KEGG   Bartonella elizabethae: NCTC12898_01176
Entry
NCTC12898_01176   CDS       T06159                                 
Name
(GenBank) adhesin
  KO
K07279  autotransporter family porin
Organism
bez  Bartonella elizabethae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bez00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:bez02000]
    NCTC12898_01176
   02044 Secretion system [BR:bez02044]
    NCTC12898_01176
Transporters [BR:bez02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   NCTC12898_01176
Secretion system [BR:bez02044]
 Type V secretion system
  Autotransporter-1 (AT-1) family
   NCTC12898_01176
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter AC_1 Beta_helix Orthopox_A43R
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEJ41726
LinkDB
Position
1:complement(1360888..1364142)
AA seq 1084 aa
MIKVFRNHVCLCACTTAILSLLENGMVIAASPENSNYNSMIPVAVIPPNVSYLYSGVEGR
PIMPPHMSSVEGSPPISAFPNDNVISGGPVYSPQLSGSNVHKPPLKGDSGDNYHHYNKIR
VDNNDEGIRGGSNYRELSGVDGENGRQENIDNSVRDADSDGRGVKPGFYYYSGLYYICDN
CGEARIDHKSYKITNENASNYPADPTAITVKQRGTRVEGENVTVKSDVLDRSFLRGVAVS
DDGKIVLKNPVLQNTKLALFSNDGLIEVKQGTIEESDRAVEAIGHSLVILEDTNINTSGG
PTSLLSYSGAEIGVEGGKINFADSHGISAMLGGKVFLDAVSVTGKGKKGENHAVFLMDEG
GEIEFKGGTVDVEDVHGILLKNSLKPLYSGPERSEEESETEDDVEDLSNNFYVTEANLKS
STFTVKGKGSYGIYFRGEKPWDESGDKKEAEILEGEKAPPRLEVVNLDTTKFSVVDDAAI
YGENGISGAVSLMKSSLRSGNFLLKAEKGASITVLADGSTLEGRTHVDKNSNAELYLGDS
TWILPQQLQRDQQGDENSSSISLVSLMGESSINFKRHESSAADDYQTLRIGKGKGEVYKA
RDNASISLHTYLNKGGNLDQQKTNRILIHGDVSGKTMLRVHAVAGSPGGYTGSGGNEEGI
SIIQVSGEAEQDSFQLEGGYVALDELPYQYKLYSYGPGSLLGKASVAQRLVEGSGEFWDF
RLESRTIDSDIQPQPDPRPTPPPGPTPPPGPAPDPHPRPKPGVKAVVPQVPTYLLLPNAL
RHLGLMNVSNQNQRLEALRIASGGLLESRENPFFFVRGYGGNHRYTSNLSALEYGYGGEL
DYNAVEAGILLKAIENMYGTTSLGITGSYEKFSLHPLNVEQSQKSTFDKWSVAAYGGMQH
DAGFYVDGLVSYGWFKGDVLTKARGKTATLKGNPLSASLMAGKTFMVGEDGFVFDPQVQV
VYQYLQFNKVRDVDGFDIDLGKLHQWVGRVGGRLTKMLVATDESQVISFYGKLHLAHGFE
GKQFVHFKDAFQLGAFGSSLETGLGFNAQLSQNFALHGDLIYQHKLTKAGFSGTSFSGGL
RYRF
NT seq 3255 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattaaagtgtttagaaatcatgtatgtttatgtgcttgtacaacagctatcctttct
ttgctcgaaaatggaatggtgattgctgcgagtcctgagaatagtaactataatagtatg
attccagttgcggttattcccccaaacgttagctatctttacagtggtgttgaggggcgt
cctattatgcctcctcatatgagtagtgttgaaggctctccccctatcagtgcttttcct
aatgataatgttatcagtggggggcctgtttatagtcctcagcttagtggaagtaatgtg
cataagcctcctcttaagggagatagtggggataattatcaccattataataaaatccgt
gttgataataacgatgagggtattcgtggggggagtaactatcgtgagttgagtggcgtg
gatggagagaacggacgacaggaaaatatagataactctgtcagagatgcagactctgat
ggaagaggtgtgaaacctggattttattactatagtggattgtattatatatgtgataat
tgtggggaagctagaattgatcataaatcttataagattacgaatgaaaatgcttccaat
tatcctgctgatccgacggctataacggtaaagcagagagggactagagttgagggagaa
aacgtgacggttaaaagtgacgttcttgatcggtcttttttgcgtggtgtggctgtgtca
gatgatggaaagattgttttgaaaaaccctgtgcttcaaaatacaaagttagctcttttt
tctaacgatggtctcattgaggtcaagcaggggactatagaggagagtgatagggctgtt
gaagctataggacattcattggttattttagaggatacaaacattaacactagcggtgga
ccaacaagccttttaagttatagtggggcagagatcggggtggaaggtggaaagattaac
tttgcggacagtcacggtatttctgcaatgttaggggggaaggtctttcttgatgcggtt
agtgttactggaaaggggaaaaaaggcgaaaaccatgcggtctttttaatggatgaaggg
ggagagattgagtttaaaggcggaactgttgatgttgaggatgtgcatggtatattgtta
aaaaattcgctcaagcctttatattctggaccagaacgatctgaagaagaatctgaaacc
gaagatgacgttgaggatttatcgaataacttttatgtgacggaggctaatttaaagtct
tctacttttaccgtaaagggtaaaggatcttatggtatctactttcggggagagaagcca
tgggatgagagtggagataaaaaagaggcggaaattttagagggagaaaaagcgccacca
cgattggaagttgttaatttggatacaacaaagttttctgttgtagatgatgcggcgatt
tatggtgaaaatggtatttctggtgcggtgagtttgatgaaaagttcgcttcgttcaggg
aattttttattaaaagctgagaaaggggcttctataacggttttagctgatggttctacc
cttgaaggtcgtactcatgttgataaaaattctaatgccgaactttatttgggagactcc
acatggattttaccacagcagttgcagagagatcaacagggggatgaaaatagctcttct
atttcacttgttagccttatgggcgagagctctattaatttcaaaagacatgaatcttct
gctgctgatgattatcaaactcttcgtattggaaagggaaagggtgaagtttataaagca
cgggacaatgcctctatttctcttcatacctatctgaataaggggggaaatcttgatcag
caaaagacgaatcgtattttaattcatggtgatgtttcgggaaaaacaatgcttcgtgtg
catgctgttgcaggaagtccaggaggatatacaggaagcggagggaatgaggaaggtatt
tcaatcattcaggtttctggagaagcagagcaggattcttttcagttggaaggtggttat
gtcgcgttagacgaattaccttatcaatataagctttatagttatggtccagggtctctt
ttaggaaaagcaagtgtggcccaaagattagttgaagggagtggagagttttgggacttc
cgtcttgaaagtagaactatagattctgatattcaacctcaaccagatcctcgtccgaca
cctcctcctggtccaacgcctcctccaggaccggctccagatcctcatcctcgtcctaag
ccgggcgttaaggctgttgttccgcaggttccaacttatttgcttttgcctaatgcctta
cgtcatcttggtttgatgaatgttagcaatcaaaatcagcggttagaagctttgcgaatt
gcttctggcggcttattagaaagtcgcgaaaatcctttcttttttgtgcgcggttatggc
ggtaatcatcgttatacttcaaatctttctgcacttgaatatggttatggtggcgagctt
gattataatgctgtagaggcaggtattttactaaaagcaatcgaaaatatgtatggaacc
acttctttgggaattactgggtcttacgagaaattttctttgcaccctttgaatgttgaa
cagagtcaaaaaagcacatttgataaatggtcagttgcagcatatggcggtatgcagcat
gatgcaggtttttacgttgatggcctcgtgtcttatggttggtttaagggggatgttctc
acaaaagcacgaggcaaaacggcaacattaaagggaaatcctttaagtgcttcattgatg
gctggtaaaacatttatggtcggagaggacggttttgtttttgatccacaggttcaggtt
gtttatcaatatcttcaatttaataaagtgcgtgatgtggacggctttgatattgattta
ggaaagcttcatcagtgggtagggcgtgttggagggcgtttaacaaagatgctggttgcc
actgatgagtctcaagttatttctttctacggcaagcttcatcttgctcatggttttgaa
ggaaaacaatttgtgcattttaaagatgcttttcagctaggtgcttttggttcttcatta
gaaactggattaggttttaatgctcaattgtctcaaaattttgcgcttcatggtgatttg
atttatcagcataagctcacgaaagctggtttttctggaaccagtttctctggcggattg
cgttatcgtttctag

DBGET integrated database retrieval system