Blochmannia endosymbiont of Camponotus (Colobopsis) obliquus 757: BOBLI757_268
Help
Entry
BOBLI757_268 CDS
T03906
Symbol
recC
Name
(GenBank) Exodeoxyribonuclease V gamma chain
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
ben
Blochmannia endosymbiont of Camponotus (Colobopsis) obliquus 757
Pathway
ben03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ben00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BOBLI757_268 (recC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ben03400
]
BOBLI757_268 (recC)
Enzymes [BR:
ben01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BOBLI757_268 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ben03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BOBLI757_268 (recC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC60432
LinkDB
All DBs
Position
308464..311889
Genome browser
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MLIVYHSNKLESLKNSLAEIIRDKSLRDPFQSEVILIQNNYISQWLQIELAYELGIVCNI
NFFDLDDYFWKICIDTLENVSCINYFSKPIMIWKLMQIISDVSEQTDCEIIKHYLLDDQD
QRKRFQLSVHIADLFIKYLLYRPDWLEAWQYNKEIKALGKAQLWQAKLWRELIIHTKLNR
HSLINYGSLYKKFISILSNNHQVIFSDFSQRIFIFSVSGLVPVYYKILQALSYHIDIYLF
FINPNLHYLDVFFDYESTLNLVKYNFCNYQDTKSQFFLCNKNRQQKLLFNDNYYNNCCCL
ESPLLFAWGESVRHDLFFLSRLKNVRKVHAFVDCVKGSLLNILQQDILNFENHINMFNIK
HYDDFCITQQNKRLLKPDDYSLCLHGCHSIQHEVEVLYNNLLSVVSNDPSILPHEIIVMM
PNIDHYIPAIQSIFGTAANKILPFIIIDQKWKNIHPILLIFFNLLKLPDIRCTSKEIFAL
LETPSIASHFGFDEKKLELLHYWIIDSGICWGLDDLTFSKLDVPIVNQYTWHFGLNRMLL
GYAIDSKYGFWKGIFPYNASSGQQYIELVGQLGFFLEKLRFWRNELTQIKILSEWQPCIR
KIIDDFFDLSIQEEEAFLLLESNWHEFVENGKLANYHQPISIVLIRDYLYSKLELRCISQ
KFLSNGINFCNFSSHSFIPFKVICLLGMNDNVYPRNHFEFDFNLMYKQKRCGDLDLYNKD
YYLFLEMILSAQQLLYISFIYCSIYDGRSLYPSVLIDKLIEYIAQNFSLGMDENKGNISM
LIECMRARLCQWHDRMPFLVECLNTNGVKQQIFYDTCLNTGSNIGNMRYNFVFSLDRMSP
DILLLDDLLNFYKSPIKTWFKERLLVNLDRNIIECSEDEPFFVDALTRYKLNKYLLNYFI
HNKKTSDINDLYNRIYATGLLPYGAFGELYWLQQCEKMSRLADKIIKWYLPDQHDMEVSL
IINDVKLTGLLRAVQSNGLLRWRPAVLSMRDGLLLWLEHLVYCVIDDGLLKNSSKMFGIN
SQWIFPVIPKMLAKEYLSILFKGYYDGMSTPLLLLNKSVGVWLNYCFDKNTKNIILCHDR
QYNARLKLIECWKGNKYIIGESHDPYLQRLLGEDINSLHIELIIDIAKFYYLPIMKFNDI
S
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgattgtttatcattctaataagttagaatctcttaaaaattcattagctgaaatt
attagagataaatctttacgtgatccatttcaatcagaagtaatattgattcagaataat
tatatttctcaatggttgcaaatagagttagcatatgaattaggtattgtttgtaatatt
aatttttttgatttagatgattatttctggaagatttgtatagatacattagaaaatgtt
tcttgtataaattatttttctaaaccaataatgatttggaaattgatgcaaattatttct
gatgtttctgaacaaacagattgtgaaattatcaaacattatttacttgatgatcaagat
caacggaaacgttttcagttatctgtgcatattgcagatttatttataaaatatttgcta
tatagacctgattggctagaggcgtggcaatataataaagaaataaaagctttaggtaaa
gcgcaattatggcaggcaaaattatggcgtgagcttataatacatactaagttaaatcgt
cattcgttaataaattatggtagtttatataaaaaatttattagtattttaagcaacaat
catcaagtgattttttcagatttttcacagagaatatttatttttagtgtttcaggatta
gtgcccgtttattataaaattttacaggcattaagttatcatattgatatttatttattt
tttattaatccaaatttgcattatttagatgttttttttgattatgagagtactttaaat
ttagttaaatataatttttgtaattatcaagatacaaaatctcaattttttttatgcaat
aagaatagacaacaaaaattattatttaatgataattattataataattgctgttgttta
gaaagtcctttattattcgcatggggtgaatcggttagacatgatttgttttttttatct
cgattaaagaatgttcgaaaagtacatgcttttgttgattgtgtaaaaggttctcttttg
aatatattacaacaagatatattaaattttgaaaatcatattaatatgtttaatattaaa
cattatgatgatttttgtatcacacaacagaataaacgtttacttaaacctgatgattat
tcattatgtttacatggttgtcatagtatacagcatgaggttgaagtactatataataat
ttattatcagtggtatctaatgatccttccatattaccgcatgaaattatagttatgatg
cctaatattgatcattatatacctgcaatacagtcaatttttggtactgctgcgaataaa
attttaccttttattattattgatcaaaaatggaaaaatatacatcctattttattaatt
ttttttaatttgttaaaattaccagatattagatgcacatcgaaagaaatatttgcgtta
ttagagactccatctatagcaagtcactttggttttgatgaaaaaaaattggaattatta
cattattggataatagattcaggtatttgttggggtttagatgatttgacctttagtaaa
ttagatgtacccattgttaatcaatatacatggcattttggtttaaatcgtatgttatta
ggttatgctatagatagtaaatatggattttggaaaggtattttcccctataatgcatct
agtgggcagcagtacattgaattagttgggcaattgggattttttttagaaaaattgcgt
ttttggcgcaatgaacttactcaaattaaaatattaagtgaatggcagccttgtattcgt
aaaattattgatgatttttttgatctgagtattcaagaagaggaagcgtttttattgtta
gaatctaattggcatgaatttgtagagaatggaaaattagcaaattatcatcaacctatt
tcaatagtattaattcgagattatttatattctaaactggaattgagatgtataagtcaa
aaatttttatctaatggtattaatttttgcaatttttcttcacatagttttattcctttt
aaagttatatgtttgttagggatgaatgataatgtttatccacgtaatcattttgagttt
gattttaatttgatgtataaacaaaaacgttgtggtgatcttgatttatataataaagat
tattatctatttttagaaatgattttatcagcacaacagttattatatattagttttatt
tattgctctatctatgatgggagatcattgtatccatcggtgttaattgataaattaata
gaatatattgctcagaatttttctttaggtatggatgaaaataaaggaaatatatcaatg
cttattgaatgtatgcgagctcgtttatgtcaatggcatgacagaatgccatttttagta
gagtgtttaaatactaatggtgtaaagcaacaaattttttatgatacatgtttaaacacg
ggtagtaatataggtaacatgcgatataattttgtattttcattagatagaatgtctcca
gatattttattattggatgatttgctcaatttttataaatccccaattaaaacttggttt
aaggaacgtttattagtaaatttagatcgtaatattattgaatgttctgaagatgagcct
ttttttgttgatgcattgactagatataaactaaataaatatttattaaattattttata
cataacaaaaaaacaagtgatattaatgatttatacaatagaatttatgctactggtttg
ttaccttacggcgcttttggagagttgtattggttacaacaatgtgaaaagatgtccagg
ttagcagataaaataattaaatggtatctacctgatcaacatgacatggaagtatcattg
atcataaatgatgttaagttaacaggtttattacgcgcggttcagtcaaatggtttatta
agatggcgtcctgctgttctttctatgagagatggtttgttattatggttagaacatttg
gtatattgtgtaatagatgatggtttactaaagaatagtagtaagatgtttggtattaat
agtcaatggatttttcctgttattccaaaaatgttagctaaggaatatttatctatattg
tttaaaggttattatgatggtatgtctacgccactattattacttaataaatcagttggt
gtttggttaaattattgttttgataaaaatactaaaaatattattttatgtcacgatcgt
cagtataatgcaagattaaagttaatagaatgttggaaaggcaataaatatattatagga
gagagtcatgatccatatttacaacgattgttaggtgaagatattaattcattacatatt
gaattaattatcgatattgcaaaattttattatttacctattatgaaatttaatgatata
tcttaa
DBGET
integrated database retrieval system