Candidatus Borrelia fainii: BOFE_00270 Help Entry BOFE_00270        CDS       T09149                                  Symbol sbcC Name (GenBank) nuclease SbcCD subunit C   KO K03546   DNA repair protein SbcC/Rad50 Organism bfai  Candidatus Borrelia fainii Brite KEGG Orthology (KO) [BR:bfai00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bfai03400]     BOFE_00270 (sbcC) DNA repair and recombination proteins [BR:bfai03400]  Prokaryotic type   DSBR (double strand breaks repair)    HR (homologous recombination)     RecBC pathway proteins      BOFE_00270 (sbcC)     Archaeal homologous recombinant proteins      BOFE_00270 (sbcC) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  AAA_23 SbcC_Walker_B SMC_N AAA_29 ABC_tran T2SSE Zeta_toxin AAA_16 AAA_22 Flp_N RsgA_GTPase DUF6985 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BDU62487 UniProt:  A0ABM8DJM5 LinkDB All DBs Position complement(34428..37277) Genome browser AA seq 949 aa AA seqDB search MRINKLVFKNIASYKGEYEINFDVSVLKNSGIFLISGNTGAGKSTILDCITLALYARVYR LDKNISDSISKGFDSAYVKLTFTISGKVYESFIELNTRQKETPKNMVLTCFSDGSFIENK DDVLSYIKSLCRLDFKQFCQTVILPQGNFQEFLTSKPKNKTAIIDNIFNLKKYDDIEIFL KKELELAKLNKERLVLLDTEERKRLSINEKKINELTESLNLIDVKVLKENLCNVYDLIVI CDELIKFNQNYLDIQHRIDNLKLELSSKVFSRKKLNNEYFLQKKSKLKLDEKLKFYNSND FLDLKNFVQRQSELLNDKNRFSLELVNIQRDLEELKYLDLDNFNFDYVKELYYENVILRE MTFDEDAYNSLLVKESQLETQRKELLVEQEIKNVEIKSINSEKISFNFDKYVYYEALKLL KGFCEELILRYKNELDLLLKSNDSDLSQAIESNIKIDLYRDFLEHLNNKRQSVEKDIEDL KHHEDAYKVYQRKEELKISSLNELFKLNSKLQILQSELDILKVDILHNKESKIKWEGCVL NFKKNNAEILKRIGQNLFQKYIDYSNKNKILIFEGKLKEISALKSMLDDLNSKISLKEVE IKENLGKIKNLLSNVNLKISLSKPALIEREFEKFLRSKRDIENDQVKLNSCLDNINNEKL KLESQIEMMEQTILDCEVEIKDKLDNFTSSFVNFKRLIKGVPFVKDPIFSLDSLTPSKNS LEHFMKLRSDFTFQIEVISKEISKYETNFSSLKELKAELNTHEINLENIKSELSSVNERN DKLEILKKVVTTSPSLKYYVQSFLIDEILSISNKKYLNIILPDFELEIDTNSKDFNFLVK SKKDGNMIRSVKTLSGGEKFLVSLSLSLALSDMIRDSELKIEAFFLDEGFGSLDEDTLKM VIPKISDFQRVDGRQIGIISHVSYLKEEIKTQIVISKISTVSKITIESF NT seq 2850 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaggataaataagttagtatttaagaatattgcttcttataaaggtgaatatgagatc aattttgatgtttctgttttaaaaaattcgggaatttttttgatttctggaaatactgga gctgggaagagtacaattttggattgtattactcttgctctttatgcacgagtttataga cttgataaaaatatttcagattcaatttctaaaggttttgatagtgcttatgttaaactt actttcactatttctggaaaagtttatgagtcatttattgaacttaatacaagacaaaag gaaacccccaaaaatatggtacttacttgttttagtgatgggagttttattgagaataaa gatgatgttttgtcttatataaagagtctttgtaggttagattttaaacagttttgtcaa actgttattttaccccaaggtaattttcaggagtttttaacttcaaaaccaaaaaataaa acagcaataattgacaatatttttaatttaaaaaagtatgatgatatagaaattttttta aagaaagaattagaacttgcaaaattaaataaagaaagattagtacttttagatacagaa gaaagaaagagattgagcattaatgaaaaaaaaataaatgaattgactgaatctttgaat ttaattgatgtaaaagttttaaaagaaaatctttgcaatgtttatgatttgatagttatt tgtgatgaactaataaagttcaatcaaaattatttagatattcaacataggatagataat ttgaaattggaattatcttctaaagtctttagcagaaagaagttaaataatgagtatttt ttgcagaaaaagagtaaattaaaattagatgaaaaacttaagttttataattctaatgat tttttggatttaaaaaattttgttcaaaggcaaagcgaactattaaatgataaaaatcgg ttctcgttagagcttgtaaatattcaaagggacttagaagaattgaaatatttggattta gacaattttaattttgattatgtaaaagaattatattatgagaatgttattttacgtgag atgacttttgatgaggatgcttataatagcttgcttgtaaaagagagtcaattagaaaca caaagaaaagaattattagtagaacaggagataaaaaacgtcgaaatcaaaagtattaat tcagaaaaaatatcatttaattttgataagtatgtttattatgaggcattaaagttatta aaggggttttgtgaagaattaatattgagatataaaaatgaattagacttgttgttaaag tcaaatgatagtgatttatcacaagctattgagagcaatattaaaattgatttatataga gattttttagaacatcttaataacaagagacagtctgttgagaaagatatagaggatctt aaacatcatgaggatgcatataaagtatatcaaagaaaagaagaattaaaaatcagtagt ttaaatgagcttttcaaattgaattcaaagcttcaaattttgcaatctgagttagatatt cttaaagttgatatcttgcataataaagaaagtaaaattaaatgggagggttgtgtctta aattttaagaaaaataatgcagaaattttaaaaagaattggtcaaaatttatttcaaaaa tatatagattattctaataagaataagattttgatttttgaaggtaaacttaaggaaatt tcagctttaaaatcaatgcttgatgatttaaattccaaaatttctttaaaggaagtagaa attaaagaaaatttaggtaaaataaaaaatttattatctaatgttaatttaaagataagt ctaagtaagcccgctttaattgagagagagtttgaaaaatttttaaggtctaaaagagac atagaaaatgatcaggttaaattaaattcgtgtcttgataatataaataatgaaaaactt aaacttgaaagtcaaattgagatgatggaacaaactatattagattgtgaagtagagatt aaagataaacttgataattttacttctagttttgttaattttaaaagattaattaaaggt gttccttttgttaaggatcctattttttcacttgattctttaactcctagtaaaaatagt ttagagcattttatgaagttgagatccgattttacatttcaaattgaggttatctctaag gagattagtaagtatgagacaaatttttcaagcttgaaggagcttaaagcagaacttaat acacatgagattaatttagagaatattaagagtgaattaagtagtgtaaatgagcgtaat gataaattggaaattttaaaaaaagttgttactacttctcctagtttaaagtattatgtt cagagttttttgattgatgaaattttaagtatatcaaataaaaagtatttaaatattatt ctgcctgattttgagcttgaaattgatacaaatagtaaagattttaattttctagttaaa agcaaaaaagatggaaatatgattcgtagtgttaaaactctatctggtggtgagaaattt cttgtatctttgtcgctttctctagctctctcagacatgataagagatagtgagcttaaa atagaagcattttttcttgatgagggatttgggagtcttgatgaggatactttaaaaatg gttattccaaagatttctgattttcagcgtgttgatgggcgtcaaattggtataatatct catgtttcttatttgaaggaagagattaagactcagatagttataagtaaaatttcaaca gtttctaagattactatagagagtttttaa

DBGET integrated database retrieval system