Brachyspira hyodysenteriae JR80: JR80WH_002201
Help
Entry
JR80WH_002201 CDS
T11265
Name
(GenBank) TRAP transporter permease
Organism
bhyj Brachyspira hyodysenteriae JR80
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
DUF3394
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOZ57313
LinkDB
All DBs
Position
complement(2498536..2500515)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MKHRNDIHIPTVEEIDSYMSKYDSESRYRKYSDWKKYLIIVISVVFCLFQLYSILSGKIT
AQVVRATHLAFVILLAYLLFPMKKDMPKDKLPWYDVIFAIIGAGSWSYITINFETIVRRA
GIYTTTDIIIGIIGILLVFEACRRIVGLPILVISIIFIIYALFGAYAPGFLNHRGYSLQR
LVSHLFYNTEGIMGTPIGASATFIFLFIFFGALLDKTGIGQFFIDICNAIAGGFDGGPAK
VAVLTSAMFGTVSGSSVSNTVGTGSFTIPMMKSLGYRPEFAGAVEASASTGGQLMPPIMG
AASFLMAESLGIPYMEVAKAAIIPAILYFTGIFIMVHLEAKKTGLKGLSRDSLPKIGELL
MKKGYLVIPLATIIYFFVLGKTAIYAGLMGIIAAGLVAIVNSIVDIIMKRKVSFGFNDLI
DVFVNAARNIISVAVACAMAGVIIGVITLTGLGLKIGAGLISISGGIPLLLLFLTMISSI
ILGMGVPTTANYLITSTIAASAIIGLGYEPLAAHMFVFYFGIIADVTPPVALAAMAGAAI
AKSDPLKTGIEATKLSIGAFIIPYMFIFNPDILMINTTIADVIPILITSLIGMFGVSAGL
EGYVFRKCKPYERILFIVAGLLSIYPEFYSDIIGIAIIAILVIVQIATRNKNKMNTAAA
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatagaaatgatattcacattccaacagttgaagaaattgatagttatatgagc
aaatatgatagtgaatcaagatatagaaaatattctgattggaaaaaatatttaataatt
gttatatctgtcgtattttgtttatttcaattatattcaatactttcaggaaaaattaca
gcccaggttgtaagggctacacatttagcatttgttatacttcttgcttacttgcttttc
cctatgaaaaaagacatgcctaaagataaactaccttggtatgatgtaatatttgctata
attggtgctggttcttggagttatattacaattaattttgaaacaatagtaagaagagct
ggtatatatacaacaactgatattattataggaataataggaatactccttgtatttgaa
gcttgcagaagaatagtaggacttccaatacttgtaatatcaataatttttattatatat
gcattatttggagcttatgcacctggttttttgaatcatagaggttattcacttcaaaga
ttagtatcacatttattttataatactgaaggaataatgggtactcctataggtgcttca
gctacatttatatttttattcatattttttggagcattgctcgataaaacaggaataggt
cagttttttatagatatatgtaatgctatagcaggaggatttgacggaggtcctgctaaa
gtagcagtacttacaagtgctatgtttggtacagtatcaggaagttcagtttcaaatact
gtaggtacaggaagcttcacaatacctatgatgaaatctttaggttacagacctgaattt
gctggtgctgttgaggcttcagcttctacaggaggacagttaatgcctcctataatgggt
gctgcttcattcttaatggctgaaagtttgggaattccttatatggaagttgctaaagct
gctattattccagctatactttactttacaggtatattcataatggtgcatttggaagct
aaaaaaacaggtcttaaaggtttatcaagagattctcttcctaaaataggagaacttttg
atgaaaaaaggttacttagttatacctcttgctacaataatatatttctttgtacttgga
aaaactgctatttatgccggtttaatgggtataattgctgctggtttagttgctattgta
aactcaatagttgacataataatgaaaagaaaagtaagcttcggatttaatgatttaata
gatgtattcgttaatgccgctagaaatataattagtgttgctgttgcttgtgctatggct
ggagttattataggtgttataactttaacaggtttaggtttaaaaataggtgctggttta
atatctatatcaggaggaatacctctattattattgttcttaacaatgataagttctatc
atacttggtatgggagttcctactacagcaaattatcttataacttctacaatagctgca
agtgcaataataggtttaggttatgaacctttagctgctcatatgtttgtattctacttc
ggaattatagctgacgttactcctcctgttgctttggctgctatggctggtgctgctatt
gctaaatcagatcctcttaaaacaggtattgaggcaacaaaactttctattggtgctttt
atcattccttatatgtttatattcaatccggatatattgatgataaatactaccattgcc
gatgttatacctatacttataacttctcttataggtatgttcggagtatccgcaggacta
gaaggatatgtatttagaaaatgcaaaccttatgaaagaatattattcattgtagcaggt
ttattatctatatatcctgaattttattctgatattataggaatagctattatagcaata
ttagttattgtacaaatagcaacaagaaataaaaataaaatgaatactgcagctgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system