Brachyspira hyodysenteriae JR80: JR80WH_001222
Help
Entry
JR80WH_001222 CDS
T11265
Name
(GenBank) AAA family ATPase
Organism
bhyj Brachyspira hyodysenteriae JR80
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_15
AAA_21
SMC_N
AAA_29
RTX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOZ56364
LinkDB
All DBs
Position
1437805..1439235
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MELNIKNFSKIKEANITIDGITVIAGENNTGKSTIGKILFSCFNSTKNIEEEIYSSKFIP
ILKNLTYLMQELSKNNESIKQIPSLYSSLLGGTAVAAGAIGATAAATSAVLGATLLPVIG
IPLAIGAAGALSMIKNKKQDSNNLNIDNLINDINNIISDLTNENNEKNAYYVLKDNLSKY
IDIEDKKNIYIIKKYSDRIQEYINIPNKKIAYKIINDYFKSIFNNQINSRIDKDSISEIN
IMDLSFKFKNDKSIESKYNDTYSKNVYFIDNPFVLDKKYDEKYMTKYEYNLIEKLLYNTE
EVNTTEQILAEEKLEEIYDKLSEAVNGKIINRDNDFYLEEENFTEPISIHSLSAGLKSFA
VIKMLIEKNALKEEDILILDEPEIHLHPKWQLLYAEIIALLQKIFNVYIIVTTHSPYFLK
AIEMYSNKYDIEEKTNYYLSDIKNNYAVFNLVNDSVEKIYSKMAEPIDEMEDFINN
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaattgaatataaaaaatttttctaaaatcaaagaagctaatataacaatagatggt
attactgtaatagccggagagaataacactggaaaaagcacaataggaaaaattttattt
tcttgttttaatagcacaaaaaatatagaagaagaaatatattcatcaaaattcatacct
attttaaaaaacttaacatatttgatgcaagaattatctaaaaataatgaatcaataaaa
caaataccatctttatattctagtttattaggcggtactgcagtagcagctggtgctata
ggtgcaacggcagcagcaactagtgctgtattaggagctaccttattgcctgtgataggt
ataccattggctataggagctgctggtgctttatctatgataaaaaataaaaaacaagat
agtaataatttaaatattgataatttaattaatgatattaacaatattatatctgattta
acaaatgaaaataatgaaaaaaatgcttattatgtattaaaagataatctcagcaaatat
atagatatagaagataaaaaaaatatttatattataaaaaaatattctgatagaattcaa
gaatatataaatattccaaataaaaaaatagcatataaaataattaatgattattttaaa
tcaatatttaataatcaaataaacagcagaatagataaagatagtatatcagaaataaat
ataatggatttatcatttaaatttaaaaatgataaatccatagaatcaaaatataatgat
acttatagcaaaaatgtttattttatagacaacccttttgtattggataaaaaatatgat
gaaaaatacatgactaaatatgaatataatttaatagaaaaattattatataatacagaa
gaagttaatacaacagaacaaatattagcagaggaaaaacttgaagaaatatatgataaa
ttatcagaagctgtaaatggtaaaataataaatagagataatgatttttatttggaagaa
gaaaattttacagaaccaatttcaatacatagtttatcagcaggattaaaatcatttgct
gtaataaaaatgcttattgaaaaaaatgcattgaaagaagaagatattttaattttagat
gaacctgaaatacatcttcatcctaaatggcagctgctatatgctgaaataatagcgtta
ttacagaaaatatttaatgtttatattatagtaacgacacatagcccttatttccttaaa
gctatagaaatgtattctaacaaatatgatatagaagaaaaaactaactattatttatct
gatataaaaaacaattatgcagtttttaatttagttaatgatagcgtagaaaaaatatat
tcaaagatggcagaacctatagatgaaatggaagattttattaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system