Bisgaardia hudsonensis: A6A11_04145
Help
Entry
A6A11_04145 CDS
T06663
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
bhud
Bisgaardia hudsonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhud00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bhud00536
]
A6A11_04145
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bhud00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
A6A11_04145
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg_2
ESPR
Fil_haemagg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB12853
LinkDB
All DBs
Position
877181..885901
Genome browser
AA seq
2906 aa
AA seq
DB search
MNKYCYRVIFSKTQQRFIVVSELAKVDGKAKTENTTSINSVSKTFEKMTALLGQGSYLFK
PLSFALYCALGFVSLIPQVQAENAPLIIKADPTANANERPIVLETANGIPQVNIQTPNPK
GLSYNRYSQFDVDNKGAILNNSRQHTQTQLGGWVQANPYLAGSEAKVIVNEVNSNKPSQL
KGYVEVAGQRADVIIANPSGLHCEGCGIINADRVSLTTGKPQLNGGSLESFVVEKGKVSV
SGKGLDNSQSNYTDIIAKEVKVNAGVWSKKAINVTTGHNKVSKNNDSVQIINSKSNTTNT
DDTHYSVDVANLGGMYAEKIHIIGTESGLGVRNLGHLGASAGDIVIDVNGKVVNKGNINA
NKQVSITAKNNIENTGNIETKQKHIVLNTQSNLQQDGSLISHQGNIIAQANKNITQQGKT
IANKSIHYKAENINTANHAVVAAGITTTEKEGVTNNQLEKQTKTGQTLSISSTNKANLQG
KHLTSGKLEVNAKSVNLTDSQNSGYDITVNSSQADLLADNSTIVALNHLTLNTPALLSTQ
RANLSADSINAKATQINNYAGKWVNRGNTLLQLQLEKGLNNHVGLMLSGGSMDLSMSNQR
LNNYQGRLLSGGQLKVEGQDIDNRGGQIIADKGITLSLTGNLDNQGINGKGSFIQTQDAL
VIDALTINNTKTKATQATPIQGILGQQVSITSQQVDNHTGGIYATNTLNANIEKVLTNQS
GEILSTGDLVIKAEQGKVVNTQGAIQANKGLNLSASYLSGDGYVEGQQVDIQLKEDFLSQ
KDIVGGDVLSLATQGNLINEAGLYSEGTLSLRSNHLQNKNKAEIQGNTTTVEVQGNLINR
GLIKGKRSSLLKVGQGLTNIGTGRIYGDTVAIQAQQLENTDELQTDGQISSAVIATHQRL
DIAAPIIKNSKTVFTKDWSFNGLGGTLSSGGDIYIGRRLNEQNQAVGKADIFLNQGALIE
GRHISLDVQEIKNTNARLRTNLDTLSDTSVNEHYLIVDNAQTGERINFDLLKWVSYSRAG
KVVFRGKELTTRPTNSDFEGYILPMPNEDVCTNEAERMGCAPSPKAIYLKDDPAWSYFKL
NAPESDAPPLPDLSQLDPSLKEPIEPSKPRKRWFESQDGYQIRIDKYLDELKDYEMAKKA
YDKKLEKYSEQIKPYLNWVKENSEKFSDLEKAIETHNSKLWGREFYKFWDVYVTRRVEKE
TIVKETHPAKILSTGNISFTGNLLNDRSTIIANDKIYNSQNNPTSLVNEDAFGIHRTEDY
GNQEWTKSRWRGGFKRYHQRDWEGRHAHLRVAEKTIALNQAIAQEQGQFEAIAIQPDLTL
NAINLNKNQKVTEGINDKQHQQQVVDEVRHIRANTVLPTSSLYKINPHANSHVLVETDPA
FTNRQKWLSSDYMFNMLRSDHNLVHKRLGDGYYEQRLIREQINQLTGRQFLGNYQDMESQ
YKALMNSGVSFAKKFNLSLGVSLSKEQVAQLTSDIVWLEAQQVTLPNGKEQRVLVPKVYV
MTKKGDIDGKGALISANNIAVNSQSLTNSGIISGRQLTLLKANNIINQGNISGELVAIQS
SGDLTNTGGKISAEKALAIDVAGDLTHQSTTINTKVDLSHYQRHTTDLDRNALIYVKGQN
GQLQISANNINIKGADIINEGDGQTIISAKNRLNLTALKTLDDEKMGKGDHYRNERVQDV
VISHVKGGGELQLQAYTIESEGAKLEAKRKLIALAENDLVLKSATKELDYDEYHYTKSGS
AISRSTKTTYDAKHNISKQGTQLNAENIALLSGNNIEAKGVEIVADKNIDIVAKNNINIE
ADTNYDKATHFEKKTKSGIFSGGGLGFTIGKRSETHHSEAEGWTQSDARSVVGSLSGDVN
IKAGNEVKVLGSDLIANRENNNKINVEAKKIKVEAGKDVFESTEKHEFKQSGLTIALSTP
VTDMAFKAQESLKRSQQVKSEKLANLYKVKAANELYLASQSIDEVKDTIDAISDSTKAMK
EGDVSNPSIKVSISVGAQKSTQESNTKQVIHSGSELSAGNLHLKTTEGDIDILGSTLSAN
QINLNSANNLNVESVQDTYTNRSSNKNAGGSIGVFVGMSGNSVGLGIEGSVQAGKGKENS
DSITQKNSHINGQAVSIETIKDANFKGAVVNADKLEATIGNNLNIESRQDSNHYDSKQVQ
ANAGFSVAIYGSGSNVSASASLNKAKLNYAQVEEQSGFNVGEGGMNVNVKHNTHLKGGLI
QSKAEADKNYFTTNSLTTEDITNHSEVKVQSVSGGFSTGNMMQNVAHGLGAAASALGNKN
DSQETTTQSAIGNNINLTTKTGEIPTALSRDTENANQKVGSYDLEEIKEQQEAARVGGEL
AASLVGDLAKKMEWKDGSPQKVALHAVAGFLVAKASGGNGLVGAGSGAVSEWINTEVADY
LKANHTNLTEDDRKVIQQISALGLGAVVGAVGGASSESIKQGALTSFNAEKFNRQLHPNE
IEWIKENAKRFAEQEGISTKEAEKRLSQQAAKELDILWFLSLDDKQDSQAQAFLASQKNK
TFTHINGEKEHYFVAGGNDFWVSRKYAKEADTYNQRTGFISEKLTSGIVRTPTEGLRDKV
KQTYKSVSENKLETVKKVGESVVNSAMDCGRDPLACGRDIVDNFVTTGKSSIEETYRNVM
GEDVEEINRLYGQDMRGEMTAISTAQLIGTVGEVVGAGKVAKAGGKAVGKGVVAIKNSDV
VKNAVEGGANQINRVVNYSTLNKVIDEVDNIAITSPSGYINAQKVCKSGCELKPTSTIER
DLIADIVKNGDKTGEKTEKLVNSLAKRSGYKVLKGGKYGGNSGFDHVLQAKDGSIVIIDS
KQITNGATKVSNKGAKLDNKVTNQLSQDWIEAVATEKFDLDKTDPAILAVRKALKNKQNQ
PIKTLIIGVDKVDEKIKLIPVEVPNK
NT seq
8721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagtattgttaccgagtgatttttagtaaaactcagcaacgttttattgtggta
tcggaattagcgaaagtagatggcaaagcgaaaacagagaataccacgtctattaactcg
gtatcaaaaacctttgaaaaaatgaccgcacttttaggtcaagggagttacttatttaaa
ccactttcttttgcactatattgtgctttaggttttgtaagccttattccacaggtacaa
gccgaaaatgccccattaattattaaagcagaccctactgccaatgctaatgagcgtcca
atagtattagaaacagccaatggtattccacaagtcaatattcaaaccccaaatccaaaa
gggctttcttataaccgttatagtcaatttgatgtggataacaaaggggcaattttaaat
aacagtcgccaacatactcagacacaactaggtggttgggtacaagccaatccttaccta
gcgggtagtgaggcaaaagtgatagtcaatgaagtcaattctaataaaccaagccaatta
aaaggttatgtagaagtggcaggacaaagagcggatgtgattattgccaatccaagtggt
ttacattgtgaaggttgtggcattattaatgcggatagagtgagcttaactactggaaaa
ccacaacttaatgggggaagtttagaaagttttgtggttgaaaaaggcaaagttagtgtt
tcaggtaaaggtttggataatagccaaagtaattatacggatattatagctaaagaagtg
aaagttaatgctggggtttggtctaaaaaggcaataaacgtgaccacgggtcataataaa
gtgagtaagaacaatgattctgtgcagattatcaatagtaaatccaatacaactaataca
gatgatacacattattcggtagatgttgctaatttagggggaatgtatgcagagaagatt
catattattggcacggaatctggcttaggggtacgtaatcttgggcatcttggtgcttct
gctggggatattgttattgatgtgaatggtaaggtggtaaacaaaggcaatattaatgcg
aataaacaagtatcgataacggcaaaaaataatatcgaaaatacaggaaatattgagaca
aaacaaaagcatatcgtattaaacactcagtctaatttgcaacaagatggctctcttatc
agtcatcaaggaaatattattgctcaagcaaataaaaatattacccaacaaggaaaaact
atagccaataaaagtattcattataaagccgagaatattaataccgccaatcatgcggta
gttgcggcaggcattacaacaacagaaaaagagggcgttacaaataaccaattagagaaa
caaactaaaacgggacagacgttatcgatttcttctaccaataaagccaatttacaaggt
aagcaccttacctcagggaagctagaagttaatgcaaaatcagttaatttaactgatagc
caaaatagtgggtatgatattacagttaattcttctcaagccgatttattagcggataac
tcaacaatagtcgctttaaaccatcttacattaaatactccagcgcttttatctactcag
cgtgccaatttaagtgcagattcgattaatgcaaaggctacacaaattaataattatgca
ggtaagtgggtaaatcgtggtaacacattgcttcaactacaacttgaaaaaggcttaaat
aatcacgttgggctaatgttatcaggcggtagtatggatttatcaatgtctaatcaacga
ttaaataattatcaaggtcgtttattgagtggtggtcagcttaaggtcgagggtcaagat
attgataatcgaggcggacagattattgcggataaagggataacgttatctttaacagga
aatctagataatcaagggataaatggtaaaggctcttttattcaaactcaagatgcctta
gtgattgatgctttaactatcaataatacaaaaacgaaggctacacaggcaacaccaata
caaggaatactcggacaacaagtcagtattacctcgcaacaagtagataatcatactggt
gggatttatgctaccaacacattaaatgccaatatagagaaagtattaacaaaccaatca
ggtgaaatcctttctacaggggatttagtgataaaagcagaacaaggaaaagtggttaat
acacaaggtgctattcaagcaaataaagggcttaatttatcagcaagttatttatctggc
gatggttatgttgagggtcagcaggtagatattcaattaaaagaagattttttatcacaa
aaagatattgtcggaggtgatgtactttctttggctactcagggcaatttaattaacgaa
gcagggttatattcggaaggtactctttctttacgtagtaatcatttacaaaataaaaat
aaagcagaaattcaggggaataccacaacagttgaagtgcaaggtaatcttattaatcga
ggattaattaaagggaaacgctcatcactgcttaaagttggtcaaggattaacaaatatt
ggaacagggcgtatttatggtgatacggttgctatccaagcacaacaattagaaaatacc
gatgaattacaaacagatggtcaaattagctcagcggtcattgctactcatcaacgttta
gatattgctgccccaattattaaaaatagtaaaacggtgtttaccaaggattggtcattt
aatggattaggaggcactctttcaagtggtggtgatatttatattggacgcagattaaat
gaacaaaaccaagcggtaggaaaggctgatatattcttaaatcaaggtgcattaattgaa
ggtcgtcatatcagcttagatgttcaagaaataaaaaatacaaatgcacgtttacgtact
aatttagatacgttaagtgatacgtcagtaaatgaacattacttaattgtggataatgct
caaacaggagaaagaattaattttgatttattaaagtgggtatcctatagccgagcggga
aaagtcgtatttagaggtaaagaattaacaacaagaccgactaatagtgattttgaaggc
tacatattgcccatgccaaatgaggatgtttgtactaatgaggcagagcgtatgggatgt
gcgccatcacctaaagcgatttatctaaaagacgatccggcttggtcttattttaaatta
aatgccccagaaagtgatgcgcctccgcttcctgatttatctcagttagatcctagctta
aaagagccaatagagccatctaaaccaagaaaacgttggtttgaaagtcaagatggttat
caaattcgcattgataaatatctggatgaattaaaagactatgaaatggctaaaaaagcc
tatgataaaaagttggaaaaatactcagagcaaattaaaccttatttaaactgggtgaaa
gaaaatagcgagaagttttcagatttagaaaaggcgattgaaacgcataatagtaaatta
tggggacgagagttttataaattttgggatgtgtatgttacaagacgagtggaaaaagaa
acaatagtaaaagaaacccatcctgcgaaaatactcagtacaggtaatatcagttttaca
ggaaatttattaaatgatcgcagtacaataattgctaatgataaaatttacaattcacaa
aataatccaactagcttggttaatgaagatgcgtttgggattcatcgtacagaagattat
ggcaatcaagaatggactaagtctcgttggcgtggagggtttaaacgttatcatcaaaga
gattgggaagggcgtcatgcccatttaagggtagcagaaaaaaccattgcattaaatcaa
gcgattgctcaagaacaaggacagtttgaagcaatagcaatacagcctgatttaacactt
aatgcaattaatttaaataaaaatcagaaagtaacagaaggcatcaatgataaacaacat
caacagcaagttgttgatgaagttcgccatattagagccaatactgttttaccaacatcg
agtctttataaaattaatcctcatgctaatagtcatgtattagtggaaaccgatccggct
ttcaccaatagacaaaaatggttaagtagtgattatatgtttaatatgttgcgttcagat
cataatttagtgcataaacgcttaggtgatggttattatgagcaacgcttaattcgagag
caaataaatcaactaacaggtcgtcaattcttgggtaattatcaagatatggaaagccaa
tataaagccttaatgaacagtggcgtgagttttgcgaagaaatttaacctttcattgggg
gtaagtttaagtaaagagcaggttgcacaattaaccagtgatattgtctggcttgaagct
caacaagttaccttaccaaatggaaaagagcagagggtattagtgccaaaagtctatgtg
atgacgaaaaaaggcgatattgatgggaaaggagcattaatatcagcgaataatattgcg
gtaaatagtcaatctttaacaaatagtggcataatttcagggcgtcaattaacgctatta
aaagcaaataatattatcaatcaaggtaatatttcaggggagttagttgcgatacaatct
tctggcgatttaactaatacaggtggaaaaattagtgcagaaaaagccctcgctattgat
gttgcaggtgatttaacacatcaaagtaccacaataaataccaaagttgacctatctcat
tatcaacgtcacaccactgacttagaccgaaacgccttaatttatgtaaagggtcaaaat
ggtcaattacagatatcagcgaataatatcaatataaaaggggcggatattatcaatgag
ggtgatggacaaaccattatttctgcaaaaaatcgtttaaatttaaccgcacttaaaacg
cttgatgatgaaaaaatgggcaaaggcgatcactatcgtaacgagcgagtacaagatgta
gtgataagccatgttaaaggtggaggggagctgcaattacaagcgtatacaattgaaagc
gaaggagcgaaacttgaggctaaacgaaaactcatcgctcttgctgaaaatgacttagtc
ttaaagagtgcaacaaaagaattggattatgacgagtatcattatacgaaaagtggttca
gcaataagtcgttcaactaaaactacttatgatgctaaacacaacatcagcaaacaaggt
acgcaactcaatgcagaaaatatcgcattattatcaggcaataatatagaagccaaaggg
gtggaaattgtagcagataaaaatattgatatagtggcaaaaaataatatcaatatagaa
gcagatacaaattacgacaaagccacgcactttgagaagaaaacaaaatcaggtattttc
tcaggaggcggattagggtttaccattggtaaacgctcagaaacgcatcattcagaagcc
gaaggctggacacagtccgatgctcgttctgttgtgggttcattgtcaggtgatgtaaat
atcaaagcaggaaacgaagttaaggtattgggttcagatttaatcgctaatcgagaaaac
aacaataagattaatgttgaagcaaagaaaatcaaagttgaagcggggaaagatgtgttt
gaaagtacggagaaacacgagtttaaacaatcaggtttaaccatcgccctttcaaccccc
gtaacggatatggcatttaaggctcaagagagtttaaaacgaagccaacaagtgaagagt
gaaaagctggctaatctttataaagtgaaagcggcgaatgaattatatctagcttcacaa
agtattgatgaagtaaaagatacgattgatgctataagtgatagtactaaggcaatgaaa
gagggcgatgtttctaacccaagtattaaagtctctattagcgtaggtgcacagaaatct
acgcaagaaagcaacacaaaacaggtgattcattcaggctcagaattaagtgcggggaat
ctacatcttaagacaacagagggggatattgatattctcggctcaaccctttcagctaat
caaatcaatctcaacagtgcaaataatcttaatgttgaatcagtgcaagacacttacact
aaccgttctagcaataaaaacgcagggggaagtattggtgtgtttgtaggaatgagtggc
aatagcgttggattaggcatagagggttcagtacaagcaggtaagggcaaagaaaatagc
gatagcattactcaaaagaacagccatattaatggtcaagccgtttctattgaaaccatt
aaagatgctaactttaaaggagcggtagtgaatgcagataagcttgaggcgactataggt
aataatcttaatatagaaagccgtcaagacagcaaccattatgattcaaaacaagtacaa
gccaatgcaggttttagtgttgctatttatggttcaggctcaaatgtttcagcgagtgcg
agcttaaataaagcaaaactgaattatgctcaagtagaagagcaaagtggctttaatgta
ggtgagggtggaatgaatgtgaatgttaagcataacactcacttaaaaggcggacttatc
caatcaaaagccgaagcggataaaaactactttaccactaatagcttaacgacagaggat
ataacaaaccattcagaagtgaaagtccaatcggtaagtggtggtttctctactggcaat
atgatgcaaaatgtggctcatgggttaggagcggcagctagtgctttaggcaacaaaaac
gacagtcaagaaacgaccacacaaagtgctataggaaacaacatcaacctcactacaaaa
acaggggaaataccgaccgccctttcaagggataccgaaaacgctaaccaaaaagtgggc
agttatgaccttgaagagattaaagagcaacaggaagcagcccgagtaggcggtgagtta
gcggcaagccttgtaggtgatttagctaaaaaaatggaatggaaagatggtagcccacaa
aaagtagcgttacacgctgtagcaggtttcttagtcgcaaaagcgagcggtggtaatggt
ttagtgggagcaggtagtggagcagtgtctgaatggattaatacagaagtagcggactac
ttaaaagccaatcatactaacttaacggaagatgaccgcaaagttattcaacaaatttca
gcactaggtttgggcgctgtagttggagcagttggcggagcgagttcagaaagcataaaa
caaggtgctttaacgagttttaatgcagagaaatttaaccgtcaattacatccaaatgaa
atagaatggattaaggaaaatgcaaaacgttttgctgaacaagaagggataagtacaaaa
gaagcagaaaaaagactatcacaacaagcagcaaaagagcttgatatattatggttctta
tcacttgatgataaacaagatagtcaagcccaagcttttttagctagtcaaaagaataaa
acctttactcatattaatggtgaaaaggagcattattttgtagcaggaggtaatgatttt
tgggtatcaagaaaatatgctaaagaagcggatacttataatcaacgcacaggttttatt
agtgaaaagttgacctcaggaatagtgagaacaccaacagagggcttaagggataaagta
aaacaaacttataaatcagtttcagaaaacaaattagaaacggtgaaaaaagttggagag
tcagttgttaatagtgcgatggattgtgggagagacccactagcttgtggtcgtgatatt
gtcgataattttgttacaacaggtaaaagtagtatagaagaaacttatcgaaatgtaatg
ggagaagatgtagaagaaatcaaccgcctatatggacaagatatgcgtggtgaaatgacc
gcaatttctaccgctcaactgattggcactgttggagaagttgttggagctgggaaggtc
gctaaggcaggtggaaaagcggttggtaagggtgttgtcgctataaaaaatagtgatgtc
gtaaaaaatgctgttgaaggtggagcaaatcaaattaaccgagtggtgaattattcaact
ttaaataaagtgattgatgaagttgataacatagcgattacctcaccaagtggctatatt
aatgcacagaaagtatgtaagtcaggttgtgaattgaagccaacaagtactattgagcga
gatttaatagcggatattgtaaaaaatggagataaaacaggtgagaaaacagaaaagctt
gttaatagcttagcaaaacgttcaggttataaagtacttaaaggcggtaagtatggtggt
aacagtggatttgaccatgtacttcaagctaaagatggctctatagttattattgacagt
aagcaaattactaatggtgcaactaaagtaagtaataaaggtgctaaattagataataaa
gtaaccaatcagctttcacaagattggattgaagctgttgcgacagaaaagtttgattta
gacaaaacagatccagcaatattagcagtgagaaaagcacttaaaaataaacaaaaccaa
cctattaaaacattaattataggggttgataaagttgatgaaaaaatcaaattaatccca
gtagaagtacctaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system