KEGG   Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica: GN160_02290
Entry
GN160_02290       CDS       T07558                                 
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
bec  Blochmannia endosymbiont of Colobopsis nipponica
Pathway
bec03030  DNA replication
bec03410  Base excision repair
bec03420  Nucleotide excision repair
bec03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bec00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    GN160_02290 (polA)
   03410 Base excision repair
    GN160_02290 (polA)
   03420 Nucleotide excision repair
    GN160_02290 (polA)
   03440 Homologous recombination
    GN160_02290 (polA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:bec03032]
    GN160_02290 (polA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bec03400]
    GN160_02290 (polA)
Enzymes [BR:bec01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     GN160_02290 (polA)
DNA replication proteins [BR:bec03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     GN160_02290 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:bec03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     GN160_02290 (polA)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     GN160_02290 (polA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N 5_3_exonuc DNA_pol_A_exo1 DNA_polI_exo1 HHH_2 Ribosomal_S12
Other DBs
NCBI-ProteinID: QOI10854
LinkDB
Position
503615..506425
AA seq 936 aa
MIDHPLIIVDGSFYLHRAYHAFPILVNSAKEPVWVIYGVLSMLKKILINYKPEYMVVVFD
SGGQTFRNFLFDKYKINRAKMPNDLYVQIKPLCKLIRAMGIPLIMESNIEADDIIGTLSL
FATRLKRKVLIFSNDKDMAQLVSTMVTVVNTTSNIMLDPKEVELKFGVPPCSIVDYLSLV
GDSSDNIPGVPNIGEKTARILLHNFGNLDGIYSHLSEISILKFRGSKSVEINLRNHRAMA
FLSYKLASIKTDLVLDINSCNQLLLHEPNVVMLMSLFKRYDFKNWLQDIENNKWLVGCKN
AILGFRDVLNISPLPKSSNRQQLQKTFDIDYQIIYNMQLFSQCVTQIRSVKLFAFDIVID
SLDVSAANLVGIFLSVVSGKVLYLPMSKFFIVNDDINNDFIRLDYIQVLVELKSIFEDSD
IDKVGYDLKIDYSVFKRYNIYLLNRVFDIRIEFYLLYGIFQINNLAKFADDDIVQRMLVF
QKNNREKKFNKFLLSGTFNQDLFYSIVKHFSLILDLHKKLWPKIIQDLNLKKIFEEIEMP
LISVLSHIECIGVLVDKTILNSYSLELKDRISKLEICAHKLANESFNLSSVKELRRILYL
KQKIPVLKKTPLGFPSTNEEVLKKLSSKYPISKIILKYRNLVKLKSVYADRLPTMINQKS
KRIHTSYHQTMTSTGRLSSTNPNLQNIPIRNNDGRRVRQAFVVPPDYLMLSVDYSQIELR
VMAHLSNDKELLSVFLSDQDVHCITASELFVTSLDRVTDDQRYRAKIINFGLIYGMTAFG
LANQLSVTRMEAQHYIDVYFARYPGIKKYMKFICKQINTYGYVTTIEGRKLYISDFNLNV
KKYKKNIERAAINAPVQGSAADIVKRAMLVIDSYLCKESIPAHMIIQVHDELIFEIHRDV
VLDFIPRVKELMENCFLLSVPLKVKVSVGKNWSQVY
NT seq 2811 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgatcatccgttaattattgtagatggttctttttatctccatcgagcttatcat
gcttttcctattttggtgaatagtgctaaagagccagtttgggtgatatatggcgtcttg
agtatgttaaaaaaaattttgattaattataagccagaatatatggttgtagtatttgat
tctggtggtcagacttttcgtaattttttatttgataaatataaaattaatagagcaaaa
atgccaaatgatttatatgttcaaataaaaccattatgtaagttgattagagctatgggt
ataccattaataatggaatccaacatagaagctgatgatatcataggtactttatcttta
tttgcaacacgtttgaaaagaaaagttttaatttttagtaatgataaagatatggcccaa
ttagtttctacgatggtgactgtagtaaatactacatcgaatattatgttggatcctaaa
gaagtagaattaaaatttggtgtacctccttgttctatagtagattatttatcattagtt
ggagattcgtcagataatattcctggcgtaccgaatataggcgaaaaaacggctagaatt
ttattacataattttggtaatttagatggtatatatagtcatttatcagagatatctatt
ctaaaatttcgtggctctaaaagtgtagagattaatttaagaaatcatcgagcaatggcg
tttctttcgtataaattagcttctattaaaactgatttggttctagatattaattcatgc
aatcaattattgttacatgaacctaatgttgtaatgttgatgtcgttatttaaacgttat
gattttaaaaattggttacaggatattgaaaataataaatggttagttgggtgtaaaaat
gctattctgggttttcgagatgttttgaatatttctccgcttcccaaatcttcaaatcgg
caacagttacaaaagacatttgatatagattatcaaataatttataatatgcagttattt
tcccagtgtgtcactcagattcgtagtgttaaattatttgcatttgatattgtgatagat
agtttggatgtttcagcagctaatttagtgggtatttttttatctgtagtttctggtaaa
gttttatatttacctatgtctaaattttttattgttaatgatgatattaataatgatttt
attagattagattatatacaagttttagtagagttgaaatctatatttgaagattctgat
atagataaagttggttatgatttaaaaattgattatagtgtatttaagcgatataacatt
tatttattgaatagagtttttgatattcgtatagagttttatttattgtatggtattttc
caaattaataatttagctaaatttgcggatgatgatatagtacagagaatgcttgttttt
cagaaaaataaccgtgaaaaaaaatttaataaatttttattatctggcacctttaatcaa
gatcttttttattctatagttaaacattttagtctaattttagatttacataaaaaatta
tggcctaaaattatacaagaccttaatttgaaaaaaatatttgaagaaatagaaatgcct
ttaatatcagtattgtctcacattgaatgtattggggtattagttgataaaactattctt
aacagttattccttagaattgaaagatcgtattagtaaattagaaatttgtgctcataag
ttagcgaatgaatcatttaatttatcttcggttaaagaattgcgaagaattttatatttg
aaacaaaaaataccagttttaaaaaaaactcctctgggttttccatctactaacgaagaa
gttttaaaaaaattatcttcgaaatatcctatatctaagattatcttgaaatatcgtaat
ttagttaagttaaaatctgtttatgctgataggttgcctacgatgattaatcaaaaatct
aaacgcattcatacttcttatcatcagactatgacaagtactggtcgtttgtcatctact
aatccaaatttacaaaatattcctattaggaataatgatggacgacgagttagacaagcg
tttgttgttcctcctgattatttgatgttatcagttgattattcacagattgaattacga
gttatggctcatttatctaatgataaagaattgttgagtgtttttctttcagatcaagat
gttcattgtattactgcatctgaattgtttgtgacttctttagatagagttactgatgat
caacgttatagagctaaaattattaattttggtttaatttatgggatgactgcttttggt
ttagcaaatcaattatctgtaacacgtatggaagctcagcattatatagatgtttatttt
gctcgttatccaggtattaagaaatatatgaaatttatttgcaaacaaattaatacttat
ggatatgttactactattgagggtcgaaaattatatatttcagattttaatttaaatgtt
aaaaaatataagaaaaatattgaacgtgcagcaattaatgctcctgtacaaggtagtgct
gctgatatagttaaacgtgcaatgttagtcatcgatagttatttatgtaaggaatcaatt
ccagcacatatgattattcaggttcatgatgaattaatatttgaaatacatcgtgatgta
gttcttgattttattccacgtgttaaagaattaatggaaaattgttttttattgtctgtt
ccattgaaagttaaagttagtgttggtaaaaattggagtcaggtatactag

DBGET integrated database retrieval system