KEGG   Bisgaardia hudsonensis: A6A11_05875
Entry
A6A11_05875       CDS       T06663                                 
Name
(GenBank) lytic transglycosylase
  KO
K08305  peptidoglycan lytic transglycosylase B [EC:4.2.2.29]
Organism
bhud  Bisgaardia hudsonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bhud00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:bhud01011]
    A6A11_05875
Enzymes [BR:bhud01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.29  peptidoglycan lytic transglycosylase
     A6A11_05875
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:bhud01011]
 Peptidoglycan biosynthesis and degradation
  Lytic transglycosylase
   A6A11_05875
SSDB
Motif
Pfam: SLT_2 DUF5033
Other DBs
NCBI-ProteinID: QLB13174
LinkDB
Position
complement(1282855..1283940)
AA seq 361 aa
MLKLKLSLFIASFILGACSSNSYSIKPIDNDTTYNKPRTLLNFDDYVVFLKQKAVAQGVS
AKLLNSQNNINYIQKAVDLDRKQAGRSIKSTATKPIANPHGVSRYLKRVLTDNKVNVAER
RYWERLPELTKASERFGVQKEYLMALWGMESSFGYYQGNYDVLSVLATLAFDGRREDLFS
KEFISAMKLLERDHIDRNKMLGSWAGAMGQTQFMPSSYLSYAADGDKDGNKDIWKNHYDV
FSSIANYLHTVGWNNELPWGVEVNLTQYMDLDLSGIENEKAGSLQEWQNKGVSLKSFSTV
EQDKLNSLSREKLWLVRPDKELGRAFLVSNNFRTLLNWNRSNYFAVSIGMFADRINQRVS
N
NT seq 1086 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaaattaaaattatcgctatttattgcgagctttattcttggtgcttgttcaagt
aatagttattccattaaacctatcgataatgatacaacatataataaaccgagaacttta
ctaaactttgatgattatgttgtatttttaaaacaaaaggcggttgctcaaggcgtatcg
gctaaattattaaattctcaaaataatattaattatatccagaaagcggttgatttagat
cgtaaacaagctggacgttcgataaaaagcacggcaactaagcctattgctaatcctcat
ggtgtcagtcgttatttaaaaagagtattaacggataataaagtcaatgtagcagaacgt
cgttattgggaaagattacctgaattaaccaaagcaagtgaacgttttggtgttcaaaaa
gaatatttaatggcgctttggggaatggaaagtagttttggttattatcaagggaattat
gatgtactttctgttcttgctaccttagcttttgatggacgtcgagaggatctatttagt
aaagaatttatatccgcaatgaaattattggaaagagatcatattgatcgtaataaaatg
ttaggctcttgggctggtgcaatgggacaaacacaatttatgcctagttcttatttaagc
tatgctgccgatggcgataaagatgggaataaagatatttggaaaaaccattatgatgta
ttttcttctattgctaactatttacatacagtagggtggaataatgagttaccttggggt
gtagaagtaaatctaacacaatatatggatcttgatttatctgggatagaaaatgaaaaa
gcaggttcattacaagaatggcaaaacaaaggtgtgagcttaaagtcatttagcactgtt
gagcaagataaattaaattcactttctcgcgaaaaactttggttagttcgacctgataaa
gaacttggacgagcatttttagtttctaataactttcgtaccttattaaattggaatcgt
tcgaattattttgcggtaagtattggtatgtttgcagatagaattaaccaaagagtttct
aattaa

DBGET integrated database retrieval system