Biomphalaria glabrata (bloodfluke planorb): 106056153
Help
Entry
106056153 CDS
T07368
Name
(RefSeq) ATP-binding cassette sub-family A member 1-like
Organism
bgt
Biomphalaria glabrata (bloodfluke planorb)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
R1_ABCA1
SMC_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106056153
NCBI-ProteinID:
XP_013068212
UniProt:
A0A2C9JFK9
LinkDB
All DBs
AA seq
2994 aa
AA seq
DB search
MQSLNQLRLLVWKNILLRRRYPLFLALELLWPVLILGIVSVLRIGSPPIKTPECHYQKWS
MPSAGLVPFLQSLVCNIDNYCFTNQESIETSKQSARSFSALTQDVLPLISSNDILDILQM
SNKSIGLLNLFKNVIKDQKFIFGLGEQLYIKYYIRNETEFKNILVNKYQILTLGEFNDIM
MSKLNIGKLLNMTEIPDLKSVLCSSEQLGSFFTFPAGTDVKNISTVLCELELQNNTELIN
EVLQHLNISSLIRAIKLIEEIKEKTGSKDNVTFALENVAQMYDIVRNEETLLRAIQALFS
IPKLDDLFSVIPYIMENSSALGSMIDLIRKLVFSLNPIMVSLKMDNSTLWGILQDIALLG
DYLTAIGDGTWNRSSADLVLPLGDLLYKLNQLSSDSSSAVAINLLKIFADFDWVTLFTEL
FGTSVAPTSSTNILIDSLIQVLLKGPDLTKALTQAIINRNYTEFTLLVTKVFLGFGLNGT
VDPLFLNPIRNLIVAVQSLTNALQNTTSPLPLFVTSIITQLNSALNVIGLSISTICNIVI
RSFGQTDPNTYLPLYVTIESIDIMSGLVKIIPELDDLVCILFDKTGLNLNVFWDTLTKIG
FWNDLHKIVTRLSNPSQSLNCSKPVEDMLVVTSSISSSFTNDGLNISRMIQCFSLSQEQI
QNLLSSFSNYLVLIKNLLNLLQKPAIQKLLTDPDILPLFDLTLEIVIYNSKAMLTVSNLL
KSDKNVAQYLLNSGISQLVVETFMNAAVNSNQAYFLQQTSLDITNILCDPDQLSKVMTPS
VTASVSLNSLSNAFCNTTLQAAVLADYLKNSSLSSSGINDLLTSASQFSGMLISLLPSLK
DLVSGFSDVTTFFIASVIDTNINILEENIDVLDKIIGSNTMSELSKQLQKLLTPLISLFP
PKYKSVTVLTSVQTILNGLVNVDFLKGYLLPEIQVKSLLKYPKNTTNYFTSVLGISQNVA
QEILNAVFSSGILQGIANYSSYTCNEVLKRLVFVNATKASLQNVQTEICALNTSQVVKLL
NVLIPELDISALISKYTSTLVDTILEDTNITSTELTELAYKINQGLVSSIKTYLMLNQSE
SKMEIIQSFSAALTSDMPLVDKISQSVCGRIISPDLAAFPSVSGITVSTDTLNLNGAQNK
SVDNDLQGTFCQDFFKTINDLEFGSILWNYLKPILLGKILYTPDNEITRTILSKANTTFA
LVGELNRIATVWANQAVNLQGLLDFIKDTSLLKDLLNNEVIQDILRATTGIQPDLLLTSL
PTLENTTFSNDILETLQSVAAMVANYTSCILADRFQPVSNETELENMAFKLAKSKTFFAG
IVFYDVFNESETSVRQKRQVNSNTIPKHIGYKIRMDIDSVMDTSLLKERTFTMNAEDNLI
ENLRYLRGFIFLQDLLDSRIIELHKNQSLTNPAVNIIQMPFPCHHADSFIFLLGTYLVPI
MMCFVYLSILGVATYNLVYDRENGQDEVLRVMGMIKGVNVLAWFLSTMFMMLTVAIIMAV
MLKYTNIFIYSNLFIMFLLLACFSLSSLMLMYMVSALFNRTSMALLFVIILYLLSYLPFT
ILIGYDFTLNFWQRILTCFACTTSLCFATLKIAFLEEQGIGVQWSNIDRAGPDELSVAWS
FYMMLIDSVIYFLVGWYIQELKPGKYGVGQPFYFPFQLSYWKSFCKYKLPTRERIDRKTH
TASSLFEAPPEGVNIGISVENISKIYYNKKVLDQLNLQFYENQITSLLGQNGAAKTTTIK
IICGLLKPTSGHVYFNRNFSLVGICPQHNSIFNYMTVREHMEFYSEIKNIKNKKMSFLEI
HRLLKEVDLWHARNVPAKNLSYGMKRRLCVALAFVGNTKKIILDEPTSGIDPHTRKHIWN
LVTRNRIGHTIVLSTHHLDEADFLSDRIAVMHQGKLLCCGSPSFLKQSIGSGYRLTIMKI
DQRNQSQSQEINELRSRSSTAAITTFIQSLCSNATLEEQAGSDLIFNLPKDDSLIVPIDE
FFRRLDQSVNQLNIASYGLSDTSLEEIFLKLTKSADQNLSNDTPSNRTYVPNSQSSITSS
ESENSRTGSTNPLLDMDRRRTGLKLMLAQILALILKRFHHYRRNWRILLSSLILPIMFFL
IALAYNSVKPSEGDAKPLLLDPSIYGSGIYSFYQDAVKSTMSNKLVHELTDSASGYGTAC
MKDWQQNYFKTDKCVSKSPWYNNSLPMYNVECVDSLQTYTSQSTNYLIPEKHVQADNFIQ
NLNDWSIPSFLINTFEMYKQNRFGGWSFESLDKNDSLDTYVWFNTKGYHSMPSYYNALTN
TILRAQLPDGRNSSEYGITAVNHPIRLSRGRLDTKTLALYAADAGLSIMMLIAFSIIPSS
FALYVVNEKVMKERQLQDISGISTFTYWTIAFACDLIVYCFTLSLAIIATVIFKPDPFYL
KDNLAGFTVGVLFYGWCMIPLVYCLSHFFNKGSNAYLVTFVISLFLGNATTMSLLLISTL
SDTYPMPTVYKVCKYLFLIFPQFSFTQGITDLATNTIVYKIFVRFDENRFMSPFEAEILG
WKILAMAIEGVLFFILNFILDAAKPPVLRLQDERQTFDEVVTEDEDVIREKERIEQGLAN
DLLIVENLSKVYRRNGRKFFAVNHISFGVPEGQCFGLLGVNGAGKTTVFRMLTGDCLPSS
GSVFLKGNRLSKKDTHFGQNVGYCPQEGGLDEYLTAEEMLYFHARLRGLQSWQTERLVPE
LLGDLGLTQYAHKAVHTYSGGTKRKLALAVALLGRPPILYLDEPTTGMDAATRRLAWKCL
EKATRNGQSVILTSHNMNECDSLCSTLAIMVDGKIKCIGSPQHLKYKFGDGYNVTIHKGH
KLLTNISHDFVNRFLGSVVKHNHQSSITLQVPTASCSLADVLTFLQAEQRVKNIGFYSLT
QTTLDSVFVNFAQDQLELSQVSGTMKVPKRSRKLSSGLTPFNELNNDMSTSVTNDDLENL
NGFKNPAFQRDNHIVLSPAVSYSGSRYVSIIPIGPQSKGNDPMENSHKGLSSYL
NT seq
8985 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagtcattaaatcagttacggcttctagtgtggaaaaatattttacttcgtcgtcga
tatccgctttttctagctttggagctactttggccagttttaatccttggaatagtatca
gttttaagaatagggtcaccacctataaaaactccagaatgtcactatcaaaagtggtca
atgccaagtgctggactagtaccatttcttcaatcattagtatgcaacatagacaattac
tgctttacaaaccaagaaagtattgagacatctaaacaatctgctagaagtttttcagct
ttaactcaggatgtgctgccactcatttcttcgaatgatatattggatattcttcaaatg
tctaataaaagcattggtttattgaatctgtttaagaatgtgataaaagaccaaaaattt
atatttggcttaggagaacaactttatataaagtactacatcagaaatgaaacagaattt
aaaaatatacttgtgaataagtatcaaatcttaacattaggtgaattcaatgatataatg
atgtctaaattgaatattggtaagctgttgaacatgacagagattcctgatttgaaatct
gttctctgtagctctgaacaacttgggtcattctttactttccctgctggaacagatgtg
aaaaatatctccacagtgctttgtgaattagaattgcaaaacaacacagaactgattaac
gaagttctccagcatctaaacatttcatcattaataagagctatcaaacttattgaggaa
ataaaagaaaagactggttcaaaagacaatgtaacatttgccttagaaaatgttgctcaa
atgtatgacattgtcagaaatgaagaaacattattaagagccattcaggcattgttttct
attccaaaattagatgaccttttctctgtgattccttatataatggagaattctagtgct
ttagggagtatgattgacttaataagaaaacttgtttttagtttgaatcctataatggtt
agtcttaaaatggataactcaacactatggggaatattgcaagatattgcattgctaggt
gattatttgacagctataggagatggcacatggaatcgctcttctgctgacttagtttta
ccacttggtgatctactgtataaattaaatcaattatcaagtgacagctccagtgcagtc
gcaatcaacttattaaagatatttgctgattttgattgggttaccttgtttactgaatta
tttggcaccagtgtagcaccaacatcaagcaccaacatcttgattgacagtctaattcaa
gttcttctgaagggcccagatttaaccaaagcacttactcaagctattataaatagaaat
tatacagaatttactttactagtaactaaagtctttttgggttttggtctcaatggtact
gttgatcctttgttcctcaacccaattagaaatttaattgttgctgtccagagtttgact
aatgcacttcagaatacaaccagtcctttgcccttgtttgttacatctatcatcacccag
ttgaattctgcactgaacgtgattggcttgagcatatctacaatttgcaacattgtcatc
cgctcatttggacaaactgacccaaacacttatctgccactttatgttacaattgaaagc
attgatatcatgtctggcttagtcaaaataattccagaacttgatgatttagtgtgcatt
ttatttgataaaactggattgaatctcaatgttttctgggatacattaactaaaatcgga
ttttggaatgacttgcataagattgtcactcgcctctctaatccaagccaatcacttaac
tgttcaaagcctgtggaagatatgctagtggttactagtagtatttctagcagttttaca
aatgatggcctgaatataagcaggatgattcagtgtttcagcttaagtcaggagcaaatt
caaaatttgctgagctcctttagcaattatttggtgttgataaaaaatttgttgaacttg
ctacaaaaaccagcaattcagaaacttcttactgaccctgatatactaccactgtttgat
cttactcttgaaatagttatctataactcaaaagccatgctgacagtgtccaatctgttg
aaatctgacaagaatgtagcacaatatcttttgaactcagggatttctcagttagttgtg
gaaacttttatgaatgcagcagtcaattcaaaccaggcttactttctccaacaaacatca
cttgatataacaaatattttgtgtgatcctgaccaactttcaaaagtaatgaccccgtca
gtgactgcttctgtcagtctcaacagcctaagcaatgctttctgtaacactacactccaa
gctgcagttctagcagattatttaaagaattcttctttgtcttcttctggcatcaatgat
cttttaacttctgccagccaattcagtggtatgctaatttcattgctgccaagtctgaaa
gatcttgttagtggattttctgatgttaccacttttttcattgcctctgttattgacacc
aacataaatatattagaagagaacattgatgtcctagataaaattattggaagcaacaca
atgtctgaattatccaaacaattacagaaacttttgacaccactgatttccttatttcct
cctaaatacaaaagtgtaactgtcttaacttcagtgcaaacaattttaaatggccttgtc
aatgttgactttctaaaaggatatttgttgcctgaaattcaagtcaaaagtctgctaaaa
tatccaaagaataccacaaattattttaccagtgttttaggaatttctcaaaatgttgcc
caagaaattttaaatgctgtcttttcttctggaatacttcaaggcattgctaattacagt
agctacacatgcaatgaagtattgaagagacttgtgtttgttaacgctacaaaagcctct
cttcagaatgtccaaactgaaatatgtgctttgaatacttcacaagttgtaaagctttta
aatgttttaatcccagagcttgacattagtgccctgatatccaaatacacatcaactctt
gtggacacaatacttgaagatacaaatataaccagtactgagctgacagagcttgcttac
aagataaatcaaggtcttgtttcttctatcaaaacttatctaatgctgaaccaaagtgaa
agcaagatggaaataatacaaagtttttctgctgccttaacaagtgatatgccacttgtt
gacaaaataagccaaagtgtttgtggtagaataatatcaccagatcttgcagcctttcca
tctgtttctggaatcacagtatctacagatacattgaatttaaatggggcccaaaataaa
agtgttgacaatgatttacaaggtacattttgtcaagattttttcaagactatcaatgac
ctagaatttggaagtattttgtggaattatctgaaacctatcctgttgggtaaaattctg
tacactccagataatgaaatcacaagaacaattttatctaaggctaatacaacgtttgca
ttagtaggagaactaaacaggattgctacagtctgggcaaatcaagccgtgaatctacaa
gggttgctagactttattaaagacactagtctgcttaaggatctccttaataatgaggtc
attcaagatattctaagagcaactacaggaattcaaccagatcttcttcttactagtttg
cctaccttagaaaacacaacttttagtaatgacatcttggaaactttgcaatcagttgca
gcaatggtggcaaattatacctcttgcattctggctgacagatttcaacctgtgtcaaat
gaaactgaactggagaacatggctttcaagttagcaaagtcaaaaactttttttgctggt
atagttttctatgatgttttcaatgagagtgagacttcagttagacagaagcgtcaagtc
aattcaaacacaatacctaaacatataggttataaaattagaatggatattgatagtgtc
atggatacaagtttattgaaggagcgcactttcaccatgaatgctgaagacaatttgatt
gaaaacttgcggtatcttagaggcttcatttttctccaggatttattagactctagaatt
atagagcttcataagaatcaaagtttaacaaacccagctgtaaatattattcagatgcct
ttcccatgtcatcatgctgatagtttcatatttctactaggaacctacttggtacctatt
atgatgtgctttgtctacctgagtatacttggcgtagccacttacaacctggtgtatgac
agagagaatggccaggatgaggtccttcgagtgatggggatgataaaaggtgtaaacgta
cttgcctggtttctcagcacaatgtttatgatgttaactgttgccattatcatggctgtg
atgctcaagtataccaacatcttcatctacagcaatttgttcatcatgttccttctgctg
gcttgttttagtctcagttcactgatgttgatgtatatggtttctgcattatttaaccgt
accagtatggctttgttgtttgtaatcatcttgtacttactgtcttatttacctttcacc
attctcattggatatgacttcactcttaacttttggcaaagaatacttacgtgctttgcc
tgcactacgtcactttgttttgctacattgaagattgcctttctggaagagcaaggcatc
ggtgtgcagtggtctaacattgacagagctggtccagatgagctcagtgtagcttggtcc
ttctacatgatgctaatagatagtgtcatttatttccttgttggttggtatatacaagaa
ttaaagccaggaaaatatggtgtggggcagccattttattttccctttcaactgtcttac
tggaaaagtttttgcaagtataagcttcctaccagagaaagaattgacagaaagacacat
acagcaagtagtttgtttgaagcaccacctgaaggtgttaatattggcatatctgttgaa
aacatcagcaaaatttactataataaaaaagttttagaccaactcaatctacagttctat
gagaatcagatcacttcactcttgggacaaaatggagctgctaaaaccactacaataaag
atcatatgtggtttgctaaaacctaccagtggtcatgtgtattttaacagaaatttctcc
ttggtaggaatttgtcctcaacataattcaattttcaattatatgacagttagggagcac
atggaattttattctgaaatcaaaaatattaaaaacaaaaagatgtcatttctggaaatt
cacagactgttgaaagaggtagatctctggcatgctagaaatgtccctgctaagaactta
tcatatggcatgaaacgtcgtctctgtgtggctttagcgtttgttggaaacaccaagaaa
ataattttagatgaacctacaagtggcatagaccctcacacaagaaaacacatatggaac
ttagtaaccagaaacaggataggtcacaccattgtgctttcaactcaccatttggacgaa
gctgatttcttaagtgacagaatcgctgtaatgcatcaagggaagttactttgctgtggc
tccccctcatttctgaaacaatcaattggtagtggctaccgtctaactataatgaagata
gatcaaagaaatcaaagtcaatcccaagaaattaatgaactaagatccaggagttcaaca
gcagcaattacaacgttcattcagtctttatgttctaatgcaactcttgaagagcaagct
ggatctgatttaatctttaacttacctaaagatgatagcttgattgtaccaatagatgag
tttttcagaagattagatcaatctgttaatcaactaaatattgctagttatgggttgtct
gacacttcactggaagagatatttcttaaattgaccaaatcagctgatcaaaacttgagc
aatgacactcccagtaacagaacttatgtaccaaattcacaatctagtattactagctca
gaaagtgagaattcaagaacaggttctacaaatcctttacttgatatggatcgcagaaga
actggtctgaaattaatgttggcccagattttagccttgatcttgaagcgctttcatcat
tatcggcgcaattggagaatactgttatcatcattgatcctgcccattatgtttttctta
attgctttggcatacaattcagtcaaacccagtgaaggggatgccaagcctctgcttctt
gacccctcaatttatggatctggaatatattcattttaccaagatgcagtcaaaagtact
atgtctaataaattagtacatgaattaacagacagtgccagtggttatgggacagcttgt
atgaaagattggcagcaaaactattttaaaactgacaagtgtgtgtccaagtctccatgg
tacaataactcactgccaatgtataatgtggaatgtgtagacagtcttcaaacctacaca
tcacagtcaacaaattatttgattccagaaaaacatgtccaggccgacaatttcattcag
aatctcaatgattggagtattccttcttttttaatcaacacatttgaaatgtacaaacaa
aacagatttggtggctggtcatttgaaagtttggacaagaatgattcattagatacttat
gtctggttcaatacaaaaggttatcactcaatgccatcttattacaatgctctcaccaac
acaatcctaagagctcaacttcctgatggcagaaactcttctgaatatggaattactgca
gtgaatcatccaataagattatctcgaggtcgacttgacactaaaactttagcactctat
gcagcagatgctggcctgtctattatgatgcttatagccttcagcatcattccaagtagc
tttgctctgtatgttgtcaatgaaaaagtaatgaaggaaagacaactccaggatatcagt
ggcatttcaaccttcacctattggacaatagcctttgcatgtgacctgattgtttattgc
ttcacactttctctggcgattattgcaaccgttatctttaagccagatcctttctatctc
aaagacaatcttgctggttttactgtgggtgttttattttacggttggtgcatgattcct
ttggtctactgtttgagccactttttcaataagggaagtaatgcttacttggtgacattt
gttatcagcctttttttgggaaatgctaccacaatgtccttgttgctaatatcaaccctc
agtgatacatatcctatgcctacagtatacaaagtgtgtaaatatctgttcttgatattt
ccacaattttcctttacacaaggcataacagacttggcaactaacactattgtctataag
atttttgtcagatttgatgaaaacagatttatgagtccttttgaggctgaaattctcgga
tggaaaattctagctatggctatagaaggagttttgttttttatattaaatttcattctt
gatgctgctaaaccaccagttctaaggcttcaggatgagagacaaacatttgatgaagtt
gttactgaagatgaagatgtaattagagaaaaagaaagaatagaacaaggattagcaaat
gatttgttgattgtggagaatttgtccaaggtttacagaagaaatggaagaaagtttttt
gctgttaatcacattagctttggtgtaccagaaggacagtgctttggccttcttggtgtt
aatggagcaggaaagacaactgttttcaggatgctaacaggagattgtctaccatcaagt
ggttcagtttttctaaaagggaacagattgtccaagaaagatacacattttggacaaaat
gttggttattgcccacaagaaggaggacttgatgaatatctgacagcagaagaaatgctt
tactttcatgctcgtcttcgtggacttcaatcttggcagactgaaaggcttgtaccagaa
ctccttggagatctcggcttgactcagtatgcacataaagctgtacatacttatagtgga
ggaacaaaacgtaaattggctctagcagttgcattgttgggtcgtccacctattttatat
ctggatgaaccaacaactggtatggatgctgctactagaaggttggcttggaaatgtctt
gaaaaagcgacaagaaatggacagtcagttatactgacatctcacaacatgaatgaatgt
gattccttgtgttcaactctagccatcatggtggatggtaagatcaaatgtataggaagt
ccacagcatttaaaatataaatttggtgatggatataatgtgactattcacaaaggacac
aaactattgacaaatatcagtcatgactttgtcaacagatttctaggctctgttgtaaaa
cacaatcatcaaagcagcatcacacttcaagtgcccacagcctcctgttctcttgctgat
gttttgacatttttacaagcagaacaaagagttaaaaatattgggttttattcattgaca
cagacaactttagattcagtctttgttaactttgcacaagaccaattagagctaagccaa
gtatctggtactatgaaagttcccaagagatcaagaaagctatcatctggcttgacacca
ttcaatgagctaaataatgacatgagcacatcagtgaccaacgatgatttggaaaatttg
aatggattcaaaaatccagcttttcagagagacaatcacatagtgctatcccctgctgta
tcttacagtggctcaagatatgttagcattatccccataggtccacagagcaagggaaat
gatccaatggaaaattcacacaaaggactttcttcttatctatga
DBGET
integrated database retrieval system
