Butyricimonas faecihominis: F1611_00415
Help
Entry
F1611_00415 CDS
T09480
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
bfh
Butyricimonas faecihominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
TTR_TEN1-4
STN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOF06973
LinkDB
All DBs
Position
117749..121150
Genome browser
AA seq
1133 aa
AA seq
DB search
MEKNEDVGLFYWKSRIKKMLLLMKLICFWILVGLMQVHATAYGQAESVAFEKKSLTIDQV
FSTITTQLKYDIFYSDDEIDVAKVVRLPNLTVNVEDVLRLVLGEHFTYQFVGKTIVIAPK
TEIPQNQKGLQLRGFVSDTKKQPMPGVTVKLVGTSIGTATNMDGWFQLPDIPANAGTLEF
SFVGYKSQKVNFTANTRDTLRIVMEEDVTEVDEVVVTGMFTRKANSFTGAAQSFSREEIR
RVGNTNVLQSIKNLDPSFRIAESLANGSNPNQQYEITMRGQSGFPDLKGEYSSNPNNPLF
IVDGFEQSLTYVMDMDMNRVASVTLLKDAAAKAIYGSKAANGVVVIETLQPEKGKLRVSY
TGTMNVQLPDLTSYDLCNAAEKLEVEFNAGKYTYFRDNGSSIWGNPVEQYSWDQVYNGLM
KEVIAGVNTDWKSIPLRNGIGQKHAIYLEGGDDFFRYGLDVSYNNVVGVMKGSNRNTFSG
GVTLSYRYNNIMLKNSFSVTYNKGENSPYGSFSEYTSMNPYYRCWDDDGNVIKILGERLG
TYQNTNVYNPVWNATINTKDFSEYTQFVNNFYVEWTPARGFKFTGRVSLNKSDTGSEIFH
PASHTDFIGWEEDEEKIYRRGSYIYGDGKSFAVSADVLANYSVQLGERHMIFANVGWSLN
NSTSESVTFKAEGFSNDKLDNLAFARQYYKDGRPSASESTTRDIGFVGAANYSYDNRYLF
DASFRLSGSSQFGSDNRWGTFWSLGLGWNLHQEKFFHSLTDSGILSQLKLRGSLGYTGSQ
NFNSYQSIATYSYYTSSAYNGNIGAVLAGMPNSRLKWQRKYDRNLGVDFGVFNGRLQGRF
DYYSTVTDDLLTDVTIPSSTGFTSYKENLGKVENIGYEISLKYRVWQEQSKDAFLNIFVA
ASHNKNTIKQISNFLQTYNDTQTSSVSNKPITRYEEGQSMSAIWAVKSMGIDPACGDELF
ITSEGTRTYEWDSDNLQICGDTEPTLQGNLGFNFDYKGISLNVTARYQFGGQVYNQTLVD
KVENANLENNVDRRIFSDRWVKKGDVSLYKNIKNEETTQATSRFVEDDDQFVISSLNLSY
ELTRIEAIKRIGMERLRLSFDMADFGRMQSVKIERGTSYPFARTFSFSLQVMF
NT seq
3402 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaaatgaggatgtaggtttattttactggaaaagtagaataaaaaaaatgtta
ttgcttatgaagctgatttgtttttggattctagtcgggttgatgcaagtgcatgcaacc
gcttatggtcaggccgagagtgtggctttcgagaagaagagtctgacgattgatcaagtg
tttagtacgataaccacgcagttgaaatacgacattttctacagcgatgatgagattgac
gtggctaaggtggttcggctcccaaatttaacagtgaatgtggaagacgttttgcgtttg
gttcttggagaacattttacctatcaatttgtcggtaagactatcgtgatagccccaaaa
actgaaatcccgcagaatcaaaagggacttcaacttagaggttttgtatcagacacgaaa
aaacaacctatgccgggcgtgacggttaagttagttggaacttctatcgggactgcaact
aacatggacggatggtttcaattgccggatattcctgcgaatgcgggaactttagagttt
tcttttgttggttataaatcgcaaaaagtaaattttacagccaacacgagagatacttta
cggattgtgatggaagaagatgttacagaagttgatgaggtcgtggttaccggtatgttt
acgcgcaaagcgaatagttttaccggtgcagcccaatcgttttctcgggaggaaattcgt
cgggtaggaaatacgaatgtattgcagagtatcaagaatcttgatccctcctttcgtatc
gcagaaagtcttgcgaacggttcgaatccgaatcagcaatacgagatcacgatgcgtggg
cagtccggtttcccagatttgaaaggagaatattcatcgaatcctaataatccgttattt
attgttgacggttttgagcaatcgctaacttatgtgatggatatggatatgaatcgtgtg
gctagcgtgacacttttgaaagatgctgcggccaaggccatatacggatcgaaagctgcc
aatggggtggtagttattgaaacgttacagccggaaaagggaaaattgagagtgagttac
acgggcacaatgaacgttcaacttccagatttgaccagttatgatctttgtaatgcagca
gaaaagttggaagtagaattcaatgcagggaaatatacctatttcagggataacggttcg
tctatatggggaaatccggttgaacaatattcatgggatcaggtctataacggactgatg
aaagaggtaattgccggggttaataccgattggaagtcgataccgttacgaaatggtatc
gggcagaaacatgctatctaccttgaaggaggggatgattttttccggtatggtctggat
gtttcatataataatgtggttggtgtgatgaaaggttctaatcggaacacgttttctgga
ggtgtgacactttcataccggtataataatatcatgctaaagaatagtttttcagtaacc
tataataagggagagaattctccgtatggttcatttagtgaatatacctcgatgaatcct
tattatcgttgttgggatgatgatggtaacgttataaaaatacttggagaacgtcttggt
acatatcaaaatacgaatgtttataatcctgtatggaacgccacgatcaacacgaaggat
ttttccgaatacacgcagtttgtaaataatttctacgtggaatggacgcctgcacgagga
tttaaatttaccggacgggtgagtttgaacaagagcgatacgggtagtgaaatatttcat
cctgcatcacacacggattttatcggttgggaagaggatgaagaaaagatttatcgacgc
ggtagctatatctatggtgacggaaaatcttttgcggtgtcagcagacgtgctggcaaac
tattccgtgcagctaggtgaaagacacatgatttttgctaacgtgggatggagtttgaat
aattctacatcggagtcggtgacctttaaagcagaaggattttctaatgataaacttgat
aatttagcttttgcacgacagtattataaagatggacgtccctcagcctccgaatctact
actcgtgatattggttttgtcggtgctgcgaactactcttacgataatcgatatcttttt
gatgcgtcgtttcgtttgtccggttcatctcaattcggtagtgataatcgttggggtaca
ttctggtcgttaggtttaggatggaatctgcatcaagaaaaattctttcattcattgacg
gattcaggtatcctttcacagttgaaacttcgtggttctttgggatacacgggttcacaa
aatttcaattcgtaccagtcgattgcaacttattcctactacacgtccagtgcttacaac
ggtaatatcggagctgtcttggctgggatgcctaattctcgtttgaagtggcaaagaaaa
tatgatcggaatctcggggttgattttggtgtgtttaacgggaggttacaggggcgtttt
gattactattcgacagttacagacgatttattaaccgatgtaacgattccttcttctact
ggatttacttcatataaagagaatttgggaaaagtggagaatattggttatgaaatcagt
cttaaataccgggtttggcaggagcagtcgaaggatgctttcctgaatatatttgtggcc
gcatcacataataaaaatacgatcaaacagatttctaactttttgcagacgtataacgat
acccaaacgtcctctgtttccaataaaccgattactcgttatgaggaagggcagtctatg
tcagcgatttgggcggtgaaatcgatgggaatcgatcccgcgtgtggagatgaacttttt
ataacatcggagggaacacgcacgtatgaatgggattccgataatcttcagatttgtggg
gatacagaaccgacacttcaagggaatcttggatttaattttgattacaagggaattagt
ttgaatgtgactgcccgttatcagttcggaggacaagtgtataaccagacattggttgat
aaggtagaaaatgcgaacttggaaaacaatgttgatcgtcgaatcttttctgatcgttgg
gtaaagaagggagacgtgagtttgtataaaaatataaagaatgaagagacgactcaagca
acttcccgctttgtcgaggatgatgatcagtttgtgatttcatctcttaatctttcttac
gagttgacgagaattgaagcgattaaacgtatcgggatggaacgtcttcgactttcgttt
gatatggctgatttcggacgaatgcagtccgtgaaaatagaacgaggaacttcctatccg
tttgcacgtacgttctcgttttcgcttcaggtaatgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system