Brachyspira hyodysenteriae JR80: JR80WH_000782
Help
Entry
JR80WH_000782 CDS
T11265
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
bhyj Brachyspira hyodysenteriae JR80
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhyj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bhyj02000
]
JR80WH_000782
Transporters [BR:
bhyj02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
JR80WH_000782
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOZ55941
LinkDB
All DBs
Position
complement(944813..946213)
Genome browser
AA seq
466 aa
AA seq
DB search
MNNEAVLNNNSKSNELANKPVGKLLFKLALPAIAAQIINVLYNVVDRMYIGHIPDIGAIA
LTGVGVTMPVIMAVSAFAYLISMGGSPRASIMMGKQDYNKAEEIVGNCAMTLIIISITLT
IILLLFSKPLLMLFGASENTIIYALRYLRIYSIGTIFVQLALGLNAFITAQGKAKTSMFT
VLIGAVTNIILDPIFIFVFNMDVRGAALATIISQAISCIWILYFMTSKRTILKLKLQNLK
ISPNIILPCLALGFSPFIMQFTESILFVSFNTSLLKYGGDLAVGAMTILSSIMQFSFLPI
MGLTQGAQPIISYNYGANNLNRVKSAFKILLISCLSFSFLMWFISEFFPYVFVRIFTSNE
ELINYAIWALKIYMAASLIFGAQTACQQTFVALGNAKISAFLAILRKVILLIPLIFILPL
FMENKVMAVLLAEPIADFLAVCTTVTLFTISFKKLINASNSKLDYK
NT seq
1401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatgaagcagtattaaataataattcaaaatcaaatgaactagcaaataagcct
gttggaaaattgctttttaaattagcacttccagcaatagcagcacaaataataaatgta
ctttataatgttgtagatagaatgtatataggacatattccagatataggagcaatagct
ttaactggtgtaggtgtaacaatgcctgtgataatggcagtatcagcatttgcctatctt
ataagtatgggaggttctcctcgtgcttctattatgatgggaaagcaggattataataag
gctgaagaaatagtaggcaactgtgctatgacattaataattatttcaataacattaact
ataatattattattattttctaaacctcttcttatgctttttggtgcgagtgaaaatacc
attatatatgctttaagatatttaagaatatattcaatcggtactatatttgttcaatta
gctttagggcttaatgcttttataacagctcagggaaaggcaaaaactagtatgtttaca
gttttaataggggcggttactaatataatactagaccctatatttatattcgtattcaat
atggatgttagaggtgcagcacttgccacaattatatcgcaggctatatcatgtatatgg
atactttatttcatgacatcaaaaagaactatattaaaattaaaattacaaaatttaaaa
atatctcctaatataatacttccttgcttggcattaggtttttctccttttattatgcaa
tttacagaaagtatcttatttgtatcttttaatacatcgctcttaaaatacggcggagat
ttagctgttggtgctatgactatattaagcagtattatgcagttttcttttcttcctata
atgggacttactcaaggtgctcagcccataataagctataattatggagcaaataattta
aatagggtaaaatctgcttttaagatacttttaataagctgtctttcattttctttcttg
atgtggtttatatcagaattctttccttatgtttttgttagaatatttacaagcaatgag
gagttaataaattatgctatttgggctttaaaaatatatatggctgcttctttgatattt
ggggcacaaactgcatgtcagcagacatttgttgctttgggtaatgctaaaatatctgca
ttccttgctatactaagaaaagtaatattattgataccgcttatatttatattgcctcta
tttatggaaaataaagtaatggctgtattattagcagaacctatagctgattttttggct
gtttgtacaacagtaacattatttactatttcatttaaaaaattgattaatgcttcaaac
agcaaattagattacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system