Brachyspira hyodysenteriae ATCC 27164: BHYOB78_08185
Help
Entry
BHYOB78_08185 CDS
T04742
Name
(GenBank) penicillin-binding protein
Organism
bhd
Brachyspira hyodysenteriae ATCC 27164
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
HCS_D2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANN63844
UniProt:
A0A3B6W5D9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2790649..2793021)
Genome browser
AA seq
790 aa
AA seq
DB search
MFKKKIKDNSNNNVVKKKKSKLKKFILTIFIVCLFISVTVGIIGIYFVGGVYKDWVARRD
QSMAMLEEYYDIIVIRGNEKRIRYFNPLNPFGDSPPTKIYDRNNILIGEYMPPAYEVVNV
DDINPLLEQTLLLMEDQKFYSHKGINYFRTAYLGIQTILTRKIVGGGSTLTQQLAKLLFT
KSERTIERKLFEMFAAREIEQKYTKKEILAMYFNTVYLGDGNYGFEAAANHYFNKPLRQC
RLLEYAILVGMLPNPTYYSIVNNPDNSRKKVEQILSRLVKNNIIDKQTMEAELDLFDKEY
TNINKQVKGAQWKMTVNRTPYVNEYVRQELLNYFNKDELALSGLKIYTTVNERYYRIADS
VMKENIRKLQSSSSNRSYQGAMVSIDPKTGGILVMIGGDGYTLQNQFNRAVQAKRQIGSV
IKPFIYLYAFEGGAQPFSTMLDTNYSYPQGAGKPAYSPRNFDRRYRGEITLETALSKSIN
TIAVKLLNDIGLSYFIEHSREFFGENAYIPNALSIGLGTMEMSPLDLASAYSALANGGIK
YEPYIVDKIIDIDGNELSVTALVDRTPHKISATSPSSYYFLNSTLQKVIAPGGTAYRSAS
TYGFKYPSYSAKTGTTSEHRDNWFAAYNDEIVTITWIGSDRNDLLPNNVTGGATTALATF
QYLDSITPSSKREFNWPVPNDVLIVEICQDSGLPRNHTCVNVSPLTVGGNVDLSTQCPID
HLRTATPRNEATNDAMMEDEGDFYYTPLDENSNSYDSNQNDNIQNNNNDNNIYLLPEDNI
EDPSLGNIRS
NT seq
2373 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaagaaaaaaattaaagataatagtaataacaatgtagtaaagaagaaaaaatca
aagttaaagaaatttatattaactatttttatagtatgtttattcatatccgttacagta
ggtataataggtatatatttcgttggaggagtatataaagattgggttgccagaagagat
caaagtatggctatgcttgaggaatattatgatataatagttataagaggtaatgaaaaa
aggataagatatttcaatcctttaaatcctttcggagattctccacctacaaaaatatat
gatagaaataatatattaataggtgagtatatgcctcctgcttatgaggttgttaatgtt
gatgatattaaccctcttttagagcagactttgcttttgatggaggatcagaaattctat
tctcataaaggtataaattattttagaacagcttatctaggcatacaaacaattttaact
agaaaaatagtaggcggcggttctacacttactcagcagttagctaaacttctatttact
aaaagcgaaaggactatagaaagaaaactttttgaaatgtttgcagcaagagagatagaa
cagaaatatactaagaaagaaattttggctatgtattttaatactgtttatcttggtgat
ggaaactacggatttgaagccgctgctaatcattattttaataagcctttaagacaatgc
agattattagagtatgctatattggttggcatgcttccaaaccctacatattactctata
gttaataatccggataacagcagaaaaaaagtagagcagatattatcaagacttgtaaaa
aataatattatagataaacagacaatggaagctgagcttgatttatttgataaagaatat
actaatatcaataagcaggttaaaggtgctcaatggaagatgactgtgaacagaacacct
tatgttaatgagtatgtaagacaagaattattaaattattttaataaagatgagcttgca
ttatccggccttaaaatatatacaacagtaaatgaaagatattatagaatagctgattct
gtaatgaaagaaaatataagaaaattacagtctagttcttcaaatagaagttatcaaggt
gcaatggtatcaatagatccaaaaacaggtggaatacttgttatgataggtggagacgga
tacacattgcaaaatcagtttaacagagcagttcaggcaaaaagacaaatagggagtgta
attaaaccttttatttatttatatgcattcgaaggcggtgcgcagcctttttctactatg
cttgatacaaattacagctatcctcaaggagccggaaaacctgcatattcacctagaaat
tttgacagaaggtatagaggcgaaataactttagaaacagcattatcaaaatcaattaat
actatagctgttaaattattaaatgatataggactttcttattttatagaacattcaagg
gaattttttggagaaaatgcttatataccaaatgctttatctataggtttaggaactatg
gaaatgagtccgcttgatttagcttcagcatatagtgcattggctaatggcggtattaaa
tatgagccttatatagtagataaaattattgatatagatggtaatgaacttagtgttaca
gctttagtcgatagaactcctcacaaaataagtgcaacttccccatcatcttattatttt
ttaaattctactttacagaaagtaatagcaccaggcggaactgcatatagaagtgctagt
acttatggatttaaatatccttcatattcagctaaaacaggtacaacaagtgagcataga
gataactggtttgctgcatataatgatgaaatagttactattacttggataggaagcgat
agaaatgatttgcttccaaataatgttacaggaggagctactactgctttggctacattt
caatatcttgattctataactccatcatctaaaagagaatttaattggcctgttcctaat
gatgtattaatagtggaaatttgtcaggattcaggacttcctagaaatcatacttgtgta
aatgtatcgccgcttacagtaggaggaaatgttgatttatctactcaatgtcctatagat
caccttagaacagctacccctagaaatgaagcaactaatgatgctatgatggaagatgag
ggagatttttattatactcctttagatgaaaatagtaacagctatgatagtaatcaaaat
gataatatccaaaataataacaatgataataatatatatctactgcctgaagataatata
gaagatcctagtttaggaaatataagaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
