Salinivirga cyanobacteriivorans: L21SP5_02877
Help
Entry
L21SP5_02877 CDS
T04172
Symbol
ypdA_4
Name
(GenBank) Sensor histidine kinase YpdA
Organism
blq
Salinivirga cyanobacteriivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
His_kinase
Y_Y_Y
HATPase_c
BRCA-2_helical
HATPase_c_2
Beta-prop_KIB1-4
Spore_YhaL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO16497
UniProt:
A0A0S2I2F3
LinkDB
All DBs
Position
3473293..3476151
Genome browser
AA seq
952 aa
AA seq
DB search
MKLFKTYLFFLLLTLQFQSPAQEPSIKQIGNIELSGVNVFDVIQDSNRYYWLATNMGIYR
YDGYNFEKIDIKNSLSVSAFSLKKDKNDQLFFKNLSGQVFKIHDDSCSLFYEVPDSLKSR
YFNYAFDDQNNLIIASKRLFAVKSNTQIDFLSKEKSSTFYNSFRQLADGTLIIPEFSRKE
MHILKNGECSVLPLNLGIEKMNSFFLMNDVPYFVWKDKLFKIELNNAAQITKTAQRFEHE
HGTYKYYDHDQLLLVPNLAGGAYLYDEDFKPFFSGLILKNHVISCGMVDMDDNIILGTFG
EGLILIPNINLKTISLPDEGLKTTQIAAGKDVMFLGFINGAVLKSNNQYTFKSFFKDSPT
GLMKRIEVLTYFPEHNHLLIDRTTPVLLDIDSKRTTKLYVGAIKDVEKLGPDKYMTSSNQ
GVYFLKLNRDKAPQVWESEPIENFKIRSQCANQDSKTKTIYAGTSSGLLMGSEENASLFR
FKQADLMCTDIVYHENKMYVATQNHGVLIFQNDSLIDQWDVKDDLLSNRIKQIKFHNNEI
YVSSYDGMQILSHKGENRNILNTSSGLSDNNILDFDILNEILWVVTVNEVQSVDIQYLNA
QSEFKPTLSLTGILVNDSLINYENRSRFSYQQNKLEFRLNSISLKYQNEIEFQYRLKPID
KEWQVNDYLENKIQYKTLPPGNYVFKAKARCRDVDSNVVSYKFAINAPFWQKWWFYVLVL
IVFLSVTIYVYKFQIKRQRQKIRIQNELNASKLIAIQSQMNPHFIFNAINSIQDLILQGD
IDNSYNYVIKFSKLVRKTLEYSDKEFIDIESEVDLLETYLELEKLRFKKDFVYAIHLNGI
ENVVVPPMLVQPFVENAIKHGLLHKKGNKKVSISFHHKDDLVCEVEDNGIGREKAQEIKA
RQPEGHQSFSVNATKSRFEIMKSHYKYDLSLQYVDSDKGTKVIIRMPYKKKY
NT seq
2859 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagctatttaaaacgtatttgttttttttactgctgacattacaattccaatctccc
gcacaggaaccatccatcaaacagattggcaatattgagttgagtggggtaaatgtgttt
gatgtcattcaggatagcaaccgttattactggttggctaccaatatgggaatttatcgt
tatgacggctataatttcgaaaaaatagacatcaaaaacagcctttctgtttcagctttt
tctctaaagaaagataaaaatgaccaactgttcttcaaaaatctgagtggccaggtattt
aaaatacatgatgatagttgctctttgttttatgaggtgccggatagcctgaaatcacgc
tatttcaattatgcatttgacgatcaaaataacttaattatcgcttctaaacgtttgttt
gctgtaaaaagcaacactcaaattgactttttatcaaaagaaaaaagcagtacattttat
aacagttttagacagctagccgatggaaccttgatcattcctgagttttccagaaaggag
atgcacattttgaagaatggagaatgcagcgtattgcccttaaatcttggtatcgaaaaa
atgaattcttttttcctgatgaatgatgtaccttactttgtctggaaagataagctattt
aagattgaattgaataatgctgcccaaataactaaaacagctcaaaggtttgaacatgag
catgggacatacaaatactatgatcatgatcaattattgctggtacccaacctggccggg
ggagcctatctctatgatgaggattttaaacctttttttagtgggctcatattaaaaaat
catgtgatatcctgcggcatggtcgacatggatgataatattatactgggaacttttggc
gaagggcttattttaataccaaatatcaacctgaagacaatcagcttgcctgatgaaggg
ttaaaaaccacacaaattgcagccgggaaagatgtgatgtttttgggcttcataaatggt
gctgtactaaagagtaataatcaatatacctttaaatcttttttcaaggacagtccaacc
ggtttgatgaaaagaatagaggtactgacgtatttccctgagcataatcacctcttaatt
gaccgtacaacccctgttttactcgatattgattcgaaaagaacaaccaaactatatgta
ggggcaattaaagatgtcgaaaagttgggcccggacaagtatatgacatcttcaaatcag
ggtgtttatttcttaaagcttaatagagataaagccccacaagtatgggagagtgaacca
attgaaaattttaaaatccgcagtcaatgcgccaatcaggattcgaagacaaaaaccatt
tatgccggaacctcaagtggtttgttgatggggagtgaagagaatgcctcactatttaga
tttaagcaagccgatttaatgtgtaccgatatagtatatcatgaaaataaaatgtatgtc
gccacgcaaaatcatggggttttaatctttcaaaatgacagcctcattgatcaatgggat
gtgaaagatgacttgctatcaaatcgcataaagcaaattaagtttcacaataatgaaatt
tacgtttcatcttatgatggcatgcaaattttgagtcataaaggagaaaatcgaaatatt
ttaaatacctcttctggcttatctgataataatattctagattttgatatattgaatgaa
atactttgggttgttacggtgaatgaagttcaaagtgttgatatacaatatcttaatgct
caaagtgaatttaaaccaacattaagcttaactggtatccttgtcaatgattccctgatt
aattatgaaaaccgaagccggtttagttatcagcaaaacaaattggaattccggctaaat
tccatcagtttaaagtatcaaaatgaaattgagtttcagtacagactaaagccaatagat
aaagagtggcaggtgaatgattaccttgagaataaaatacaatacaaaacattgcccccg
ggcaattatgtgtttaaagccaaagctagatgtagagatgtagatagcaatgtggtgtca
tacaaatttgctataaatgctccattttggcaaaaatggtggttttatgtacttgtactc
attgtgtttttaagtgttacgatatacgtatataagtttcaaataaagcggcaaaggcag
aaaataaggattcaaaatgaattaaatgcatctaaactgattgccattcagtctcaaatg
aatcctcattttatatttaatgccattaattccatacaggacttaattttacagggtgat
attgataattcttacaattatgtaatcaaattctcgaaactggtaagaaaaacactggaa
tattccgataaagagtttattgatattgaatctgaggtggatttgctggaaacttacctt
gaattggagaaactaaggtttaaaaaagattttgtttatgccattcacctcaatggaatt
gaaaatgttgttgtacctccaatgctggtgcaaccctttgttgaaaatgccattaaacat
ggattattacataaaaaaggaaataaaaaagtaagtatttcatttcaccataaggatgat
ttggtgtgcgaggtagaagataatgggattggtcgcgaaaaggcgcaggagatcaaagca
cggcagccggagggtcatcagtccttttcagtaaacgcaacaaaaagccggttcgaaatc
atgaaatcgcactataagtatgatctgagcctgcaatatgtcgattctgacaagggtaca
aaggtcatcatccgtatgccttataaaaaaaagtactaa
DBGET
integrated database retrieval system