Bacteroides intestinalis: DXK01_009780
Help
Entry
DXK01_009780 CDS
T06090
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
bis
Bacteroides intestinalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bis00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bis02000
]
DXK01_009780
Transporters [BR:
bis02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DXK01_009780
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CooC_C
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO69188
LinkDB
All DBs
Position
complement(2695777..2698995)
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MDLKRLAKRALATLALSMLCLVAFAQGRQVTGTIIDSTGEPVIGANVLEVGTTNGVITDI
DGNFRLMVQPNAKLQISFIGYITQVITVGNQNNIKVTLKDDAQALDEVVVVGYGSMKKND
VTGSLSSVSADKLAARGALRIEDALQGSVPGVNITQSNSRANGSFNIQIRGQASINNTSG
PLYVVDGMVVSSIDFLNPEDIERIDVLKDASSTAIYGSRASEGVVIISTKGTGAGQNKAQ
PVEITYDGYYGIRKVARMPDFMDATEWMNYRFARYTTGSSDETGRGAYKITDSDLQSVFQ
NGTEWKGSPLYNSWLNNEGYDWADMVLRTASQQNHFISASGATEKTNYRLGIGYQGEENV
FKKNDYNRINIKGSFDSKLSKVVEAGIAVNLVHDVQNDWITDTSNAYSPYNNAFWFAPVV
SPWDEDGNLLAIPAKVGNMSLTSTPSPLVDFELDAYENETRKFHVFGNVYMRFNIMDGLK
FTTTLSPNYYHGRQGIFMGTGVSEKYPLGTAYYQNQKHNQASVINTERLDWTWDNQIDFS
KTWGQHRLNAMGLFSMYASNRETYTQTVTDISDDKLSYHSMEKGSGTKTIKSTYTESSLV
SVAARLNYAYKERYMATVTMRTDGSSRFAKDNRWGWFPSAAVAWRASEEDFLKDVEWLDN
LKLRVSYGITGNNNVGDYATASSASGPNYSVIGGQEYQGYYANGLIDRNLIWEKIKEFNF
GVDFSVLQNRINLTADTYRRLSDGQIMKATVPLETGEGSITTNIGAVRNTGIELGLNLGV
IRNKNFTWDVNLAFARNWSKITELPNGDDVSNNWFIGERLNVLRDYTSAGIITTDGITMR
TKDGDRHYTLQEVYDTFGPGGQGLKWYEGQMAVNDWNNDGKINDEDKQIFGCTDPKWTGS
LSSTMTYKGFDFSFMLYTKQGQWSRSYFHEQYMNYGDRGRQKVNFDYYIPAGTPVLDKNT
GDVTYLSEAHIGKYPYPNNTEKTGGGYFSSSSAAVRYHKTSFVKVKNITLGCTFPKAWLS
KIAVKHLRLYVNVINPFCFTDYEGFDPEWASANLTNGGPASVTYQIGANIKF
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttaaaaagacttgccaaaagggcattagctactctagcattgagtatgttgtgt
ttagtcgcttttgcacaaggtcgccaagttacaggtactattatagatagtacaggcgaa
cccgtgataggcgcaaatgtattggaagttggtactaccaacggagtaataactgacatt
gacggtaatttccgcctgatggtgcagcccaatgcaaaactccaaatttcttttatcggt
tatattacacaagtcattacggtaggtaaccagaacaacattaaagtaactttaaaagat
gatgcacaggcactcgacgaggtggttgttgtaggttacggttctatgaagaaaaatgac
gtgacaggttctttatcctcagtatctgctgataaattggctgcacgcggtgctctccgt
atagaagatgcattgcaaggctcagtaccaggtgtcaacattactcagtcaaacagccgt
gccaacggtagtttcaatattcaaatccgtggtcaagcctccatcaataatacaagcggt
ccgctttatgtagtagatggcatggtcgtatcttctattgacttcctgaatcccgaagac
attgaacgtattgacgttctgaaagatgcttcctctacagcaatttatggttcacgcgcc
tcagaaggagtagttattatttctacaaaaggaaccggagcaggacaaaataaggcccaa
ccagtggaaattacttatgacggctactacggcatccgtaaagtagcacgcatgccggat
ttcatggatgcaactgaatggatgaactatcgttttgcacgctacacaacgggaagttcc
gacgaaacaggacgtggtgcatacaagattactgatagcgacctgcaatccgtatttcaa
aatggtactgaatggaaaggttctcctttatataatagctggctaaacaatgaaggctat
gattgggcggacatggtactgcgaacggcatctcaacaaaaccactttatcagtgcaagc
ggtgcaactgaaaaaacaaattatcgtttaggtatcggttatcaaggtgaagaaaatgta
tttaaaaagaatgattataatcgtatcaatatcaaaggatcattcgacagcaaactgtca
aaggttgtagaagcaggtatagctgtcaacttagtgcacgatgtgcagaacgactggatt
accgatacttcgaatgcttattctccttacaacaatgcattctggtttgctccggtggtt
tcaccgtgggatgaagacggtaatttgctggctatcccggcaaaagtaggcaatatgtcc
ttaacttctacaccttctccgttggtagacttcgaacttgacgcttacgagaatgaaact
cgtaaattccacgtcttcggtaacgtttatatgcgttttaacattatggatggtttgaaa
ttcacaaccaccctatcccctaattattatcatggccgtcaaggtatctttatgggtacc
ggcgtttccgaaaagtatcctttgggaacagcttattatcagaaccagaaacacaatcag
gcttctgtaattaatacagaacgcttagactggacatgggacaaccaaattgacttcagc
aaaacatggggacaacatagattaaatgcaatgggattattctccatgtatgccagcaat
agggaaacctatactcagactgtaactgatatttcagatgataaactctcataccattcc
atggagaaaggttcgggtacgaaaactattaaatccacttatacagaatcctctttggtg
tctgtagctgcccgtttaaactatgcctacaaagaacgctacatggctaccgttaccatg
cgtactgatggttcttcacgctttgccaaagacaatcgttggggatggttcccctctgct
gctgtagcatggcgcgcttcggaagaagatttcctgaaagacgtagaatggctggacaac
ttgaaactgcgtgtatcttacggtatcacgggtaacaacaatgtgggtgactatgctact
gcatcttctgcttcaggtcctaactattccgttattggcggacaggaatatcaaggctat
tatgccaacgggttaattgacagaaacctaatttgggaaaagattaaagaattcaatttc
ggtgttgacttctctgttcttcaaaatcgcattaacttaactgcagatacttatcgccgt
ttatccgacgggcaaatcatgaaggccactgttcctttggaaacaggtgaaggttctatt
acaaccaacattggtgctgtacgtaataccggtatcgaattaggattgaatcttggagtt
atccgtaacaaaaatttcacatgggacgtaaatcttgcattcgctcgtaactggagtaaa
attaccgagcttcctaatggagacgatgtcagcaacaattggttcatcggcgaacgtctg
aacgttttgcgcgattacacaagtgccggaatcatcactaccgatggtatcaccatgcgc
acaaaagatggagaccgtcattatacccttcaagaagtatacgatacctttggtcctggc
ggacaaggattaaaatggtatgaaggtcagatggctgtaaacgattggaataatgacggc
aagattaatgatgaagataaacaaatcttcggctgtacagatcctaagtggacaggtagt
ttaagctctactatgacttacaagggattcgacttctcctttatgctctacacgaaacaa
ggacaatggtcacgcagttatttccacgaacaatatatgaactatggtgatcgcggacgt
caaaaagtgaattttgattattacatccctgcaggaacccctgttctggacaaaaacaca
ggagatgtaacctatctgtcagaagcacacataggcaaatatccttatccaaacaataca
gaaaaaacaggaggcggttacttcagcagcagcagtgcagcagtgcgttatcacaaaaca
tcctttgtgaaagtgaaaaatatcacattaggttgcactttcccgaaagcatggctaagc
aaaattgccgtaaaacatctgcgcctctatgtaaatgtaatcaatcctttctgtttcacc
gactatgaaggtttcgatcctgaatgggccagtgcaaacctgacaaacggcggacctgcg
tctgttacttaccagattggtgcgaacattaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system