KEGG   Bombus huntii (Hunt bumble bee): 126866927
Entry
126866927         CDS       T10446                                 
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial isoform X1
  KO
K10908  DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial [EC:2.7.7.6]
Organism
bhun  Bombus huntii (Hunt bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bhun00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03029 Mitochondrial biogenesis [BR:bhun03029]
    126866927
Enzymes [BR:bhun01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     126866927
Mitochondrial biogenesis [BR:bhun03029]
 Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
  Mitochondrial transcription and translation factors
   Mitochondrial RNA polymerase
    126866927
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol RPOL_N PPR_2 PPR_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 126866927
NCBI-ProteinID: XP_050476899
LinkDB
Position
6:6203098..6213126
AA seq 1248 aa
MYKLLITRVTERISPHGVFFIPKQVIMMQRSMRLCSFCNFYHGNISKSIKYQQVRIYGTT
TVDILSHSSIKKGKKQRTKKYAELLAVTNKTASTKRTEIEKLTASDLPMLVDNPDITTDN
SCESKDVTLNQLFDSKYMNENYHDFCDTEIYLNIENNVDIVTENEMKDNLNIGNEIKNNM
LQKDSTFHSIKQTKLKDQKLENVLKLSTGNAHKKMEICKTENKYRVKNYVESLLAHIQVY
LSCGLLNRANKTLMKCRKYVKNSLECNEIIKLYNILLEAYAFRRQIGKVLELYDMIKNDS
LTPTSQTYGYIFDALGNETVDKKQIELLKKLNVEMNNYNISFDDIFSKSYFKISQQKNIL
KAIRILIPDFEPAYATLNRNYRCKLVEEIQMASSCESPAKGILTIKQLKNLLETQLQTEL
KIETQIPSIKVCKENINTNLETKIMELENYWKDAALAAFERNLKCLKQKECQSHNALMIL
YPFLEVLDKEYYIDAILREIRQLAAGSETFSSSLKSLYIALGKYIYRKYEIEIKKQTGVL
DKIINIYSKYLEWYLHPEKMPHLNNMNNRTVWEYFEYKETKYGTPLNFTSVNWPMNVIIN
IGKFLYHIILNDIMLKPDILKGQDLKYSIPAFYTLFRNKGSYLSEQIKPHPLVSKLYRKV
HLKTLTFESLLLPSYSPPSPWISIHLGGYLITKTDFIRTSSDFGRLWHKFENTEPEQLFP
IFDSLNQLSSIPWKINTAILDIVIKIFQDGGSVELNVPQSVSVLTPPGPINKNATVEEKQ
KAAIAIAQYNQKKYDMYSLWCDTLYKLSIANHFRNKIFWLPHNLDFRGRVYPVPPYLNHL
SSDLGRSLLLFGKGKPLGPNGLDWLKLHVINLTNFKKAGSVKERLEYANQNMDNILDSAT
KPLTGKMWWKQSEEPWQTLAGCMEIANALKTPNVEEYVSTFPVHQDGSCNGLQHYAALGK
DKIGAESVNLHPFDTPKDVYSEVVSIIETQRQIDAKNNVKIAQILEGYVKRKVIKQTVMT
TVYGVTKYGAKHQIAKQLKDMENFPKEHIWSASIYLTESTFHSLRKMFKSAREIQDWFTE
CAQIISSICCENVEWVTPLGLPIIQPYLKQKSLNNYINDNRKPDRIKQRNAFAPNFIHSL
DSTHMMLTGLNCNKNNITFVSVHDCFWTHSCTIDAMNKICREQFVALHSEPILEDLAIFF
VKRYLPIYKQLKCKNKPDIETIRRCLTNVPSKGTFDINNVLSSVYFFN
NT seq 3747 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtacaaacttttaataacacgagttacggaacgaatatctccacatggtgttttcttc
ataccgaagcaagtaataatgatgcagcgatcaatgcgtctatgctccttctgtaacttt
taccacggaaatatatcaaaatctatcaaataccagcaagttcgtatttatggtacaaca
acagtagatatattgagtcattcatcaataaagaaaggaaaaaagcaaagaacaaaaaaa
tatgccgaattattagcagtaacaaataaaacagcaagtactaagagaactgaaatagaa
aagttaacagcatctgatttacccatgcttgttgataatcctgacatcactacagataat
tcatgtgaaagtaaagatgttacacttaatcagctctttgattcaaaatatatgaatgaa
aattatcatgatttttgtgatactgaaatttatttaaatattgaaaataatgtagatata
gttactgaaaatgaaatgaaagataatttgaatattggtaatgaaatcaagaataatatg
cttcaaaaagattccacatttcattctattaaacagaccaaattgaaagatcagaagttg
gagaatgtgttaaagttaagcacaggtaatgcacacaagaagatggaaatatgtaaaact
gaaaacaagtatagagtaaaaaattatgttgaaagtttattagcacatatacaagtttat
ttaagttgtggattgttaaacagagcaaacaaaaccttaatgaaatgtaggaaatatgtt
aaaaatagtttggaatgtaatgaaattattaagctttacaatatacttttggaagcttat
gctttcagaagacaaataggaaaagttttagagttatatgatatgataaaaaatgattct
ttaacaccaacatcccaaacttatggatatatatttgatgctttgggaaatgagactgta
gataaaaaacaaattgaattactcaaaaaattaaatgttgaaatgaataattacaatata
tcttttgatgatatctttagtaagtcatactttaaaattagtcagcaaaaaaatatatta
aaggcaattaggatattaataccagactttgaaccagcatacgctacattaaatagaaac
tatagatgtaaacttgtagaagaaattcaaatggcaagtagctgtgaaagtccagcaaaa
ggaatattaacaataaaacaactaaaaaatttgttagaaacacagcttcaaactgaatta
aaaattgaaacacagataccaagtattaaagtatgcaaggaaaatataaacactaatctg
gaaacaaaaattatggaactagaaaattattggaaagatgcagcattggcagcttttgaa
aggaatttgaagtgcttaaaacaaaaggagtgtcaatctcataatgctctgatgattttg
tatccatttttagaagttttggataaagaatactacatagatgctatattacgtgaaatt
agacaattagctgcaggatcagaaacttttagttcatctcttaaatcattatacattgca
ttgggaaaatacatttataggaagtatgagattgaaataaagaaacaaactggagtgtta
gataaaattattaatatttattcaaaataccttgaatggtacttacatcctgaaaaaatg
ccacatttaaataatatgaataatcgtactgtatgggaatattttgagtataaggaaaca
aaatatggtacacctttaaattttacctctgtaaattggcctatgaatgtaataataaat
attggcaaatttttgtatcatattatcttgaatgatattatgcttaaacctgacatttta
aaaggacaagatttaaaatattcaatccctgcattttatacattgtttaggaacaaagga
agttatttatcagaacagattaaaccacatcctctggtatcaaagttatatagaaaggta
catttaaaaacattaacatttgaatcacttcttctaccttcttatagtccaccaagtcca
tggatttcaatacatttaggaggatatcttataacgaaaactgattttataagaacctca
agtgattttggtcgcttatggcataaatttgaaaatacagaaccagaacagttatttcct
atatttgattcattgaatcagcttagttctattccatggaaaattaatactgctatactc
gatattgtaattaagatttttcaagatggtggttctgtagaattaaatgttcctcaatca
gtttctgtactaactccaccaggtccaataaataaaaatgctactgttgaagagaaacaa
aaagcagcaatagcaatagctcaatataatcaaaagaagtatgatatgtattcgttgtgg
tgtgatactctttataagttatccatcgccaatcattttagaaacaaaatattttggctc
ccacataatttggattttagaggaagagtttacccagtacctccttatttaaatcattta
tcatctgatttgggccggtctttacttttatttggaaagggaaaacctttaggtccaaat
ggattagattggttgaaattacatgttattaatttaactaactttaagaaagcaggttct
gttaaagaacggcttgaatatgcaaatcagaatatggataatatacttgacagtgctact
aaacctttaacaggtaaaatgtggtggaaacaatcagaggaaccatggcaaactttagct
gggtgcatggaaatagcaaatgcattaaaaacaccaaatgtagaagaatatgtgtctaca
tttccagtacatcaagatggcagttgtaatggacttcaacattatgcagcacttggtaaa
gataaaattggcgcggaaagtgttaatttacatccatttgataccccaaaagatgtatat
tctgaagttgtgtcaattattgaaacacaacgacaaattgatgcaaaaaataatgttaaa
attgcacaaatattggaaggatatgtaaaaagaaaagttataaagcaaactgtgatgaca
acagtatatggtgtaacaaaatatggtgcaaaacatcaaatagcaaaacagttaaaagat
atggaaaactttccaaaggaacatatttggtctgctagtatatatttaactgaaagcaca
tttcacagtttaagaaaaatgtttaaaagtgcaagagaaattcaagattggttcacagaa
tgtgctcaaattatttcttctatttgttgtgaaaatgtggagtgggttaccccattaggt
cttcctattatacaaccttatttgaaacaaaaatctttaaataactatattaatgataat
aggaaacctgataggataaaacaacgaaatgcatttgcaccaaactttatacactctcta
gattccactcacatgatgcttactgggctaaattgtaataaaaataatattacttttgtc
tcagtacatgattgtttttggactcattcttgtaccatagatgctatgaacaaaatatgc
agagaacaatttgttgctcttcattctgaacccatccttgaagatttagctatatttttt
gtgaaacgatatttaccaatttataaacaattaaagtgtaaaaataagcctgacattgaa
acaatacgcagatgtttaactaatgtaccatcaaaaggtacttttgatattaataatgtt
ttgtcgtctgtatacttctttaattaa

DBGET integrated database retrieval system