Bisgaardia hudsonensis: A6A11_08635
Help
Entry
A6A11_08635 CDS
T06663
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K01347
IgA-specific serine endopeptidase [EC:
3.4.21.72
]
Organism
bhud
Bisgaardia hudsonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhud00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
bhud01002
]
A6A11_08635
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bhud02000
]
A6A11_08635
02044 Secretion system [BR:
bhud02044
]
A6A11_08635
Enzymes [BR:
bhud01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.21 Serine endopeptidases
3.4.21.72 IgA-specific serine endopeptidase
A6A11_08635
Peptidases and inhibitors [BR:
bhud01002
]
Serine peptidases
Family S6
A6A11_08635
Transporters [BR:
bhud02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
A6A11_08635
Secretion system [BR:
bhud02044
]
Type V secretion system
Autotransporter-1 (AT-1) family
A6A11_08635
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S6
Beta-sol_PIC_HAP1_IgA0_2nd
Pertactin
IgA0_D2
GluRS_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB13670
LinkDB
All DBs
Position
1890351..1894493
Genome browser
AA seq
1380 aa
AA seq
DB search
MGKNQKLKLTFIATFISLSISYPTFSSIVRDDVDYQYFRDFAENKGSFTVGARDIPVYNK
NKELIGYALGNIPMPDFSSADRNNAVAAAIHAQYIISVKHNRGYSTTQFGGQGNNPDAHH
YAYLITGRNNYPEGLNNLNDDYHLPRLHKLITEIVPSEETEYGIDGATYLDKDRFPIFAR
VGSGTQAIRDKQNNRTGLVGAYNYLTGGVPLRVTGRRFAWFDTGGSVFDDYYGPLVTYST
PGDSGSSMWVFDKEKQKWLHHSVLNFYAGDHGHANTGSITRKEWNNTIINSNIINIDNKS
TYPLVWNATNNTSTITNEDTPISIDLYSQDLKDKKTDTAGPERLDFNHGKTIRFTGNKGT
LTLNNNINQGAGALYFETDFDVTGTDINTLWQGAGIYIDEGKTVNWKLHNPQNDRLSKIG
KGTLHINGIGKNLGDISVGDGIVILDQQPDQTGHKQAFNQLGIVSGRPTVILNSPDQLDP
NNIYFGFRGGRLDINGNNLSFKYIQNVDEGAKIVNHNTDKIANLTITNRSLTNIEDLNIG
DRVSANQDLYRWHKKQSGKPYDYFLPRNNRQSNHPYYPTNQTSNEYWEYLGDDLDEAKKI
ALERKNQKLLYSAFNGYFGEDNNQYPNGRMNINYNPDSNKHLLLISGGININGDLSIHRG
KLVLSGRPTPHAYDHLNHKEVVIENDWINRTFNAKNIVISNDATLDIGRNVSNVNSNFSL
HQNASANLGFISGTTPECIRSDLSGVINCGIKTLSSDTLSSLPITTINGNITLSDQSILK
LGRAILTGSIQGTDNSETILNADSYWKMTENSTVGNLQLTKGSKIKLSHTSNSDISNKYN
VLNISQLSGNGFFEYFTNLNANQGDRIIVSNQATGEHKLYVTDSGQEPKTDKLTLLTVKN
FSQNAINLNVSLANPNESVDLGTYRYQLRHKDDSYVLSIAHKNGSGVTEEKYRIPKLIHQ
NGDVIFNEDKPIVEFKNGKNVHTEDKPTIEFKNGKSVQAEDKPTVEFKNGKSVQAEDKPT
VEFKNGKSVQTEDKPTIEFKNGKSVHVENKPNVEFKNGKSVQAEDKPYLNFEILNLVQQD
NIGKIPNTQQSEIISRYSNTGLSELSSQTHTLVNVNSTINKEVINNNAQDLNVWTNIQRS
TLFSSSVNYREYQQSGNLIQLGIEKSLHNDIMIGGILSNAKISNIFDDNIVGKARLTQFT
LYTKKIWDNQIISNIDISYGKSHNEINYKNRVSFNRNIFSIGSILGKSWKFNDFDIKPSL
GIRYYHISKTNYNFDGAKISISPLDFVTYQIGLNINKSFIFNKLIIKPEYNLNFVDTLYK
NINFKINNNRLNQQIGRYIENELGITTQYGQWNIKIHGSLLNGNEIKKQHTVGLKLSYNW
NT seq
4143 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaaaaaatcaaaaacttaagctaacttttatagctactttcatttcattatctatt
tcttatccaacattttctagtattgttagagatgatgttgactatcaatatttcagagat
tttgctgaaaataaaggctcatttactgtaggtgcaagagatatccctgtttacaataaa
aataaagaattaataggatatgctctagggaatattccaatgcccgattttagttccgca
gatagaaataacgctgtcgcagcagcgatacatgctcaatacattatcagcgtaaaacat
aatcgagggtactcaaccactcaatttgggggacaagggaataatcctgatgcacaccat
tatgcctatttaataacggggaggaataattatccagagggactaaataatctaaatgat
gattaccatttacctcgtttacacaaattaattactgaaattgttccttcagaggaaact
gaatatggaatagatggtgcaacttaccttgataaagaccgctttcctatctttgctaga
gtaggctcaggaacacaagccattagagataagcaaaataacagaactggactagtaggt
gcatataattatctcacaggcggagtacctcttagagtaacaggtagacgattcgcttgg
tttgatactggtggtagtgtttttgatgattattatggtcctctcgtaacatatagcact
cctggagatagtggatcttctatgtgggtctttgataaagaaaaacaaaaatggttacat
cactctgtgcttaatttttatgcaggagatcatggtcatgcaaatactggatcaataact
cgtaaagagtggaataacactattataaattcaaatatcataaatattgataataaatcg
acatatccacttgtttggaacgccacaaataacactagtactattacaaatgaagataca
cctatttctattgacctctatagccaagatttaaaagataaaaaaacagatacagccgga
cccgaacgcctagactttaatcatggtaaaactatacgctttaccggaaataaaggaaca
ttaacattaaataacaatatcaaccaaggtgcaggcgctttatattttgaaactgatttt
gatgtaactggtaccgatataaatactttatggcaaggcgcggggatctatattgatgaa
ggaaagactgttaattggaaattacataatcctcaaaatgatcgcctatccaaaatagga
aaaggaacgctacatattaacggaattggaaaaaatttaggagatataagtgtaggtgat
ggaatcgttatattggatcaacaaccagatcaaacgggacataaacaagcatttaatcaa
ttaggtattgttagtgggcgtccaacagttattttaaatagtccagatcaactcgatcct
aataatatttattttggattccgaggtggacgtctagatattaacggtaataatttatct
tttaaatatatccaaaatgtagatgaaggtgcaaaaatagttaaccataacacagataaa
attgctaatttaacaattacgaatcgttctctcacaaacatagaagatctaaatattggt
gacagagtaagtgctaatcaagatctttatagatggcataagaaacaatcaggaaagcca
tatgattattttttacctagaaataatcgacaaagcaatcacccatattatccaacaaat
caaaccagtaacgaatactgggaatatttaggcgatgacttagatgaggctaaaaaaatc
gccttggaaagaaaaaatcaaaaacttttatattcagcttttaatggatatttcggtgaa
gacaacaaccaatatcctaatggaagaatgaatataaactataatccagattctaataaa
catttattacttatttctggtggtattaatattaatggagatttatcaattcatcgtggt
aaattagttttatctggaagacctactccacatgcttatgatcaccttaatcataaagaa
gtcgtcattgaaaatgattggataaaccgcacttttaacgcaaaaaatatcgtcatatca
aatgatgcaacactcgatattggtagaaatgtttctaatgtgaacagtaatttttcattg
caccaaaatgcttctgcgaatttaggcttcatatcaggtactactcccgaatgtattcgt
tctgatttatctggagtgattaattgcggcattaaaactctctctagcgacacattatca
tctctacctataactacaattaatggtaatattaccttgtctgatcagtctattttaaaa
ttaggaagagccatattaacaggatctattcaagggactgataatagcgaaactatacta
aatgccgatagttattggaaaatgactgaaaatagtacagttggtaatcttcaactcaca
aaaggttctaaaataaaattgagccatacttcaaattctgatatctccaataaatataat
gtattaaatatctcccaattatcaggaaacggattctttgaatactttactaatttaaat
gctaaccaaggggatcgcataattgtttcaaatcaagcaacaggagaacataaattatat
gtcacagattcaggacaggaaccaaagacggacaaattaaccttattgactgtaaagaat
ttctctcaaaatgccataaatctaaatgtttctcttgctaatcctaatgaatctgttgat
ttgggtacttaccgatatcaattaagacataaagatgatagctatgttttatctattgcc
cataaaaatggctctggtgtaaccgaagaaaaatatcgaataccgaaactcattcatcaa
aacggcgatgttatttttaatgaagataagccaattgttgagtttaaaaatggtaaaaac
gtccacactgaagataaaccaactattgaatttaaaaatggtaaaagtgtccaagctgaa
gataaaccaactgttgaatttaaaaatgggaaaagtgtccaagctgaagataaaccaact
gttgaatttaaaaatgggaaaagcgtccaaactgaagataaaccaactattgaatttaaa
aacgggaaaagcgtccacgttgaaaataaaccaaacgttgagtttaaaaacgggaaaagt
gtccaagctgaagataaaccttatcttaattttgaaatacttaatttagtacaacaagac
aatattggaaaaatacctaatactcaacagtctgaaattatcagtcgttattctaatact
gggttatcagagttgtcttcacaaactcatacattagtaaatgttaactcaactattaat
aaagaagtgattaacaataatgcacaagatctaaatgtttggacaaatatccaacgctca
actttattttcatcttctgttaattatcgtgaatatcagcaatctggtaatttaattcaa
ttaggcatagaaaaatctctacacaatgacattatgataggaggaatattatctaatgcc
aaaatatctaatatatttgatgataacattgtagggaaggctcgattaactcaatttacg
ttatatacgaaaaaaatatgggataaccaaattatctccaatattgacataagttatgga
aaatcacataacgaaataaattataagaatagagtatcttttaatcgtaatattttcagt
atcggctccatattaggaaaatcttggaaatttaatgattttgacataaaaccatcattg
ggtatccgttattatcatatatctaaaacaaactataattttgatggtgcgaaaatttcc
atatcaccattagattttgtaacgtatcagattggtcttaatataaataaatcatttata
tttaataagttaattatcaaaccagagtacaatctaaattttgttgatactctatataaa
aatattaattttaaaattaataataatagattaaatcaacaaattggacgatatattgaa
aatgaattaggaataactacacaatatggtcaatggaatattaaaatccatggtagttta
ttaaatggtaatgaaatcaagaaacaacatactgtaggattaaaattaagctacaactgg
taa
DBGET
integrated database retrieval system
