Salinivirga cyanobacteriivorans: L21SP5_03230
Help
Entry
L21SP5_03230 CDS
T04172
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
blq
Salinivirga cyanobacteriivorans
Pathway
blq02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
blq00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
L21SP5_03230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
PEGA
ASH
CarbopepD_reg_2
Cep192_D4
CARDB
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
Por_Secre_tail
Phage_tube_C
SpaA
Big_1
TMEM131_like_N
Reelin_subrepeat-B
CBM60
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO16844
UniProt:
A0A0S2I4D0
LinkDB
All DBs
Position
3911998..3917034
Genome browser
AA seq
1678 aa
AA seq
DB search
MRHLHFLLMLLFVVFSTFGNAQTIIQETFGSGIPTEWSVIDNNEDSQTWDGYASAGYTDT
YSASIQAYAAHDDYLVMPQLTVEEGMTIEFVTKSHNTSWLEDMEVIASKDVDTAGAFNIQ
LGDYQNIPGTWTTYEIDLTANANISAGDNIYVAFRCYSNNAYYIYLDDVVVATPLSNDLS
VSALSFNPATVLEGDNTEITATIENTGLNDQTGVVADFKVDGASIGTQSFDVTSGASTDV
TLSWTAELGTHDITVELPADDNTANDVLTESLSVFSASALVEDFEGTFPPSGWTGDISSS
GWKQYDLAPYEGTYSAYVSAGSLKRFITPKLAIDATSVINFWAKAAYGSHSIKLAYSTDL
TTWTDVPSGSVSIDGTYSQYSVDLSAIDVKGNYYIAFVYNLNYTSVYLDNVVGPEVAVEA
PVAAINPTPADAATAVIAGTDLTWEDGAGGVPTGYKVYFGTDSDGTTTPTNIENGTEQSA
KVYSPASVLDYETTYYWQIIPTNSLGDASNCPIWSFTTESNPTQAIPYIEDFESVAVNSL
PENWTSDFTYQVQENHGTGSSKGITVNMWSSTNTAQATTMPVGPLSATANQIVFDYRVVD
YSGYPSNATSLGTNDKVELQVSADGGASFTTVHTIDQATHTTTTEFTTITHNLDAAYNGE
TIHVRFKNTWGTGDYFVDIDNVKIRETSTDPLFLANTDTLQFAGVPVSLSASKILSIMND
GGGTLQINDGNIALSGTSAEDFSLGTVAYPIELGAGESVDLELTYTPAAAGEDTVSLNIT
HNGVKTVNSVALIGSSYEPFATYFENFDATPIDQIPEKWNQFVDGAGTVGVSESTSDSYS
QPNYLMLSNSSQLTGNLMAIAPALEMGNKRMVFYAKHGYYAASLSVGTMSDPTDPTTYTE
LQNLTLTGNYQEYEVDFSSYSGSDVFVAFKHELNSTYSTIFLDDVKWEEIPTTPVCEVSP
ATLDWGLTTVGQVSEQTLTVSNAGVGTLTINNGDLLINGINAADFAVGDITYPIELAADE
SADIIINFVPQAEGAREAILSVAHNGNNSPVEVPLSGDGLAGMLEDFNAVGTTFPPEGWT
ASDSWKALTFSTYEGAGGVWFNPAEDVTDAKLITPLLDVQSGDTFSFYAKKSTNDATLTV
MYTDDTASGTWNDIQSFTITNTDYEQKTADLSAMPTGEYFIAIAGSGVAFTSTYIDYVQG
PSVAGTFDINFIVTDQTTGDPIEGAIINVAGNDYMSDASGEALIQLSNGTFPYQITANGY
EDYSETVAVNGAGQTVNVAMSPVDGYVASFTITDVDSNPVQGATVSIDGTDLITDASGTT
EIILPNGEYQYTISADGYAPVTDTIIISDANVNITETLLNVYSVTFVVTDQAGNPINGAF
VVIGSNFYNTNASGEVNVDAVNGTYYYTVTKADYEMVSGEVTVNGAAVTEEVTLRLVYVV
YFEVAEPTGSPVENAEITIADSTLTTDIDGLAVIELPNGDYEATISKSGYEDAIENFTVS
DAELDIPVTLNPVATTYNIYFNVTDDQSVAIEDATIELTNGIDTWTEITDATGEASFADK
PNGTYDYTITKSGYEAVSNSVMVADGDEAVDISMTLVGIQNASEIAFNIYPNPTRNSVTI
NTDETEVFISVINANGDVVETADIHNKTTLNLRQYGTGVFFIRIQTAHGVNTRPVIVN
NT seq
5037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacatttacactttttattaatgcttttatttgtagtgttttcaacttttggaaat
gcgcaaacaattattcaggaaacatttggtagcggaatccctactgaatggagtgttatc
gacaataacgaggatagtcaaacctgggatggctatgcatctgctggttacaccgatacc
tattcggcaagcattcaggcttatgcagcacacgacgattacctcgtaatgccacaatta
actgtagaggaaggcatgacaattgaatttgtgaccaaatcgcataacacttcatggctc
gaagatatggaagttattgcttcaaaggatgtcgacactgcaggtgcttttaatattcaa
ttgggagattaccagaatattcccggcacgtggactacctatgaaatagaccttacggcc
aatgctaacatctctgccggagataatatttacgttgcatttcgctgctattcaaataat
gcctattatatctatcttgatgatgttgttgttgctacgcctctttcaaatgacttgtct
gtaagcgcattgagttttaatcccgctacggttttagaaggtgataatacagaaattact
gcaaccatcgaaaatacaggacttaatgatcaaacaggcgttgttgctgattttaaggtt
gatggtgcctctattggtacgcaaagttttgatgtaacatctggtgcaagcacagatgtt
acgctttcatggacagctgaactgggtacacacgatattaccgttgagctgcctgcagat
gacaataccgctaatgatgttttaacagaatcattatctgtttttagtgcatctgctctg
gtagaagattttgagggtacttttcccccttcaggatggaccggtgacatttcaagttct
ggctggaaacaatacgaccttgcgccttatgagggaacctattccgcatatgtatcggcc
ggaagcctaaaacgttttattacaccaaagctcgctatagacgctacttctgtaattaat
ttctgggcaaaagcagcatatggctcacacagcataaaattggcctattccactgatttg
accacatggacagatgtgccttctgggtctgtttctatcgatggaacttatagtcaatac
agtgtggatctttctgcaattgatgtaaaaggtaattattacatcgcttttgtttacaat
ttaaactacaccagcgtttatcttgataatgtagttggacctgaagttgctgttgaggca
ccagttgccgcaattaatcccactccggcagatgcagctactgctgtaatagcaggcaca
gacctgacctgggaagatggtgccggcggagtgcctaccggatataaagtatatttcgga
accgatagcgatggcactacaacacccaccaatattgaaaatggtacagagcaatcagcg
aaagtttattcgcctgcatcagtactcgactatgaaaccacttattattggcaaattatt
cctaccaacagtctgggcgatgcttccaattgccccatatggagctttaccaccgaatct
aatcctacccaggctataccgtatatagaggatttcgaatcagtcgcagttaattcatta
ccagaaaactggacaagcgactttacataccaggtgcaggaaaatcatggcacaggaagt
agtaaaggcataactgtaaatatgtggagtagcacaaatacagcacaggctactacaatg
cctgttggtccattatcggctactgccaatcagattgtttttgattaccgcgtagtagat
tattctggttatccttccaatgcaacatcacttggtacaaatgacaaagttgaactacag
gtttctgcagacggtggcgcaagttttacaactgtacataccattgatcaggctacgcat
acaactactacagaatttacaaccattacccacaacctggatgctgcttacaatggcgaa
actattcacgtacgctttaaaaatacctggggcacgggtgattattttgtagatattgat
aatgtgaaaattcgtgaaacttccacagatcctttatttcttgcaaataccgacacattg
caatttgctggtgtccctgtttcattaagtgcttcaaaaatactcagcattatgaatgat
ggaggcggcacattacaaattaacgatggaaatatagctttaagtggcactagtgccgaa
gattttagtttaggtactgtggcgtatccgattgaattgggtgctggcgaatcagttgat
ctggaattgacatatacgcctgcagcagcaggagaggatacagtatcgctgaatataact
cataatggtgttaaaacagtaaattctgtagcattgatcggttcatcatatgaaccattt
gctacttattttgagaattttgatgctacaccaatcgatcaaattcctgagaaatggaat
caatttgttgatggggctggtactgttggtgtatctgaaagtaccagtgattcttattca
caacccaattacctgatgctgtccaatagcagtcagctaacgggaaatcttatggctata
gctcccgctttggaaatgggtaataaacgcatggttttttacgccaaacatggatactat
gccgcctcattgagtgttggaacaatgtcagatccaactgatccaactacttatacagaa
ctgcagaatttgaccttaactggtaattaccaggaatatgaagtagattttagtagctat
tcaggtagtgatgtctttgtagcttttaagcatgagctaaatagcacttattcaaccatt
ttcctggatgatgttaaatgggaagagattcctacaacgccagtttgcgaagtaagccct
gcaacactcgattggggactaactactgttggacaggtttcagaacaaacacttactgtt
tctaacgcaggtgtaggcacactgactattaataacggcgatcttttaattaatggtatt
aatgcagcagattttgcggtgggcgatattacatatccaatagagcttgcagcagatgaa
tcggctgatattatcataaattttgtcccccaggctgaaggtgcaagagaagccatactg
tctgttgcacacaatggtaataatagcccagtggaagtaccactttctggagatggtttg
gcaggaatgctggaagattttaatgctgtgggaactaccttccctccggaaggttggact
gcatctgatagttggaaagcattgacctttagtacctatgaaggagctggaggagtttgg
tttaaccctgcagaagatgtgaccgatgcgaaacttattacacctttgctggatgttcag
agtggcgacacattctccttctacgccaaaaaatcaaccaatgatgcaactttaacggta
atgtataccgacgatacagccagcggaacgtggaatgatatccaatcttttaccatcacc
aatacagattatgagcaaaaaacagctgatttaagtgccatgccaacaggtgaatatttt
atagccattgcaggttcaggagttgcttttacaagtacctacatcgattatgtgcagggt
ccgtctgttgcaggtacatttgatattaactttattgtaacagaccagactaccggtgat
ccaattgagggagctattataaacgttgcaggcaatgattatatgagtgacgccagcggc
gaagctttgattcagcttagtaacggtacgttcccatatcaaattactgcaaatgggtat
gaagattatagcgaaactgtagcagtaaatggtgccggacaaacggtaaatgttgcaatg
tctcctgttgatggttacgtggcttcttttacaattacagatgtagattccaatcccgtt
cagggcgctactgtgagcattgatggcacagatttaattacagatgccagtggaaccact
gaaattatattgcccaatggtgaatatcaatacacaatatctgctgatgggtatgcacct
gttacagatacaataataatttcagatgcaaatgtaaatattactgaaactttactcaac
gtatattcagttacatttgtggttacagatcaggcaggcaaccctattaacggggctttt
gttgtaattggttcaaatttttataacaccaatgccagcggagaagtgaatgttgatgcg
gtaaatggaacttattattacacagttaccaaggctgactatgaaatggtttcaggagag
gttactgtaaatggagcagcagttactgaagaagtgactttgcgccttgtatacgttgtt
tatttcgaagttgccgagccaaccggaagtccggtagaaaatgcagagattacaattgca
gattcaacacttacaaccgatattgacggccttgctgtaattgaattacccaatggtgat
tatgaggctactatttccaaatcaggttatgaggatgctattgaaaactttactgtaagt
gatgcagagctcgatattcctgttacacttaatcccgtagctacaacatacaatatttat
tttaatgtaacagacgatcaatctgttgccatcgaagatgcaacaattgagttaacaaat
ggtatagatacgtggacagaaatcacagatgcaacgggtgaagcatcttttgctgataaa
cccaatggtacttatgattataccataacaaaatcgggatatgaagccgtttcaaattct
gtaatggttgcagatggtgatgaagctgtagatataagtatgacgcttgttggtatccaa
aatgcttcagaaatagcgtttaatatctatccaaacccaacacgcaacagtgttacaata
aatacagatgaaaccgaagtatttattagtgttattaatgctaatggcgatgtagtggaa
actgcagatattcacaacaagactacattaaatttacgtcaatatggtacgggtgtattt
tttatccgtattcagacagcgcacggagtgaatacaaggcctgttattgtcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system