Alkalihalobacillus lehensis: BleG1_1824
Help
Entry
BleG1_1824 CDS
T03204
Name
(GenBank) triple helix repeat-containing collagen
Organism
ble
Alkalihalobacillus lehensis
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ble00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
BleG1_1824
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIC94402
UniProt:
A0A060LW30
LinkDB
All DBs
Position
1776334..1780842
Genome browser
AA seq
1502 aa
AA seq
DB search
MRLSYFEECSNYQRFRRTSTNGRVLFNNSFPISITGATGITGPTGPAGGITGATGATGAT
GIGLTGVVNYDPVLATNYQIGQVVIYEGGTYLVVSSPPSGIPSESNDYLLLAAPGNTGAT
GAGFEGTVPYDPARVFDYKIGQVVTFEGSAYIVNTTPPTGLPSTSSDYTLLVSRGATGIG
FDSGIVDYNPTLVSDYSVGQLVSFRGSLYVVNTAPPIGEPETSADYSLVAERGATGVTGP
TGVTGVTGATGATGVTGAMGMTGATGLTGATGVAGATGVTGATGVTGATGPTGATGVTGI
TGATGVTGVTGTTGVTGSTGVTGNTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGATGATGVTGV
TGVTGVTGFTGVTGVTGVTGSTGVTGATGATGVTGATGVTGITGVTGVTGATGVTGATGV
TGSTGVTGATGSTGPTGVTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGVTGVTGSTGATGS
TGVTGVTGATGSTGPTGVTGVTGSTGVTGATGATGVTGITGVTGVTGATGVTGATGVTGS
TGVTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGATGVTGSTGVTGVTGATGPTGVTGGTGVTGA
TGVTGATGPTGVTGVTGVTGATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGVTGVTGVTGATGVTGS
TGVTGVTGATGPTGVTGGTGVTGATGPTGVTGATGSTGPTGVTGVTGSTGVTGATGVTGA
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGATGVTGVTGATGVTGVTGVTGATGV
TGATGVTGSTGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGATGVTGPTGATGPTGVTGVTGS
TGVTGATGVTGATGVTGITGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGATGVTGA
TGVTGSTGVTGVTGATGPTGVTGGTGVTGATGPTGVTGATGVTGATGPTGVTGVTGSTGV
TGATGVTGATGVTGITGVTGVTGATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGVTGATGITGVTGA
TGVTGITGVTGATGATGPTGVSGATGVTGVTGVTGATGATGITGLTGVTGATGVTGITGA
TGVTGVTGATGVTGATGVTGATGATGATGVTGSTGATGVTGPTGVTGVTGATGATGVTGP
TGVTGVTGATGATGVTGVTGVTGVTGATGVTGSTGTTGVTGATGVTGVTGVTGPTGVTGS
TGVTGSTGVTGPTGATGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGPTGATGVTGITGATGVTGV
TGTTGVTGSTGVTGATGATGVTGVTGATGITGATGVTGVTGPTGVTGATGATGVTGATGV
TGVTGATGVTGATGATGVTGVTGATGATGATGVTGVSSLQPFFNSNVQAQTVAAGGPVNL
LTPGAYSGFGFVPGIGLITIVTPGMYYISVGLNKAAGTTVGAVFGLTINGVASPSAPIAC
SDTGGLSLVIRVQNYNAGDTIQITNFSTFSVVLANAPNQANSAGHVTIHRYASGPSGTLI
TI
NT seq
4509 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagattgagttattttgaagagtgttcaaattatcaacgatttaggcgtacttcaaca
aacggtagagttttatttaataattcctttccaatcagtataacaggagccactggaatt
accggtcctactggacctgctggaggaattacaggagctactggtgcaaccggagccact
ggaattggattaacgggggttgtaaattacgaccctgtacttgctacaaattatcaaatt
ggtcaagttgtaatttatgaaggtgggacgtatcttgtagttagttccccaccatcagga
atacctagcgaatcgaatgattatttactgttagcggctccaggcaacacgggggctacc
ggtgcaggctttgaaggtactgtgccttacgaccctgctcgtgtgtttgactataagatt
ggtcaagttgtgacgttcgaaggtagtgcttacatagtaaacactaccccaccaactggt
ttgccatcgacatcttctgactatactctacttgttagtagaggagcaacaggaatcgga
tttgatagtgggatagtggactacaatccaacacttgtttcagactattcagttggtcag
ctagtaagttttagaggaagtttgtatgtagtaaacacggcaccaccgataggagaacca
gaaacatcagcggactatagcttagtcgcagaacgaggagcgactggagtcactggacct
acaggagtcactggcgttaccggggctactggagcgactggagtaacgggtgctatggga
atgacaggtgccacaggtcttaccggggctactggagttgccggggctactggagttacg
ggtgctactggagttacgggtgctactggacctacgggagccaccggagttacaggtatt
actggcgccactggtgttacgggagttactggaactacaggtgttactgggtcgacggga
gttactggaaatactggagccactggggttactggagttactggggctacgggagtaaca
ggagtaacaggtgccactggagtaaccggagctactggcgcaacaggagttacgggtgtt
acgggtgttacaggagtaacaggatttaccggggttactggagtcacgggagttactgga
tctactggagtaaccggtgctactggtgctactggtgttacaggtgctacaggagttact
gggattacaggtgttacgggagtaacaggagctactggtgttacaggtgcaactggagtt
acaggatctactggcgtcactggtgctaccggatctactggtcctacgggagtaacggga
gttactggatctactggagtaaccggagctactggagttactggagctactggagttact
ggagttactggagttactggagttactggagttactggatctactggagctactggttct
actggagtcactggtgttactggtgctaccggatctactggtcctacgggagtaacggga
gttactggatctactggagtaaccggtgctactggtgctacaggagttactgggattaca
ggtgttacgggagtaacaggagctactggggttacaggtgcaactggagttacaggatct
actggcgtcactggtgctaccggggtaacgggagtaacaggagcgactggtgctactggt
gtcaccggagccactggcgttactggcgctacaggagtaacaggatctacaggggtaaca
ggtgtcactggagcgactggtcctactggagttactggtggcactggcgtcactggtgct
accggagttaccggggctacaggtcctacgggagttacaggtgttacgggagtaacagga
gctactggggttacaggtgcaactggagttacaggatctactggcgtcactggggctacc
ggggtaacgggagtaacaggagtgactggagttaccggagctacaggagtaacaggatct
acaggggtaacaggtgtcactggagcgactggtcctactggagttactggtggcactggc
gttactggagctacaggtcctactggcgtcactggtgctaccggatctactggtcctacg
ggagtaacgggagttactggatctactggagtaaccggagctactggagttactggagct
actggagctactggtgttactggagctactggtgttactggagcaacaggggttactgga
gtcactggagcaacaggggttactggtgctactggcattacaggagctacaggagtaacg
ggagttaccggcgctactggagtaacaggggtaactggggtaacaggagctactggtgtt
actggcgctactggagtaacaggatctacaggggtaacaggtgtcactggagctaccggg
gtaacgggagtaacaggagctactggtgttaccggagcaacaggtattactggcgccact
ggtgttacaggtcctactggggctacaggtcctacgggagttacaggtgttactggatct
actggagtaaccggtgctactggtgttacaggtgctacaggagttactgggattacaggt
gttacgggagtaacaggagtcactggagttactggtgctacgggagttacaggtgttacc
ggcgctacaggagttacgggagtcactggtgctaccggggccactggcgttactggcgct
acaggagtaacaggatctacaggggtaacaggtgtcactggagcgactggtcctactgga
gttactggtggcactggcgttactggagctacaggtcctactggcgtcactggtgctacc
ggagttaccggggctacaggtcctacgggagttacaggtgttactggatctactggagta
accggtgctactggtgttacaggtgctacaggagttactgggattacaggtgttacggga
gtaacaggagctactggggttacaggtgcaactggagttacaggatctactggcgtcact
ggtgctaccggggtaacgggagtaacaggagcgactgggattactggagttactggagct
actggtgttactggaattacgggagttactggagctactggtgccacaggacctacgggt
gtctcaggagctacaggagtaacaggggttaccggggttacaggagccacaggagctact
gggattacgggacttacaggggttacgggagccaccggagttacaggtattactggcgcc
actggtgttacgggagttacaggtgctaccggagtaacaggagctactggtgttacagga
gccactggggctactggagcgactggagtaacaggatctacaggagcgactggagtcact
ggacctacaggagtcactggcgttaccggggctactggagcgactggagtcactggacct
acaggagtcactggcgttaccggggctactggagcgactggagtaacaggggttactggg
gtaacgggagtaacaggagctactggtgttaccggatctactggtactacgggagttact
ggggctactggagtaaccggagtaacaggggttactggtccaactggagtaacaggatct
actggggtcacgggatcaacaggtgttacaggtcctactggggctacaggagtaacagga
gtaacaggagtaacaggagtaacaggtgctactggcgttacaggtgtcactggagcgact
ggtcctacaggagccaccggagttacaggtattactggcgccactggtgttacgggagtt
actggaactacaggtgttactgggtcgacgggagttacaggtgccactggcgctacggga
gttactggcgttactggtgccactggcattaccggagctacaggagtcactggtgttaca
ggtcctacgggagtaacaggtgccactggcgctacgggagttactggcgctacgggagtt
actggcgttactggagctactggcgttaccggggctactggcgcaacaggagttacgggg
gttacaggagccactggtgcaaccggagctactggtgtcactggagtatcctcacttcaa
ccgttttttaacagcaatgttcaagctcaaacggtagcagcgggtggtcctgtaaattta
ttaacgcctggtgcatactcaggattcggattcgttccaggcattggtttgattacgatt
gtaacaccaggtatgtactatataagtgttggtctgaataaagcagcggggacaaccgta
ggggcggtttttgggttaacaataaacggtgttgcctcaccgagcgctccgattgcttgc
tctgatacaggagggttatctttagttattcgcgttcaaaattacaatgcaggggataca
attcagatcacgaatttctccacattctcagtcgtccttgctaatgctccaaaccaagct
aatagtgcaggtcacgtaaccattcatcgttatgcaagtggaccatccggaactttaatt
acaatttag
DBGET
integrated database retrieval system
