Benincasa hispida (wax gourd): 120082832
Help
Entry
120082832 CDS
T07258
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
bhj
Benincasa hispida (wax gourd)
Pathway
bhj03015
mRNA surveillance pathway
bhj03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
120082832
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120082832
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
bhj03041
]
120082832
Spliceosome [BR:
bhj03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
120082832
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120082832
NCBI-ProteinID:
XP_038894092
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(15426243..15437070)
Genome browser
AA seq
480 aa
AA seq
DB search
MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGG
RGGGGGGGYGGRGGGGGGGGGYQGGDRGGRGAGRSGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLN
FARRVECNKCGAPSPGGASDRSGGGGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSYHGGRSGAHD
GGRNEGGNRGGNSFGGHQGGEDSRYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHAGTADYGTDAVP
PPASYSGTTYPPSYGAPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAGGRGGYNAGGRG
GGSYNASGGRGGGYGSTPTAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFG
GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG
YSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1443 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtacgatcaaggaggagacgctgctccgtcgtacggagcccctggaggc
ggtggaggatacggtggtggaggtggaggtggaggatatgggggcggtggagggaagggc
ggtgacggtggatatggcggtggaggccggggtggcggcggcggtagaggctatggagga
cgaggtggcggcggaggtggaggctacggtggtcgaggcggcggaggcggaggcggaggc
ggatatcaaggaggagatcgaggagggcgaggggctggacgcagtggcggaggtggtcgt
ggcggaagtggcagagatggggattgggtctgccctaatcctggctgtggaaatttgaac
tttgctagaagagtggagtgtaacaagtgtggtgcaccttcacctggtggtgctagtgat
cgaagtggtggtggcggcggtggtggtggttataatagaggtggagctgatgggggttac
ggtggaaatcgtaatggcagaggtggtagttaccatggtggtagaagtggagctcatgat
ggaggtcgaaatgaaggtgggaacagaggtggtaattcttttggtggtcaccagggagga
gaagatagcaggtacggtcaggtgcccccatcctcggcaccctcatctggtggtcttgct
ggctcttatccaccatcttaccatgctggaactgcagattacgggactgatgcagttcct
cctcctgcaagctacagtggaactacataccctccaagttatggtgctcccactggtggc
tatggtggtgatagtctaggtgatgggcgtggtgctgctggtcggggtgggccatcaggt
ggatatgatggtggctacaatgctggtggtagaggtggctataatgctggtggtagagga
ggaggaagctataatgccagtggcggtagaggtggtggttatggaagtacaccaacagca
gagccagcacaggttaagcagtgtgatgacaattgtgatgattcgtgtgataactctaga
atctatgtatctaatttgccaccagatgtgaccattgatgaattgagagaattatttggt
gggattggtcaaattggaagaatcaagcagaagaggggctacaaggatcagtggccttgg
aacataaaaatatatacagatgagatggggaataacaaaggcgatgcatgtgtatcatat
gaagacccctccgcggcacattctgctggcggtttctataacaattatgatttgagaggc
tatagcatcaatgttgcaatggctgaaaagtctgcaccgagggctccacccacatacaac
catggtggtggtggtagaggtggatatggaggtggtggagataggcgcagagatagctat
agggatggaggctctggacctgatagacatcagcatggtggaaatcgatcccgtccttac
tga
DBGET
integrated database retrieval system
