Bacteroides fragilis YCH46: BF1991
Help
Entry
BF1991 CDS
T00202
Name
(GenBank) putative TonB-dependent outer membrane protein
Organism
bfr
Bacteroides fragilis YCH46
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
Ntox25
CooC_C
CILP
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAD48739
UniProt:
Q64UU0
LinkDB
All DBs
Position
2332117..2334906
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MRRHLIHFLLVAVLTVCSAATAIAQVTVKGQVVDAETGEPLIGAAVTIVGTTQGSVTNLD
GMFTQKAASGSTLLIKYLGYKEFSKKITQKGGTEDLGVIKMAADAMVLNDVIITSSVAVS
RKTPVAVSTVDPVFIEEKLGTQEFPEVLKSTPGIYATKQGGGFGDSKVNIRGFKTENSAM
MINGVPMNDMEWGGIYWSNWAGLSDVTRSMQVQRGLGASKVAAPSVGGSINIVTNTIDAN
KGGFVSYGMGNDGLNKILFKVSTGLTKSGWAMTLLGGKTWADGYIQGTNYEAYNWFVNIT
KRFNDNHQLSFTAFAAPQWHNQRGNKDGLTIEGWQEVAKNYMNGEKPYRYNPTYGFGLNG
QRKSSAYNVYNKPQLSLNHLWQINEKSSLSTALYASIGRGYGYSGQGLTSADRSNWYGSN
NGNLNMTFRKADGTFAYDEIYALNEASENGSVMAMSKSKNFHNWYGLLSTYTTKFGDYFD
FYGGIDYRYYKGTHTNELVDLYGGDFYVDSSSRKSVLASNNAAAAAGSSFVNQKLKVGDI
VYRDFDGYVMSEGVFAQGEYNRDKLSAFISGSVSNTGYWRYDRFYYDKAHAKSKTVNFIG
WNAKGGLNYNLTENHNVFANIGYISRAPFFSGGAFLNSTVSNATNPDAVNEKVFSFEIGY
GYRSSFLTVNINAYHTRWMDKTTTRSQDITNYYEGSLSEPYDASKLVSTKSVINMQGVNA
LHQGVELDFVAKPFQWLDLSGMFSIGNWRWDSNASGSFTVEGQFVNSASIKGSDGKDVTV
LVNAAANGLEPGTMKLNLKDVKVGGSAQTTAALGATFKIDKALRLGIDWNLYARNYADWS
LNSNDLVMNSEKDFSTPWRIPTASTFDLNASYKFNFGKLNAVLSGNVNNLFDQTYISDAT
DGSNHDWKTAYNVFYGFGRTYSLRLKVNF
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagacatctaattcatttcctgctggttgcagtgctgacggtatgttctgccgct
acggccattgcccaggtaacagtgaaaggtcaagttgtggatgcggaaacaggtgagcca
ttgattggtgcagccgtaacgattgtcggtaccacccagggtagtgtgactaacttggat
ggtatgttcacacaaaaagctgcctccggttcaacgctgcttatcaagtaccttggttac
aaggaattcagcaagaagatcacccagaaaggtggtactgaagatttgggcgtaataaaa
atggcagccgatgcaatggtgctgaatgatgttatcatcacttcttctgttgctgtttcg
cgtaaaacaccggtagctgtatcgacagttgaccctgtctttatcgaggagaagctcgga
acacaggagtttcctgaagttttaaagtctactccgggtatctatgcaactaagcaaggt
ggtggttttggtgactccaaagtgaacatacgtggttttaagaccgagaactctgctatg
atgattaacggtgttccgatgaatgatatggaatggggtggcatctattggtcgaactgg
gccggtttgagtgatgtgactcgtagcatgcaggtacagcgtggtttgggtgcatcaaag
gtagcggctccttcagtgggtggttctatcaacattgtgactaatacaatcgatgccaac
aaaggcggtttcgtatcttatggtatgggtaacgacggattgaacaaaatcctgttcaag
gtatctaccggattgaccaaatcaggttgggccatgacccttttgggaggtaagacctgg
gccgatggttatatccagggaaccaactacgaagcttacaactggtttgtgaatattaca
aagcgtttcaatgacaatcatcagttgtcatttactgcttttgctgctccccagtggcat
aatcagcgtggaaataaagacggacttaccattgaaggatggcaggaagttgcgaagaat
tatatgaatggtgagaagccttatcgttataaccctacctacggattcgggctgaacgga
caaagaaagtcatcggcatataatgtgtataataaacctcagctgtcattgaaccatttg
tggcagattaatgaaaagtcaagtttgagtacagctctgtatgcttctatcggtcgtgga
tatggctattccggtcagggattgaccagtgcggatcgcagtaactggtatggcagtaac
aatggtaacctgaatatgactttccgtaaagccgacggtacatttgcgtatgatgaaata
tatgctttgaatgaagcgagtgagaatggttcggttatggcaatgtcgaagtctaagaac
ttccataactggtatggtctgctttctacttatactactaagttcggtgattacttcgat
ttctatggtggtatagactaccgttattataaaggtacacacaccaatgaattggttgac
ctctatggtggtgacttttatgtagactcttcttcaagaaaaagtgttttggcttcaaac
aatgccgccgctgctgccggttcttcatttgtgaaccagaaattgaaagtaggtgatatt
gtttatcgtgactttgatggctatgtgatgtctgagggagtatttgctcaaggtgaatac
aacagagataagttgagtgccttcatttccggttcggtttctaataccggttactggcgt
tacgaccgtttttactatgacaaggcgcacgccaagtcaaaaactgtcaacttcatcggt
tggaatgcaaagggaggtttgaactacaaccttaccgaaaatcataatgtgtttgccaat
atcggttatatcagccgcgctccattcttctcgggaggtgctttccttaattcaacagtc
agcaatgcgacaaaccccgatgcagtgaacgagaaagtgttctctttcgaaatcggatac
ggctaccgttcgagcttccttactgtgaacatcaatgcctaccacactcgttggatggat
aaaaccactacccgttcacaggatatcacaaactactatgaaggcagccttagcgagcct
tacgacgcaagtaagctggtttctaccaagtctgttatcaacatgcagggtgtgaatgct
ttgcaccagggtgtcgaacttgattttgtagcaaaacctttccaatggctggatttgagc
ggtatgttctctatcggtaactggcgttgggatagcaatgcttcgggtagcttcactgta
gaaggtcaatttgtgaacagcgcatctatcaagggaagcgatggtaaggatgtgaccgtt
cttgtaaatgcggcagctaacggactggaaccgggtacaatgaaactgaacctgaaagat
gtgaaagtgggtggatctgcacagactaccgcagctttgggtgctactttcaagatcgac
aaagcccttcgtctgggtatcgactggaacttatacgcacgtaattatgctgactggtca
ttgaactcaaacgacctggtgatgaacagtgagaaagacttttctactccttggcgtatt
ccgactgcaagtactttcgatttgaacgcaagttataaattcaactttggtaagctgaat
gcagtactgtcaggtaacgtgaacaacttattcgaccagacttatatttctgatgcgaca
gatggtagcaatcacgattggaagaccgcttacaatgtgttctacggattcggccgtact
tatagcttgagattaaaagttaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
