Bacteroides finegoldii: BFINE_41530
Help
Entry
BFINE_41530 CDS
T09648
Name
(GenBank) PAS domain-containing sensor histidine kinase
Organism
bfin
Bacteroides finegoldii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
PAS_3
PAS_9
PAS
HATPase_c_2
Topoisom_I_N
PAS_4
HATPase_c_5
Ig_Shg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDW78358
LinkDB
All DBs
Position
complement(3542976..3544850)
Genome browser
AA seq
624 aa
AA seq
DB search
MNKQKDFIFFSKLMNAADMGWWKADLTTLNYECSEYISELLGLDDSGIISFEDFNKRILK
EEQRPTTVHSFSEQQMSEVVYLLDTVKGAVWVRSKVCFQETDKEGHTNVYGIAELQEAPN
MTSAYQALQHSERILHNIYKHLPVGIELYNEDGILIDLNDKEQEMFHLEKKEDLLGLDIF
KNPMFPEEMKERLRRNEDADFTFRYDFSKIGSYYKNSKREGTIDLVTKVTTLYDDEGNPI
NYLLINADKTETTIAYNKIQEFEEFFELVGDYAKVGYAHLNLLTGEGYAQKSWYRNIGEA
DGTPLSDIIGIYRHLHPDDRNCMVQFFEDVRNGLTAKLSKEVRVLRSNGEYTWTHVNLLV
RKYIPQDKIIELISINYDITELKKTEEMLVKARDKAEASDRLKSAFLANMSHEIRTPLNA
IVGFSALLAATEDMAEKELYNSLISHNNELLLELINDVLDLSKLESGYLELHPSWFNLAE
LLDESVAEYTRQLAAGVELRTHYLDQGFLVELDRLRIKQILNNFLSNALKNTTSGYVEVF
YEIDSSYVRIGVRDTGRGIPQNMLEKIFERFEKVDSFTQGAGLGLPICKSIVDKMNGRIW
ADSQLGIGTTFMVELPCSVTPIDA
NT seq
1875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaacagaaagattttatatttttttcaaaattgatgaacgctgctgacatgggt
tggtggaaggctgatctgacaactttaaattatgagtgttcggagtatatctcggaattg
ttgggtttggatgattcgggtattattagttttgaagattttaacaaacgcatattgaag
gaggagcaacgccctacaacagttcattcttttagtgagcagcagatgtcggaagtagtg
tatttacttgatacggtaaaaggggctgtttgggtgcggagtaaggtctgctttcaggaa
acggataaagaagggcatacaaatgtctatgggatagccgaattgcaggaggctcctaat
atgacatcagcttatcaggccttgcagcacagcgaacgcatcttgcataatatttataag
cacctgccggtcggtatcgaattatacaatgaggatgggatattgatagatttgaatgat
aaagagcaggagatgttccatctcgagaaaaaggaggaccttttaggacttgatatcttc
aagaatccaatgttcccggaagaaatgaaagagcggttgagaaggaatgaagatgcagac
tttacatttcgttatgacttctctaagatcggttcatattataaaaattccaaaagggaa
ggtacgattgacctggtaactaaggtaacgacactgtatgatgatgagggcaatccgatt
aattacctgttgatcaatgctgataagacagaaacgaccattgcttataataaaattcag
gaatttgaagagttttttgagctggtgggagattatgccaaggtaggatatgcccatctt
aatcttctgaccggagaaggttatgcccaaaagagttggtataggaacatcggtgaagcg
gatggaacgccgttgtccgatatcattggtatctacagacatctccatccggacgaccgt
aattgcatggttcaattctttgaagatgtacgaaacggattgacggctaaattaagtaag
gaagtgcgtgtccttagaagcaacggtgaatatacatggacgcatgtcaatttgttagtt
cggaaatatatcccgcaagataaaattattgaactgatcagtataaattacgatataacg
gagttgaaaaagacagaggaaatgcttgtcaaggcgcgtgataaagccgaagcgtccgac
cgtcttaaatcagcttttctggctaatatgagccatgagattcgtacgccgttgaatgcg
attgtcggcttttcagccctattggcagctacggaggatatggctgaaaaagaactctac
aactctctcatcagtcataataatgagcttctgttggagctgataaacgatgttcttgat
ttgtccaagttagaatccggttatctggagctgcatccgagttggtttaatctggcagaa
cttttagatgaaagtgttgcggaatatactcgtcagctagctgcgggagttgaacttcgg
acccattatcttgatcagggttttctagtagaattggataggttgcgaatcaagcagatc
ttaaataattttctttccaatgctctaaagaatacgactagtggatatgtggaggttttt
tatgagatagattcgtcctatgtgcggatcggtgttcgagataccggtcgtggtattcct
cagaatatgttggaaaagatatttgaaagatttgagaaagtcgactctttcactcaggga
gctgggttaggtttgcctatttgtaaatctattgttgataagatgaacggacggatatgg
gctgattcccaattgggaataggtactacttttatggttgagttgccttgttctgtcact
ccaattgatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
