Bdellovibrio sp. qaytius: CIK05_05965
Help
Entry
CIK05_05965 CDS
T05880
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bdq
Bdellovibrio sp. qaytius
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
ketoacyl-synt
Aminotran_3
Ketoacyl-synt_C
PP-binding
Acyl_transf_1
KAsynt_C_assoc
Thiolase_N
AMP-binding_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZZ36354
LinkDB
All DBs
Position
complement(1240025..1246189)
Genome browser
AA seq
2054 aa
AA seq
DB search
MSQLLHLLKETFNRRSLAPAMSFGQETWTYSDLDTRSEIIAQNLTQKHGIQANDIVAIRC
AKSLEQMALLFALVKIGATYLPVDLDLPVQRAEYILSHSKAKVIIDAAALTELLQPNTNS
ITLAHPPEHGFYLLYTSGSTGTPKGVLMGSAALHHLLDWQIQETSLKEKSITLQFAPLGF
DVHFQEIFGTLASGGLLVMVSEDDRKDMSKLITAINDNSINRLYLPFVAFNLLSEVTVRT
NKTLNSVREITVAGEQLKITQYIRNFITQQDSVTLFNHYGPTETHVVTSLKLDHKMTPAI
HWPELPSIGYATGTNKIFIVDSDMNEVSPGVTGELLISGLALADGYHFNDDENTKRFLTH
PKFGRVYRTNDLAKVLANGEIEFLGRNDRQMKIRGHRVELSEIEAQILKVSHALTCAVIP
YKVNDLNYLKAIISGTSLKGSEIKEALKTAIPEFMIPDVIEVQEQMPLTSSGKIDYQKLT
AEINSNTSKSKLEQQIEQKIIAIWKKHLPVTEFDTATSFFDLGGHSLSLSQMLLDVNEIL
KLNLDLVEVFENNTIEKLASLCNKAHGATSATKTHLKAKTETAPNDKIAIIATHGHFPES
ADVQIFWKNLLALKNLVRTFDPSQVHPLTTVDENHVFVSGEYPDGDTFDYEHFGMSLLES
QLMDPQQRKFLELCFEALYLAGYPAAKNLPTHKNTGVFASMSSSRYADLVREYPDKVNTL
GAFATSLGIEKDYLATRVAHKLNLGGPALNINTACSSSLVAVIQAVESLRAGKCDMALAG
GIAIAALENEGHSHNEGSIYSENNECRVFDSNATGTIFTHGSGVVVLKRLNDAIRDHDNI
LGLISGVGLSNDGSDKMSFMGPSIEGQAQAITKAHSDAKISPEQLLFVEAHGTGTPIGDP
AEVTGLTRAFEKQTTAKEYCYISSVKANTGHLNAASGVVGLIKATQVLRTNILPGQIHVD
AVNPLLKLQQTPFKISTKNTLLNPTQENRYAGVSSFGVGGTNAHVILESYTAETNDDRHV
TLVFPGFGSQYSQMGQQLLAEHSDVLSLELAELNAALNRQGYTTAKELLDSTDTALATQQ
LQIFIYQYLLAKLVISRFNFKNISLLGCSLGEISAACVAGLISIDDTINFVADRTGILKN
APEGAMLLINANKNDYVSILSSFDVEIAIVYSENMFVATGLKESILKFKTALENQGTHSL
LIESVYPYHSTKLKGSDAELAAMTEGLTLKTSAYNFIKTGDSEFELTDLAYWQTHHLHKV
DFDKAVRSLIASQEQSLIIEIGPQIYLTQQIKKTAAQMNVSHKVSLINISTHVSANEVSQ
LIDGLNEIAQHFESARLNRKTSQLTKKVLKKTKVILPQIQRKNKPIMQNSSTNSLDSLIQ
QLVTMFSDDLGYTTDSSITDMNRTHFFELGLDSLMLTQMSSLVKAKFKTSVSFRELKEKY
STLETLAQHINEKNPQAAPVVSTATSIVTAQTQTTPVVSTNALENIIQMQLQLMQDQMNL
LKGATAVTTKTQTQNVIQPTASTPTATVGVITKDTFGAQAKINLHSTYTQDPIVRQNIKN
FEKKYNQKTQASKDFAERSRKVHADPRAVSGFRPETKEITYPIVVKKSEGQYLWDLNDNT
YIDMLCGFGSNFFGNKNTQIMNAMQEQLKAGIEVGPQHSLALDAAQLVVDLTGNERAAFC
NTGSEAVLGAIRIARTVTAKKKIVSFAGSYHGINDDVIVRTGANGQTIPAASGIAPESVS
NTIVLEYGVQTSLDYIRANVDDIAGVLVEPVQSRRCNFQPAQFLTDLRALTTELDICLIF
DEIITGFRIQADGAQGFFNIKADLCTYGKIIGGGLPIGIVAGKAKYMNALDGGPWTFGDD
SSPQDGVTYFAGTFVRHPLALAACKASLEIIKANPKSLFLDLNKKSEKFVNELNQLFVNE
NFPLTFDRFGSLMKPRWTQTPLASEVFFALLRYNGVHSYDGFPWFVNLAHTEAQLQEVIT
VFKKAINEMKTLGLFTTGTYAMSRIDFIEAKAERTIIGKDQNGFPATFIEDKNNPGAYIQ
LNSLAVTPTGDKND
NT seq
6165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcccaattgctccacctcttaaaagagacttttaaccgtcgctctttagcacctgcc
atgtcatttggtcaggaaacttggacatattctgaccttgatacacgctctgaaatcatt
gcccaaaatttaactcaaaaacacggcattcaagctaacgatatcgtggccattcgctgc
gcaaaaagccttgagcaaatggcgttactatttgctttggttaaaattggcgcaacgtac
ttgcctgttgatttagatttacccgttcaacgtgctgaatatattttatctcactcaaaa
gctaaagtgatcatcgatgccgctgcattaactgaacttttacaaccaaatacaaattca
atcacgcttgctcacccgcctgagcatggtttttatcttctttacacaagcggatcaacc
ggcacaccgaagggtgtactaatgggaagcgctgctcttcaccatttgttagattggcaa
attcaagaaacttcacttaaagaaaaaagtattacgttacaatttgcacctttaggtttt
gatgtgcactttcaagaaatttttggaactttagcaagcggtggacttcttgttatggtt
tctgaagacgacagaaaagacatgtcaaaattaatcacggcgattaacgataactcgatc
aatcgtttgtatttaccgtttgtggccttcaatcttttatctgaagtgacagtgcgaaca
aataaaactttaaactcagtgcgcgaaatcactgtcgctggtgaacaattaaaaatcaca
cagtacatccgcaactttatcacacagcaagattcagtgacgttgtttaatcactacggc
ccgactgaaactcatgttgtgacaagcttaaaattagatcacaaaatgactccagcgatt
cattggccagaacttccctctatcgggtacgcaacaggcacaaataaaatttttatcgta
gatagcgatatgaacgaagtatcacctggtgttacgggtgaacttttaatttcaggcctt
gccttagctgatggttatcatttcaatgatgatgagaatacaaaacgctttttaacgcat
ccaaaatttggtcgcgtataccgcacgaatgatttagcgaaagttttagcaaatggcgaa
attgaattcttaggccgcaacgatcgccaaatgaagattcgcggtcaccgtgtagagctc
agcgaaatcgaagcgcaaattctaaaagtatctcacgctctaacgtgtgcggtgattcct
tataaagtaaatgacttaaactatttaaaagctatcatctctggcacaagtcttaaaggt
tctgaaatcaaagaggctttaaaaacggctattccagaatttatgattcctgatgttatt
gaagttcaagagcaaatgccgttaacttcatctggtaaaattgattatcaaaaattaacg
gcagaaattaattcgaacacttcaaagtcaaagttagaacaacaaattgaacaaaaaatt
attgctatatggaaaaagcatttacctgtaactgaatttgatacagcgactagctttttc
gatttaggcggacactcgttatcactttcacaaatgttgcttgatgtgaacgagatttta
aaattaaatttagacttagttgaagtctttgaaaataacactatcgaaaaattagcttct
ctttgcaataaagcccacggagcaacatctgcgactaaaactcatttaaaagctaaaact
gaaactgctccgaatgataaaattgcgatcattgcaactcatggtcattttcctgaatcg
gctgatgtgcaaattttctggaaaaacttattagcgctgaaaaatctagtgcgcactttt
gatccgtcgcaagttcatcctttaactacggttgatgaaaatcacgtgtttgtatctggc
gaatatccagatggtgatacgtttgattatgaacacttcggtatgagcctgcttgaatct
cagttaatggatccacagcaacgtaaattcttagaactatgttttgaagctttatattta
gcgggttacccggctgctaaaaacttaccaacacataaaaacactggcgtgtttgccagc
atgagttcttctcgttatgcagaccttgttcgcgaatacccagacaaggtgaatacgctt
ggagctttcgccactagtcttggaattgaaaaagattatttagccacacgtgtggcccac
aaacttaatttaggtggaccagctttaaatattaacacagcttgttcttcatctttagtg
gcggttattcaagccgttgaaagtttacgcgctggaaaatgtgatatggccttagctggt
ggtattgctattgcggctcttgaaaatgaaggccatagccataatgaaggcagcatctat
tcagaaaataacgaatgtcgtgtgtttgactctaatgccactggcacaatctttactcat
ggttctggcgttgtagttttaaaaagattaaacgatgcaattcgtgatcatgataatatc
ttaggtttaatttctggtgttggtttaagtaatgatggctcagataaaatgagctttatg
ggcccgtctatcgaaggccaagcacaagctattactaaagcgcatagcgatgcaaaaatt
tctccagaacaattattatttgttgaagctcacggcacaggtacaccgattggtgatcca
gctgaagtgactggcttaactcgtgcttttgaaaaacaaactacagctaaagaatattgc
tatatcagttcagtgaaagctaatacgggtcatttaaatgcagcttcgggtgttgtaggt
ttaattaaagccacgcaagtcttaagaacaaatatcttaccgggtcaaattcatgtagac
gctgtcaacccgcttttaaaattacaacaaactccgtttaagatttctactaaaaatact
ttattaaacccaacacaagaaaatcgctatgcaggagtttcttcttttggcgtcggtgga
acaaatgctcatgttattttagaaagttatactgcggaaacaaatgatgatcgtcacgtg
actttagtgtttccagggtttggcagtcagtattcacaaatgggtcagcagttattagct
gagcactctgatgtgttaagcttagagttagctgagttaaatgccgctttaaacagacag
ggctatacaacagccaaagaattattagatagcacagatacagctttagctacgcagcaa
ttacaaatttttatttatcagtacttattagctaaactggttatttcaagattcaacttt
aaaaatatttcgcttttaggctgcagcttaggcgaaatctctgcagcctgtgtggctgga
ttaatttcaattgatgatacgatcaactttgtggctgatcgcacaggaattttaaaaaat
gctcctgaaggcgcaatgcttttaatcaacgcaaataagaatgattatgtttcaatttta
tcttcattcgatgttgagatcgcgatcgtttattctgaaaacatgttcgtggccacgggc
cttaaagaaagcatcttaaaattcaaaacagctttagaaaaccaaggcacacatagctta
ttaattgaaagtgtttacccttaccattcaacgaaacttaaaggctctgatgctgaatta
gctgcgatgactgaaggcttaactttaaaaacttcagcttataactttattaaaactggc
gattcagaatttgaattaactgatttagcttattggcagactcaccacctgcataaagtt
gatttcgacaaagccgttagatctttaattgcatcgcaagagcaatcattaattattgaa
attggcccacagatttatctgactcaacaaattaaaaaaacagctgctcaaatgaacgta
agtcataaggtcagcttaattaatatctcaacacatgtatcagctaacgaagttagtcag
cttatcgatggtttaaacgaaatcgcgcagcactttgaaagcgctcgtttaaatcgtaaa
acttctcaattaacaaaaaaagttcttaagaaaacaaaagttattctgccccaaatccaa
agaaagaataagcccattatgcaaaattctagcaccaactctttagattcgttgattcaa
caacttgtaacaatgttcagcgatgatttaggctatacaactgattcatcaatcactgat
atgaatcgcacacatttctttgaattaggcttagattcattaatgcttacgcaaatgtct
tcattagttaaagccaaatttaaaactagcgttagctttcgtgagttaaaagaaaaatac
agtacacttgaaacattagctcaacatattaacgagaaaaatccacaagcagcacctgtt
gtttctacagcaacttcaattgttacggctcaaactcagactacacccgtagtaagcact
aatgcgttagaaaatatcattcaaatgcaattgcagttaatgcaagatcaaatgaactta
ttaaaaggcgcaacagctgtaactacaaaaacacaaacgcaaaatgttattcaacctaca
gcatcgactcctacagcaactgtcggtgtaataactaaagatacttttggcgctcaagct
aaaatcaatttacattcaacatacacacaagaccctatcgttagacaaaatattaaaaac
tttgaaaaaaaatataaccaaaaaactcaagcttctaaagacttcgcagagcgcagtcgt
aaagttcacgctgacccaagagctgttagcggatttagacctgaaacaaaagaaataact
tacccgatcgtggtgaaaaaatctgaaggtcaatacctttgggatttaaacgacaacact
tacatcgatatgctttgcggttttggttcgaattttttcggtaacaaaaacacacaaatc
atgaatgcgatgcaagaacaattaaaagctggtatcgaagttggcccacaacattcatta
gctttagatgcggcacaattagtagttgatttaacaggtaacgagcgcgctgcattttgc
aacacgggatctgaagccgtgttaggtgctattcgtattgctcgcacagtcactgcaaaa
aagaaaatcgtatcatttgcaggttcttatcacggcatcaatgatgatgtgatcgtacga
actggtgcgaacgggcaaacaattccagccgcttctggaattgcaccagagtcagttagt
aataccatcgttttagaatacggtgttcagacttcattagattatattcgtgcaaatgta
gatgacattgcaggcgtattagttgaacccgttcaaagccgtcgttgtaattttcaaccg
gcgcagtttttaactgatctacgcgccttaacgactgaattagatatctgtcttatcttt
gacgaaattatcacgggctttcgtattcaagctgatggcgctcaaggattttttaatatc
aaagctgatctttgcacatacggtaaaattatcggtggtggtcttccgattggtatcgtt
gccggaaaagctaaatacatgaatgctctagacggaggtccatggacttttggcgatgac
tcgtcaccacaagatggcgttacttattttgcgggaacatttgttcgtcatcctttggca
ttagctgcttgtaaagcctcattagaaatcattaaggccaatcctaaaagtttattttta
gatcttaataaaaagagcgaaaaatttgttaacgaattaaatcaattatttgtgaacgaa
aattttccgttaacgtttgatcgctttggctcattgatgaaacctagatggacacaaacg
ccgttagcctctgaagttttctttgctctactccgatataatggagtgcattcttacgac
ggatttccgtggtttgtaaacttagcgcacactgaagctcagttacaagaagtgatcact
gtatttaaaaaggccattaacgaaatgaagacattaggtttatttacaactggaacatac
gcaatgtctcgcattgattttatcgaagcaaaagctgagcgcactattatcggtaaagat
caaaatggttttccggcaacatttatcgaagataaaaataatccaggtgcttacattcaa
ttaaactctttggcggtcacgccaaccggagacaagaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system