Bartonella elizabethae: NCTC12898_00035
Help
Entry
NCTC12898_00035 CDS
T06159
Symbol
yadA_1
Name
(GenBank) Adhesin yadA precursor
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
bez
Bartonella elizabethae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bez00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bez02000
]
NCTC12898_00035 (yadA_1)
Transporters [BR:
bez02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC12898_00035 (yadA_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
Spike_torovirin
DUF7310
LPP
Sec3_CC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEJ39529
LinkDB
All DBs
Position
1:41017..46374
Genome browser
AA seq
1785 aa
AA seq
DB search
MKKKYSTPNLIKAVSLSAAMATLLSSVSPVFAANLAITGANNLSTNLGGVSYAHGSHGSV
VLSGDDDYCGADNVIGRGGKQQKGITDSQRISAEDQYERFIGEKVFNGRQPYGTTTQKVI
WQSEGILTNDATYMGTNTNGFQNAMPEAYGVYSFATGCGSAATGNYSTVFGAGATAKAGG
AQAFGVSALAGGIASVAMGVGSEAAGKSAVAIGGLANALGENSIALGTKVKAAQSYAIAI
GTDAEARASGSIAIGSRRSNRTEENKPNREVLAEAENSIAIGTFAYAKTEDSVALGVNAQ
VFSKDGVAIGGGSVSRREKGAEAYDPATDTVSSEKSGLAWKSTAGVFSIGEVNADGNDGK
GELTRQITGVAAGKEDTDAVNVAQLKALRGIIGKGGGGGWKISANNTGPTDVNVGNTVDF
SVIKSNVGPDNLKITKSNENDNHKIQFTLADELKLTKVTTGQSSMSDDGFIIGNDGPKMV
LDGFFVNGQNGPSMTQEGIDAGNKKITNVAEAENDTDAVNFEQLKKFTEGIKGGGWKLSV
EDGKATDITAGSTVRFFAVSNNYTGQKNIKIANTNGQNVSFDLANNINVESVTAGESIMD
ASGFRFEGDDGTEGPSITVNGIYAGDKTITGVATGEQDTDAVNFGQLKKYVEKNGGSWKL
SVDGNNATDVKVGSTVDLVAAEGDGGYKNITIEKSNGNEVTFALNDNLKLTSVTTGNSLM
NDQGFSFVDGDGPKITLNGIEAGNKKITKVADGAEPNDAVNYKQLTEIKTLAENGWQLSV
DGKNPTGVKAGSTVDLVTAEGDGGHKNITIEKSNENKVTFTLNDKLKLTNVTTGNSIMDG
SGFGFVDAGPKITVNGINAGDKKITGVAKGEGNTDAVNFSQLKEMKDQIASDSLVKWDER
QNLITIGGEKDGIEINVANNEDENRIISGVAVGKVSADSTEAINGHQLFNYAANISEYFG
GETDVIDGFKPTFTIQDNEYHNVTDAFGGLDDYITDIYTQINNVTESSLVKWDEGEGLIT
IGKEKSGTKIDIKGTEGERTIAGVKDGDLGKDSKEAVNGSQINAISGDIAKYFGGGASFE
NGVFKRPRYNLTTIDSNGEVKQKEHNDVGSALSGLDTNIRNVNHHFINAMNDIANYFGGG
AGYDKNGEWHAPTFQVYHINDNGTVSKKPHQNVADAFEDVNNTFTNIHNQISNIKENNLV
QQEEEFGLITIGAKTGGTEISIENMNGEERTLFGVKDGEISRTSTEAVNGSQIFKIAKNI
SNYFGGSTDVYEGIKPAFLIDGETYHNVTDAFTGVNVSITNIDNKISEMKENSLVKWDEG
QQLITIGKDKAGTEINIAGYGNAPRKISRVREAENDDEAVNKAQLDKSIKGISKDALLWD
DNEEAFVALHEKNGEKTKSKLKYLLDGDISKNSTDAINGSQLYSISNQLANYFGGDAKYE
NGKWTAPTFKIVQVDVNGKTIENSYNTVAEAFGGINSGMSNINNRIDDVINKVDSDALKW
NSNKNAYDASRDGKPSKIINVADGRIEKGSKDAVNGGQLWQTNERVAKVENRVTDVENHV
EIIDKKVDNISNTIEDIGDTVNNINIKVDNIDNKVNDIAEDAVRYDRDENGNKTNKITLA
GGDASEPVVIDNVADGKIEKGSKEAVNGGQLHDYTQEQMKIVLDESKQYTDQKINNIRID
AIDEAVDKSKNYTDMKFDALNYSIENVKKEARQAAAIGLAVSNLRYNDTPGKLSVGFGTG
LWRSQSAFAFGAGYTSENGNIRSNVSVTTSGGHWGVGAGFNMTLN
NT seq
5358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaatattccacaccaaatttaattaaagctgtctcgctcagcgcggcaatg
gcgacactcttgtctagtgtttcccctgttttcgctgccaatctcgcgataacgggggca
aataatttaagtacaaatcttggcggcgtttcatatgcacatggtagccatggtagtgtt
gttttatctggtgatgatgactactgtggtgcagacaacgttatcggtcgtggtggcaaa
caacaaaagggtattactgatagtcaacgaatatctgcagaggaccaatatgaaagattt
attggcgagaaagtttttaatggtcgtcagccttatggcacaaccactcaaaaggttatt
tggcaaagtgaagggattctgaccaacgatgctacttatatgggaacaaacactaatggg
tttcaaaatgctatgcctgaagcttatggcgtttattcttttgcaacgggctgtggttct
gcggcaacaggaaattattccacggtatttggtgcaggcgcaaccgcaaaagctggaggg
gcgcaagcttttggtgtttctgcgcttgcagggggtatagcaagcgttgctatgggtgta
ggctcagaagcggcgggaaagtctgcggttgccattggagggcttgcaaatgcattaggt
gaaaatagtattgctttggggactaaagtaaaggcggcacagagttatgcgattgctata
ggtacagatgctgaagctcgagcttcaggttctattgcaataggtagcaggcgctctaac
agaactgaagaaaataaacctaacagagaagtattagcggaggcagaaaattcgattgct
ataggtacgtttgcttatgctaaaacggaagattcggttgcccttggtgtaaatgcgcaa
gtattttctaaggatggtgttgctataggtggtggctctgtttctagaagagaaaaaggt
gccgaggcttatgatcctgcaacagatacagtctcgagcgaaaaaagcggtcttgcatgg
aaaagtacggcaggtgtttttagtattggtgaagtaaacgctgatggtaatgatggcaaa
ggtgaattaacacggcaaattaccggtgtggctgctggtaaagaagataccgatgcggta
aatgtcgcacagttaaaagctctaagaggtatcataggaaaaggaggaggaggggggtgg
aaaatttctgctaacaacacaggtcctacagatgttaatgtaggcaataccgtagatttt
tcagtgataaagagtaacgtaggaccagataacttaaaaattacaaaaagcaatgaaaac
gataatcataaaattcaatttactttggctgatgagcttaagttaacaaaagtcaccaca
ggtcaaagctctatgagtgatgatggctttattattgggaatgatggacccaaaatggtt
ctggatggcttttttgttaatggtcaaaatggtccaagtatgactcaggaaggtattgat
gctggtaataaaaagattacaaatgtggctgaagcagaaaacgatactgatgcagtgaat
tttgagcagttgaaaaaatttacagaaggaattaaagggggcggctggaagctttctgtt
gaagatggaaaagctacagatattactgcaggcagcacagtccgtttttttgctgtttcg
aataattatactggtcagaaaaacataaaaattgcaaatacaaatgggcaaaacgtctct
tttgatttagctaataatattaatgtagagtctgtcacagcaggagaaagcattatggat
gcttcgggctttcggtttgaaggtgatgatggtactgaggggccgagcataactgttaat
ggcatttatgctggtgataaaacgattacaggggtagcaacaggagaacaagataccgat
gcagtgaattttgggcagctgaaaaaatatgtagaaaagaatgggggaagctggaaactt
tctgttgatggcaataatgctacagacgttaaagttgggagtacagtagatcttgttgcc
gctgaaggtgatgggggttacaaaaatatcacaattgaaaaaagtaatggaaatgaagtc
acatttgctttgaatgataatcttaagttgacgagtgttacgacaggcaatagccttatg
aatgatcagggcttttcatttgttgatggtgatgggcctaaaataactttaaatggtatt
gaggctggtaataaaaaaattacaaaagtagcagatggagctgagcctaacgatgctgta
aattataaacagttgacagagataaaaacacttgcagaaaatggctggcaactttctgtt
gatgggaaaaatcctacaggtgttaaagctggtagtacagtagatcttgttactgctgaa
ggtgatggtggtcacaaaaatattacaattgaaaaaagtaatgaaaataaagtcacattt
actttgaatgataagcttaaattgacgaatgtcacgacaggcaacagcattatggacggt
agtggctttggatttgttgatgctggtcccaaaataactgtaaatggcattaatgctggt
gataaaaagattacaggagtagctaagggagaaggcaatactgatgctgtaaatttttca
cagttgaaagaaatgaaagaccagatagctagcgatagccttgttaaatgggatgaaaga
caaaatcttatcaccattggtggagaaaaagatggtatagaaatcaatgttgcgaataat
gaagacgaaaatcgaattatttctggtgttgcagttggaaaagtcagtgctgattcaaca
gaagcaataaatggtcatcagcttttcaattatgctgctaatatatcagaatattttggt
ggcgagacagatgtgatcgatggtttcaagccaacttttactattcaagataacgaatat
cataatgttactgatgctttcggaggacttgatgattatatcacggatatttatacgcag
attaataatgtaactgaaagtagccttgttaaatgggatgagggggaaggacttattact
attggtaaggaaaaaagtggtactaaaattgatattaaaggtactgagggggaacggact
attgcgggtgtgaaagatggtgaccttggaaaggattcaaaagaagctgttaatgggtcc
cagattaatgcaatatctggagatattgcaaaatattttggtggtggggcctcgttcgaa
aatggtgtttttaaaagaccaagatataatttaacgactattgattccaatggtgaagta
aaacaaaaggaacataatgatgttgggtcagctttgtcagggcttgatacaaatatcagg
aatgttaatcatcattttataaatgcaatgaatgacattgccaattatttcggtggtggt
gctggatatgacaaaaatggagaatggcatgcccctactttccaagtctatcacatcaat
gataatggtactgtttctaagaaacctcatcaaaacgttgctgatgcttttgaggatgtg
aacaatactttcacgaatattcacaatcaaatctctaatatcaaagaaaataatttagtt
cagcaagaagaagagtttggtcttatcactattggtgcgaaaacaggggggacagaaatc
agtattgaaaatatgaatggtgaggagcgaacactttttggtgtaaaagatggtgaaatc
tctcgaacatcaacggaagcagtcaatggttctcagattttcaagattgctaaaaatata
tcaaactattttggtggcagtacagatgtatatgaaggtataaaaccagccttccttatt
gatggagagacatatcataatgttaccgatgcttttacgggtgtgaatgtttctatcaca
aatattgataataaaatttctgaaatgaaagaaaacagtcttgttaaatgggatgaagga
cagcaacttatcacgattggtaaggataaagctggtactgagatcaatattgcaggatat
ggtaacgcaccacgtaagatttctcgcgtgcgggaagcagaaaatgacgatgaagctgtt
aataaagcccaacttgataaaagcataaagggcatctcaaaagatgctttactgtgggat
gataatgaagaagcattcgttgcacttcatgaaaaaaatggagaaaagaccaagagcaaa
ttgaagtatcttttggatggtgacatttctaaaaattcaacagatgctataaatggttct
caactttattctataagcaaccaacttgcgaattattttggcggtgatgcgaaatatgaa
aatggcaaatggacagcccctactttcaagattgttcaagttgacgtaaatggtaaaact
attgaaaatagctataatacagttgctgaagcttttggtggtattaacagtgggatgtcg
aatattaataaccgtattgatgatgtcatcaacaaggtcgattccgatgcgttaaagtgg
aatagtaataaaaacgcttatgatgctagccgtgatggtaaaccaagtaagattatcaat
gtagccgatggtagaattgaaaaaggttccaaagatgcggttaacggtggacaactttgg
caaaccaatgagcgtgttgcaaaggttgaaaatcgtgttacggatgttgaaaatcatgtt
gagatcatcgacaaaaaagttgataacatttccaataccattgaggatattggggataca
gttaacaatattaatatcaaagttgataatattgataataaggttaacgatattgctgag
gatgctgttcgctatgacagagatgaaaacggcaacaagaccaataaaatcacattagcg
gggggggatgccagtgaacctgttgtgattgataatgttgctgatggtaaaattgagaaa
ggatcaaaagaagctgtaaatggtggtcaactccatgactatacccaagagcagatgaag
attgttcttgatgaatctaagcagtatacggatcaaaagatcaataatattagaattgat
gcgattgacgaagctgttgataaatccaaaaactataccgatatgaagtttgatgcttta
aattacagcatagaaaatgtgaaaaaagaagcaagacaagcagcagctattggtttagca
gtgtctaacttacgctacaatgatacacctggaaaattaagcgttggatttggtactggt
ttatggcgcagtcaatcagcttttgcctttggtgcaggttacacctcagagaatggaaat
attcggtctaatgtatctgttactacttctggtggtcattggggtgtaggtgcaggattc
aatatgacattgaattga
DBGET
integrated database retrieval system