Phocaeicola dorei HS1_L_1_B_010: EL88_19220
Help
Entry
EL88_19220 CDS
T03262
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
bdo
Phocaeicola dorei HS1_L_1_B_010
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bdo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bdo02000
]
EL88_19220
Transporters [BR:
bdo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EL88_19220
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
CREG_beta-barrel
CILP
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AII65152
UniProt:
A0A076IWV3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4267306..4270716)
Genome browser
AA seq
1136 aa
AA seq
DB search
MENVQKTRRLFASAYGCKASRSFLIWGLSAAMSISVIPMMAEISVGEKNYDTQIVSQTKT
ITGTIIDETGEPMIGVSVLVQGTTTGAVTDLDGKFTLEVPANATLVVSYIGYKTQNVKVG
SQNTFAIKMESDNEVLDEVVVIGYQTIKRKDLTGSVASVSGKTVSVMPVSNVAQAMQGKL
PGVNITSQDGRPDAAISIRVRGGGSISQSNEPLILVDGVTVNSLNDIPSDQVESIDVLKD
ASSTAIYGARGANGVILVTTKGAKEGKVSVSYNGYVKFNTPTKYLETLDPYDYLSFVWGN
AAASGDAYRLPFEKLYGIGDYLGSNTEGIESYRNTKNYNIQKDVYNSSVSHNHDLSVSGG
TEKTKVLFAMNYMDEQGMKLNSYAKRGGVSLKINQKLRDNLDINLDTRYSDMRTMGDEGT
TNGSGSLLSSSYRFRPIATRDILGDLNALREGNMEMYGRQSTWDTYSPVARIGDYDPLYI
KQRLRGTLSLNWRLFDGFAYHTDFTLNQSWEQDKIWGGAIYNNYLDDETGAKLYAGNVEY
TKRDSWGLRWTNTISYDFNFLPKQHRLNILLGHEVTDSGGSKMSISASHFPSNFTKDNAF
AMINQYDADHGTSKFSSGVDIPGRILSFFGRANYTLMDRYLFTVTFRADGSSKFSPEHRW
GYFPAAAFGWRLSEETFMEGTKDWLDNLKVRLSYGTVGNDGISSDLWSQTWTSETDLRYQ
YILNNQYSSSYDLSTEQMANKNLKWETTITRNFGFDFGFLKNRLWGSLDLYWNTTKDLLM
LTSLPGITGFTSTYDNIGQTSNKGIEFSLSGVIFENKDWNITAGMNINFNKGKVDKLAEN
VTGLYGSSWCGSSSFPGEDYILQEGKPVGMVRGFIYDGFYTTDDFNYVNGQYILKEGVAD
LGSFINPVHGVDRPSGQNAYPGLPKFRDMDNSGSIDEKDVTIIGDMNPVHTGGFNINTTY
KNFDLGLYFNWSYGNDVYNVNKIASLYGAKEKGVYENKLGFMKDSYKIYDVVDGKLVRLT
TPEQLNAANVNANLPLPYSENGVTSSIAIEDGSYLRLNTLTLGYSLPDKVLHKAGLSKLR
IYGTIYNLFTLTGYSGLDPEVSANTSQNKAKYPTVGLDWGTYPRARSFVVGLNLAF
NT seq
3411 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatgttcagaaaacaaggcgtttgtttgcaagcgcatacggttgcaaagccagc
cgttcttttcttatttggggattgtcggccgcaatgtctataagtgttataccgatgatg
gctgagatttctgttggtgagaaaaactatgatactcaaattgttagccagacaaagact
ataaccggaaccattattgatgaaacaggtgaacctatgattggggtgtcggttttagtt
caagggactactacaggggcagttacagatttggatggtaaatttacattggaagttccc
gcaaacgctacattggtagtttcctatatcggatacaagactcaaaatgtaaaagtcggt
agccaaaatacgtttgccattaagatggagagtgataatgaggtgcttgatgaagtggta
gtaattggttatcagactattaaacgtaaggacttgactggttctgttgcttctgttagt
ggtaaaaccgtgtctgttatgcctgtttctaatgtagcacaggctatgcaaggtaaactt
cctggtgtgaacattacctcacaagatggacgtcctgatgcggcaatttctattcgtgtg
cgaggaggaggttccatttcgcaaagtaatgaacctttgattttagtagatggtgtaact
gtgaattctttaaatgatattccgtctgatcaagtggaaagtattgatgtgctgaaagat
gcttcttctacagctatctatggtgcgcgtggtgccaatggtgtaattcttgtgactaca
aagggagcgaaagaaggaaaggtttcggtttcttataatggctatgttaaattcaatact
ccgactaaatacttggaaacattagatccttatgattatttgtcatttgtttggggaaat
gccgccgccagtggcgatgcatatcgtttgccatttgaaaaattatatggtattggtgat
tatttgggtagtaatacagagggtatagaaagctatcgtaacaccaagaattataacatc
caaaaagatgtgtataatagttctgtatcccataatcatgatttgtctgttagtggaggt
actgaaaaaacaaaagtcttgtttgcgatgaactatatggatgagcaaggtatgaaactt
aactcttatgcaaagcgtggaggtgtttcgttgaagattaatcagaaattacgtgataat
ttagatattaatctggatactcgttatagtgatatgcgtactatgggagatgaaggaaca
actaatggttccggctcattgctttcatcttcttatcgttttcgtccgattgctactcgt
gatattttgggggacttgaatgctttgcgtgaagggaatatggagatgtatggtcgtcag
tctacctgggatacttatagtcctgtggctcgtatcggagattatgatccactatatatt
aaacaaagacttcgtggtactttatctttaaattggagattgtttgatggctttgcttat
catactgactttactttaaaccaatcatgggaacaagataagatttgggggggggctatt
tataataattatttggatgacgaaacaggagccaaactatatgcgggaaatgtggaatat
acaaagcgtgacagttggggactgcgttggacgaatacaatcagttatgacttcaatttt
ttacctaaacagcatcgtttgaatattctgttgggacatgaagttacagactccggaggt
agtaaaatgtcaatttcagctagtcactttccctctaattttacaaaggataatgcattt
gccatgattaaccaatatgatgcagatcatggaacaagtaaattttcttctggagtagat
attcccggacgtattctctcattctttggtcgtgctaattatacattgatggatcgttat
ttgtttactgtgacattccgtgccgatggctcttctaagttttcccccgaacaccgttgg
ggatattttcctgctgcggcttttggatggcgcctttctgaagaaactttcatggaaggg
acgaaagactggttagataacttgaaagtccgtttgtcttatggtacggtaggtaatgat
ggtatcagctctgatttatggtcacaaacgtggacttctgaaacagatttacgatatcaa
tatatactaaataaccagtattcatcttcttatgacctttcaacggaacaaatggcaaat
aaaaatctaaaatgggaaacaactattacacgtaattttggtttcgatttcggattttta
aagaaccgtttgtggggatctttggatttatattggaatacaacaaaggatttgctgatg
ttgacttcgcttccggggattaccggattcacatctacgtatgataacattggtcagact
agtaataagggaattgagttttctttgtcaggtgtgatttttgaaaataaagattggaat
attacggctggtatgaatataaatttcaataagggtaaggtcgataagttggcagaaaat
gtaacaggtttatatggctctagttggtgtggcagtagcagtttcccgggtgaggattat
attttacaggaaggcaaacctgtgggtatggtcagaggttttatatatgatggcttttat
actacagatgactttaattatgtaaacggacaatatatattgaaagagggcgtggcagat
ttaggttcttttattaatcctgtacatggggtggaccgtccgtccggacaaaatgcctat
ccgggtcttccgaaatttagggatatggataatagtggcagcattgatgagaaagatgtt
accattattggtgatatgaatcctgttcatacaggtggtttcaatatcaatacaacttat
aaaaattttgatttaggattgtattttaattggagttatggtaatgatgtgtataatgtg
aataaaatcgcttccttgtacggcgcaaaagaaaagggagtatatgagaataaacttggt
tttatgaaagactcctataagatttatgacgtggtagatgggaaattagttcgtctcact
actcctgagcaattaaatgcagctaatgtaaatgctaatttaccattaccttatagtgaa
aatggggttacttccagtattgctattgaagatggttcttatttgcgtctgaacacgttg
acattggggtattcattgcccgataaggttttgcataaggctggtttgagtaaattgcgt
atttatggaacaatctataatttgtttaccttaaccggttactcaggtctggatcctgaa
gttagtgctaatacctctcagaataaggcgaaataccctacagtaggattggactggggt
acttatcctagagcacgttcgtttgtggttggtttaaatcttgctttctaa
DBGET
integrated database retrieval system