaaagtattgct
ttaaaagaggtaacatttgattttgataaatatgtttattatgaggcattaaagttatta
aaaggattttatgaagagttaatattgaaatataaaaatggattatcgttattgttaaac
ttggataatgaaaataatgacttttctcaaattgttaatatgaatattaagattgatttt
tatgaaaaatttttggaacatcttattaaaaataaagaattggttgaaagagatatagaa
aatcttaagtttcttgaagatgcatatagagcatatcaaggaaaagaaaagttaaaaatt
agtaatttaaatgatcttttagaattaaattcaaagcttcaagttttacaatctgaattg
gatatcttgagattggatatcttgcgtaataaagaaaataagattaaatgggaaggttgt
gttgcaaattttaagaaaaatgattcagaaattttaaaaagagttggccaaaatttattt
cataaatatatagattattctgataaaaataagatgttggtttttgaaagtaaatttaaa
aaagtttcagaattgaaattaattcttaatgatttaaattctaaaatttccttaaacgat
gtaaaaattaaagataatttggataagataaaaaatttactgtctaatattaatttaaac
attaattttagtgatcctactttattagaggaagaatttgaaaaatttttaatttctcaa
agaaatatagaaaatgatcgtatgaaatttaatgtgtgtcttgacaatataaacaatgaa
aaattgaaacttgagagtcaaattgaatttataaaacaaactatgttaaattttaaaata
gagcttaaagatgagttagataattttacttctaattttttaaatttcaaagtagcaatg
cgaggtaatacttgtgatacagatcccattgtttttcttgattctttaactcctagcaaa
aatagtttggaacattttttaaaattaaagtctaattttatgtctcaaattgaagttttc
tctaaagagattagtaagtatgatgcagctttttcaagtgtacaaaatcttcaattagaa
cttaatgaacaggaaattaatttaaggaatatcaatagtaaattaatcaatatcaatgaa
cgtaatgataaacttgaaattttaaaaaaaattattactgtatctcctagtttaaaatat
tatgttcaaagttttttgattgatgaaattcttagtatagcgaataagaaatatttaagc
attattcttcctgattttgagcttgaaattaatacaggtagtagagattttaatttttta
gttaggagtaaaagggatggaaatatgactcgtaatgttaaaactttatctggtggtgag
agatttcttgtatctttatctctctctttagctttttcagatatgatcagggatagtgat
cttaaaatagaggcgttttttcttgatgagggttttggaagtcttgatgaagacacttta
aaagtagtgataccaagaatttctgatttacagcgtatcgatgggcgtcaaataggtata
atatctcatgtttcttatttaaaggaagaaattaagacgcaaatagttgtagagaaagtt
tctacagtttctaaaattactatagagagtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
