Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica: GN160_02290
Help
Entry
GN160_02290 CDS
T07558
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bec
Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica
Pathway
bec03030
DNA replication
bec03410
Base excision repair
bec03420
Nucleotide excision repair
bec03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bec00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
GN160_02290 (polA)
03410 Base excision repair
GN160_02290 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
GN160_02290 (polA)
03440 Homologous recombination
GN160_02290 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bec03032
]
GN160_02290 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bec03400
]
GN160_02290 (polA)
Enzymes [BR:
bec01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
GN160_02290 (polA)
DNA replication proteins [BR:
bec03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
GN160_02290 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bec03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
GN160_02290 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
GN160_02290 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
DNA_polI_exo1
HHH_2
Ribosomal_S12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOI10854
LinkDB
All DBs
Position
503615..506425
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search
MIDHPLIIVDGSFYLHRAYHAFPILVNSAKEPVWVIYGVLSMLKKILINYKPEYMVVVFD
SGGQTFRNFLFDKYKINRAKMPNDLYVQIKPLCKLIRAMGIPLIMESNIEADDIIGTLSL
FATRLKRKVLIFSNDKDMAQLVSTMVTVVNTTSNIMLDPKEVELKFGVPPCSIVDYLSLV
GDSSDNIPGVPNIGEKTARILLHNFGNLDGIYSHLSEISILKFRGSKSVEINLRNHRAMA
FLSYKLASIKTDLVLDINSCNQLLLHEPNVVMLMSLFKRYDFKNWLQDIENNKWLVGCKN
AILGFRDVLNISPLPKSSNRQQLQKTFDIDYQIIYNMQLFSQCVTQIRSVKLFAFDIVID
SLDVSAANLVGIFLSVVSGKVLYLPMSKFFIVNDDINNDFIRLDYIQVLVELKSIFEDSD
IDKVGYDLKIDYSVFKRYNIYLLNRVFDIRIEFYLLYGIFQINNLAKFADDDIVQRMLVF
QKNNREKKFNKFLLSGTFNQDLFYSIVKHFSLILDLHKKLWPKIIQDLNLKKIFEEIEMP
LISVLSHIECIGVLVDKTILNSYSLELKDRISKLEICAHKLANESFNLSSVKELRRILYL
KQKIPVLKKTPLGFPSTNEEVLKKLSSKYPISKIILKYRNLVKLKSVYADRLPTMINQKS
KRIHTSYHQTMTSTGRLSSTNPNLQNIPIRNNDGRRVRQAFVVPPDYLMLSVDYSQIELR
VMAHLSNDKELLSVFLSDQDVHCITASELFVTSLDRVTDDQRYRAKIINFGLIYGMTAFG
LANQLSVTRMEAQHYIDVYFARYPGIKKYMKFICKQINTYGYVTTIEGRKLYISDFNLNV
KKYKKNIERAAINAPVQGSAADIVKRAMLVIDSYLCKESIPAHMIIQVHDELIFEIHRDV
VLDFIPRVKELMENCFLLSVPLKVKVSVGKNWSQVY
NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgatcatccgttaattattgtagatggttctttttatctccatcgagcttatcat
gcttttcctattttggtgaatagtgctaaagagccagtttgggtgatatatggcgtcttg
agtatgttaaaaaaaattttgattaattataagccagaatatatggttgtagtatttgat
tctggtggtcagacttttcgtaattttttatttgataaatataaaattaatagagcaaaa
atgccaaatgatttatatgttcaaataaaaccattatgtaagttgattagagctatgggt
ataccattaataatggaatccaacatagaagctgatgatatcataggtactttatcttta
tttgcaacacgtttgaaaagaaaagttttaatttttagtaatgataaagatatggcccaa
ttagtttctacgatggtgactgtagtaaatactacatcgaatattatgttggatcctaaa
gaagtagaattaaaatttggtgtacctccttgttctatagtagattatttatcattagtt
ggagattcgtcagataatattcctggcgtaccgaatataggcgaaaaaacggctagaatt
ttattacataattttggtaatttagatggtatatatagtcatttatcagagatatctatt
ctaaaatttcgtggctctaaaagtgtagagattaatttaagaaatcatcgagcaatggcg
tttctttcgtataaattagcttctattaaaactgatttggttctagatattaattcatgc
aatcaattattgttacatgaacctaatgttgtaatgttgatgtcgttatttaaacgttat
gattttaaaaattggttacaggatattgaaaataataaatggttagttgggtgtaaaaat
gctattctgggttttcgagatgttttgaatatttctccgcttcccaaatcttcaaatcgg
caacagttacaaaagacatttgatatagattatcaaataatttataatatgcagttattt
tcccagtgtgtcactcagattcgtagtgttaaattatttgcatttgatattgtgatagat
agtttggatgtttcagcagctaatttagtgggtatttttttatctgtagtttctggtaaa
gttttatatttacctatgtctaaattttttattgttaatgatgatattaataatgatttt
attagattagattatatacaagttttagtagagttgaaatctatatttgaagattctgat
atagataaagttggttatgatttaaaaattgattatagtgtatttaagcgatataacatt
tatttattgaatagagtttttgatattcgtatagagttttatttattgtatggtattttc
caaattaataatttagctaaatttgcggatgatgatatagtacagagaatgcttgttttt
cagaaaaataaccgtgaaaaaaaatttaataaatttttattatctggcacctttaatcaa
gatcttttttattctatagttaaacattttagtctaattttagatttacataaaaaatta
tggcctaaaattatacaagaccttaatttgaaaaaaatatttgaagaaatagaaatgcct
ttaatatcagtattgtctcacattgaatgtattggggtattagttgataaaactattctt
aacagttattccttagaattgaaagatcgtattagtaaattagaaatttgtgctcataag
ttagcgaatgaatcatttaatttatcttcggttaaagaattgcgaagaattttatatttg
aaacaaaaaataccagttttaaaaaaaactcctctgggttttccatctactaacgaagaa
gttttaaaaaaattatcttcgaaatatcctatatctaagattatcttgaaatatcgtaat
ttagttaagttaaaatctgtttatgctgataggttgcctacgatgattaatcaaaaatct
aaacgcattcatacttcttatcatcagactatgacaagtactggtcgtttgtcatctact
aatccaaatttacaaaatattcctattaggaataatgatggacgacgagttagacaagcg
tttgttgttcctcctgattatttgatgttatcagttgattattcacagattgaattacga
gttatggctcatttatctaatgataaagaattgttgagtgtttttctttcagatcaagat
gttcattgtattactgcatctgaattgtttgtgacttctttagatagagttactgatgat
caacgttatagagctaaaattattaattttggtttaatttatgggatgactgcttttggt
ttagcaaatcaattatctgtaacacgtatggaagctcagcattatatagatgtttatttt
gctcgttatccaggtattaagaaatatatgaaatttatttgcaaacaaattaatacttat
ggatatgttactactattgagggtcgaaaattatatatttcagattttaatttaaatgtt
aaaaaatataagaaaaatattgaacgtgcagcaattaatgctcctgtacaaggtagtgct
gctgatatagttaaacgtgcaatgttagtcatcgatagttatttatgtaaggaatcaatt
ccagcacatatgattattcaggttcatgatgaattaatatttgaaatacatcgtgatgta
gttcttgattttattccacgtgttaaagaattaatggaaaattgttttttattgtctgtt
ccattgaaagttaaagttagtgttggtaaaaattggagtcaggtatactag
DBGET
integrated database retrieval system