Bombus impatiens (common eastern bumble bee): 100749504
Help
Entry
100749504 CDS
T04362
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing-splicing factor 8
KO
K12856
pre-mRNA-processing factor 8
Organism
bim
Bombus impatiens (common eastern bumble bee)
Pathway
bim03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bim00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
100749504
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
bim03041
]
100749504
Spliceosome [BR:
bim03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
100749504
Complex C
U5 SnRNP specific factors
100749504
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PROCN
PRP8_domainIV
U6-snRNA_bdg
PRO8NT
U5_2-snRNA_bdg
PROCT
RRM_4
JAB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100749504
NCBI-ProteinID:
XP_003484634
UniProt:
A0A6P8L959
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2374 aa
AA seq
DB search
MSIPPYLLGPNPWATMMAQQQAHAQLAAAQAHAQAAAHAQAAHHAHMQAIAGPPLPQMPK
QPEVLSEDKLQEKAQKWQQLQSKRFAEKRKFGFVDAQKEHMPPEHIRKIIRDHGDMSSRK
YRHDKRVYLGALKYMPHAVMKLLENMPMPWEQIRDVKVLYHITGAITFVNEIPWVIEPVY
IAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIELDSEED
ESVALWFYEHKPLVGTKHVNGSTYRRWNLTLPQMATLYRLANQLLTDLVDHNFFYLFDPK
SFFTAKALNMAIPGGPKFEPLVKDSNAADEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYRIAFPYLYN
NMPHFVHLSWYHAPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNSLKTVEPQIEDDEDFVLP
EEVQPFLQETPLYTDNTANGIALLWAPRPFNTRSGRTRRAIDIPLVKSWYREHCPPGQPV
KVRVSYQKLLKYFVLNALKHRHPKPQKKRYLFRSFKSTKFFQTTTIDWVEAGLQVCRQGY
NMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLIIDSH
VQYRLNNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPV
GKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHF
DLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPIPIENMILR
YVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYI
SPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQR
EELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRTFKEVGIEFMDLYSHLIPVYDVEPLEKITDAY
LDQYLWYEADKRRLFPPWVKPSDTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWDVSEGECNVLLESKF
EKLYEKIDLTLLNRVLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIA
QYYGLVLDLLVLGLQRASEMAGPPQMPNDFLTFQDVASETAHPIRLYCRYVDRIHLFLRF
SADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRL
PRSTTTIQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTTHEEFTHRDGVWNLQNEIT
KERTAQCFLRVDDESLQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNT
QELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLR
WSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEANAQNR
RLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHD
GKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTNA
QRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHL
WQKVHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFSAYKWNVSR
PSLLADSKDLMDNTTTQKYWIDVQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGL
LIAIDLAYNLHSAYGNWFPGCKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSEPTEP
YLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKI
IHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPN
IVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILR
ALHVNTERTKVVLKPDKTTITEPHHIWPSLTDDEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVAS
LTQSEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATTTRTVNKHGDEIITATTSN
YETQTFSSKTEWRVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFVTISDLR
AQIAGYLYGISPPDNPQVKEIRCIVMAPQWGTHQTVHLPNTLPNHQYLKEMEPLGWIHTQ
PNELPQLSPQDISTHARIMAENPIWDGEKTIVITCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFEWGKQN
TDKGNNPKGYLPSHYEKVQMLLSDRFLGFFMVPSQGSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANP
KEFYHEIHRPAHFLNFSSLEDGEGVGADREDVFA
NT seq
7125 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgattccaccatatttattgggcccaaacccttgggccacgatgatggctcaacaa
caggctcatgctcagttagctgcagctcaggctcatgctcaagcagctgcacatgcacaa
gctgcacatcatgctcatatgcaagcaatagctggacccccattgccacaaatgcctaaa
caacctgaagttttgtcagaagataaacttcaagaaaaagctcaaaaatggcagcaactt
caatcaaaaagatttgcagagaaaagaaagtttggttttgtggatgctcaaaaagaacat
atgcccccggaacatataagaaaaattattagagatcatggagacatgagcagtcggaaa
tatagacatgataaacgtgtttatttaggggcattaaaatacatgcctcatgcagttatg
aaacttctagaaaatatgcctatgccttgggaacaaattcgagatgtaaaggtgctgtat
catatcacaggtgcaattacatttgtgaatgaaattccttgggttattgaacctgtatat
attgcacaatggggtacaatgtggattatgatgaggagagaaaaaagggatcgtaggcat
ttcaaaagaatgaggtttcccccctttgatgacgaagaacctccgttggattacgcagac
aacgttttggatgtagaaccattggaagctattcaaattgaattggattcagaggaggat
gaatccgtggcattatggttctatgaacataaaccacttgttgggacaaaacacgtaaat
ggatctacttaccgaaggtggaatttgactttaccacaaatggcgactttatatcgttta
gctaatcaattattgacggatttggttgaccataactttttttatctctttgacccgaag
tcgttttttactgcgaaggcattaaatatggctataccaggtggaccaaaatttgaacca
ttggtgaaggactcaaatgcggctgatgaagattggaatgagtttaatgatattaataaa
attattattagacagcctataagaacagaataccgcattgcgtttccttatttatataac
aacatgccacattttgtacatttatcgtggtatcacgcaccaaatgttgtttatataaaa
accgaagatcctgacttacctgcattttattttgatcccttgattaaccctatttctcac
agaaattccctcaagactgtggaaccacaaatcgaagatgacgaagattttgtgcttcct
gaagaagtgcaacctttccttcaagaaactccattatatacagacaacacagcaaatggt
atagctttattatgggcaccaaggccatttaatacccgttccggcagaacaagaagggcc
attgacattcctctagtgaaatcttggtatagagaacattgtccaccaggacaacctgtt
aaagttcgagttagttatcaaaagttgttgaaatactttgtgttgaatgcactgaaacac
agacatcctaaaccacaaaagaaacgttatttgttccggtcgttcaaatccacgaaattt
ttccaaacaactacaattgattgggtcgaagctggtttacaagtctgtagacaaggatat
aatatgttaaatttactaattcacagaaaaaatttgaattatcttcatttagattacaat
tttaacctgaaaccagtaaaaactctaacgacgaaagaaagaaagaaatctagatttgga
aatgctttccatttatgtcgtgagattctccgtttgacgaaattgatcatcgattctcac
gtacaatatcgtttaaataatgttgatgcatttcaactcgcggatggtttgcaatatatt
tttgcacacgttggtcagttaactggaatgtaccggtataaatataaactaatgcgacaa
atcaggatgtgcaaagacttaaaacatttaatttattatcgctttaatacgggccctgtc
gggaaaggtcctggatgtggattctgggcacctggttggagagtatggcttttctttatg
aggggtattactccattattggaaagatggttagggaatttgttgtctaggcaattcgaa
ggtcgccattcaaagggagtcgcgaaaactgtaacgaaacagcgagtagagtcgcatttt
gatcttgagctaagagcatcagtgatgcacgacattgtagatatgatgccagagggaatc
aaacagaataaagcccgaacaatacttcagcatcttagcgaggcatggagatgttggaag
gctaatattccgtggaaggttccgggattaccaataccgatcgaaaatatgattcttcgt
tatgttaaaatgaaggcagattggtggaccaatactgcgcattataatcgagaacgtatt
agacgtggtgctaccgtggataaaactgtttgtaaaaagaatcttggacgtctcacccga
ctttatctgaaagccgaacaagaacgacagcataattatttgaaggatggtccgtatatt
tccccagaggaagctgtagctatatatactacaactgtacattggttggaatcgagaaga
tttgctcctatacctttcccaccattgtcttataaacatgacaccaagcttttgatatta
gctttggaacgattaaaggaagcatatagtgtcaaatcaaggcttaatcaaagtcaacgc
gaagaactcggattgatagaacaagcatatgacaatcctcatgaagcactgtctagaatt
aaacgtcatcttctcacccaaagaacgttcaaagaggtgggaatagaattcatggatctt
tatagtcatctgattcccgtttacgacgtcgaaccgcttgaaaaaattacggatgcctat
ttagatcaatacttgtggtatgaagcagataagcgaagattatttccaccatgggttaaa
ccttcagatacagaaccacctcctctattggtatataaatggtgtcagggtatcaataat
ctacaagatgtttgggatgttagcgaaggggaatgtaatgtattgttggaatcaaaattc
gagaaactgtatgaaaaaatcgatttgacgttattgaatagagtgcttcgattgatcgtt
gatcataacatagccgattatatgactgcaaagaataacgttgtcataaattacaaggat
atgaatcatactaacagttatggaataattagaggattacaatttgcgtcttttatagcg
caatattatggtctggtattagacttgttggttcttggattacaaagagctagtgaaatg
gctggcccaccccaaatgccaaatgattttctaactttccaagacgtagcttcagaaaca
gcacatcctattaggttatattgcagatatgtagatagaatacatttgtttctgaggttt
tctgccgatgaagcgagagatctaattcagagatatttaacggagcatccagatcctaat
aatgaaaatatcgttggttataataataaaaagtgttggccccgagatgcgcgaatgcgt
cttatgaagcatgacgttaatttaggtcgcgctgtattttgggatattaaaaatcgttta
ccccgttccacgactacgatacaatgggaaaatagttttgttagtgtatatagtaaagat
aatcctaatttgttatttaatatgagtggatttgagtgcagaattttgccaaaatgtaga
actacgcacgaggagttcacgcatagggatggtgtgtggaatttacaaaacgaaattaca
aaagaaagaacggctcagtgtttcttgagagtcgatgatgaaagtctgcaacgatttcat
aacagagttaggcaaatccttatggcttctggatccacaaccttcacgaagatcgttaac
aaatggaatacagctttaattggactcatgacctacttccgcgaagctgtggtgaacaca
caagaacttctagatttattggttaaatgcgaaaataaaattcaaacgcgtatcaagatt
ggtcttaattcaaaaatgccttcgcgatttccaccggtagtgttttatacaccgaaggaa
ttgggtgggcttggaatgctttcgatgggacatgtacttatacctcagtcggatttaaga
tggtcgaaacaaaccgacgttggtattacgcattttcgttcaggcatgagtcacgatgaa
gatcaattaattccaaacttatatcggtacattcaaccctgggaatccgagtttatagat
tcccaacgagtatgggcggaatatgcgttgaagcgacaagaagccaatgcacaaaatcgt
agacttactttggaagatcttgaagatagttgggatcgtggtatccctagaataaataca
ctgttccagaaagacagacacactcttgcctacgataagggttggagaatacgtacagaa
tttaaacagtatcaggtcttaaaacaaaatccattctggtggacccatcaacgtcatgat
ggtaaattatggaatttaaataattaccgaacagatatgatacaggctcttggcggtgta
gagggtattttggaacatactctctttaaagggacatacttcccaacatgggaaggtctc
ttttgggagaaagcatctggattcgaagaatctatgaaatataagaaactgactaacgct
caaaggtctggtttaaatcaaattccaaatcgtcgattcactttatggtggtcaccaact
attaacagagcaaacgtgtacgttggttttcaggtacaactggatttaacaggaatattt
atgcatggtaaaattccaacgctaaagatttcgctaattcaaatatttcgtgctcacttg
tggcaaaaagtacacgaatcgatagtgatggatctttgtcaagttttcgatcaagaattg
gatgcattggaaatcgaaactgttcaaaaagagaccattcatcctagaaaatcgtacaag
atgaattcttcctgcgccgatattttgcttttctctgcatataagtggaatgtctctagg
ccatcgctactcgctgattcaaaagatcttatggataatactaccacacaaaaatattgg
atagatgtacagcttagatggggagattatgattctcacgatattgaacgatatgctagg
gccaaatttttagattacacaacagacaatatgtctatttatccatcaccaacagggcta
ttaattgctatcgatttggcttataatttacatagcgcctatggtaactggttcccagga
tgtaagcctcttatacagcaagcaatggcaaaaataatgaaggctaacccggctttatac
gtattaagagaacgcattcgaaaagcattgcaactttattcatcggaacctacagaacca
tatctatcttcacaaaattatggggaactcttttcaaatcaaattatttggtttgtcgat
gatactaacgtttaccgtgttacaattcataaaacatttgaaggtaatttaacgacaaag
cctataaatggagctatctttatttttaatcctcggactggccaattatttttaaaaatt
attcatacttctgtttgggctggtcaaaagcgtttaggtcagttggcaaaatggaaaact
gctgaagaagtagctgcacttattcgatctttaccggttgaagaacaacctaagcagatt
atagtaacgagaaagggaatgttggatcccttggaagtgcatttactcgattttccgaac
attgttataaaaggatcggagctccaattaccattccaggcttgtttgaaagtcgaaaag
tttggtgacttaatattgaaggcaacagaacctcaaatggtgttatttaacttgtatgat
gattggttaaaaactatttcatcgtacacggctttctcacgtttgattcttatccttcgc
gcattacatgtcaacactgagagaacaaaggttgttttaaaacctgacaagacaaccata
acagaaccacatcatatatggccttctttaacagatgatgaatggattaaagtcgaagta
caattaaaagatcttattttagccgattatggtaaaaagaacaatgtaaacgttgcatcg
ctgacacagtcagaaattcgagatatcattttgggtatggaaattagtgcaccatctgca
caacgtcaacaaatcgctgaaatagaaaagcaaacaaaagaacaatcgcagcttacagcg
acaactacacgaacagtaaataaacacggggacgaaattattacagcaacaacttctaat
tacgaaacgcaaacgtttagttctaaaactgaatggcgagtaagagcaatttcagctact
aatttgcatcttcggaccaatcatatatatgtatcgtctgatgacattaaggagactggt
tacacttatattttgccaaagaatgttcttaagaaatttgttaccatttcggacttgaga
gcgcagatcgcggggtacttatatgggattagtccaccagataatccacaagttaaagaa
atacgatgtatagttatggctccacaatggggtacccatcaaactgttcatttgcctaat
acacttccgaatcatcaatatctcaaagagatggagcctcttggttggattcatactcaa
cctaacgagttgccacaattgtcaccgcaggatatatctacgcatgctcgaataatggca
gaaaatccaatttgggatggagaaaaaactatcgttattacttgtagttttacgccagga
tcttgttctctcacggcatacaaattaacacctagtggcttcgaatggggaaagcaaaat
accgacaaaggaaataatcctaaaggttatctaccgagtcattatgaaaaagtacaaatg
ttgttgtctgatcgtttccttggatttttcatggttccaagtcaagggtcttggaattat
aactttatgggtgtgagacatgatccaaatatgaaatatgagctgcaattggcgaatccg
aaagaattctatcacgaaattcacagacctgcccactttttgaatttctctagcttggag
gatggagaaggcgttggagccgatagagaagatgtatttgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
