KEGG   Salinivirga cyanobacteriivorans: L21SP5_00997
Entry
L21SP5_00997      CDS       T04172                                 
Name
(GenBank) CRISPR-associated protein Cas9/Csn1, subtype II/NMEMI
  KO
K09952  CRISPR-associated endonuclease Csn1 [EC:3.1.-.-]
Organism
blq  Salinivirga cyanobacteriivorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:blq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:blq02048]
    L21SP5_00997
Prokaryotic defense system [BR:blq02048]
 CRISPR-Cas system
  Type II CRISPR-Cas system
   Type II signiture cas proteins
    L21SP5_00997
SSDB
Motif
Pfam: HNH_4 RuvC_III Cas9_a DUF4288
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALO14664
UniProt: A0A0S2HX99
LinkDB
Position
complement(1212262..1216587)
AA seq 1441 aa
MKVLGIDMGSNSIGLSVRNPELGNDLENQLEYFSSVIFSSGVGNGKTGEYSYAAERTKYR
SSRRLYQSRKYRKWETLKVLRYNKLCPLSESGLAQWSIYNKAKGLYRKYPVNEQQFEQWI
KLDFNGDGKPDYASPYQLRDELMNRQLDMKNAIDRYKLGRALYHIAQRRGFKSSKGETIK
EQENLENNSIESKPDKDIIRELKKSEDNKSKELTTYMKENNLKTVGQAFALLERNGIRIR
GGKYQAIRSQYKEEVYEIFKFQQALSTDSDLFDRIISERKEKGSIFYKKPLRSQKGLVGL
CTMERKIFFDKRNNQKIEKGKPRCPISHPDFEEFRAWSLINNIRYRRNAEEEWQSLALED
KHDLFNEKFLLTRSNFKFEDIAKWLSKRFGIALSYKDKTLNYKEKTNVAGCPISGRLKNL
LGDNWKSMLIPVDKEKVNRTTGEVKKITYNYEDIWHICFSYDESEFVYEFGIKRLGYNEI
KANELVRIWGAIQQGYGMLSLKAIRNINPFLKQGYPYTEAVLLAKIPELMGSHKWEKYGQ
LVEKSISDIIVKNRFEKRILNIVNNLIGNYKSLQYNDEGFATKEVNYLLDEKDKEQIEEF
CIANYGAKSWSEMSVEKRGVVLDVVREDYQAFFKTEKRDFFKIPKVSDALKEFLSKKFEM
FRCENYEEYSHQNNCKCDACKKLNKLYHPSQIAFYPPAIAQSFNYNGVQLSMKLLESPVI
GSFKNPMAMKALHILRKEINKLLKEGIIDEDTRIVVETARDLNDANKRWAIRKYQGEREK
ENDEISKIIQTYFNTNRKISNDEIQKAKLLIDQHEIPVEDGMFEKNVKKYKLWLEQGCRC
IYTGKPLNLTSLFSENNTTDFEHTIPRSKSFDNSLANLTVCDAYYNRTIKKNKLPFELEN
YEKTARIGDEEYPPIKDQLKHWKKKVERLQDNVNNWKFKAKRAQDKPAKDFAIRQRHLWE
MELDYWKNKLERFTMKEVKSSFKNSQLVDTRLITKYVFHYLKTVFNSVDVQKGEVTADFR
KMLGVQKAYEKKDRTKHSHHAIDAATLTLIPKSAKREKMLSLFYKIEEHKKLNKDTPELQ
EELNKERLSCNFNKVKNMVPFIEDKILIKHESKNQALAPAKKVVRKRKKIVKVKNNRGEK
VSMVAKGDSIRGQLHEETFYGKIKALDKKDEFWMVGRKKIEELNPKTDIIVDKALSEHIH
QQIDNGVELNKLKDKAGNTIRHIRCRVKAGRGFLSPDDVTTVKQQTYLSRYDYKNYYYAN
SGDNFGFALYVDENKKPLKIIPKSLFEVSKQDIDEHKKIEDYFERNIMVGRGQRKKIGEL
YNVFQVGQHVLFYVDDKEELKHTDNLSSHLYVVKTLFDGKTGRIQFQHHLEARTDEQLIR
DFPDKDENGKKLFGKAGKNGFSSFGLDFIRPRLLLTVGKLNCIYEGKDFEFKADNQIRFF
F
NT seq 4326 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagttttaggtatagatatgggatcaaattcaataggattaagtgtacgtaatcct
gaattgggaaatgatctcgagaaccaattagaatattttagttcggttatattcagttcc
ggtgtgggtaatggtaaaaccggagagtattcgtatgctgcagagagaacaaaatacaga
tcaagtaggagattatatcagtctcgtaagtatcgaaaatgggaaacacttaaggtttta
agatataataaattgtgtccattatctgagtcaggtttagcacaatggagtatttataac
aaagccaaagggctttatcgaaaataccctgtaaatgaacagcaattcgaacaatggatt
aagcttgactttaatggtgatggaaaaccggattatgctagtccatatcaactgagagat
gagctaatgaatcgacagttagatatgaagaatgccatagatcgctataagttaggacga
gctttatatcatattgctcagcggagaggtttcaaaagtagtaaaggagaaacaataaaa
gaacaagagaatttagagaataatagtattgaaagcaagccagataaagacataatacgt
gagttgaaaaagtctgaagataataaatctaaagagctaacgacatacatgaaagaaaat
aatctaaaaacagttggacaggcttttgcattattggaaagaaatggaataagaataaga
ggtggaaagtatcaagccataaggtcacaatataaagaggaggtctatgagatttttaaa
tttcaacaagccctgagtaccgatagtgatcttttcgatcgaataattagtgagcgtaaa
gaaaaagggtctattttctataaaaagccattacggtctcagaaaggattagtgggactt
tgcacaatggaacgtaagattttttttgataaaagaaacaatcagaaaatcgaaaaagga
aaacctcgatgccctataagtcatccagattttgaggagtttagggcatggtcattgatc
aataatatcaggtaccgaagaaatgctgaagaagaatggcaatcattagcattagaagat
aaacatgatttatttaatgagaaatttttgttgacacggtcaaattttaaattcgaagat
attgcaaagtggttatctaaacggttcggtatcgctttatcttacaaagacaaaacttta
aactataaagaaaaaacgaatgtggcgggttgtccaattagtggtagacttaaaaacctt
ttgggagataattggaagagtatgttgatacctgttgataaagagaaagttaataggaca
actggtgaggtgaaaaaaattacctataactatgaagacatttggcatatttgcttttca
tacgatgaaagtgaatttgtatatgagtttgggataaaaaggctgggttataatgaaata
aaagcaaatgagttagtgagaatttggggtgctattcaacaaggttatggtatgttaagt
ttaaaggcaattcgcaatatcaatccgtttttgaaacaaggatatccttatactgaagcc
gtattgttggcaaaaatacctgaattgatgggtagccacaagtgggaaaagtatggacag
ctagtagagaaatcaatttctgatataattgtcaaaaatcgctttgaaaaaagaatttta
aatattgtaaacaatttaataggaaattataagtcgctgcaatataatgatgaaggattt
gcgactaaggaggtaaattaccttctagatgaaaaagataaagagcagattgaagagttc
tgcattgccaattatggagccaaatcttggtcagaaatgtccgttgaaaagagaggggtg
gttttagatgttgttagggaggactatcaggcattctttaaaactgaaaaaagggatttt
tttaaaatcccaaaagtaagtgatgctttgaaggagttcttaagtaagaaatttgaaatg
tttcgatgtgaaaactacgaggagtattcacatcaaaacaattgcaaatgtgatgcctgt
aaaaagcttaataaactctatcatccttcccaaattgcattttatcctccggcaatagca
cagtcatttaattacaatggcgtgcaattatccatgaagctattagaaagtcctgtaatt
ggatcatttaaaaatccaatggccatgaaagcactgcacatacttcgtaaagagattaat
aaacttctgaaggaaggaatcattgatgaagatacccggatagttgttgaaactgctcgt
gatttgaatgatgcgaataaacgctgggcaattaggaaatatcaaggggagcgggagaaa
gagaatgatgaaatatcaaagataatacagacttattttaatactaatcgaaaaataagc
aatgatgaaatacaaaaagctaaactacttatagatcagcacgaaattcctgttgaagat
ggcatgtttgaaaaaaacgtaaagaagtataaattatggcttgaacaggggtgcagatgc
atttatacaggaaaaccattaaatcttaccagcttgttttctgaaaataatactactgat
tttgaacacacaatccctcgaagtaaatcttttgataattctttggcgaacctaactgta
tgtgatgcatattacaaccgaaccattaaaaagaataaacttcctttcgaattggagaat
tatgaaaaaactgcaagaattggtgatgaagaatatcctcccataaaagaccagctaaag
cattggaaaaaaaaggtagaacggttacaagataatgtgaataactggaagtttaaagct
aaacgggcacaagataagccagccaaagattttgccattcgccaaaggcatttatgggaa
atggaacttgattactggaaaaacaagttggaacgatttactatgaaagaggttaagtcg
agttttaaaaatagtcaacttgtagacactcgtttgattacaaagtatgtctttcattat
ctaaaaacagtatttaatagtgttgatgtacagaaaggtgaagtgacagcagattttaga
aaaatgctaggcgttcagaaagcctatgaaaagaaagacagaacgaaacactctcatcac
gcaattgatgctgcgacccttacattaattcctaaatcggccaaaagagaaaagatgctt
tctttattttacaaaattgaagaacataaaaaactcaacaaagatacccctgaattgcag
gaagaacttaataaggaacgcttaagttgcaattttaataaggtgaaaaatatggtgcct
ttcattgaggacaaaatactgataaaacatgaatcaaaaaatcaagccttagctcctgca
aaaaaagttgtccgcaaacgaaaaaaaattgtgaaggtgaaaaacaataggggtgaaaag
gtttcaatggttgcaaagggtgatagtatcagaggccaattacatgaagaaaccttttat
ggcaaaattaaagcgttggataaaaaagatgagttttggatggtaggaagaaagaaaatt
gaagaattaaatcccaaaactgatattattgtggataaagccctttcagaacatattcac
caacaaatcgataatggagttgagttaaataagctaaaggataaggctggtaatacaata
aggcatattaggtgccgggtgaaagccgggagaggttttttatcacctgacgatgttact
accgttaaacaacaaacttatctgtccaggtatgattataagaattattattatgctaat
tcaggtgataattttgggttcgccttatacgtggatgaaaacaaaaagccgctaaagatt
attcccaaaagcctatttgaagtatcaaagcaggatattgacgagcacaaaaaaattgag
gattactttgagcgaaatataatggtaggcagagggcaacgaaaaaaaattggggagctt
tataatgtatttcaggttgggcagcatgtgttattttatgttgacgataaagaagaatta
aaacatacagataatttatcctctcacttatatgtagttaaaactttgtttgatggtaaa
acagggaggattcaatttcaacatcatttggaggctcgtactgatgaacagctaatcaga
gatttccctgataaagatgaaaatgggaagaaattatttggcaaagcgggtaaaaatggt
tttagttcatttggattggattttatacggccacgtttgcttcttacagtggggaaatta
aattgcatttacgaaggtaaagattttgaattcaaagcagataatcaaatcagattcttc
ttttga

DBGET integrated database retrieval system