KEGG   Bdellovibrio bacteriopascens: QJS83_05965
Entry
QJS83_05965       CDS       T11753                                 
Name
(GenBank) tail fiber domain-containing protein
Organism
bdv  Bdellovibrio bacteriopascens
SSDB
Motif
Pfam: Peptidase_S74
Other DBs
NCBI-ProteinID: WII73414
LinkDB
Position
1229073..1233950
AA seq 1625 aa
MCARFLTFFLLYFFIASVQAAGPVASSGSLTYQGRILKSDGTSFENSNVSFVFQILDPSG
QCVVYQEQVNGINMSQSRGVFDVPIGMGSIQYITGTGASSVVDVFNNDASIGYYCGACSS
SGNSYNCSATTTPYNPIAADGRLLRVAFYDGTGWQTITPDNVIRSVPYAGFSLSAQKLGK
NSVADFVLKNDVNNSGAGSVSCDGGKFLTWDAATKKFGCAAVGGANGGTVTSITAGVGLN
GGTITSSGTIDLATTSVTSGTYGSATQVPVIQVDSYGRITSAVSTTIAGVSPGGAAGGDL
SGNYPNPTVGALSGKPLTITSASSGQFLKYDGANWVNAAIQQSDVANLATTLGGYVSYSS
IPTCNSANTTLTFVSATDTFSCTAIAIAGSKVSGDIAGNASGFTGALAGDVTGTQGATVV
GAIQGKAVATTVPTTNQVLQFDGSQWTPATISTAPSGAAGGDLTGTYPNPTLSPIVVAGT
GTKITYDTKGRVTASASLVAGDIPSLDWSKIATGKPTTLTGYGIGDAIKNGGGIGAITSG
TDASKSSLTPASGDLFVATDTQKIYRYNGSAWDLMSSASGSGGTITGVTAGAGLSGGGTS
GNVTLNVNVGTNANEIVQLDTSSRLPAVDASLLTNLQAAQIPNLDVSKITTGVLPVIRGG
TGQSTYTDGQLLIGNTATNGLSKATLSAGAGVSITNGNGSITISATGSGGTVTSVSGSSP
INVATGTSTPMISLANGSAVGQVYRWDGASAWVATKLFYTDLINVASGSPWPASSCTAGQ
AVTWSSATDSFSCTTLSIAATQLTGTLVAAQMPALSGDVTSAAGSTTLTLATSGVTAGTY
KSVTVDAKGRVTAGTNPTTLSGYGITDAVKNAGSGAGNVVTSIQSGNTAGRPAAGTDGRL
YLDTQAGIIYRDNGASWTTVASSAGTGISALTGDVTASGTGSVAATVGKVNGVTYPSGPS
TNTVPVVTGANTVTYQTVPLAAGGTGATTAAGARTNLGLGSAATVNTGSAAGNIPVLGVG
GLVANKICTSDGTASGIICSTTMPVSSQWIASGSDIYYSAGKVGVGVTAPSAPLHVNGNA
TDGNFDPSKGLLISGGSWPNLNSSLTLAYGGKYSTGSSLGAQFALIGVNTKYDSAADTLK
RQGVDSSRESSMAITMNPYSNQTGGYRMGFWLGAGGDPSERMVITGSGNVGIGTTSPAFK
LEISGASPADQKIGIDGRQTVYLPSQGAFAGSLFLGDGGENLLNTDGSEGLANTGLGVSA
LYSITKGSYNLAGGYQALYSNTTGSYNVALGPLALLSNSTGGINTATGGYSLMLNTTGNL
NVANGFSSLNNNTTGSGNAGIGTYSLYRNTEGVNNVAVGTQTLYNNTIGNGNTAIGNGSL
VNVTSGSSNIGLGRGSGSAISTGNANVIIGSDDGTSIATLSNYVLIADGVGNRRITIDNT
GKVGVGITSPGQALDVSGNIKTSGCLYYASSSLGTCASDVRIKKDVHAFDLGLESLLGIR
PVSFKYNGLAGYPDNGQSQLGVIAQDVEKVAPTLVKKQMVQLRAGDKKKTEIKVVDYGAF
TYVIINAVKDMYQRFTERFDSQDRSIASIKSENEEIKIQNMQLKNENSAIRDYLCKKDPA
APFCK
NT seq 4878 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtgcgcacgttttctgacattctttctcctatatttttttattgcgtcagtacaggct
gcagggccggtcgcatcttcggggtctctgacttaccaaggtcgtattttaaagtctgac
ggaacgtcctttgaaaactccaacgtctcttttgtatttcagattttggatccttccggt
cagtgtgttgtttaccaagagcaagttaacggtattaatatgagtcagtcccgtggtgtc
tttgacgttcctattgggatgggctccattcaatacatcacggggacgggcgcctcttca
gtcgtagatgttttcaataatgatgcaagtattggttactattgcggggcttgttcgagt
tcaggaaattcttataactgttcggcaacgaccactccatataatcctatcgccgctgat
ggacgactcttgcgggttgctttttatgatggaacgggttggcagacgatcacgcccgat
aatgtgattcgctccgtcccctatgccggattttctttatcggcacaaaaattgggaaaa
aattccgtcgcggacttcgtattaaagaatgatgtgaataactcgggagcgggaagtgtt
tcttgtgacggcgggaagtttttaacttgggatgcggcaacgaaaaagtttggatgcgcg
gccgttggcggagccaatggtggcactgtgacaagcatcactgccggagtggggcttaac
ggtggcaccattactagcagtggaactattgatttggcaacgacgagtgtgacaagtgga
acatatggatccgcaacgcaagtgcccgtgatccaagtggactcttatggccgtattaca
tcggctgtaagtacgaccatcgctggggtttctccaggcggagccgccggaggcgacctt
tcaggaaattaccctaatcccacagtcggagcgctgagcggaaaacctctgacgatcacg
tcggcctcgagtgggcaatttctgaaatatgatggagcgaattgggtcaatgccgctatt
caacaatccgatgttgcaaatcttgcgacgacgttgggtggttacgtttcttattcaagc
attccaacctgcaactctgcaaacacgactctgacctttgtatcggcgacggacactttt
tcttgcacggccattgcaatcgcaggttcgaaagtttctggcgatatcgcaggcaatgcc
agtggatttacgggtgctcttgctggtgatgtgacggggacacagggggccactgtggtt
ggcgcaattcagggaaaagccgttgcgacgacagtgccgacgacaaatcaagttttacaa
tttgatggttcgcaatggactcctgcgacgatctcgacggcgccaagcggagctgctggt
ggagatttaactggaacctatccaaatcctactttgagtccgattgttgtcgcaggaaca
ggaacaaaaattacttacgataccaaaggtcgtgtgactgcttcagcctcattagtggcg
ggtgatattccgtctcttgactggagtaaaatcgcaacgggtaaacccacaacacttacg
ggttatggaattggtgacgctattaagaacggcggtggtatcggagctattacttcggga
actgatgcaagcaagtcttcgctgacgcctgcttcgggagatctttttgtcgcaacagat
acgcaaaaaatttatcgctataatggttctgcttgggatttaatgagttccgcgtccggg
tctggtggaacgattacgggtgttacggcgggtgcaggactttccggaggcggaacttcc
ggcaatgtgactttgaatgtaaacgtgggaacgaatgcaaatgagatcgttcaactagat
acctcttcaaggcttccggctgtggatgcgagtctcttaacgaatttgcaggcggcacaa
attccgaacttagacgtttcaaaaatcactaccggagttttgccagtcattcgcggcggt
acggggcaatctacttatactgacggtcagttgttaattggtaatacagcgacgaacggt
ctctcgaaggcgaccttaagcgcgggcgctggagtgtccattacgaacggaaatggttct
atcacaattagcgcgacaggttccggcgggactgtcacttcggtttcaggctcatctccg
atcaatgtggcgacgggaacatcaacgccgatgatttctttggcgaatggttcagcagta
ggacaggtgtatcgttgggatggagcaagcgcatgggtcgcaacgaaacttttttataca
gaccttatcaatgttgcgagtggaagtccttggcctgcgtcttcttgtacagcgggacaa
gcagtgacgtggagttctgcgacggatagtttttcttgcacaacattatctattgcagca
actcaactcacgggaacattggttgccgcacagatgcctgcattgagcggagatgtgaca
tctgctgcgggctcaacgactttaactcttgcaacatccggcgtgacagcaggaacttat
aagtctgtgacagtcgatgcgaagggcagagttactgctggaacaaatcctacgactctt
tccggttacggcatcacggatgctgttaaaaatgcgggaagtggggctggcaatgtggtc
acaagtatacaatcgggaaatacggcgggaagacccgcagcaggtaccgatggaagactc
tatttagatacacaagctggaataatctaccgcgataacggagcaagttggacgacagtc
gcttcaagcgcaggaacaggtatttcagcattgactggcgacgtaacggcatcaggaaca
ggttccgttgctgcaacagttggtaaagtgaatggtgtaacgtatccttcaggaccctcc
acaaatacagttcctgttgtcactggtgcaaacacagtgacctatcaaacagtgccattg
gcagcaggtggtacaggcgcgacgacagctgcaggcgcaagaacgaatttaggacttggt
tcagcagcaactgtgaatacgggatcagcggcggggaatattcctgtcttgggagttggc
ggattagtcgcaaataaaatttgtacttccgacggaacggcgagcggaatcatttgtagc
acgacgatgccggtgagttcgcaatggatcgcctctggatctgatatttactatagtgcc
ggaaaagtgggcgtgggtgttacagctcccagtgcacctcttcacgtgaatggaaatgcg
accgatggtaattttgatcctagcaagggtctattaatcagcggcggttcttggcctaat
ttaaacagctctctcactcttgcatacgggggaaaatattctacgggttcttctttaggg
gctcagtttgctttaatcggcgttaatactaagtacgacagcgcggccgacactttgaag
cgtcagggagtggattcttcgcgtgaaagctctatggctatcacgatgaatccatattcg
aatcaaacgggcggatacagaatgggattttggcttggtgctggcggcgatccttccgaa
cgcatggttatcaccggttccggaaacgtgggaattggaacgacgtctccggcgttcaaa
ctcgaaatctccggcgcttcgcctgctgatcagaaaatcggaattgatggacgacaaacc
gtatacttgccgtctcaaggagcatttgctggctctctttttctaggagatggaggcgaa
aatcttcttaacactgacggtagtgaaggattagcgaatacggggcttggcgttagtgca
ctgtattcaattacgaaaggtagttacaatctggccggtggttaccaagcactttactcg
aatacaaccggttcttataacgtagctttaggtcctttggctctattatctaattcgacg
ggcggtatcaatacggccaccgggggctattcgcttatgctcaatacaaccggtaatctc
aatgttgcgaatgggttttcttcactcaacaataatacgaccggtagcggaaatgccggg
atcggaacttactcgctttatcgtaatacagaaggtgtaaacaatgtcgcggtgggaacg
cagacgctttacaacaatacgataggcaatggaaacacggccattggaaatggcagtctg
gtaaacgtaacatcgggttcaagtaacataggcttggggcgtggctctggttcggcaatt
tcaacgggaaacgccaacgtcatcataggatctgatgatggaacttccattgcgacgctt
tcaaattatgttttgatagcagacggtgttggcaaccgcagaatcactattgataacacc
ggtaaggtcggtgtagggatcacaagtcccggacaggcacttgacgtgtcaggaaatatt
aaaaccagtggttgcttgtattacgcaagttcctcgttgggaacctgtgcttcagacgta
agaatcaaaaaagacgttcacgcgttcgatttaggtttggaaagtttattagggattcgt
ccagtgtcgtttaaatataatggcctggctggttatccggataatggtcagagtcagtta
ggtgtgattgcccaagatgttgaaaaagtggcgccgaccttagtgaaaaaacaaatggtg
cagttgcgtgctggtgacaagaagaaaacagaaattaaagtggtggactatggagctttc
acctacgtcattatcaatgcggtgaaagacatgtaccaacgtttcacagagcgatttgac
tctcaggaccggtccatcgcttcgataaaatcagaaaacgaagaaattaaaattcaaaac
atgcagttgaaaaacgagaattcagcgattagggactacctttgcaagaaggaccctgcg
gctccgttctgcaaatga

DBGET integrated database retrieval system