Brachyspira hyodysenteriae JR80: JR80WH_001503
Help
Entry
JR80WH_001503 CDS
T11265
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
bhyj Brachyspira hyodysenteriae JR80
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhyj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bhyj02000
]
JR80WH_001503
Transporters [BR:
bhyj02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
JR80WH_001503
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOZ56637
LinkDB
All DBs
Position
complement(1774886..1776259)
Genome browser
AA seq
457 aa
AA seq
DB search
MSVSSNPLYYEKIHRLLFKYGTPSIISMLVGSLYNIVDQIFIGQGVGINGNAATNVAFPL
TIICIFISLFLGVGGASLYSILLGKGENKHASVIIGNSITLSFVFGIILSIVVKIFNTKL
MIAFGSTKEVLDYAVIYTDITSFGFTAYIFSMVMSYTIRADGSPKYSMASVLSGAIVNTI
LDPLFIFVFKMGIAGAALATVIGQYVSFFIAFAYVFKFKNIQFEKQSFMPEFKSILKIFA
LGASAGFSNLSMMILQIVMNNVLSYYGSNSIYGGNIPLAVSGIVAKVNMLVMSFVIGASQ
GSQPIIGFNYGAKNYDRVIETYKYTIIITSAITFIAFLLFQFFPRQIVSIFGDGSELYFQ
FSEKYMRIFMMLMIINAAQPVTGTFFSSLGKAFKGAFLAVTRQTLFLLPLIIILPRIFGI
DGVMYAGPIADGAALLVTIIMVAIEIKHLKSLQDNTK
NT seq
1374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgtttcatctaatcctttgtattatgaaaagatacataggcttctttttaaatat
ggaactccaagtattatatcaatgcttgtgggttctctttataatatagtagatcaaata
tttataggtcagggagtgggaatcaatgggaatgccgcaactaatgtggctttccctctc
accataatatgcatatttatatcattgttcctaggtgttggaggagcttctctttacagc
atactgctaggaaaaggtgaaaataaacatgcttctgttatcataggaaacagtattact
ttatcctttgtattcggtataatattatcaatagtagtaaagatatttaatacaaaattg
atgatagcattcggatctacaaaagaggttttggattatgctgtaatatataccgatata
acttctttcggatttacagcttatatattttctatggttatgagctatactataagagca
gatggaagtccaaaatattctatggcttcagttttaagcggtgctattgttaatactatt
ttagaccctttatttatattcgtatttaaaatgggtattgcaggtgctgcacttgccact
gtaataggacagtatgtatctttctttatagctttcgcctatgtatttaaatttaaaaat
attcaatttgaaaaacaaagctttatgcctgaattcaaatcaatattaaaaatatttgca
ttaggtgcttcagcaggattcagtaacttatctatgatgattcttcaaattgttatgaat
aatgtacttagctattatggaagtaattctatatacggcggcaatatacctttagcagtt
tctggaatagtagctaaagttaatatgcttgtaatgtcattcgtaataggagcttctcaa
ggcagtcagcctataataggttttaattacggagctaaaaattatgacagagttattgaa
acatataaatacactatcataataacaagtgctataacattcattgcatttttattattt
caattcttccctagacaaattgtctctatattcggagacggaagcgaactttattttcaa
ttctctgaaaagtacatgagaatatttatgatgcttatgataatcaatgcagcacagccc
gtaactggtacattctttagttccttaggaaaagcatttaagggggcatttcttgctgta
actaggcagactttatttcttttgcctttaataattatacttcctagaatatttggtata
gacggtgtaatgtatgctggtcctattgctgatggagctgctttgctagttactattata
atggtagctatagaaataaagcatttaaaaagccttcaggataatactaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
