Branchiostoma floridae (Florida lancelet): 118409491
Help
Entry
118409491 CDS
T01074
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
bfo
Branchiostoma floridae (Florida lancelet)
Pathway
bfo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bfo00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
118409491
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bfo00536
]
118409491
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bfo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
118409491
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
hEGF
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_PEAR1L
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118409491
NCBI-ProteinID:
XP_035666436
UniProt:
A0A9J7HVM7
LinkDB
All DBs
Position
2:16185787..16253384
Genome browser
AA seq
2621 aa
AA seq
DB search
MEINTVFRWCYCCLITFVGYGLVTGEQEFLEESDVGRVKRTGKSASVLTGPNVCGSRFQS
YCCPGWRTLPSGNQCIVPICKNTCGEGYCSRPNSCTCPGGKTGPACSGGGSGIGGVGISF
CTRRCFNGGTCGGSQCSCPGGFIGPHCGQPVCSEGCLNGGRCVGPNRCACVYGFSGPRCE
KDYRTGPCFTKVENQMCQGQLSGVVCTKTLCCATIGRAWGHPCEQCPAQPQPCRRGFLMH
QKSGDCVDIDECQAIPNLCQGGLCINNPGSFVCQCGEGYRRDPQDGKCVDVNECDTIPNL
CAGGECTNTKGGYMCTCPDGYVINAGGTKCIDQRQDVCYREFTTPGRCVNALPVRTTYRD
CCCEQRGRGWGSPTCQLCPETSEDEFPQLCLVDEVIGPTYPGGVIPGRPGTGIPGFPGGN
LIPGRPDGPQFPDGPGPVGPVGPGEVIPGTPGGPDGPRPGGPGGTGTGPFEENVCQQFRN
LCLHGRCVDTIGSYTCACDDGYRLDAVSPACVDLDECVESPCVNARCQNLLGSFRCECDQ
YYLTLDPTGRTCLDERRGTCWLAIRDGRCEENINGETLKEDCCASLGAAWGSPCEPCEKD
PSKRKCALGYTYQNGVSCEDVNECEVFPNICDNARCVNTPGSYRCECSPGLTLDNSGRRC
IDARQEFCYLEYRYGQCQRELPIPVRTSICCCSIGSGWSEDCISCPRPGTDKFNELCPKG
PGFAQQPPKGGDILDGGLFFQDINECVMFPSLCHHGRCRNTIGSFRCECEEGYDLDHAGR
NCTDIDECGIAFGICGNGTCVNLEGNFMCNCNPGYESGFMGMRTCMDINECERNRHLCRG
GVCINTPGSYKCNCPAGHELNSAGTACKDIDECSMNSDVCSNGRCINVMGSFQCLCSKGY
SETDNRRSCEDFDECSVNNGGCQTSCTNIVGSFECSCEQGYVLGPDKRRCMDVDECADTP
DLCGGGMCTNEPGTYSCNCIDGFITEPSGKMCMDVDECDLNPNICQNGQCENTRGSFTCL
CDPGYSVKGEGEGCTDDDECELGLAQCDIHADCSNTDGSYICICRKGYIGDGVICNDLDE
CLEGTSTCDPNGNCMNIPGSYTCECKQGFQGDGFFCRDLDECAINGRLCENGQCLNIPGS
YSCDCDMGFVPHNRDRECIDINECASFDGNICVNGECMNLLGTFKCMCDMGYELDKSGGN
CTDQNECNLKEKCLNGICTNFPGGYTCDCPPNFISNTAGTGCVDPRRGLCYFDYQERGDV
EVCTQDVGSDMSRAACCCSLGQAWGDPCEPCPPVNSTEYNTLCPGGEGFKPNDVTVILED
IDECMELVGLCQGGMCVNTFGSFTCECPRGFTLDRDSRTCNDIDECLIDPTICGAGTCLN
TIGNYTCVCPNGHMAINGGRSCMDMRKSFCFAMVKGGRCENPTSFNLTERSCCCSVGAGW
GDPCITCPVERTDPFIELCGSPDKGVVIDPNTGEAIDIDECQTIPDLCQNGICINSVGSY
RCECPSGFQFSSDLLICEDINECFLGQNPCDPSAVCVNIPGSVKCGCDPGYKLLPNQISC
RDVDECTEQPGICGQGRCTNLLGSYNCFCDNGFRLSEDRSTCEDVDECGRFPGMCGNGTC
QNTLGSYNCFCFGGFKLTDNNDCIDIDECSVLSSICMQGFCQNVPGGFNCICDLGFEQSP
DGRNCIDIDECRVPGTCGSGTCRNTDGSFYCECYDGYRINPRGDFCEDINECELPGRCQN
GECQNYDGGFQCTCPDGFQLDDDGNKCMDMRESYCFNKFEASQCRTPRAMNTTKMKCCCS
MGAGWGDPCEVCPDKEDDPEGFSVLCPGGAGFEVNGGNLLVDINECGIDPLNICNGGTCV
NTDGSFRCQCTPGYLLDDTGLNCIDADECAIGNPCGNGTCTNVIGGFECDCFGGFEPGPM
MMCVDVDECAYDGTLCAFRCLNVPGSYKCTCPRGFTLTADGKHCRDLDECSSPALNDCPP
TLRCKNFVGTYQCLCPEGYTKVGITSDVCVDIDECTLGGKCENGVCVNTRGGFRCDCFDG
YEVSLDGKQCYDRRQGYCYTSRSRLCIREFQGPETVTKAECCCDGGGAWGSDCEACPRKG
SVDFSNTCPHGPGFTPDGQDIDECKVRPNLCENGECVNTLGSYKCMCEEGFVEDFSGQKC
VDVDECEEDKPCSFTCKNTEGSYLCTCPKGYILNADGKTCQDLDECDAKGDNCQYICVNL
VGGFTCQCPPGFNQIHLTCVDVNECNAQAGVCGVNGQCQNMEGSYQCQCSQGFNLDPDTQ
QCQGMSVAANVNECDGTHRCQSGCQNTVGGFRCGCPPGFVQHYYWNQCVDDNECVNGNTC
GGATCYNTVGSFKCACPSGYNFDQSSGGCRDINECGSPSNPCSFGCSNTDGGYSCGCPPG
YFRIGQGHCVSTLGIGPVGGPGKSIDSGSNSDTCYECNLNNVEHQRRKRAVNGSEEIVVD
DGDDSEEATDSPDTEEPDKNMIIEDQPAKDVNNVDTNKDAMLEDAETKKVVDGVQTPITL
RVKLHNAHPKRRLLKIQPALDYLVGRAHYKIVDGNNEGLFTIVEGRKVSSLQFARELDTS
GVYNLQIAEYIDGQTKEENEAVEELEREKPLFMRVTVLILQ
NT seq
7866 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagataaacacggtcttcagatggtgctattgttgtttgataactttcgtcggatat
ggactcgtgacgggtgaacaagagtttctggaggaatcagacgttgggagagtaaaaaga
actggcaaaagtgcttcagtattgacaggacccaatgtgtgcggctcgcggttccaatca
tactgctgcccgggatggagaacgctgcccagcggtaaccagtgcatagtccctatttgt
aagaacacatgtggggaaggctactgttccagacccaactcctgtacctgtcctggaggg
aagaccgggccggcctgttctggaggtggttcaggtattggtggtgttggtataagcttt
tgtaccagaagatgctttaacggagggacctgtggcggatcgcagtgtagctgtccggga
ggattcatcgggccccactgtggacagcctgtgtgttcggaggggtgcctgaatggtggg
cggtgtgtgggaccaaacaggtgtgcctgtgtctatggattttctgggccaagatgtgag
aaagactacaggacaggaccatgtttcacgaaagtggagaaccagatgtgccaaggacag
ctctctggtgtggtgtgtaccaagaccctgtgctgtgccaccattggccgagcctggggc
catccatgtgagcagtgccctgcgcagccgcagccatgccgcagaggcttcctcatgcac
caaaagtctggggactgtgtagacatcgacgagtgccaggccattcccaacctgtgtcag
ggaggcctgtgcatcaacaatcctggctcctttgtttgtcagtgtggagaaggctacagg
agagatcctcaagatgggaagtgtgtggatgtcaatgagtgtgataccatccctaaccta
tgtgctggaggagagtgcaccaacacaaagggaggctacatgtgtacatgtcccgacggg
tatgtcataaatgctggtggcaccaagtgtatagatcaacgtcaggatgtttgctacaga
gagttcaccaccccaggaaggtgtgtgaatgctctgcctgtccgcaccacctaccgggac
tgttgctgtgagcaacgtggcagaggctggggatcaccaacatgtcagctctgtccagag
acctcagaggatgagtttcctcaactttgccttgtggatgaggttattgggccgacatat
cctggtggagtgattcctggtagaccaggcacaggcataccaggctttcctgggggaaac
ttgattccagggaggcctgatggaccgcagtttcctgatggaccaggacctgttggacct
gttggaccaggagaagtgattccaggaactcccggtggacctgatggaccacgaccaggt
gggccaggtgggacaggaacaggtccttttgaggagaatgtttgccagcagttccgtaac
ctgtgcctccatggcaggtgtgtggacacaatcggctcctacacctgtgcctgtgatgat
gggtacaggctagatgctgtcagcccagcttgcgtggatttggatgagtgtgttgagtcg
ccttgcgtgaatgcaagatgtcagaacttacttggcagcttcagatgtgagtgtgaccaa
tactacctgactctggaccctactggaagaacatgcctggatgaacggcgtggcacgtgt
tggttggctatccgagacgggcgctgtgaagaaaacatcaatggagagactctgaaggag
gactgctgtgcctcattgggggcagcatggggcagcccctgtgagccatgtgagaaggat
ccgtcaaaacggaagtgtgcacttggatacacttaccagaatggcgtgtcttgcgaagat
gtgaatgagtgtgaagttttccccaacatttgtgacaatgccagatgtgtcaacactccc
ggttcctaccgttgtgagtgttcaccaggcttgacactggacaattcaggaaggaggtgt
attgatgcccgtcaggagttctgttacctggagtaccgttatggccagtgtcagcgggaa
ctccccatccctgtacgcacgtccatctgctgctgctctatcggatcaggctggagtgaa
gactgtatctcttgtccccgcccaggaacagataagttcaatgaactgtgtcccaaggga
cctgggtttgctcagcagccaccaaaaggaggagacattctggatggaggcttattcttc
caagatatcaacgagtgtgtgatgttcccgtcactgtgtcaccacgggcgatgtcgcaac
accatcggcagcttccgctgtgagtgcgaggagggctacgacttggaccatgcaggcagg
aactgcacagatattgatgaatgtggcattgcttttggcatctgtggcaacggtacctgt
gtcaacctggagggcaacttcatgtgtaactgtaaccctgggtatgagagtggcttcatg
ggcatgagaacttgcatggatatcaatgagtgtgagaggaatcgacacctgtgcagaggg
ggcgtctgtatcaacacacctggcagctacaagtgtaactgccccgctggccatgagctc
aactctgctggaactgcttgcaaggatattgatgagtgtagcatgaacagtgatgtctgc
tccaatggcagatgtattaacgtgatggggagcttccagtgcctgtgcagcaagggctac
tctgagacagataacaggaggagctgtgaagattttgatgaatgctctgtaaataatgga
ggatgccagacctcttgtaccaacattgtgggcagcttcgagtgtagctgtgagcaggga
tatgtacttggaccagacaagaggagatgcatggatgtggatgagtgtgcagacaccccg
gacctgtgtgggggtggaatgtgcaccaatgagcctggcacctacagctgcaactgtatc
gacggcttcatcacggagccttctggcaagatgtgcatggacgtggacgaatgtgacctc
aaccccaacatctgtcagaacgggcagtgtgagaacaccagggggtccttcacctgtctc
tgtgatcccggatattctgttaagggcgagggagagggatgcacagatgatgatgagtgt
gagctgggcctagcacaatgtgacatccacgcagactgttccaacacagatgggtcctat
atctgtatctgtaggaagggctacataggagatggagtcatctgcaatgatctggatgag
tgtctggaggggaccagcacctgtgatcctaatggcaactgcatgaacatccctggctcc
tacacctgtgagtgtaagcaaggtttccagggcgatggcttcttttgcagagatctcgat
gagtgtgccatcaatggccgcctgtgtgagaatgggcagtgcctcaacatacctggcagt
tactcctgcgactgtgacatgggcttcgtacctcacaacagagacagggagtgtatagac
attaatgagtgtgcatcttttgacggaaacatctgtgtcaacggagagtgtatgaacttg
ctgggaaccttcaagtgcatgtgtgacatgggatacgagctggataagagtggtggaaac
tgtacagatcagaatgagtgtaacctgaaggaaaagtgtctgaatggaatatgtaccaac
ttccctggtggctacacctgcgactgtcctcccaacttcatctccaacactgctgggact
ggctgtgttgaccccaggagagggctttgctactttgactaccaggagcggggagatgtg
gaggtgtgtacgcaggatgtgggatcagacatgtcccgagctgcatgctgctgcagtctg
ggacaagcctggggagacccgtgtgaaccctgtcctcccgtcaactcaactgaatacaat
acactgtgtccgggtggtgaaggctttaaacccaatgatgtcactgtcattttggaagat
attgatgagtgtatggagttggtgggcctgtgtcagggtggcatgtgtgtcaacacgttt
ggcagcttcacctgtgagtgtccccgaggcttcacattggacagagactcccgcacctgt
aatgacattgatgagtgcctgattgaccccaccatatgtggagcaggcacctgtctgaac
acaattggcaactacacctgtgtatgtcctaatggtcacatggccatcaacggtggtcgc
agctgtatggacatgaggaagagtttctgttttgccatggtgaagggaggacggtgtgag
aaccccaccagcttcaacctgacggagcggagctgctgctgctcagtgggggccggctgg
ggagacccctgcataacctgccctgtggagaggactgatcccttcatagaactttgtggt
tcacctgataagggtgtagtgattgatcctaatactggagaagccattgacattgatgaa
tgtcagactatcccagacttgtgccagaatggcatctgtatcaacagtgtgggcagctat
cgttgtgagtgcccatcaggcttccagttcagctcagacttgctgatatgtgaagacatc
aatgagtgtttcctgggacagaacccttgtgatccaagtgcagtttgtgtaaacatccct
ggaagtgtcaaatgtggctgtgatccgggctacaaactcttacccaaccagatcagctgc
agagatgtggatgaatgcacagaacaaccaggaatttgtggccaggggcgctgtactaac
ttactgggcagctacaactgtttctgtgacaacgggttcaggctgtcagaagacaggtcc
acttgtgaagatgtggatgaatgcggacgctttccaggcatgtgtgggaatggaacgtgc
cagaatactcttgggtcctacaactgcttctgttttggaggattcaagctgactgataac
aatgactgcattgatattgatgagtgctcggttctgagctccatctgtatgcagggattc
tgccagaatgttcctggtggttttaactgtatctgtgacctgggattcgaacaaagtcca
gatggcaggaactgtattgatattgatgaatgcagagtgccaggtacatgtgggtctggt
acatgtaggaacacagatgggtccttctactgtgagtgctacgatgggtacaggatcaac
cccaggggagacttctgtgaagacattaatgaatgtgagctgcctggtagatgtcagaat
ggagagtgccaaaactatgatggaggtttccagtgcacctgtcctgatggcttccaactg
gatgatgatggcaacaagtgcatggatatgagggaaagctactgcttcaacaagtttgaa
gccagccagtgcagaaccccccgtgccatgaacaccaccaagatgaaatgctgctgcagc
atgggtgccggctggggcgatccctgtgaggtgtgtcctgacaaggaggatgatcctgaa
ggcttcagtgtcctgtgtcctggtggagctggctttgaagttaatggaggaaaccttctc
gtggacatcaacgaatgtggcattgacccactcaatatctgtaatggtgggacatgtgtc
aacactgacgggtccttcaggtgtcagtgtacgccaggctacctactggacgatacagga
ctcaactgtatcgatgctgatgagtgtgcaattggaaacccatgtgggaatggtacctgc
accaatgttattggtggctttgagtgtgactgctttggtggctttgagccgggtcctatg
atgatgtgtgtagatgtggatgagtgtgcctatgatgggactctgtgtgccttccgttgt
ctgaacgtaccagggtcatacaagtgcacatgtccaaggggattcactctgactgctgat
ggcaagcactgcagagatcttgatgagtgttcaagcccagccctgaatgactgtccgccc
actttgaggtgtaagaactttgttgggacgtaccagtgtctgtgcccagaaggatacacc
aaagtgggcatcacatcagatgtttgcgtggatattgatgaatgcactcttggagggaag
tgtgagaatggcgtctgtgtcaacaccaggggtgggttcaggtgtgactgtttcgatggc
tacgaagtttctctggatgggaaacagtgctatgaccgccggcagggctactgctacacc
agccgtagtcgattgtgtattagggagttccagggcccagagacggtcaccaaggcagag
tgttgctgtgatggaggtggtgcctggggcagtgactgtgaagcttgtccgcgcaagggt
tctgttgacttcagcaacacctgcccacatggtcctggcttcacccctgatggtcaagac
atcgatgaatgtaaggttcgaccaaacctgtgtgagaatggggaatgtgtcaacaccttg
ggatcctacaagtgcatgtgtgaagagggctttgttgaagacttcagcggacaaaaatgt
gtagatgtggatgagtgtgaggaggacaaaccttgttccttcacctgtaagaacacagag
ggcagctatctttgcacgtgtcccaaaggctatatcctgaatgcagatggcaagacttgt
caagatcttgatgagtgtgacgcaaagggagacaactgtcagtacatctgtgtgaaccta
gtgggaggtttcacctgccagtgcccacctggcttcaaccagattcatctcacctgtgtg
gatgtgaacgagtgtaatgcccaggctggtgtgtgtggagttaacgggcagtgccagaac
atggagggctcgtaccagtgccagtgttcacagggcttcaatctcgacccagacacacaa
caatgtcagggtatgtccgtggcagcaaatgtgaatgagtgtgatggcacccacaggtgc
cagtctgggtgccagaacacggtgggtggtttccgctgtggttgtccacctggatttgta
cagcattactactggaaccagtgtgttgatgacaatgaatgtgtgaatggaaacacctgt
ggcggggccacctgttacaacactgtgggcagcttcaagtgtgcctgtccatctggctac
aactttgaccagtcatcaggaggctgcagagatatcaatgagtgtggttctcccagcaac
ccctgctcgtttggttgctccaacactgatggagggtacagttgtggctgtccaccaggg
tacttccgcattggacaggggcattgtgtgtccactcttgggatcgggcctgttggcggg
cctggcaagagcatagacagcggttcaaattccgacacatgctatgagtgcaatctcaac
aacgtggagcatcaaagaagaaagagagctgtcaacggctcagaagagattgttgtagat
gatggggatgacagtgaggaggctacagattcccctgacacagaggagcccgacaagaac
atgatcatcgaggaccagcctgccaaggatgtgaacaatgttgacaccaacaaagatgcc
atgctggaagatgccgagaccaaaaaggttgtggatggagtccaaactcccatcacactc
cgtgtcaagctacacaatgcccacccgaagaggcggttgttgaagatccagcctgcctta
gactacctggtaggtcgagcccattacaagattgtagatgggaacaatgaagggctgttc
acgatagtggaaggtcgcaaagtcagctccttgcagtttgccagagagctggatacatca
ggcgtttacaacctacagattgctgagtacattgatgggcaaacaaaagaggagaatgaa
gctgtagaggagttggaacgtgaaaaacctttgttcatgagggtcacagttctcattctc
caataa
DBGET
integrated database retrieval system
