Bisgaardia hudsonensis: A6A11_08625 Help Entry A6A11_08625       CDS       T06663                                  Name (GenBank) RNA polymerase-binding ATPase   KO K03580   ATP-dependent helicase HepA [EC:5.6.2.-] Organism bhud  Bisgaardia hudsonensis Brite KEGG Orthology (KO) [BR:bhud00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03021 Transcription machinery [BR:bhud03021]     A6A11_08625 Transcription machinery [BR:bhud03021]  Prokaryotic type   Bacterial type    Other transcription-related factors     RNA polymerase-associated proteins      A6A11_08625 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  RapA_C Tudor_1_RapA Helicase_C Tudor_RapA SNF2-rel_dom ResIII DEAD RNaseH_like Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QLB13668 LinkDB All DBs Position complement(1885936..1888836) Genome browser AA seq 966 aa AA seqDB search MLFAIGQRWISESEGNLGLGMITAVDNRTVTIAFPASDETRIYALENAPLVRVLFQKNTE ITAEAGWKGKVIEIMERNNVAFYLVQCLDNDEELILPETEISHQIAFSKPQERLFNAQID RSDRFVLRYQSFKHQQAQFRSHLRGLRGIRAGLIPHQLHIANEVGHRIAPRVLLADEVGL GKTIEAGMILQQQIFSEKVQRALIIVPETLQHQWLVEMLRRFNLHFSLFDEERCGDFDAD EDNVATNPFLSENLIICSLDLLVAQPNRAKQILTGEFDLLIVDEAHHLEWSPDNPSIQYQ LVAQLTRAIPAVLLLTATPEQLGQASHFARLSLLDPNRFYDYDAFIAEQKNYQAVADIVK RLLSENELSQQEQDHLSELLSDQEISSLIQRVNSELDISQRKQVRQQLIDNLIDRHGTSR LLFRNTRQSVQGFPKRFYHQINLVMPKQYTNVINLLTTVDNKADLNLFYPEKILQELNPD ASWWEFDPRIEWLIDFLKDNRDEKVLVICQYAKSAVELERVLREKEGIRSAVFHENMSII ERDRASAYFSDEEGAQVLLSSSIGSEGRNFQFACHLVLFNLPDNPDLLEQCIGRLDRIGQ TRDIHIHIPCFKDTPQILLARWYHEGLNAFEETCPMGATLFEKCGQKLQYFLKNTTALDE FEDFIQDTRQQQIQLKAELEQGRDLLLELNSSGGSQAKQIAMDIAQEDSHTDLVNFTLSL FDVIGVEQEDLNEKSILITPSSTMLIPDFPGLKDEGVTVTFDRDLALVREEFEFLTWDHP IVCNGIDLITSGDIGKCAVSLLVNDKLPVGTLLVELVYIVETQAPKGLHLSRFLPPTPVR LLLDGKGNDLNNAVPFTTLQKKLKPMKKNMANKVVKMLRESIEGLLQLSETKIVDLAQQI IDEAQQQADQTLTADLNRLIALQKVNKNIRQDEIDTLANLREATLDQLQKASWHLDSLHV IVSSKG NT seq 2901 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttgtttgctattggtcaacgttggataagtgaaagtgaaggtaatttaggattggga atgattactgctgtggataatcgaactgtaacgattgcctttcctgcatcagatgaaacc cgaatttatgccttagagaatgctcctttggtacgtgtattgtttcaaaaaaatacggaa atcactgctgaagctggttggaaaggtaaggttattgagataatggaacgtaacaatgtg gctttttatctggtacaatgcttggataatgatgaagagttgatcttacctgaaacggaa atatcacatcaaattgcctttagtaagccacaagagcggctttttaatgctcaaattgat cgttctgatcgctttgtattgcgttatcagagttttaaacatcagcaagctcaatttcgt tctcatttgcgtggtctaagagggattagagctgggttaattccacaccaattacatatt gcgaatgaagttggtcatcgtattgcaccgagagtgttattagcggatgaagtaggttta ggaaaaaccattgaagcgggaatgattttgcaacagcagattttttctgagaaagtacag cgagccttaattattgtacctgaaacattgcagcatcaatggcttgtggaaatgttacgc cgctttaatttgcatttttcactttttgatgaggaacgctgtggtgattttgatgctgat gaagacaatgtcgcaacgaatccatttttaagtgaaaatttaattatttgttcactggat ttattagtagctcagcctaatcgagcgaagcaaattttaacgggtgagtttgatttactg attgtcgatgaagcacatcatttagaatggtcgccagataatccgagtatccaatatcaa ttagtggcgcaattaacacgcgctattccagcggtgttattgctaacggcgacgcctgag caattaggacaagcaagccattttgctcgtttaagcttgttagatcctaatcgtttctat gattatgatgcatttattgcggagcaaaaaaattatcaagcagtagcagatattgtcaaa agattattatcagagaatgagcttagtcagcaagagcaagatcatttgagtgagttatta tcagatcaagagatttcatcgcttatccaaagggttaattctgaattagatatttcacag cgtaagcaagttcgtcagcagttaattgataatcttattgatagacacggtacaagccgc ttgctatttagaaatactcgtcaaagtgtacagggcttccctaagcgtttttatcatcaa attaatttggttatgccgaagcaatatactaacgtgattaatttattaacaaccgttgat aataaggcagatttaaatttattttatccagagaaaattcttcaagagcttaatcctgat gcgagttggtgggaatttgatccgcgtattgaatggttaattgatttcttaaaagataat cgagatgagaaggtattagtaatttgtcagtatgcgaaaagtgcggtggaattagagcga gttttacgagaaaaagaagggattcgctcggcagtatttcacgaaaatatgtcgattatt gaacgagatcgtgcatcggcttatttttctgatgaagaaggggcacaagtattattaagc tcaagtattggttctgaagggcgtaattttcagtttgcttgtcatttagtgctatttaat ttaccagataatcctgacctattagaacaatgtattgggcgtttagaccgaattggacaa acccgagatattcatattcatatcccttgctttaaagatacaccgcagattttacttgcc cgttggtatcatgaagggctaaatgcttttgaagaaacttgcccaatgggagcgacactt tttgaaaagtgcggtcaaaaattacaatatttcttgaaaaatactaccgcacttgatgaa tttgaggattttattcaagatactcgtcagcaacagattcaattaaaagcagaattagag caagggagagatttattgcttgaattaaattcaagtggtggatcgcaagctaagcaaatc gcaatggatattgcacaagaagatagccatactgatttagttaatttcacgttaagtctt tttgatgtaattggtgttgaacaagaggatcttaatgaaaaatcaattttaattaccccc tctagtactatgcttatccctgattttccgggactaaaagatgaaggggtaaccgttact tttgatcgagatttagcacttgttcgtgaagaatttgagtttttaacttgggatcatccg atagtttgcaatggtattgatttgatcacttcgggcgatattggaaaatgtgcagtgtct ttattggttaatgataaattacctgttggtactttattagttgaattagtttatatagtt gaaacacaagcaccaaaaggcttacatcttagtcgttttttaccaccgacaccagtacgt ttattattagatggaaaaggaaatgacttaaataatgccgtaccatttactactttacag aaaaaattgaagccgatgaagaaaaatatggcaaataaagtggtaaaaatgttacgagaa tctattgaggggttgttacaactatcagaaactaaaatagttgatcttgcccagcaaatt attgatgaagcacagcaacaagcagatcaaaccttaaccgctgatttaaatcgcttaatt gcattacaaaaagtaaataaaaatattcgtcaagatgagattgatactctagcaaattta cgtgaagctactcttgaccagttacagaaagcaagctggcacttggatagtttgcacgtg attgtaagtagtaaagggtaa

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