Borrelia hermsii CC1: L283_02555
Help
Entry
L283_02555 CDS
T03871
Name
(GenBank) membrane protein
Organism
bhi
Borrelia hermsii CC1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJW73312
LinkDB
All DBs
Position
521715..528899
Genome browser
AA seq
2394 aa
AA seq
DB search
MIDFVTILVNLLLVFVILFIYRQYDRRSRALEKIKKFIDLAKDNLEDFIDEKTKEISNLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIDEVQQKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDDMALKVQDNIQ
RLQVDGKIVDKLSKTLKNFNTQIDSIDSRLNTVFEKFDKANKENLEAIKIESWDKFDNTI
KDFSVRMDNLDRDLMSYQESLVMIEEKKREILDKGNEKLENEFKEFLFKIESSIDNYDKS
MEDSFNIYATKYKSIENSLDLIVEQAKTKINDKEDFILTRLNEELQIKFDEVFMYVDERS
NQIRDKLEGKLVLIDNEISSLGSVFKDNTYSRLNSLEETIRQEMRQYEEQFADILEQFRV
QIESNVGDIYREYDSRINQFDKGIRERIESSLKDANSKIEGVQGSVKTLLDDLEDDSNRI
YVEFKEKVKGDINSFSENVFSRMSDIGNELELRLSHISTDIHDRISKLDGNLYSQLKEMN
ERFVNDYSCLDGSISSKYETLLEALNLKSSELETQLESKYKNVADKFESDIDNFAIKCDE
KFSKISEKSDYDYQNFEITSKKIKEGIGSLNDLLVQDFETLRRDFESKLSGISADINDEV
SNLKSHYGEDIGKFIRQMEANKLQHEHWQREVGLNLEDIKFHLNKTNEEFLNLIETQRTK
GKELSENIFNELSGHIQKKAMDMHTNWKDELIVLNKSLLDIKISSEELLLSASSKIESFE
KDINERLEYVSSKTEDFESSVLDKYKELRDMSYKNSEETLSGIKEFIDDQAEIIHDKIIM
MLNGLNDDFSNKEELIKGKVEELDYRLKDFKVECEDVLNNLRSDLDGFIESRMQKVSEIK
VDNQRQIDTFLSRISEDILSKRDMLNSEIDNKLNDWQGKLSEISVNIENILSSGKIDINA
IDSEMTLKIKDLKTTFEGLESYYLEKIDEFRNQGNVYADELLKNIMNHFDADTKELEESL
SKKFATVLERSEEFVKEVDSLLKDKRTDISSFQASIDITIDSLNSRFSDLNREINEKYSK
VISDSRGYSETLANKLESEIGYEIENVNRRLTDKIDILNRNMDENLEKFKSSFDVSKYQV
ENFEIKIKNIIEHEELRIGEFFREIEHQYKIRREEAIDYKKTIDSDILQLREQFIGVINE
LKNNIEDKSEFLNELYKERFKIIENNFEERYSTFFIESEGAISKIRDEIYKILTDNDEHL
RAKISEMDRNFEIIEERSKEILELEEGLRQKIQEDSNNIYNQFDAIKSGIEKEMKAQFDM
YMMRATAAIDEEIEKYEHGINEKISAIKSIENHFEMIEKDLKDKISGYHNELDKTLALKY
AELEDKYDERYLFVEKKIDDKTTSIDGLIASKYAELEDKYDEKYLLVEKKIDDKTTSIDG
LIASKYAELEDKYDEKYLLVEKKIDDKTTSIDSLIASKYAELEDKYDEKCLLVEKKIDDK
TNAVDGLIASKYAELEDKYDEKYLFVEKKIDDKTTSIDGLIASKYAELEDKYDEKCLLVE
KKIDDKTTSIDGLIASKYAELEDKYDERYLFVEKKIDDKTTSIDGLIASKYAELEDKYDE
KYLLVEKKIDDKTTSIDGLIASKYADLDIKYSDMYLDMENRLNTCISALTAKLSSSGERM
EREINEQLQNLGKLKLSLSNVEEDVLKLKEDSYHNVSSHLKLLEEDFFKDLRERSDNLKS
SLENFVASSDQRIENLERDIIKSLEEKEILMKNFKVEFERELLLNKENFYLEFNKEFDIR
KRDAESKIVSMETNVTNRIDEFIQLVDNRQDNVDSWFLKVKDDMTNWQEHTYKEFEERAG
ITAKSLNEIKSDVLVIENGLEVIKDSVNQRTKEIFDRLHVDIKEFENRSYLNLKNISDEV
QGRVLNIENSMDSKISSINEKINSHVEELATQVEIRFLSQQKDIEDKILEANEKLEYEFN
LMASRLEEEKQDIVNSFLNDKGGVESQVKLMQDDVLKLSDKVNEYRVNIEKTIRENYDSF
TSSIREEYVSFENELKHSLSYSEEEIRTLRDGLKVQVNSIESEFKDKYNLMIEGIDENVS
QLKLKVLNYDSELNHFIDEVKDNLIVYKADLKEELDSRYAVISSKLENFKRLEVELEKNN
VLIKEVYYFKDKLEELREALANEINLVQGYKGDFEGIIREIGDIKAKSSDIIEIFDDLKM
HQMDIEGIKKDLSQFLEFYTSFKERYKKFTESYDEMQLYKTKFKEIKEEQNNILDNYDRI
SNKDSLLKSTLESVDKNFDLINEIESRMHVLFKESSGFQQSLGELKGIMSELLVNKDLSQ
EVLDNAQTLKEMLGEIDRKLEHTRNIREKVAKSETRLENLNIAAEERIKTLGILVKTESK
YKDNVGLNNETVRDSVIKLMRQGWSALEISRATKLSVGEVELILELGIISKSDD
NT seq
7185 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgtaaccattttggttaatcttttattggtttttgtgattttatttatt
tataggcagtatgacagacgttcaagggctttagagaagattaaaaaatttattgatctt
gctaaggataaccttgaggattttattgatgagaaaacaaaagagataagtaatcttgct
gttgatatggaagcgtatcaacgttctagtatagagatcataaaaaaaatagacgaagtt
cagcaaaagattaaaaataaaagtaatgattttgcagaagttgaaaaaaaaattgcttat
catgattctatgcttaaagatctagatgacatggctcttaaagtgcaagataatatacaa
cgacttcaagtggatgggaaaatagtagataaactttcaaaaaccttaaagaattttaat
actcagattgattctattgattctagattaaatacagtttttgaaaaattcgataaagca
aataaggaaaatcttgaggctatcaagattgagagttgggataagtttgataacaccatt
aaagattttagtgtgagaatggataacctggatagggatcttatgtcttatcaagaatct
ttagtaatgattgaagagaaaaagagagaaattttagataagggtaatgaaaagcttgag
aatgagtttaaggagtttttgtttaaaattgaatctagcatagataattatgataaatca
atggaagattcttttaatatatatgcaactaaatataaatcaatagaaaattctcttgat
cttattgtagaacaagctaagactaaaattaatgataaagaagattttattttaactaga
ttaaatgaggagctacagataaaatttgatgaagtctttatgtatgtcgatgagcgctct
aatcagataagagataaacttgaaggcaaattggtattaattgataatgaaatttcttct
ctgggttctgtttttaaagacaatacctattctaggctgaattctcttgaagagactata
agacaagagatgaggcagtatgaagagcaatttgcagatattttggagcagtttagggtt
caaattgaatctaatgttggtgatatttatagagaatatgatagtaggataaatcaattt
gataagggcataagagagaggatagagagtagcttaaaggatgctaattctaagatagag
ggtgttcaaggtagtgttaagacgttgcttgatgatcttgaagatgattctaataggata
tatgttgaatttaaggaaaaagttaaaggggatattaatagttttagcgagaatgtattt
tcaaggatgagtgatattggaaatgaattggaattgagactttcacatataagcacagat
attcatgataggatttccaagttggatggtaacttatattcacagcttaaagaaatgaat
gaaaggtttgttaatgattattcatgtttagatggtagcattagttcaaagtatgaaact
ttattagaagctttgaatttaaaaagtagtgaattagaaacccaactggagagcaagtac
aagaatgttgcagataagtttgagagtgatattgataattttgctattaaatgtgatgaa
aagtttagcaagatctctgaaaaatcagattatgattatcaaaattttgaaattactagt
aaaaagataaaggaaggtatagggtctttaaatgatttattagtgcaagactttgagact
ttaagaagagatttcgaatccaagttgagtggcataagcgctgatattaatgatgaagta
tctaatttaaagagtcattatggagaggatataggtaaatttattaggcaaatggaagct
aacaaattgcaacatgaacattggcaaagggaagtaggtttaaatttagaggatattaaa
ttccatttaaataaaactaatgaagaatttttaaatttgattgaaactcaaaggactaag
ggaaaagaacttagtgagaatattttcaatgaactctcaggacatattcaaaaaaaagca
atggatatgcatactaattggaaagatgagcttattgttttaaacaaatctttactcgat
attaagatttcgagtgaagaattactcttatcagcttcttcaaagatcgagtcttttgaa
aaagatattaatgagagacttgaatatgtctcgtcaaagacggaagattttgaaagttca
gtattagataaatataaagaattaagagatatgtcatataagaacagtgaagagacttta
tcagggattaaggaatttattgatgatcaagccgaaataattcacgacaaaattattatg
atgcttaatggacttaatgatgacttttctaataaagaagaattaattaaaggcaaggta
gaagaacttgattatagacttaaagacttcaaagttgaatgcgaagatgttttaaataat
cttagatcagaccttgatggatttattgaatctaggatgcaaaaagtctctgaaattaaa
gtggataatcagaggcagatagatacttttttaagtcgaatatcggaagacattttaagt
aaaagagatatgcttaatagtgaaatagataataagcttaatgattggcaaggtaagtta
agtgagatatcagttaatattgagaacatattatcatcaggaaagattgatataaatgca
attgattctgagatgactttaaagatcaaggatcttaagactacttttgaagggcttgag
agttattatcttgaaaaaatagatgaatttagaaatcaagggaatgtatatgcagatgaa
cttctgaaaaacattatgaatcattttgatgcagatactaaagagcttgaggaaagttta
tctaagaaatttgctacagttttagaaaggtcagaagagtttgttaaggaagttgatagt
ttgcttaaggataaaaggacagatatttcttcattccaggcaagtattgatattaccatt
gattctcttaattcaagattctctgatttaaatagagaaattaatgaaaaatatagtaaa
gtaatatctgattctagaggatattcagaaacacttgcaaataaattagaaagtgagata
ggatatgagattgaaaatgtaaatagaaggctaacagataaaatagatattcttaacagg
aatatggatgaaaatttagagaagtttaaatcatcttttgatgtatcaaagtatcaagtt
gaaaattttgaaatcaaaattaagaacataatagagcacgaggaactaagaattggcgaa
ttctttagagaaattgagcatcagtataaaattagacgagaagaggcaattgattacaag
aaaaccatagatagcgatattcttcagttaagagaacagtttataggagtaattaatgag
cttaagaataatattgaggataaatctgaatttttaaatgagctttataaagaaagattt
aagattattgaaaataatttcgaagagagatattcaacatttttcattgagagcgaaggg
gctatttcaaagattagagatgaaatatataagatacttacagataatgatgagcacttg
agggcaaaaatttctgagatggatcgtaatttcgagataatcgaggaaaggtcaaaagaa
attttagaacttgaggaaggtttaagacagaaaatacaagaggatagtaataacatatat
aatcaatttgatgccattaagtctggtattgaaaaagaaatgaaagcccaatttgatatg
tatatgatgagagctactgctgcaattgatgaagagattgaaaagtatgagcatgggatt
aatgagaagatatctgctattaagtcaattgaaaatcattttgagatgatagagaaagat
ttaaaggataaaattagtggatatcataatgaattagataaaactcttgctttgaaatat
gctgagcttgaagataagtatgatgagaggtatttgtttgtagagaagaagatagatgat
aagactacttcaattgatggtcttattgcaagcaaatatgctgagcttgaagataagtat
gatgagaagtatttgcttgtagagaagaagatagatgataagactacttcgattgatggt
cttattgcaagcaaatatgctgagcttgaagataagtatgatgagaagtatttgcttgta
gagaagaagatagatgataagactacttcaattgatagtcttattgcaagcaaatatgct
gagcttgaagataagtatgatgagaagtgtttgcttgtagagaagaagatagatgataag
actaatgcagttgatggtcttattgcaagcaaatatgctgagcttgaagataagtatgat
gagaagtatttgtttgtagagaagaagatagatgataagactacttcaattgatggtctt
attgcaagcaaatatgctgagcttgaagataagtatgatgagaagtgtttgcttgtagag
aagaagatagatgataagactacttcaattgatggtcttattgcaagcaaatatgctgag
cttgaagataagtatgatgagaggtatttgtttgtagagaagaagatagatgataagact
acttcaattgatggtcttattgcaagcaaatatgctgagcttgaagataagtatgatgag
aagtatttgcttgtagagaagaagatagatgataagactacttcgattgatggtcttatt
gcaagcaaatatgctgatcttgatatcaaatattccgatatgtatcttgatatggaaaat
agattaaatacatgtatttctgctctaactgcaaaactctctagttcaggtgaaaggatg
gagagagagattaatgaacaattgcaaaatcttggtaaacttaagttaagcttgagtaat
gttgaggaagatgtattaaaacttaaagaggactcttatcacaatgtgtcatctcatctc
aaacttcttgaagaggacttttttaaagatttaagagaaagaagcgataatttaaaaagt
tctttggaaaattttgtggcatcctcagatcaaagaattgagaatttagagagagatata
attaagagtttggaagaaaaagaaatccttatgaagaattttaaggttgaattcgaacgg
gaacttctgcttaataaagaaaatttttacttggaatttaataaagagtttgacatcaga
aaaagagatgcggagagcaagatagtttcaatggaaactaatgttaccaatcgaatagat
gagtttattcaacttgtagacaatcgtcaagataatgttgactcttggtttttaaaagtt
aaagatgatatgacaaattggcaagagcacacttataaagaatttgaagagagagcaggt
attacagctaaaagtttaaatgaaattaagagcgatgttttggttattgagaatggctta
gaagttattaaagatagtgttaatcagagaacaaaagaaatttttgatcgtttacatgta
gatattaaggaatttgagaatagatcttaccttaatttgaaaaatatttcagatgaggta
cagggtagagttttaaatattgaaaattccatggattctaagattagttctataaatgag
aagataaattcacatgttgaagagcttgcaacacaagtggaaattaggtttttaagtcag
caaaaagatattgaagataaaattcttgaggctaatgaaaaattagaatatgaattcaat
ttaatggcttctaggcttgaggaagaaaagcaagacattgtaaatagttttttaaatgat
aaaggtggtgttgaatcccaagtaaaattgatgcaagatgatgttttaaagctttctgat
aaagtgaatgaatatagagttaatattgagaaaacaattagggaaaattatgattctttt
accagctctataagagaggagtatgtttcttttgaaaatgaacttaagcatagtttaagt
tattcagaagaagagataagaactttaagggatggcttgaaggttcaagttaatagcata
gaatctgagtttaaggacaaatataatttaatgattgaaggtattgatgagaatgtgtca
caacttaagttgaaggtattaaattatgatagtgagcttaatcattttatagatgaagtt
aaggacaatctaattgtatacaaggctgatttgaaagaagaacttgatagtcgctatgct
gttattagttctaagcttgagaatttcaagagacttgaagttgagttagagaagaataac
gtactgattaaagaagtttattatttcaaggataaattagaagaattacgagaagcttta
gcaaatgaaataaatcttgttcaaggatataaaggtgactttgaaggcattattagagaa
attggcgatattaaagctaaatcatcagatattattgaaatatttgatgatttaaagatg
catcaaatggatattgagggaattaaaaaggatctatctcaatttcttgaattttacact
tcctttaaggagaggtataagaaatttacagaatcttatgatgaaatgcagctttacaaa
actaagtttaaggagataaaggaagaacaaaataatattctggataattatgataggatt
agcaataaagatagtttattaaagtctacattagaatctgttgataaaaattttgatttg
ataaatgaaatagagagtagaatgcatgtattatttaaagagagttctgggtttcagcag
agtcttggtgagcttaaaggtattatgtcagagctgctggtaaataaagatttatcgcaa
gaagtgctagataatgctcaaactcttaaagaaatgctaggggaaattgatcgtaaattg
gaacatactagaaatataagagaaaaggttgcaaaatctgaaactcgactagaaaattta
aatattgctgcagaagagagaattaaaacccttggaattcttgtaaaaacagagtctaaa
tataaagataatgttggtcttaataacgaaacagttagagattctgtcattaagcttatg
agacaaggttggagtgccttggaaatttcaagagctactaaattatctgttggagaggtt
gagcttattttggaacttggaattattagtaaaagtgatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system