Borreliella finlandensis: QIA19_03420
Help
Entry
QIA19_03420 CDS
T09223
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bff
Borreliella finlandensis
Pathway
bff03030
DNA replication
bff03430
Mismatch repair
bff03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bff00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
QIA19_03420 (dnaE)
03430 Mismatch repair
QIA19_03420 (dnaE)
03440 Homologous recombination
QIA19_03420 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bff03032
]
QIA19_03420 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bff03400
]
QIA19_03420 (dnaE)
Enzymes [BR:
bff01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
QIA19_03420 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
bff03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA19_03420 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bff03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA19_03420 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
GHMP_kinases_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKC90083
LinkDB
All DBs
Position
591420..594905
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MLKIKFYFDKIILGMSFRSRFIHLHVHSDYSLLDGAAKISDIISKAKKCNMSHIALTDHG
NLFGAIKFYKEAKKAGIKPIIGIEAYMAKTSKFLKKQDDLGKMSYHLILLAKNELGYKNL
LKLTSISYLEGFYYRPRIDKEDLEKYSEGLICTSACIGGLIPRLILANRFEDAKNEILWF
KKVFGNDFYLELQRHGIKDQDIVNERLVKYSRELGVPLTAANDSHYVNREDATAQDIIVC
IGTGAKKSDENRLKMETNEFYIKSQEEMCELFNDLPEALENTVRIAEKCDDFKITFPGPI
LPDYQIPVEFNTLGEYLEHLTLEGLKFRYKNLTSKIKDRAFYELSVIIGMGFEGYFLIVW
DFIKFAHDNDIPVGAGRGSGAGSIVAYALRITDIDPLKYNLLFERFLNPERISMPDFDID
FCFEGRDEIIKYVTNKYGEDKVAQIITFGTLKPKAVVKDVARVLDIPFAESNELTKFIPD
GPKVSLKEVLDDNSLKEYFTSKPVYKELMNAALVLEGMNRHASTHAAGIVISKTPLTDYV
PLYKDYKQGSVSTQYTMDLLEECGLVKMDFLGLKTLTLIKNAENLIRSVNPDFKIKNIPD
NDVKTFNMLGEGRSASVFQFESEGMQQILKDAKPDSIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFIA
AKKGVKRIKYPHPDLKEVLRPTYGVIVYQEQVMEVAKIIGGFSLGKADILRRAMGKKKED
EMNEMKVDFLRGAIEKGYDKEIASEIFELLKPFSGYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANY
PEYFMAANLTNEINNNDKLSYYIEESKAIGINVLKPDINRSFREFRVTDSGISYGLNGIK
NLGGIVVDLIIDEREKNGKYSSFEDFIRRVDDKVINKKFLESAIKSGLFDSLDQNRKTLF
ENLDRLIEVVSEDKNNKKLGQNSLFGALESQDPIRQSFNYQAFKEYSYSELLGFEKELLG
FYVSGHPLDPYKKAIDSFSSLNVLTDLAAKKDSIVQFSGILNSVKVIQTKRNNAKMAFGV
IEDFKGAIDIVVFTESYERYRNFLLEGNVIGVVGRLTFNRDKFSIVVEKVVNIERLSEDK
INNIHIKFLNNKLNDLQLLNSLKESISNFEDNSGFSNVYFYLRENGKDLKLKMNSILNFV
PDEDKLDKLRKCVIVEDVWVD
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaaaaatcaagttttattttgataaaataattttaggtatgagttttaggtctagg
tttattcatcttcatgttcattcagattattctcttttggatggagctgcaaaaatatca
gatattatatcaaaagcaaaaaaatgcaatatgtcgcatattgcattaacagatcatggc
aatctttttggagctattaaattttacaaagaagctaaaaaagcaggaattaagccaata
attggcattgaagcctatatggcaaaaacttctaagtttttaaaaaaacaggatgatctt
ggaaaaatgtcttaccatttaattttgcttgccaagaatgagttgggttataaaaaccta
ttaaagttaacaagtatttcttatcttgaagggttttattatcgtccaaggatagataaa
gaggaccttgaaaaatattcagaaggtttgatttgtacttcagcttgcattggggggctc
attccaagacttattttggccaatagatttgaagatgctaagaatgaaattctttggttt
aaaaaagtttttggcaatgatttttatcttgagcttcaaaggcatggtattaaagatcaa
gacattgtaaatgaaaggttggttaagtattctagggaacttggagttcctttaacagca
gccaatgattctcattatgttaacagagaagatgcaactgctcaagacatcattgtttgt
attggtactggcgctaagaaaagcgatgagaatagattaaaaatggaaaccaatgaattt
tatattaaatctcaagaggaaatgtgtgaactttttaatgatttgcctgaagctttagaa
aatactgtaaggattgcagaaaagtgtgatgattttaaaataacttttccaggccctatt
ttgcctgattatcaaattcctgttgaatttaatactcttggtgaatatttggaacatctc
acacttgaggggttgaaatttagatataaaaatttgacaagcaaaataaaagatagagct
ttttatgaattgagcgtaataattggaatgggctttgaaggctattttttgattgtttgg
gattttattaaatttgctcatgataacgatattcctgttggagctgggcgtggttctggt
gctggttcaattgtggcttatgctcttaggattactgatattgatcctttaaagtataat
ttgctttttgagagatttttaaatcccgagcgtatttctatgcccgattttgatattgat
ttttgttttgaaggcagagatgagattataaaatatgttaccaacaagtatggagaagat
aaggtagctcaaataattacttttggaaccttaaagcctaaggctgtagttaaggatgtg
gctagagttttagatattccatttgctgaatcaaatgaacttactaagtttattcctgat
ggtcctaaagtttctttaaaagaggttttagatgacaattctttgaaggagtattttact
agcaagcctgtttataaagaattaatgaatgccgcattggttcttgagggaatgaataga
catgcttcaactcatgctgcaggaattgtaatttctaaaacccctttaaccgactatgtg
cctctttataaggattataagcaaggttctgtttctactcaatacacaatggatttgctt
gaagaatgtgggcttgttaagatggattttcttggtttgaaaacattgacgttaataaaa
aatgcagaaaatcttattagaagtgtaaatccagattttaaaataaaaaatattccagat
aatgatgttaagacttttaatatgctaggagaaggaagaagtgcgtctgtttttcagttt
gaatctgaaggaatgcagcaaattctaaaagacgcaaagcctgatagcattgaagattta
atagctttaaatgctctttatagaccaggtcctatgcaatttattcctcaatttattgct
gctaaaaaaggtgttaagagaattaaatatcctcatcccgatttaaaggaagttttaaga
ccaacttatggggttattgtttatcaagaacaagtaatggaagttgcaaaaataattggg
ggcttttctcttggcaaggccgatattttaagacgtgctatgggtaaaaagaaagaagac
gagatgaatgaaatgaaagtcgactttttaagaggcgctattgagaaaggatatgacaaa
gaaattgctagtgaaatttttgaacttttaaagcctttttctgggtatggatttaacaaa
tcgcatgcagcggcgtattctttaatagcatatcaaaccgcttatcttaaggctaattat
cctgaatattttatggctgccaatttgaccaatgaaattaataataatgataagctttct
tattacattgaagagtcaaaagctataggtataaacgtgctcaagcccgatataaatcga
tcatttagggaatttcgtgtaactgattctggaatttcttatgggcttaatgggattaaa
aatcttggaggaattgttgttgatttaataattgatgagagagaaaaaaacggcaaatat
agttcttttgaagattttataagacgcgtagatgataaagtaattaataagaaattttta
gaatctgcaataaaatctggactttttgatagtttggatcaaaatagaaaaactttattt
gaaaatcttgatcgtttgattgaagttgtttcagaagataaaaataataaaaaacttggt
caaaacagcttatttggtgctcttgaaagtcaagatccaattcggcaaagttttaattat
caagcctttaaagagtattcttattctgagcttttaggatttgaaaaagagcttttagga
ttttatgtgtcaggtcatcctcttgatccttataaaaaggcaattgacagtttttccagt
ttaaatgttttaacagatcttgctgccaaaaaagatagcattgttcaattttctggcatt
ttaaattcagtaaaagttattcaaactaaaagaaataatgcaaaaatggctttcggtgtt
atagaagattttaaaggcgcaatagatattgtagtttttacagaaagctatgaaagatat
agaaattttttacttgaaggcaatgttattggggttgtgggtaggcttacgtttaacaga
gacaaattttcaattgtggttgaaaaagttgtaaatattgagagactttccgaagataaa
ataaataatattcatattaagtttttaaataataaattaaatgacctacaattacttaat
tctttaaaggaaagtataagtaattttgaggacaattctggattttcaaatgtttatttt
tatttaagggaaaatggtaaagatttgaaattaaaaatgaattcgattttaaattttgtg
ccagatgaagataagcttgataagttgagaaagtgtgtgatagttgaagatgtttgggtt
gattag
DBGET
integrated database retrieval system