Candidatus Borrelia fainii: BOFE_03520
Help
Entry
BOFE_03520 CDS
T09149
Name
(GenBank) membrane protein
Organism
bfai
Candidatus Borrelia fainii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU62812
LinkDB
All DBs
Position
complement(425687..432475)
Genome browser
AA seq
2262 aa
AA seq
DB search
MIDFVTVLVNLLLVFVILFIYRQYDKRSRALDKIKKFIDITKDNLEDFIDEKTKEINNLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIDEVQRKIKDKSNDFAEVEKKISYHDSMLKELDEMALKVQDNIQ
RLQVDGKIVDKLSKTLKNFNVQIDSIDSRLSTVFEKFDKTNKENLETIKIESWDKFDNTI
KDFSVRMDNLDRKLISYQESLVMVEEKKREILDKGNEKLENEFKEFVFKIESSIDNYNKS
MEDSFGIYETKYKSIENSLDLIVEQVRTRINDKEDFILTRLNEELQIKFDEIFMYVDERS
HQMRDKLEGKLVLIDNEISSLSSVFKDNAYSRLNSLEETIRQEMRQYEEQLADILEQFRV
QIESGVGNIYKEYDSKINQFDKDIRDRIESSLKDANSRIESVQGGVRTLLDDLEEDSNRI
YVEFKERVKGDIDSFSENVFSRMNDVGSELELKFSNISTDIQDRIFKLDSSLSLELKEMN
EKFVNDCSRLDGSINLKYETLLEALNLKSGELETQLKDKYKNIADKFERDIDELTIKCDE
KFSKISEKSDYDYQSFEITSTKLKESISSLNDLLVQDFETLRGDFESKLNKMSSDINDEV
FNLKSHYEEDIGKFIKQMETDKLQYEHWQREVGLNLEDTKFHLNKTNEEFLNLIETQRSK
GKELSENIFNELSEHVQKKAMDMHTNWKDELIILNKSLLDIKISSEELLLSASSKIESFE
KDVNERLEYVTSKTEDFESSVLDKYKELRNMSYSNSEETLSRIKEFIDNQAEIIHDKIIM
MLNGLNENFSNKEELIKGNIEELDYRLKDFKVECEDALNNLRSYLDEFIETRMQKVSEIK
IDNQKQIDNFLNKISEEILSRKDMLNSEIDNKLNDWQGKLSEISVNIENVLSSGKIDINL
IDSEMTLKIDELKSTFEGLESYYLEKIDEFRNQGNVYADELLKNIMSHFDTDSKDLEENL
SKKFATVLERSEEFVKEVDSLLKDKRTDIASFQASIDITIDSLNSRFNDVNREINEKYSK
VVSDSREYSETLANKLENEIGYEIENVNRRLTDKIEILSKNMDENLENFKSSFDISKYQV
ENFEIKIKDIIEKEELRLGELLREIERQYRVRREEAIDYKKAIDSDIIHLREQFIGVINE
LKNNIEDKSEFLNDLYKERFRIIENNFEERYSTFFIESEGAISKIRDEIYKILTDNDEHL
KAKISEMDRNFELIDRRSKEILELEEDLRKRIQEDSNNIHHQFDVIKSNLEKEIKDHFDM
YMMKAAAAINEEIEKYEHGINEKISALKSIENNFEMIEKNLKDKITECHNELDKTLDMRY
AEIESKYDERHLLVEEKINDKTNSVEKLIANKYAELEGKYDEKHLLVEKKINDKTNSVEE
LIANKYAELEGKYDEKHLLVEKKINDKANSVEELIANKYAELEGKYDEKHLLVEKKINDK
TNSVEDLIANKYAELDIKYSNMHLDMENRLNACISDLGIELARSSEKIDKEIEEQLKNLG
ELKLNLSNIEGDVLKLKEDSYHNVSSHLKLLEEDFFKDLKERSDNLKNSLENFVASSDQR
IENLERYIIKNLEDKEILMKNFRVEIEQELIFNKESFWSEFNKEFDVKKRDVESKIVVME
ANVTNRLDEFIKLVDNRQNNVDSWFFKVKDDMINWQENAYKELEERVGITKRSLDEIKSD
VSAIESGLEVVKDDVNQRAKEIFDRLQADIKEFESRSYLNLKNISDEVQDKVLNIEDCMD
FKIKSINDKIDLHVEELVTQVEIKFLSQQKDIEDKIIEANEKLEYEFNSMTSRLDEEKQN
IVSKFLNDAGVFESQVQLMQDDVLKLTEKVNAYRIDIEKTIKENYDSFSSSIREEYTVFE
NEIKNVWNYSEEEVQALKDNLKIQLNSIESEFKDKYNLMIKGIDDHVSQLKLKVLNYDGE
LNHFIDEVKDNLIVYKADLREELDSRYAVMSSKLENFKRLEIELDKNNELMKEVYYFKNN
LEELRETLASEINLIQVYKDDFEGITREIGDIKSKSSDIIEVFNDLKVHQMDIEGIKKDL
TQFLEFYTSFKERYKKFTESYDEMQIYKTKLKEIKEAQSNILDNYDRISNKDSVLKSTLE
SVDKNFDLINEIESRMNILFKESSEFQQSLGEFKGIISELLVNKDLSQEVLSNVQTLKEM
LGEIESKLEYTKNIREKVAKSETRLENLNIAAEERIKTLGILVKTESKYKDNVGLNNETV
RDSVIKLMRQGWSALEISRATKLSIGEVELILELGIISKSDD
NT seq
6789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgtaaccgttttggttaatcttttattggttttcgtgattttatttatt
tataggcagtatgataaacgttcaagagctttagataagattaaaaaatttattgatatt
actaaggataaccttgaagattttattgatgagaagacaaaagagatcaataatcttgct
gttgatatggaagcgtatcaacgttctagtatagagatcataaaaaaaatagatgaggtt
cagcgaaagattaaagataaaagtaatgattttgcagaagttgaaaaaaagatttcttat
catgattctatgcttaaagagctagatgagatggcccttaaagtgcaagataatatacaa
cgacttcaagtggatggaaaaatagtagataaactttcaaaaactttaaaaaattttaat
gttcaaattgattctattgattctagattgagtacagtttttgaaaaattcgataagaca
aataaggaaaatcttgagactattaagattgagagttgggataagtttgataacactatt
aaagattttagtgtgagaatggataatctagatagaaagcttatatcttatcaagaatca
ttggtaatggttgaagagaaaaaaagagaaattttagataaaggtaatgaaaagcttgag
aatgaatttaaagagtttgtgtttaaaattgaatctagcatagataattataataaatca
atggaagattcttttggtatatatgaaactaaatataaatcaatagaaaattctcttgat
cttattgtagagcaagttaggactagaattaatgataaggaagattttattttaactaga
ttgaatgaggagctacagataaaatttgatgaaatctttatgtacgttgatgagcgttct
catcagatgagagataaactcgaaggcaaattagtattaatagacaatgaaatttcttct
ttaagttctgtttttaaagataatgcctattctaggctaaattctcttgaagagactata
agacaagagatgagacagtatgaagagcaattagcagatattttggaacaatttagggtt
caaatcgaatctggtgttggtaatatttataaagagtatgatagtaagataaatcaattt
gataaagacataagagataggatagagagtagtttaaaggatgctaattctaggatagaa
agtgttcagggtggagttaggactttgcttgatgatcttgaagaggattctaataggata
tatgttgaatttaaggaaagagttaaaggggatattgatagttttagtgaaaatgtattt
tcaagaatgaatgatgttggaagtgaattggaattgaaattttcaaatattagtacagat
attcaagatagaattttcaagttggacagtagcttgtctttagagcttaaagaaatgaat
gaaaaatttgttaatgattgttcgcgtttagatggtagcattaacttaaagtatgaaact
ctcttggaagctttgaatttaaaaagtggtgaattagaaacccaactgaaggataagtat
aaaaatattgcagataaatttgaacgtgacattgatgagcttaccattaaatgtgatgag
aaatttagtaaaatttctgaaaaatcagattatgattatcaaagttttgaaattactagt
acaaagctaaaagaaagtataagttctttaaatgatttgttagtgcaagactttgagact
ttaagaggggatttcgaatccaagttgaataaaatgagttctgatattaatgatgaagtg
tttaatttaaaaagtcattatgaagaggatataggtaaatttattaagcagatggaaact
gacaaattgcaatatgaacattggcaaagggaagtaggtttgaatttagaggatactaag
tttcatttaaataaaactaatgaagaatttttaaatttgattgaaacccaaaggagtaag
ggaaaggaacttagtgaaaatattttcaatgaactctcggaacatgttcaaaaaaaagca
atggatatgcatactaattggaaagatgagcttattattttaaataaatctttacttgat
attaagatttcaagcgaagagttacttttatcagcttcttcaaagatcgagtcttttgaa
aaagatgttaatgagagacttgaatatgttacatcaaagactgaggactttgaaagttca
gtattagataagtataaagaattaagaaatatgtcatatagtaacagtgaagagactttg
tcaaggattaaggaatttattgataatcaagccgaaataattcatgacaaaattattatg
atgcttaatggacttaatgagaacttttctaataaagaagagctaattaaaggcaatata
gaagaacttgattatagacttaaagatttcaaagttgaatgtgaagatgctttaaataat
cttagatcgtatcttgatgagtttattgaaactaggatgcaaaaagtttctgaaattaag
atagataatcagaaacagatagataattttttaaataaaatatcggaagagatcttaagt
agaaaagatatgcttaatagtgagatagataataagcttaatgattggcaaggtaagtta
agtgaaatatcagttaatattgaaaatgtattatcttcaggaaagattgatataaactta
attgattctgagatgactttaaagattgatgagcttaagagtacttttgaagggcttgag
agttattatcttgaaaaaatagatgaatttagaaatcaaggaaatgtatatgcagatgag
cttttgaaaaatattatgagccattttgatacggattctaaggatcttgaggaaaattta
tctaagaaatttgctacagttttagaaaggtcagaagagtttgttaaggaagttgatagt
ttgcttaaggataaaaggacagatattgcttcatttcaggcaagtattgatattaccatt
gattctcttaattcaagatttaatgatgtaaatagagaaattaatgaaaaatatagtaag
gtagtatctgattctagagaatattcagaaacccttgcaaataaattagagaatgagata
ggatatgagattgaaaatgtaaatagaaggttaacagacaaaatagagattcttagcaaa
aatatggatgaaaatttagaaaattttaagtcatcttttgatatatcaaagtatcaggtt
gaaaattttgaaattaaaattaaggatataatagaaaaagaagaactaagacttggagaa
ttacttagagaaattgagcgacagtatagagttagacgggaagaggcaattgattacaaa
aaagccatagatagtgatattattcatttaagagaacagtttataggggtaattaatgaa
cttaagaataatattgaggataaatctgagtttttaaatgatctttataaagaaagattc
aggattattgaaaataattttgaagagagatattcaacgttttttattgagagcgaaggg
gctatttcaaagattagagatgaaatatataagatacttacagataatgatgaacatttg
aaagcaaaaatttctgagatggatcgtaattttgagctaatcgatagaaggtcaaaagaa
attctagagcttgaagaagatttaagaaagagaatacaagaagatagtaataacatacat
catcaatttgatgtcattaagtctaatcttgagaaggaaataaaagatcactttgatatg
tatatgatgaaagccgctgctgcaattaatgaagagattgaaaaatatgagcatgggatt
aatgaaaagatatccgctcttaagtcaattgaaaataattttgagatgatagagaagaat
ttaaaggacaaaattaccgaatgtcataatgaattagacaagactcttgatatgagatat
gctgagattgaaagtaaatatgatgagaggcatttgcttgtagaagagaagataaatgac
aaaactaattcagttgaaaagttgattgcaaataagtatgctgagcttgaaggtaagtat
gatgagaagcatctgcttgtagagaagaagataaatgacaagactaattcagttgaagag
ctgattgcaaataaatatgctgagcttgaaggtaagtatgatgagaagcatctgcttgta
gagaagaagataaatgacaaggctaattcagttgaagagctgattgcaaataaatatgct
gagcttgaaggtaagtatgatgagaaacatctgcttgtagagaagaagataaatgacaaa
actaattcagttgaagatctgattgcaaataaatatgctgagcttgatatcaaatattcc
aatatgcaccttgacatggaaaatagattaaatgcatgtatttctgatttaggtatagaa
cttgctcgttcaagtgaaaagatagataaagagattgaagaacaattaaaaaatcttggt
gaacttaagttaaatttgagtaatatcgaaggggatgtattaaaacttaaagaggattct
tatcacaatgtgtcatcccatctcaaacttcttgaagaggatttttttaaagatttgaaa
gaaagaagtgataatttaaaaaattctttagaaaattttgtggcatcctcagatcaaaga
attgaaaatttagagagatatataattaagaatttggaagataaagaaatccttatgaaa
aattttagagttgaaattgaacaagaacttatctttaataaagaaagtttttggtcagaa
tttaataaagagtttgatgttaaaaaaagagatgtagagagtaagatagttgtaatggaa
gctaatgttactaatcgattagatgagtttattaaacttgtagacaatcgtcaaaataat
gttgattcttggttttttaaagttaaagatgatatgataaattggcaagagaatgcttac
aaagagcttgaagaaagagtgggtattacaaaaagaagtttagatgaaattaaaagtgat
gtttctgctattgagagtggcttggaagttgttaaagatgatgttaatcaaagagcaaaa
gaaatttttgatcgtttgcaagcagatattaaggaatttgaaagtagatcttatcttaat
ttgaagaatatttcagatgaggttcaggataaagttttaaatattgaagattgcatggat
tttaagattaaatctataaatgataagatagacttacatgttgaagagcttgtaacacag
gtagaaattaaatttttaagtcagcaaaaagatattgaagataaaattattgaggctaac
gagaagttagaatatgaatttaattcaatgacttctaggcttgatgaggaaaaacaaaat
attgtaagtaaatttttaaatgacgcaggtgtttttgaatcccaagtgcaattgatgcaa
gatgatgttttaaagcttactgaaaaagtgaatgcatatagaattgatattgagaaaaca
attaaagaaaattatgattctttttccagttctataagagaggaatatactgtctttgag
aatgaaattaagaatgtttggaattattcagaagaagaggtacaagctttaaaggataac
ttgaagattcaacttaatagtatagaatctgaatttaaggataaatataatctaatgatt
aaaggtattgatgatcatgtgtcacaacttaagttgaaagtattaaactatgatggtgag
cttaatcattttatagatgaggttaaggataatttaattgtatacaaggctgacttgagg
gaagaacttgatagtcgttatgctgtcatgagttctaagcttgaaaattttaagagactt
gaaattgagttagataaaaataatgagctgatgaaagaggtttattatttcaagaataac
ttagaagaattacgggaaactttagcaagtgaaataaatcttattcaagtatataaggat
gactttgaaggtattactagagaaattggagacattaagtctaaatcatcagatattatt
gaggtatttaatgatttaaaggttcatcagatggatattgagggaattaaaaaagatctt
actcaattccttgaattttatacttcttttaaggagaggtataagaaatttacagaatct
tatgatgaaatgcagatttataaaactaaacttaaagagataaaagaagcacaaagtaat
attcttgataattatgataggattagtaataaagatagcgtattaaagtctacattagaa
tctgttgataaaaattttgatttgataaatgaaatagagagtaggatgaatatattattt
aaagagagttctgagtttcagcagagtcttggtgagtttaaaggcattatatcagaatta
ttggtaaataaagatttatcacaggaagtgctaagtaatgttcaaacgctcaaagaaatg
ctaggtgagattgagagtaagttggaatatactaaaaatataagagaaaaggttgcaaaa
tctgagactcggttagagaatttaaatattgctgcggaagagaggatcaaaacccttgga
attcttgtaaagacagaatctaagtacaaagataatgttggtcttaataacgaaacagtt
agagattctgtcattaagcttatgagacaaggttggagtgccttggaaatttctagagct
actaaattatctattggagaggttgagcttatcttagaacttggaattattagtaaaagt
gatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
