Bacteroides helcogenes: Bache_0387
Help
Entry
Bache_0387 CDS
T01393
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
Organism
bhl
Bacteroides helcogenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV42414
UniProt:
E6SUX8
LinkDB
All DBs
Position
complement(501641..504997)
Genome browser
AA seq
1118 aa
AA seq
DB search
MNEDHKKRGSAHSKLLTAVAISALFLGSGNMMATQTAFADTHGVLEQMQSISVTVTVVDS
KGEPIIGANVIERGTTNGGITDLDGKFKMKVKPGAMIQVSFVGYQTQDVKAAPNMRVILK
EDAELLDEVVVVGYGSQKKVNLTGAVASVDVNKTIDSRPITDIGRALQGAVPGLTVTTNS
GEIGGAPTIKIRGSVGSPNGSANPLILVDNVEITDISLVNPDDIESISVLKDASSASIYG
ARGAFGVVLITTKSKQKHERLSVKYTNNFAWRTPTVTPKQLPGWQQADINLKGVQNGVTP
ANSYSVIGNLVIDEAGVAKMKEYWDKYGFGNQFGSEIVEGRDFDWDGTGMHMYRTWDWYD
MYIKNWMPQQSHNVSLNGGNGKTNYNISLGYIHQEGLTKINSDEYTRYNGNISLNSDLNK
YISVRAAVMYTRADYDKPYNYNSDLYDAMYYLYRWQPVYPYGTLDGKEFRSALTELKSAP
MQTKEREYVRLSGGATIKPIEGLTIDIDGIYSSVETREHKYGTPGLVAGYNVFTAYNSLE
AFKNSYSNYVAASHDFVQMINGRTETLTGNFVATYGKRIKDHDFKVMAGSNIEKSEYKYF
WGKRMRLLSTEKPELNMATGDQTTSSDHTWWAVAGFFGRINYSYKDRYMLELNGRYDGSS
RFPSGQRFAFFPSMSVGYRISEEAFMQSLKPYLSTLKLRGSWGTIGNQDVGTDRFVSTLS
TAQDSWIIDGQKVQSTGMPTIVSSELHWEKVSTLDFGFDARLFDDALGVTFDWYNRKTTD
ILTTANVPWTLGATAPYQNMGAIETPGWELAVDYRHSFKNGLTIGIGASVSDYTTKVTKW
TNNTRMPAYGGDGTGWWSTTYYQEGMRLGDIWGLQFDRFLTDADFNADGTLKSNIPDQTQ
VFPKNYRFAPGDVLYKDLPGKDGKTDGKITKGTATDNPGDMSVIGNALPRYQVGFNFDAA
YKGFDFNIFFQGVLKNNLWAAGNQVLPGFTSGEPYYEGAEDYWTPENQNAFYPRPMTYGQ
ATTGNYQINDRYMLNMAYLRCKTLTVGYSLPKTLLSKVKIQNLRIYFTGENLFTISGIKP
DIDPEIGVRYVGSSADQRNFGRSYPYQKSISFGLQLSL
NT seq
3357 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaagatcacaaaaaacgaggatcagcgcatagtaaactcctcacggcagtggct
atcagtgcgctgtttttaggcagtggcaatatgatggctactcaaacggcatttgccgat
actcatggagtattagagcagatgcaatctatttctgtgactgtcacggtggtagattca
aagggtgaacctataatcggcgccaatgtcattgaaaggggtacgactaatggtggtatc
acagatctggatggtaaatttaaaatgaaagtgaagcccggagccatgatacaggtctct
tttgtgggctaccaaactcaagatgtgaaagctgctcccaatatgagagtaatcttgaaa
gaagatgcggaacttttggacgaagttgtggttgttggttatggttcacagaagaaagtg
aacttaacgggtgcggttgcttcagtagatgttaataaaaccattgatagtcgtcccatt
actgatattggtcgcgctttacaaggtgctgttccgggattaacggtaactacaaattca
ggagaaataggtggtgctcctaccattaaaattcgtggtagtgttggttcgccaaatggt
agtgccaacccacttattttggttgataacgtagaaatcaccgatatttcattggtaaat
cctgatgatattgaaagtatctcagtattgaaagatgcttcttctgcttctatttatggt
gcgcgtggagcttttggtgtagtacttattactaccaagtccaaacaaaagcatgaacgt
ctttctgtgaagtacaccaataactttgcttggcgtacaccgaccgtgactccgaaacaa
ttgcctggatggcaacaagccgacattaacctgaaaggtgtgcagaatggtgtaactcct
gctaatagttatagtgtgattggtaatctcgttatagatgaagcgggtgttgccaagatg
aaagagtattgggataagtatggttttggtaaccaatttggttctgaaatagtagaaggt
cgtgactttgattgggacggaacaggtatgcacatgtaccgtacatgggactggtacgat
atgtacattaagaattggatgccgcaacaaagtcataatgtttcattaaatggtggtaac
ggaaaaaccaactataacatttctttgggctatattcatcaagaaggtttgactaaaatt
aactccgatgagtatacacgttacaatggaaatatttctctgaattctgatttgaataaa
tatatttctgttcgtgcagcagtgatgtacactcgtgcagactacgataaaccttacaat
tacaattccgatttatatgatgccatgtactacctctaccgctggcagccggtctatccg
tacggaactcttgatggaaaggaattccgtagtgcattgaccgaattgaaatcagctcca
atgcaaaccaaagaacgtgaatatgtgcgtttaagtggtggagctacaattaaacctatc
gaagggttgacaatcgatattgatggtatatatagttcagtggagacacgtgaacataag
tatggcacacctggtttggtagctggatataatgtatttaccgcctataactcattggag
gcttttaagaactcgtattctaattatgtagctgcttcccatgattttgtacaaatgata
aatggacgtactgaaactctgactggtaactttgtagcaacctatggtaagcgtatcaag
gatcatgactttaaggtaatggctggttcgaatattgaaaagagcgaatacaaatacttc
tggggaaaacgcatgcgcttgctgtctacagaaaagccggaactaaatatggctaccggt
gaccagactacaagtagtgatcatacgtggtgggctgtagctggtttcttcggtcgtatt
aactattcatataaagaccgttatatgttagaattgaatggtcgttacgacggttcgtca
cgtttcccctcaggacaacgttttgctttctttccatcaatgtcagttggttaccgtatt
tctgaagaggctttcatgcaatcattgaaaccttatcttagcacattgaaattgagagga
tcatggggaactatcggtaaccaggatgttggtacagaccgttttgtttctacactttct
actgcccaggatagttggattattgatggacagaaagttcagtctaccggaatgccgaca
attgtatcttcggaattacattgggagaaggtttctactcttgacttcggttttgatgca
cgtctcttcgatgatgctttgggggtgacttttgactggtataatcgtaagacaactgat
attcttaccactgcaaatgttccttggacattaggagctaccgccccctatcaaaatatg
ggagctattgaaactccgggatgggaattagcagttgattatcgtcatagttttaaaaat
ggtcttacaatcggtattggagcttctgtttcagactacacgactaaagttaccaagtgg
acaaataacactcgtatgcctgcttatggtggcgatggtactggctggtggagtactact
tactatcaggaaggtatgagactcggtgatatttggggacttcaatttgaccgtttcctt
accgatgcagacttcaatgcagatggtactttgaagagtaatatccctgaccaaactcag
gtattcccaaagaattatcgttttgctccgggtgatgtgctctataaagatctgcctgga
aaagatggaaagacagatggcaaaattaccaaaggaactgctactgacaatcccggtgac
atgagcgttatcggcaatgctttgccacgctatcaagtaggatttaattttgatgccgct
tataaaggatttgattttaatattttcttccaaggcgtattgaagaataatctttgggct
gcaggtaatcaggttctgccgggcttcaccagtggtgagccctattatgaaggtgcggaa
gattactggactcccgaaaaccagaatgcattctatccacgtcccatgacttacgggcaa
gcaactacgggtaactatcagatcaatgaccgttatatgttgaatatggcatatttgcgc
tgcaagacattgaccgtggggtattctttgccgaaaaccctgcttagcaaagtgaagata
caaaatctacgcatctactttaccggtgaaaatttgtttactattagtggtatcaaaccg
gatattgacccggaaattggtgttcgctatgtcggttcttctgccgatcaacgtaatttc
ggacgtagctatccgtatcaaaaatcaatttcatttggtttacaactcagcttataa
DBGET
integrated database retrieval system
