Brachypodium distachyon (stiff brome): 100841161
Help
Entry
100841161 CDS
T01717
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g50990
Organism
bdi
Brachypodium distachyon (stiff brome)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
DYW_deaminase
RNase_T
PPR_1
PPR_long
PPR_3
E_motif
Eplus_motif
RNase_H_2
Rv2179c-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100841161
NCBI-ProteinID:
XP_010228725
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(64188920..64194929)
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MSYTNCLKKHPTRLFFPYANSILRASLEKGSPQKSLMDYGTMLNSTTFCPDYRTYGILLR
ACLKYSDIYAAMQIHSRLTKVGLLRNQHIIAPLLRLYIDYDCMTEARELFWLMLEWSTDP
FHGNLMLTGFLKGGQLDKAYQIFKRMPVKDVVSWNSMIAGAVRSSHLKDAMILFSRLVNS
GLVPDGFSFSSVLSACARAGALFYGVWVHRLMAELGVEKNNILISALVDMYAKCGRIDVS
VEIFNTVKRNHVPMWNTMIGSLAAHGLGQDVVVLFHRMEHAGVVPDGVTFVALLTACSHC
GMVEEARQYFEAMTTKYYITPKVEHYGAMVDTLSRAGLLDEAYNLVRSMVVKPDAVIWRA
LLSACRRHHQTKLGEITIEQMVCQGSGDYTLLSNIYSSINRWVDSENVWKERKKKKVRKN
KGLSWVELGGSTHEFKAGDRSHPDTDDIYRVLHGLSKKAKAEGYSPSTELVMKDVSHEER
EENLTFHSEKLAVAYSVLKTGPGTEIMVSKNLQTCGDCHEWIKIISKVLCRVIIMRDRAR
FHRFESGCCSCKDYWTNNIFDALFTPFVQCPYILYAHLKSLQCYNIEEKVSGVKPECPAT
ILVFDIETTGFSRRGDRIIEFAVRDLAGGKNSTFQTLINPERVIPNTHIHGISTNMVCRS
DIPRFGEFIPILLQYVLSRQMAGKPVLWVAHNGKTFDVPFLICEFQRCKMEMPGDWLFVD
TLPIARQLVDGKTKGAATLKTLTERYKIPVNGDAHRAMQDVTALCYVLQKLTLELKITVP
QLLENSFRVSDVATTPAKK
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcctacacaaactgtctgaagaaacatcctacaagactcttctttccatatgccaat
tccatcctccgagcatctttggagaaaggctccccacaaaagtcactgatggactatggc
actatgctcaattctaccacattttgccctgattacagaacatatggtatccttctcaga
gcttgtttgaaatattcagacatctatgctgcgatgcaaattcattcacgtctcactaaa
gttgggttgttacgtaaccaacatataatagctccacttttgaggttgtatattgattat
gattgcatgacggaagcacgtgaactgttttggttaatgctggagtggagcactgatcct
ttccatggtaatttgatgcttacgggattcttgaagggtggacagctagacaaggcatat
cagattttcaagaggatgcctgtcaaggacgtggtctcatggaattcaatgatagcaggt
gcagtaaggagctcccacctgaaagatgcaatgattctttttagcaggttggtcaattca
ggtcttgtgcctgacggtttctcattctcttcagtcctgtcagcttgtgctcgagctggt
gccctgttttatggtgtgtgggttcatcgactgatggctgaactgggggtggaaaagaat
aatattttaatctcagcacttgttgatatgtatgccaaatgtggaaggattgatgtgtca
gttgagatattcaacacagttaagagaaaccatgtgccaatgtggaacacaatgattgga
agcctggcagcacatggtcttggacaagatgtagtggtgttgttccacaggatggaacat
gcaggtgtggttcctgatggagttacgtttgttgcactattgacagcatgcagccattgt
ggtatggttgaagaggctcgtcaatactttgaagcaatgactacgaagtattatatcact
ccaaaggttgaacattatggtgcaatggtggatactttgtcacgagctgggctgctggac
gaagcatacaacttggtgaggtcaatggttgtgaagcctgatgctgtgatatggagggca
ttacttagtgcttgtcgtaggcatcatcagaccaaattaggtgagatcaccattgagcag
atggtgtgtcagggcagtggtgattatacccttctttcaaatatctactcatcaataaac
aggtgggttgattcagagaatgtatggaaagagaggaagaaaaagaaagtaagaaagaac
aagggattgagctgggttgagttagggggaagcacccatgaattcaaagctggtgatcga
tctcatcctgatactgatgatatttacagagtgctgcatggcttatctaaaaaagcgaag
gctgaagggtatagtccatctactgaattagtaatgaaagatgtctcacatgaggaaaga
gaagaaaacctcaccttccacagtgagaagcttgcagtggcttatagtgtccttaagact
ggtcccgggacagaaataatggtgtcaaagaatctgcagacttgtggtgactgtcatgaa
tggataaagataatctcaaaggtactttgtcgtgttataattatgagggatagagctcga
tttcaccgttttgaaagcgggtgctgctcctgtaaagattactggacaaacaatatcttt
gatgccctatttactccatttgtacaatgtccttatattctatatgctcacctgaaatca
cttcagtgctacaatatcgaggaaaaggtttctggagtcaagcctgaatgccctgcaact
atccttgtttttgatatcgaaactactggattttcacgccgtggtgacagaattattgag
ttcgccgttcgtgatcttgctggtggaaagaatagcactttccagaccctaataaacccc
gagagagtgatacctaatacacatattcatggtattagcaccaacatggtctgcagatct
gatatcccaagatttggggagtttatccccattttactacaatatgttttgagtcgtcaa
atggctggtaaaccagttctgtgggttgctcataatgggaaaacctttgatgtgcccttt
cttatctgtgagttccaacggtgtaaaatggagatgcctggtgactggctgtttgtagac
acacttcctattgcaagacagttggttgatggaaaaacaaaaggtgctgcgacattgaag
actctgacagagcgctacaagatcccagtcaatggggacgcacaccgtgcaatgcaggat
gtgaccgccctgtgttatgttctccagaagttaacgttggagctgaaaataactgttccc
cagctccttgagaactcattccgggtctctgatgttgcaacgacccctgctaaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
