Babesia microti: BMR1_02g01960
Help
Entry
BMR1_02g01960 CDS
T05554
Name
(RefSeq) intron-binding protein aquarius
KO
K12874
intron-binding protein aquarius
Organism
bmic
Babesia microti
Pathway
bmic03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bmic00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
BMR1_02g01960
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
bmic03041
]
BMR1_02g01960
Spliceosome [BR:
bmic03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
BMR1_02g01960
Complex C
BMR1_02g01960
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Aquarius_N_1st
AAA_12
Aquarius_N_2nd
AAA_11
AAA_19
AAA_30
ResIII
Viral_helicase1
UvrD-helicase
AAA_22
UvrD_C_2
DEAD
SLFN-g3_helicase
AAA_16
AAA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24424176
NCBI-ProteinID:
XP_012648159
UniProt:
I7IQ72
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(<705850..>710766)
Genome browser
AA seq
1638 aa
AA seq
DB search
MGTNINVTHEDIVSNSFYRKILDYISKYTNSDNSSKNVKAAIATVAGFYTEFYERGFEKL
DLAILDTSDLLNSVLWPLVQLITGDGKKIGKDFDSVILLAVWLKGANPEAVDQRFGSEFM
APFLYRSTSILIRKLLLLTNNNKHSVKLIETLLECRVLLRFLIDCFQNFEYESLRKCCLS
IVSPLIWYHLPSCYRSIKLFGRHEMWSKLYARVIANTNKLCEKIKKSVEFSAIIEGNVHY
DLENVVINRDFIHILLKIFMYLLDLSKEDDNFDSTVVTPEFQSKIMLLETILELFNDLIS
QMPTRRIIKPLLDANFFLVLCKRSPMYSHLQGTYFKKMTDILDFYLSFPISEETGLPIEY
DKQLSEHYKRFEQFQKIIFHEFKHVDLLENMHLESVNTFSTEKLEALFDKLKLKVLLDLT
SKLEIVYLDDLSQQKGEDNYEEDKSGLELIVPFKIDIKRTNKEIKSFLTFLLVNYLSKPA
DPKLRIINDPVYPNEDYLWNSGSIPVNTAYVDYSSLPLPKLTLQYLSVYDYLYRNYQLYR
LEAGYQIKSDLEETIYRMKPVCSLGLNGKFTAEQLRGYRDSQTVANTRFLNASRMGIRLE
SVVITNVYKPQVGIDAIPKVTADLYVDLSELTDYTFRDDWDSLRTYDVLFLVSIAAPLEF
TEKRIEQMNIDEIPLNLGIMGVRGAQIISIADENGMIFSDSNPYEPKLPSGTKRCISVYL
DYAQYELDLKEDIEGIYSNCNLLLRRHARFNNFKSTLDTIKGLVSNPGSLASWLEPFFLG
YGHPNSLKYFASNLDTPALTLNWLNILHDLQHLVSSFPSILYYELGQEFDVNKLQQINVS
NITFKTIVKHDNGIKFKVKKNIPLQYVQLVVDNIISYEYSDQPASFQAKLIPKETKNTKV
TIKGYLDFTLEIHNCTVEMHGIVFEHNNKIYNPIWRAEMESNINELENNLFTTHPLYPNT
NYPLKGIHIGTTSSDIPLHIRLTDRQVEAIYSAVQCGMTCIMGPPGTGKTDVVAQAINIL
YTNYPNEKIVVLAHSNQCLNDIFEKILQSKYVDQRYLVRLGMGERKLDLQYGQDFGKWGR
VNYMLQSRLDLLEYVGKLAKKLRVEGDVDYTVQLALQFYQTHIIHRLIDYKSLLLENKTY
DEVLLDMRLDCCIYSRNGLNQLGIDPKMVGFCEYLFLSSIKTQFSVDGPLKAWAESLENF
SSYGSIKDNILQIDMNFEGIFKFVCINNYAIIHPQHALSLLNLPKYVVFNPFDRDDFMKI
QDIIPLIDELDFTLSKPPAVNCYPVTTVLDTFCKLKECLPFEVLRSNTDRGHYLITRHAR
IVAMTCTHAAIARERLIESNFTYDTLVMEEAAQVLEIETFIPLTLQLQGDKLKRIVLIGD
NRQLPPIIQNRTVASYCKLDQSFYTRVIRLQHPCILLNSQGRSRPEIVSLYSHYYPEPIG
NVGLEREEFGRDNLGFRYNYQFINVDSERGESCPIPHFYQNLEEAEYVIALFTYMRMIGY
DSNKITILTTYNGQRALIEDVMKHKCAWNPRVGTCAVSTVDKFQGQQNDYIIISLVRTRM
VGHIRDPRRLTVALSRARLGLYIFGKWDLFYNCYEIRQTLDKLAFENKLVLDDNKCGESQ
PHVIDNCEQLQKIVQQMQ
NT seq
4917 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaccaatataaatgtgacccatgaggatatagtttccaattcattttatcgcaaa
atcctcgattatatctcaaaatacactaattctgataattcttctaagaatgtgaaggct
gctattgcgacagttgctggattctatacagagttctatgaacgagggtttgagaaattg
gatttagcaattttagacacatctgatctgctaaattctgtattatggccactagtccag
ttgataacaggagatgggaaaaaaattggtaaagattttgattctgttatcttgcttgcg
gtctggctcaaaggggcaaatccagaggcagttgatcaacgtttcggtagtgaattcatg
gcaccatttctataccgctccacctcaattctcatcagaaaactgctattgctcacaaat
aacaataaacattctgttaaactgatagagacattactcgaatgccgtgtattattacgg
tttttgatagattgttttcagaacttcgaatatgaatcactgcgtaaatgttgtttatca
attgtatctcctctgatttggtatcacttaccatcatgttataggagtattaaattgttt
ggaaggcacgaaatgtggtccaaactttatgcacgtgtaatagctaacaccaacaaattg
tgcgaaaaaattaagaaatcagtcgaattttcagcgattatagagggaaatgtgcattat
gatctggaaaatgtggtaattaatagggatttcatccatattttgttgaagatttttatg
tacctactagacctgagtaaggaagatgacaattttgattccaccgtcgtcacacctgaa
tttcagagtaaaattatgctactagagacaatacttgaactatttaatgatttgatcagc
cagatgcctacccgtcgcataataaaacctctgttagatgcaaatttttttctcgtcctt
tgcaaaagatcgcccatgtactctcatttacaggggacttacttcaaaaaaatgacagat
atattggacttctacctctcatttccaataagcgaggaaacaggccttccaattgaatat
gacaaacaattatcggagcactacaaacgatttgaacaatttcaaaagattatctttcac
gaatttaagcatgtagatttgctagagaacatgcatttggagtcagtaaacactttcagt
acggagaaattggaggcattgttcgacaagttgaaattgaaagtattgctagatttaaca
tctaagctggagattgtttatttagacgatttgtcacagcaaaagggtgaagataattac
gaggaggataaatcagggttagagttgattgtgccatttaaaatagatattaaacgtact
aacaaggagatcaaaagttttttaacttttttgttagtaaactacttatcaaaaccagca
gatcccaagttgcgaataataaatgatcccgtgtatcccaatgaagattatttgtggaac
tctggtagtataccagtaaacacagcatacgtagattattcatctcttcccttaccaaaa
ttgactttacagtatctatctgtttacgattacctatatcgtaactaccaattgtacagg
ttggaggcaggttaccaaattaagagtgacctagaggaaacaatttacaggatgaaaccc
gtttgttcattgggtctgaatggaaaatttactgctgaacaattgagggggtatagagac
tcacaaacggtggcaaatactagatttttaaatgcttcaagaatgggcataaggcttgaa
agtgttgttataacgaatgtatacaaaccgcaagttggtattgatgctatccctaaagtt
actgccgatttgtacgttgatctatcggaacttaccgattatacattccgagatgattgg
gattccttacgcacgtatgatgttctgtttctagtgagtatcgctgccccccttgagttt
acagaaaaacggatagaacaaatgaatattgatgaaataccacttaatcttggtattatg
ggcgtaagaggggctcaaataatttcaatagctgacgaaaatggtatgatattttcagat
tcaaatccctacgagccaaaactcccgagtggaacaaagcgttgtatctctgtatatctg
gactatgctcagtatgagctagacctaaaggaggacattgaaggtatttactccaattgt
aatctcttactgaggaggcatgctcggtttaataattttaaatcgactctggataccatc
aaaggattggtttcgaaccctgggtcgctggcatcctggctcgaaccattttttttgggt
tacggtcaccccaactcgctgaaatattttgcctctaaccttgacactccggcactcaca
ctcaattggttaaatatactacacgacctacagcatttagtcagttcattccccagcatc
ttgtattatgaattaggtcaggaatttgatgttaataagttgcaacaaataaatgtctcc
aacataacattcaaaacaattgttaaacatgacaatgggattaagtttaaggtgaagaag
aacataccactgcaatatgtacaattggtagttgataacataatatcctacgagtactct
gatcagcctgccagttttcaggctaaattgatacctaaagaaacaaaaaatactaaggtt
actatcaaagggtacctagacttcacacttgaaatacacaactgtacggtggaaatgcat
ggtatagtatttgaacacaacaataagatttacaatcccatatggcgtgctgaaatggaa
tcgaacattaatgaacttgaaaataatttattcacaactcatccattatatcctaataca
aattatcctctaaagggcatacacattggcacaacttctagtgacataccgttacatatt
aggctgacagataggcaggtggaggcaatttactccgcagtgcagtgcggaatgacttgt
ataatgggccctcctggtacgggtaaaacagatgttgtggcgcaggcaattaatattttg
tatacaaactatcccaatgaaaagatcgttgtattggcccattctaatcagtgtttgaat
gatatttttgaaaaaattttacagagtaaatatgtagatcagagatatctagtaagactt
gggatgggagagaggaagttggatttgcaatatggacaagattttggcaaatggggaagg
gttaactatatgctccagtcacgattagatctgctagagtacgtaggcaagttagctaaa
aaacttcgcgtcgaaggtgatgtggattacactgttcaattagcactccagttctaccag
acccacataatacaccgattgattgactataaatcgctgcttcttgaaaataaaacatac
gatgaggttctactagatatgagattggattgttgtatatactccagaaatggacttaat
cagttgggtattgatcccaaaatggttgggttttgtgaatatctgttcttaagttcgatt
aaaactcaatttagcgtggatggtccattgaaggcatgggctgagtccctagaaaatttt
tccagttatggttccattaaggacaatattttacaaatagacatgaattttgaaggtatt
ttcaagtttgtatgcataaataattatgctataatacaccctcagcacgcattgtcactg
ctaaaccttccaaaatatgtcgtttttaacccatttgaccgtgatgatttcatgaaaata
caagatatcatccccttaattgatgagttggattttaccttaagcaagccacccgcagta
aattgttacccagtcactaccgtattggataccttctgcaaattaaaggaatgtctacct
tttgaggtgttgaggagtaatacggacagagggcattatttaatcactcgacatgctaga
attgtggcaatgacttgtactcatgctgcaattgcgagggagcgattaattgaatcaaat
tttacctatgatactttagtgatggaggaagcagctcaagtgttggagattgaaacattc
atacccctaacccttcagttacagggtgataaattgaagaggatcgtcctaattggtgat
aacagacaattgcctccgataatacaaaatcgtacagttgctagttattgcaaactagac
caatccttttatactagggtaattaggcttcaacatccatgcatactacttaactcccag
ggcagatctcgacccgaaattgtatcattatattcgcattattaccctgaaccaattggt
aatgtaggcttggaaagggaggaatttggtagagataatttaggtttcagatataattac
caattcataaatgtggacagtgaacgtggtgagtcttgtccaattccacatttctaccag
aacctagaagaggcagaatatgttattgcgttattcacttacatgagaatgattggttat
gattccaacaaaattacaatacttaccacgtataatgggcaaagagcattaattgaagat
gtgatgaagcataaatgcgcgtggaatccacgtgtgggaacttgcgctgtatccaccgtt
gacaaatttcagggtcaacaaaatgactacataattatatctttggtgagaactagaatg
gtaggtcacattcgtgacccaagaaggttaactgtggcattgtcccgtgccaggttgggg
ctgtatatatttggcaaatgggatctgttttacaattgctatgagatccgtcagacattg
gacaagttggcctttgagaataaactggttttggatgataataaatgtggggaatctcaa
ccgcatgtaatcgataattgcgaacagttgcaaaagattgtccaacaaatgcagtga
DBGET
integrated database retrieval system