Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica: GN160_00835
Help
Entry
GN160_00835 CDS
T07558
Symbol
bamA
Name
(GenBank) outer membrane protein assembly factor BamA
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
bec
Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
bec03029
]
GN160_00835 (bamA)
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bec02000
]
GN160_00835 (bamA)
Mitochondrial biogenesis [BR:
bec03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
GN160_00835 (bamA)
Transporters [BR:
bec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GN160_00835 (bamA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
ShlB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOI11157
LinkDB
All DBs
Position
complement(187706..190180)
Genome browser
AA seq
824 aa
AA seq
DB search
MILQCNLSKKHRIIIISIIIKFLFFTILVFGSKFVCAEQFVIQSINFEGLQRVSMVLVLS
NMPFSTGDKINDSDFGKIIKSLFVTGYFEDIQILRDGDSVIVRVREYPIINDISFQGNKI
IKEEVLKEILELQDIRIGHMLNSYSLEKVKKDFNEFYYSIGRFQFFVEIAITSLTRNRVD
LKIILTEGKLAQVKQINIIGNNEFNADQLFSDFQFYNHFQWWHLIKDNGYQNQRLFHCLQ
SLRNFYLSRGYVRFNIDSIQIHLTSDKQNVYITIYINEGVQYTFSKIAVSGQMSNLLTKI
QQLSEIIQNELYSNLKIEKIKNDIESLSGNNGYVYPNVLINENIDDFNQTVELSIVVNIG
NRFYVRQICFDGNYLTEDEVLRREIGQMEGSHFVLYLVEQGKQRLERLGFFDFVTFDFKR
VPNVFDQVDVIYKVKERNTGSMNISVGIGSESGANFQFNIQEENLLGKGYVFGLSGIKNH
YQTYMEVLMFNPYLTLDSISFSRKFFYNSFNANNAELADYDLKSYGLSFNIGLPIKEYHS
LNMGMDYMYNNLGNIKPQVVILRYLKAQNIIPTIIFNHQMNNSLNFSAKDFFLMIGWNYK
KLDSNYFPTSGSCFRFLNKIAIPGSDNEYLRMAFDLDQYIPLDINRSWIFMHQVRFGYSM
GMCNKEMPFYDNFYAGGINSVRGFKSNTIGPKAAYYKFVCNNGNYDICLVENSNDAIGGN
AMAVVRNELIVPLPWIHEKYFDTIRTSLFVDMGSVWDTYWKDTIKTYIAGIPNYKNPKNI
RVSGGVSLQWISPFGPIILSYAQLIKKYAGDQLEQFQFNVGKTW
NT seq
2475 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattctgcaatgtaatttaagtaaaaaacatagaattattattatatcgataataatt
aagtttttatttttcacaatccttgtttttggttcaaaatttgtatgtgctgaacagttt
gtaattcaaagtatcaattttgaaggattacaaagagtaagtatggttttagtattgtct
aatatgccttttagtacaggtgataaaataaatgacagtgattttggtaaaattattaag
tctttatttgttacaggttattttgaagatattcagatattgcgtgatggcgattcagta
atagtacgagtaagagaataccctataattaatgatattagttttcaaggaaataagata
ataaaagaagaagtattaaaggagattttagaattacaagatatacgaataggtcatatg
ttgaattcttattctttagagaaagtaaaaaaggattttaatgaattttattatagtatt
ggtagatttcaatttttcgtggagatagcgattacttcgttaactaggaatcgtgttgat
ttaaaaattatattgactgaaggtaaattagctcaagtaaaacaaataaatattataggt
aataatgaatttaatgctgatcaattattttccgattttcagttttataatcattttcaa
tggtggcacttaattaaagataatggatatcaaaatcaaagattatttcattgcttacaa
tctttgcgtaatttttatttgagtagaggttatgttaggtttaatattgactctattcag
atacatttaacatcagataagcaaaatgtttatattacgatatatattaatgagggagtt
caatatacattttcaaaaattgcagtcagtggccaaatgtcaaatttacttacaaaaatt
caacaattatctgaaattattcaaaatgaactatatagtaacttaaagattgaaaaaata
aaaaatgatattgaatctttatcaggaaataatggttatgtatatcctaatgtgttaatt
aatgaaaatattgatgattttaatcaaacagtagaattaagtattgtagtaaacattggt
aatagattttatgttcgtcaaatatgttttgatggaaattatcttacagaagatgaagtg
ttacgtagagaaataggacaaatggaggggtcgcattttgttctttatcttgtggaacaa
ggtaagcaacgattagagcgtctcggtttttttgattttgttacgtttgattttaaacgt
gttccaaatgtgtttgatcaagtagatgtgatatataaagtaaaagagcgtaatactggt
agtatgaatattagtgtaggtattggtagtgaaagtggtgccaattttcaatttaatata
caagaggaaaatttactaggtaaaggttatgtttttggtttaagcggtattaaaaatcat
tatcaaacttatatggaagtattaatgtttaatccttatcttactttagactctattagt
tttagtaggaaatttttttataattcttttaacgctaataatgcagaattagcagattat
gatttaaaaagttatggtttaagttttaatattggtttacctataaaagaatatcattca
ttgaatatgggcatggattatatgtacaataatttgggtaatataaaacctcaagtagta
atattgaggtatttaaaagcacaaaatattattccgacaattatttttaatcatcaaatg
aataatagtttaaactttagtgctaaagatttctttttaatgataggatggaattataag
aagttggatagcaattattttccaacgagtggttcgtgttttcgttttttaaataagata
gcaatacctggttctgacaatgaatatttaagaatggcgtttgatcttgatcagtatata
ccattagatattaatagaagttggatttttatgcatcaagtacgatttggatattctatg
ggaatgtgtaataaagagatgcctttttatgataatttttatgctggaggaattaacagt
gtaaggggtttcaaatctaatacgattggtccaaaggctgcgtattataaatttgtttgt
aataacggtaattatgatatatgtttagtagagaattctaatgatgctataggtggtaat
gctatggctgttgttagaaatgaattaatagtgcctttaccttggatacatgaaaaatat
tttgatactatacgtacttctttatttgtagatatgggtagtgtttgggatacgtattgg
aaggatacaataaagacttacattgctggtattccaaattataaaaatccgaagaatatt
agggtgtctggcggtgtttctttgcagtggatttctccatttggaccaattatcttatct
tatgctcaattgattaaaaaatatgcaggtgatcagttagaacaatttcaattcaatgtt
ggaaaaacatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
