Candidatus Blochmanniella camponoti: M9394_01955
Help
Entry
M9394_01955 CDS
T08425
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel MscM
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
bhb
Candidatus Blochmanniella camponoti
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bhb02000
]
M9394_01955 (mscM)
Transporters [BR:
bhb02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
M9394_01955 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MscS_porin
MS_channel_2nd
MS_channel_1st
MS_channel_3rd
GDH_HM3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URJ27318
UniProt:
A0AAE9I929
LinkDB
All DBs
Position
complement(467758..471144)
Genome browser
AA seq
1128 aa
AA seq
DB search
MVTIQKKTIFFKYFFLLTYIITWLLPLVTFSYNFLNEQEIKKYLQYAQKKEHINAHQKAI
IDNLQSALHFISEQKHSNIKIQEYQKIINDFSYITLQLYEEYNNTSNTIIDIDKNLSENE
LKQKLFRIDNQLTDLSEQLKQEHNHVRSINELLILLPQQQVAAQNILNNLEQRQILYTNA
NTLIEQSKFAVLQSEQTARQLKVAELKLAELSINNRKELSRLRIELLKKKYNYINNEAHT
LRHQLNYLCQKGKNQSIDYIKKTLTEHNNTLPKSIEKQLQINRDLSIILNQQTHRINSIE
SNKQEVASCILQVRQTFNNLNEQAQWLDASSVLKETLRSQVSKLPEIPKSRQLDHDMAQL
RTKRLQYENQLKKIIPLSSQIKQDDGTPLTAPHKHILETQLTIQRNLITSLLNSFDAQIL
ELTKLKIAHRQLKEALQDVQKTAHRHLFWIADFHPITISYPLNVYQDLYKLLTSDESNYQ
IISLLNRICTMRKTLILIISCIIISTGLYCAIHYHYQTFLEQSSKKIGKVNQDSFLLTFY
NIWYSMLIALPIPILWAFVGYSLNHDWLYPVSVAINDGIKVTTFILWISIVGAYFSSSKG
LFIVHFGWSKKRVQKVFSHHYTWAVGTIVFLIMMLTIFNNYNDREFSNTLGRLCFILLCI
YLTFITNNLKHSGLPLYLNKHDSSDNIINHGLWNIIICAPVIAAISCILGYLFIAQELLA
RLETSLFIWIISLIVYHIIRRWTSIQRRRIAFERAKQKRILQLTLRTHNESNSSQLLQTN
KLVSNDEKNSKILDLDTISTQSLQLIRSIITIIALLLMTLLWSELHSSFSFLENITLWDV
TSTIKGVDNIQPITLNSFLIAILVIVITTKTVKNLPAFLELTVLQHLDLTPGTGYAITTL
IKYILMFLGGIIGCSLIGIEWTKIQWLIAALGVGLGFGLQEIFANLVSGLMILFEKPIRI
GDTVTINKLTGNITRINTRATIITDWNHKEIIIPNKEFITKQFINWSLSDTLTRVVLRVP
APFQTDMKKIVKVLLQIAKNSSFSLNTPPPEVYLVDLQQGLPMFEIRIHISDIKLRMPLC
HQMHMLIIEYYQNNGIKLPCIPNYLYNNQLSINNFDSNYPNTNYYTIT
NT seq
3387 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttactattcaaaagaaaactatattttttaaatatttttttttattgacatacata
ataacatggttacttccattagtaacattttcttataatttcttaaatgaacaagaaata
aaaaaatatttacaatatgcgcagaaaaaagagcatataaatgctcatcaaaaagccatt
atagataatctacaatctgcgttgcattttatttctgaacaaaaacattctaacattaaa
attcaagaataccaaaaaatcataaacgacttttcatacataactcttcaattatatgaa
gagtataataatacatccaataccatcattgatattgataaaaatctttctgagaatgaa
ctaaaacaaaaattatttcgcattgataatcaattaacagatttgtcagaacaattaaag
caagaacataatcatgtacgttctatcaatgaattattaatattactaccgcaacaacaa
gttgcagctcaaaatatattaaataatttagagcaacgacaaatattatatacaaatgca
aatactctaatagaacaatctaaatttgctgtgttacaatcagaacaaacagctagacag
ctaaaagtggccgagcttaagcttgctgaactaagcatcaacaatcgtaaagaattatcc
cggctacgcatagaattgcttaaaaaaaaatacaattatataaacaatgaagcacacaca
ctaagacaccagttaaattatttatgtcaaaaaggaaaaaaccaatccattgattatatc
aaaaaaacattaacagaacataataacacattgccaaaatccatcgaaaaacaattacaa
atcaatcgtgatctttcaattattctaaatcaacagacacatcgcataaacagtatcgag
tcgaacaagcaagaagttgcgtcatgtatattacaagtacgccagaccttcaacaactta
aatgaacaagcacagtggttagatgcatcttcagttcttaaagaaacactgcgttctcaa
gtctctaagttgccagaaatacctaaatctcgacaactagatcatgatatggcgcaacta
agaactaaacgtctacaatatgaaaatcaattgaagaaaataataccactatcatcacaa
attaaacaagacgacggcacaccactaacagccccccacaaacatattctggagacacaa
ctcaccatacaacgtaaccttatcacttcattgttgaatagttttgatgcacaaatttta
gaattaacaaaattaaaaattgctcacagacaacttaaagaagcactacaagatgtacaa
aaaactgcacatcgccatttattttggattgctgattttcatccaattactatatcttat
cctttaaacgtttatcaagatttatacaaactattaacttcagatgagtctaattaccaa
ataatatctttgttaaataggatctgtactatgcgcaaaacactgatactaataatatcg
tgtattataatatcaactggattgtattgtgctatacattatcattatcaaacattttta
gaacaatctagtaaaaaaataggaaaagtaaatcaagatagtttcttgctcactttttat
aatatatggtattcaatgttgatagctttaccaatcccgatattatgggcgttcgtaggg
tatagtttgaaccatgattggctatatcctgtttctgttgcaattaatgatggaattaag
gttacaactttcatattatggatatccatagtaggcgcttatttctcgtcttcaaaagga
ttatttattgttcattttggttggtctaaaaaaagagttcaaaaagttttttcgcatcat
tatacctgggctgttggaacaattgtttttttaataatgatgctaactatatttaataat
tataacgatagagagttttccaatactttgggtcgtttatgttttattctattatgtatt
tatttaacttttattaccaataacctaaaacattctggattgcctttatatttaaacaaa
cacgattcttctgacaatatcatcaatcatggtttatggaatataataatatgtgcacca
gtaatagcagcaatttcttgtatattaggctatttatttatcgcgcaagaactattagcg
cgactggaaacatcgttattcatttggattatatcattaatcgtataccatataattcgt
agatggacatcgatccaacgacgtcgtattgctttcgaacgcgccaaacaaaaacgaatt
ctacaattaactctaagaacacataatgaatctaattcttctcaactactacaaactaat
aaattggtatctaatgatgaaaaaaatagcaagattttagatttagatactattagcaca
caatcattacaattgatacgatctattattactattattgccttattattaatgacttta
ttgtggtctgaattacattcttcattttcttttttagaaaatattacattatgggatgtc
acttctactataaaaggggtagacaatattcaacctataacattaaattcatttcttatt
gctattctagtaattgttattaccacaaaaacagtgaaaaacttaccagcgtttttagaa
cttaccgttttacaacatttagacctcacaccaggtacaggatatgctattaccacatta
attaagtacatattgatgttccttggcggaataataggatgttctttgataggcatagaa
tggactaaaatacaatggttaatagcagcattgggtgttggattaggttttggattgcaa
gaaatatttgctaatcttgtatctggtttaatgatactttttgaaaaaccaattcgtatt
ggtgacactgtaactattaacaaacttaccggtaatattactcgaattaacactcgtgca
actattattactgattggaatcataaagaaatcattattccaaataaagaatttattaca
aaacaattcattaattggtctttatcggatacattaacacgagtagtactacgtgtacct
gctccttttcaaacagatatgaaaaaaatagtaaaagttttattacaaatagcaaaaaat
tcttctttttccttaaataccccgcctccagaagtatatttagtagatttgcaacaagga
ctacctatgtttgaaatacgaatacatatatcagatataaaactgcgtatgcctctatgt
catcaaatgcatatgttaattatagaatattatcaaaataatggaataaaattaccatgc
atacctaattatctttataataatcaactgtctattaataattttgattctaactacccg
aacacaaattattacacaataacataa
DBGET
integrated database retrieval system