Bdellovibrio sp. KM01: HW988_13545
Help
Entry
HW988_13545 CDS
T08445
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bdk
Bdellovibrio sp. KM01
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5907
DUF8740
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLY24473
LinkDB
All DBs
Position
2787125..2792959
Genome browser
AA seq
1944 aa
AA seq
DB search
MGSFNYKKTMLRIGILCSLLAISTEALASATSLTYQGRILTASGQPFEYAHASFLFKITS
PDGQCVIYQEQFNGVDMTNSNGIFDVPIGTGSVQYISSPALTVIDIFNNSGSYQCGTCTP
SAGNTYTCSPSMAAPYVAAPADGRLLRVAFYDGSGWNAVTPDNKIRAVPYAGYSFTSYKL
GSHTANDFMLKADVPSACGTAGNFLTWDAGQSKFACSTLASAGAGTITGVTAGSGLTGGG
SSGNVTVSLANTGVTASTYGSATQVPVLTIDAQGRVTGVTNTSITGIAPTGAASGDLTGN
YPSPTIAGNAVTSAKILDGTINAADMNFTGTNTATSGIVIKDSLGNFSEFACSTVGHIAM
WTSVGWGCQAPSTTDSTKLPLTGGTMAGAIDMNSNNITNIGFMTMSANKSLHVSNNSSDP
SLVAADKGKIWFNSTTNELKYWNGTAAVAVGSTGAAITDLTGDVSATGPGSAAATIANSA
VTNAKMANMAAHTLKGNITGSAAAPTDITIASLQGTSGTTFAAGNDSRITGALQSGTAAG
GDLAGTYPNPTLATGAVTSTKIASATIVGANLDFTGANSATTGMVLKDATGKFLSFVCST
AGDVPTWTTSGFSCQTPSPLLPALADGKIWVGVAGTATAVTMSGDANLSNAGALTLASVV
SAGTYTKVTVDVKGRVTTGANLAAGDIITALTYTPVNKAGDVMTGSLGLGNFTNATEATL
ITGWTAADKGKTWFNTSTNQVKYWDGSAAQALGVSGAGLTSLNGESGSAQTFATPGTAGT
APAWSSASNTHTLNIPMASAAGVTAGLLNKTDYDTFAAKQAAGNYVTALTGDVTASGPGS
AAATIASNAVTSAKIADGTVVAADMDFTGVNAGTANLVIKDSSGKFANFGCSTAGHVATW
SVAGWSCAAPTPLMPSLADGKMWVGDNANTATAVTMSGDATLSNSGALTLANVVSAGTYT
KVTVDTKGRVTTGANLAAGDITTALTYTPVNKAGDVMTGSLGLGNFTNATEATLITGWGA
SDKGKTWFNTSTNQMKYWDGSVAQALGVSGAGLTSLNGQSGSTQTFATPGTSGTAPAWSS
SSNAHTLNIPMASAASVTAGLLSKTDYDAFAAKQAAGNYVTSLTGDVTATGPGAAAATIA
ANAVTSSKIADGTIVGADIDFTGANAATTGIVLKDSTGKFMNFTCATAGHIPTWTASGFA
CQAPTALLPTLADGKIWVGVAGTATAATMSGDATISNTGALTLATVATAGTYTKVTVDTK
GRVTTGANLVAADITSALTYTPVNKAGDVMTGSLGLGNFTDATEATLITGWNTADKGKTW
FNTTSNVVKYWDGSAIKVIGSVGAAISSMNGLSGTTQTFATPGTTGTAPSWSSVGSSHTL
NIPMASASSVTAGLLSKTDYDAFAAKQAAGNYVTALTGDVTASGPGSAAATIANSAVTNA
KMANMAANTLKGNNTGSAAAPTDITIASLQGTTSTTFAAGNDSRITGAMQSGATAGGDLT
GTYPNPTVASGAVTTGKIASGTILGTNMNFTGTNAGTTSMVLKDSTGKFFDFACSTAGHV
ATWTVSGWACQVVSLTPSGFGSQTQNTFLAAPNGSAGNPTFRTIASADLPITGATGVYIN
GGNSFGSAATLGTNDANSLSLETNNTTQLFISATGSVGIGTVSPTAKLHISSSLTGNSGQ
LYTNFFYATADPTAASSATYYGSQGTVSNYNSNTRLNGATLTGVAGLVEQGGTGIVGNAN
AIEALVSKFASGNMTSVNGVYSHLNSSTSGTTDTFRGLYVSTNISGTSTLTNGYGVYIDS
MSGTTNSYGIYQNGASDRNYFAGRVGINTASPSANAKLEVTGTIVSTPTSVAGASVNLAT
SNTITLTAVGGTAITLSNMVNGGNYTLLVSDTTSRTYTFTGCNTSKFRPANAATVAGTAT
MYSIITIYNGSTYDCWITWGSGYQ
NT seq
5835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatcgttcaactacaaaaaaaccatgctaagaattgggatactttgctctttgctt
gcaatttccactgaagcattggcgagtgcaacctccctcacctatcaagggcgaattcta
accgcgagcggtcaacccttcgaatatgctcacgcaagttttctttttaaaatcacctca
cccgatggtcagtgcgtaatttaccaagaacaatttaatggtgttgatatgacgaactcc
aatggcatctttgatgtgccgattggaactggtagcgttcaatatatatcgagtccggca
ttgactgttatagacatctttaacaactccggaagttatcaatgcggaacttgcacccca
agtgcagggaatacttatacatgctccccatcgatggcggctccctatgtggcggcacct
gctgatggacgtcttttacgagtggcattctatgacggctcaggttggaatgcggtcact
cctgataacaaaattagagcagtgccgtatgctggatattccttcacttcatataaatta
ggttcacacaccgctaatgattttatgttaaaagcggatgttccatcagcctgcgggacc
gctggaaattttctgacttgggatgcggggcaatccaaatttgcctgttcaactcttgcg
agtgctggagctgggactatcacgggtgtcacagccggaagcggacttacaggtggaggc
agctctggaaatgtgactgtgtcattagcaaacacaggtgtgactgcaagcacttatggt
tctgcaactcaagtaccagtattgactatcgatgctcaaggacgagtgaccggcgtgaca
aacacctctatcacgggcattgcacccaccggcgctgcgagtggagatcttacaggaaac
tatccatcccctacaatcgcggggaatgctgtcaccagcgccaaaattttggatggtact
atcaatgccgctgatatgaattttacgggcacgaacacagccacgtcaggaatcgtcatt
aaagattccttgggtaatttttctgagttcgcttgctcgactgtgggacatatcgcaatg
tggacatcagtgggttggggctgccaagcaccttcgacaacggattcaacaaaattaccg
cttactggtggtacgatggccggcgccattgatatgaactctaacaacatcacaaacatc
ggctttatgacgatgtcagcgaataaaagtttgcatgtatcaaacaattcctcagacccc
agcttggtcgcagctgataaaggtaaaatttggtttaactcgacgacgaatgaattaaag
tattggaatggtactgccgcagtggcggtgggatccacaggtgctgctatcacggacctc
actggagatgtgtcagcaaccggccccggctctgcagcggcaacgattgcgaatagcgca
gtgacaaatgcaaagatggccaatatggcagcccatactttaaaaggcaatatcacgggt
tccgcggccgcaccgacggatataactatagcgagtcttcaaggtacttccggaactaca
tttgccgcaggtaacgattctcgcatcacgggagcacttcaatccggtactgctgcaggt
ggtgatcttgctggtacttatccaaatccaactcttgccacaggtgcggtgacctctaca
aaaatcgcaagtgcgacaatcgtgggtgcaaatctggattttacgggagccaatagtgca
accacgggaatggttcttaaagatgccacgggcaaatttttaagttttgtgtgttcgacg
gctggcgatgttccaacttggacgacatcgggtttttcatgtcagacgccttcaccactt
ctccccgctcttgccgatggtaaaatctgggtgggtgtagcaggaactgcgacagcagtc
acgatgtcgggcgatgcgaatctctcgaatgcaggggcattgactcttgcaagtgtagtt
tctgcaggtacttatacaaaagtaactgtggatgtaaaaggtcgtgtcacaactggtgct
aacttagctgctggcgatatcatcacggctctgacatacactccagttaataaagctggc
gacgtgatgactggatctttgggtctgggcaatttcacaaatgcgacggaagcgactctt
atcacgggttggactgctgcagacaaaggtaaaacttggtttaacacatcgacaaatcaa
gtgaagtattgggatggctctgcagcccaggccttgggagtttctggtgcaggcttgact
tcacttaatggtgagtctggttctgcgcaaactttcgcaacaccgggtactgctggtacg
gctccagcctggtcatctgcttccaatacacatacgttaaatattccaatggcatctgct
gccggcgtgactgcgggccttttaaataagaccgattacgataccttcgcagccaaacaa
gcggcaggcaactatgtcacggctttaaccggtgacgtgacagcttctggtcccggttct
gctgcagccacgattgcctccaacgcagtaacaagtgcgaaaattgcagacggtacggtt
gttgccgctgatatggatttcaccggcgtaaacgctggcaccgcgaatttggttatcaaa
gattcctctggtaaatttgcaaacttcggctgttctacggctggtcacgttgcaacctgg
tccgtagctgggtggtcttgtgccgctccaaccccactgatgccttccttggctgatggt
aaaatgtgggttggcgacaatgcgaatacggcaactgcagttacaatgagtggtgatgcg
actctttcaaatagtggcgccttgacattagctaacgttgtttctgctggcacttatacc
aaagttacagtggacacaaaaggtcgcgtgacaacaggtgcaaacttagccgctggcgat
atcacgacggccttaacttacactcccgtgaataaagctggcgatgtgatgaccggttct
ttgggtcttggtaatttcacgaacgcgacagaagctactttgatcacaggctggggcgct
tctgacaaaggtaaaacctggtttaatacttcgacgaatcaaatgaagtattgggacgga
tctgttgcccaggcgttaggagtttccggtgcaggcttaacttcattgaatgggcaatct
ggttctacacaaacttttgccactccgggcacctccggaacggctccggcttggtcttca
tcttctaacgcgcataccttgaatatccccatggcttcggccgcaagtgttacagcgggt
cttttaagtaaaacggattacgacgctttcgcggcaaaacaggctgcaggtaactatgtg
acctctttaacaggggacgtgacagctaccggtcccggtgctgctgcagcaacgatcgca
gcaaatgcggtaacgagttcaaaaatcgctgatggcacgatcgtgggcgcagatatcgat
ttcaccggagcgaatgcagcaactactggaatcgttctgaaagacagcactggtaaattt
atgaattttacttgcgcgactgcaggccatattccgacttggacagcttcaggatttgca
tgccaagcaccgacggctctattaccgactcttgctgatggtaaaatctgggtgggtgta
gcgggaaccgcaaccgctgcaactatgtctggtgatgcgacaatttcaaataccggtgca
ttgacactggcaactgttgcaactgcaggcacttatacgaaagtcacagtcgataccaaa
ggtcgcgtcacgaccggtgcaaatcttgtggcggcagatatcacgtcagcattaacatac
acgccagtaaataaagctggtgatgtgatgaccggctccctgggattgggcaactttact
gatgccacagaagccactttaatcacaggctggaatactgccgacaaaggtaaaacgtgg
tttaatacgacttccaatgttgtaaaatattgggatggtagcgccataaaagttatcggc
tctgtcggtgccgcaatcagctcgatgaatggtctttcagggacaactcaaacttttgca
actccgggcactacaggcaccgctccctcatggtcttcagtgggttcctctcacacactc
aatatcccaatggcatctgcatcgagcgttaccgcgggtcttttaagtaaaaccgattat
gatgcattcgccgccaagcaagccgccggcaactatgtaactgcattgacaggtgatgta
actgcatcggggccgggttccgcagccgccacaattgcgaacagcgccgtgacaaacgct
aaaatggccaacatggcagcgaatactctaaaaggcaataataccggttctgcagctgcg
ccgacagatattacgattgcgagtcttcaaggtacaacatccacaacattcgcggcgggt
aatgactctcgtatcacaggggcaatgcaatcaggtgcaacagcaggcggtgatttaacg
ggaacatatccaaatccaaccgtggcatcaggggctgtgacgactggaaaaattgcctcg
ggaaccattcttggaacgaacatgaattttactggtacgaatgccggtacgaccagcatg
gttttgaaagattcaacaggtaagttttttgacttcgcctgcagtactgcaggccacgtt
gccacttggaccgtttccggatgggcttgtcaggtagtcagccttactccttccggcttt
gggtcccagacacagaataccttccttgccgctccaaacggttcagcgggcaatcccaca
tttagaacaatcgcctctgcggatcttccgattacaggtgcaaccggtgtctatatcaat
ggtggtaactcatttgggtcggctgcaacacttggtactaatgatgccaactctctttct
ttagaaacgaacaataccacgcagctttttatcagcgcgacaggttctgtgggtattggg
actgtatccccgacggcaaaacttcacataagcagttcacttacaggaaactccgggcaa
ctttacaccaacttcttttatgcaacggcagatccgaccgcggcctcgtctgccacttac
tatggaagtcaggggactgtttcaaactacaacagcaataccagattgaacggtgcaact
ctcacgggtgttgcaggcctggttgaacaaggtggaactggaatagttggaaatgcgaac
gctatcgaagccctggtcagtaaattcgcatcgggcaatatgacatcggtaaatggtgtt
tactcccacctgaatagttcaacttctggcacaaccgatacgttccgcggactttatgta
agcacgaatatttctggcacaagtacgttgacgaatggttatggggtttacatagattca
atgagtgggacgacgaatagctatggtatttatcaaaatggcgccagcgatcggaactac
tttgcaggacgcgttggtatcaatactgcatccccaagcgccaatgcaaaacttgaagtc
acaggcaccatcgtcagcactccgacttcagtcgctggagcctctgtgaatcttgcaaca
tcaaatacgataactcttacggctgtgggaggaactgcgattacgctttcgaacatggtt
aatggaggcaactatacattgcttgtgagtgatacgacttcccgcacgtatactttcact
ggttgtaacacgagcaaatttagacccgcaaatgctgcaactgtcgccggcactgccacc
atgtacagtattattacgatctataacggatccacatacgattgctggattacctgggga
agcggctatcaatag
DBGET
integrated database retrieval system