Bacteroides fragilis 638R: BF638R_4259
Help
Entry
BF638R_4259 CDS
T01691
Name
(GenBank) putative outer membrane protein
Organism
bfg
Bacteroides fragilis 638R
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW24681
UniProt:
E1WQQ5
LinkDB
All DBs
Position
complement(5017196..5019175)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MKKILLALLTSCALVSCEGYFDQLPKTELPSETFYTSYDAALRNVAILYANAGHVNDGIM
TSDRFMMPSLMNEGPFDLTSTSGSVLNLWSKHYAYIAQANLILERLETNKEVIDENAGHS
ALDKATITGSATEMLMGEVRFLRAYAYFTLYRYYGGVPLIIEPTGPKPDYVPRATRQEMF
KFLYDEMAYALDKCLDNRSGIAYGRVTKGAVAGMLAKMKIFHASYIRRAEMYGNKINETT
ADDVDKTTLYADAVKLCDDIIAGVYGTYKLEEYFPAVFTKRNNEIMFSVLAEEGVGTGNK
IPMGFAGEGKYGATGGRNLTSWLTLLYDIPMWEHNYSFKDVCMDYGQVDRFNAESPKPGT
TPYDLQNLYDRTGKYTITGDITRRMWSSVKGWVTGPNSGGAPIGLWVFEPAGRELGPEFY
IEPGKVNDYTEEQLKVMDVALESHERAWWKNETNGQNKPNLWNCNWWQLGKFRNLNPSEL
SSTFDINYGGVDYPVLRLAEIYLLKAEAQIMQGHVSEGVKTMNIIRDRACHQGSIKDMFV
SQGDAPYTYQPGSVMMIPTNISPANALKELMYERLRELAAEDDCGWLDVARFPDVSMVDL
ADICRYRDPLQFFDPFGDPARGEYLWHLFNEEKVYRVLMPIPFTELSFFPEMKQNPGYF
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatattattagcccttttaacctcttgcgccttagtgtcgtgtgaggggtat
ttcgaccagttaccgaaaacagaacttccgtctgaaactttctatacttcctatgatgct
gctttacgtaatgtagctatattgtatgctaatgcagggcatgtcaatgatggaattatg
accagtgaccggtttatgatgccttcattgatgaatgaaggtccgttcgacctgacttcg
acatcgggtagcgtactgaatttgtggtcaaagcattatgcgtatattgcacaggcaaat
ctgatacttgagaggctggaaaccaataaagaggtgattgatgagaatgcaggacattct
gcattggataaagctacgatcaccggatcagctactgaaatgctgatgggagaagttcgt
ttcctccgggcttatgcttactttacattgtatcgttattatggcggtgtacctctgatt
atagagcctaccggaccgaagccggattatgtgccgcgagcaacccgccaggagatgttc
aagttcctctatgacgagatggcctatgcattggacaagtgtttggataaccgttcgggc
attgcttatggtcgtgttacgaaaggtgccgtagccggtatgttggcaaaaatgaaaata
ttccacgcttcttatatccgccgtgcagaaatgtatggaaacaagattaatgaaacaaca
gctgatgatgtagataagacaacgttatatgctgatgcagtgaagttgtgtgacgatatc
attgccggtgtgtacggaacttataagttggaagaatatttccctgctgtatttaccaaa
cgaaataacgagattatgttcagtgtattggcagaagaaggagtcggtacaggaaacaag
atacctatgggttttgccggtgaaggtaaatacggagcaaccggtggaagaaatcttact
tcgtggctgacgttgctgtatgatataccgatgtgggaacataattacagtttcaaggac
gtgtgtatggactatggccaggtagatcgtttcaatgccgaaagtccgaagcccggaacg
actccttatgacttgcagaatctctatgatcgtaccggaaagtacaccataactggagat
attacccgtcgtatgtggagttcggtgaaaggctgggtaaccggtcctaacagtggtgga
gctcctatcgggttgtgggtgtttgaacctgccggacgtgaattaggccccgagttttat
attgagccgggtaaggtgaacgattacaccgaagaacagctcaaagtaatggatgtagct
cttgaaagtcatgaacgggcgtggtggaagaatgaaacgaatgggcagaacaagcctaac
ttgtggaactgtaattggtggcaattaggtaaattccgtaacctgaatccgagtgagttg
agttcaacctttgatattaattatggtggagtggactatcctgttttacgtttggcagag
atttacttgctgaaagcggaggcacaaatcatgcagggccatgtttcggaaggagtgaaa
acgatgaatattatccgtgatcgtgcttgccatcaaggatctattaaagatatgtttgtt
tctcagggagatgctccttatacttatcaaccgggttcggttatgatgattccgactaat
atcagtccggctaatgcactgaaagagttgatgtatgaacgtttacgcgaattggcagcc
gaggatgattgcggatggctcgatgtagcacgctttcctgatgtttcaatggttgacctg
gctgatatctgccgttatcgcgatcctctacaattctttgatccgtttggtgatccggcg
cgtggggaatacctttggcatctttttaatgaagagaaagtgtaccgtgtgctgatgccg
ataccgtttaccgagttatcgttcttcccagaaatgaaacaaaatccgggatatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
