KEGG   Babesia microti: BmR1_04g06670
Entry
BmR1_04g06670     CDS       T05554                                 
Name
(RefSeq) DNA polymerase epsilon subunit 1
  KO
K02324  DNA polymerase epsilon subunit 1 [EC:2.7.7.7]
Organism
bmic  Babesia microti
Pathway
bmic03030  DNA replication
bmic03410  Base excision repair
bmic03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bmic00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    BmR1_04g06670
   03410 Base excision repair
    BmR1_04g06670
   03420 Nucleotide excision repair
    BmR1_04g06670
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:bmic03032]
    BmR1_04g06670
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bmic03400]
    BmR1_04g06670
Enzymes [BR:bmic01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     BmR1_04g06670
DNA replication proteins [BR:bmic03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   DNA polymerase epsilon complex
    BmR1_04g06670
DNA repair and recombination proteins [BR:bmic03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    Long Patch-BER factors
     DNA polymerase epsilon complex
      BmR1_04g06670
SSDB
Motif
Pfam: POL2_thumb DNA_pol_B_exo1 DNA_pol_B DUF1744 DNA_pol_B_exo2 zf-DPOE RNase_H_2 zf_DPOE_2 DUF6897
Other DBs
NCBI-GeneID: 24425979
NCBI-ProteinID: XP_021337751
UniProt: A0A1N6LXU1
LinkDB
Position
IV:complement(<690090..>697123)
AA seq 2269 aa
MEPKYKGTTIRTGYLYNVAVNNITINTSSDTFNYNSNSSSFEKLQSSRNFSEINTFSALK
LFFVSEDGQDWFTNLVHLPYFYVGLSNDNYLDHVKHFLEQNVKGLVEKVYREDLSRPNHI
KNPKLSKQATKRSFLKISFATIDLLRQGLQYIRSIKSRYKDSNAYDTSKLNNNACLRFSH
VKQHLNNLCNDQFNDFNPDCLAYIDECYEADVRYITRVLIDKNIRCASWYNVEIASTDNL
TLSLNQIDRTILPPLNVLAWDIECYKAPLKFPDMEVDPIILISFMFNGQGYLLVNREYVS
HDIEDFSYKPNHDLSGAGTFRVFNEPNEYAIISRFFECVKNLGTHILVTYNGDNFDFPYL
YRRAQINNVRNPLANIKNMENKFTRSEFLNMDCYKWVERDSYLPNGSRTLKQVCRIKLKY
NPAEVDPEEMITLAINDPQTLATYSVSDAVATYYLYIKFIHNFVLALSYIIPLAVEDVLR
QGSGTLCENLLMAEAYAKEIIFPNKHQSESSSYYKDENTGKFHLIYDDSYVGGKVETLRC
GLYRDDLPEQFTIDHNAYQQLIDNIAETISHWGKNLNPPKHCSCSVDTLEHNESDLIVGK
MDRNLHYFTNIRDIYDEIHSKLTDLKNAKQLYCLPKVIHLDVGAMYPNIILTHRLQPTAI
VNEEFCSKCSYYSEAHECQKRMKWKRKIEISPIDHSHIMPILNELKTRVYKPTQRKFYNS
VTNIASEDDISDFGSDSDGENINLKKPEAKVTSVKWNQLSAKEQNTELMKAVKAYSLKTT
QKSKLVKEVEVESIVCQRENPFYVNTVLKFRDRRYVFKRNVKQAERIKHNILQSSVVDIV
KLKEINESILINDSLQLAHKCILNSFYGYVKRNGSRWFSMEMGAIVTFTGSQIIEFARKL
IDKIGIAIELDTDGIWCMLPEKFPFIFNLQYFVCTCGTNQKLDKLTFEYPTNMLNLLIDK
NWANTQYLEYDELTEKYRIERHNHVEFELDGPWYGMFLPASEKSEELLKKRYVVYNHQKC
ISELKGFEIKRRGELQLIQRFQEEIFGKFALGTTKQEAFSHAAAVGIRWRRTLDDKAKCI
SDDMELFDLLMSKSVIKKSVLEQPNMKGFGITTARRLSELLNNPMYIQDRNVSTQFLITN
KPSDADKTARAIPIQLFLSEDTTRHAFISKWLKVSLSQASQLNSRDILDWDYYRQRLDIQ
LLKLICIPCIIQGVPNPIPFIKIPDWLYRKERSLNPSQGRITAFFASKPAQLVDSKDSNK
CASKGDVIDLTTQIVECDKEVLVIDSDGEKTPIDVDSIISQEITRLRGKWSFHILNLLRR
KVGRIETVSDNLYTFLKGVSMDSLTIDDLYTLFTETWHIIDIQSTLRLGIFKCQISVLNH
NKIYQVYITVKRWIYINFEGDLNDLPYEITKNAKVIKVRHSLPKSAEKKTLLQLELYEEN
AVQSVFTLNALFHNKIRGIYESKIPLIFDFIVRKGNEIAVDKDKFQTAVSDNGSTMINSF
NEKSLAGISFGSNSSKYLMDADIRYVYVYHSYTDGNITRFCAIIYSAQNKGEEVSATDII
SSLIIVGGSKEITQNVSSEQMVELMKQFKQDYDGGDMLKDYEYQPFPNCINNFSEAIKFD
HRSPSISCKNAIKYFTNYLQSLVNLKKCLFIVNTSLEDNNLFSCVYDNVLTINNMTLNFR
LKMAPDSTFLQANVRDSLSLLQDDYFNFEEKLALARISGLPINMIINETTIDVARLFLDI
SYARSLRSFNHILWCNEDTQSTKVIDYDIINNCMLKMTNSGIYRGYVVKIEFDPSIIFHA
IRHANKFESVDKSNNLHHSSNEPLKILAQTLDGILKTLMNLYESISYRSFQNIFQTLTNI
RAWISDSSSILYDPLLYSQIVICYESYLSQLLLQLKSRFGIMPIYVGSSFAILDTGQVNV
EMGRQVIDLAMRSIKSLGSCYESVTFTLCDEYIAVIQLNDDNYIRFKEYSPHNVKNSVED
LPLLKLYPLPIQGFFRDLIDSIVLTPLINTLNNCGQTKDKMIESEELLCTSIRDWWLGDN
LYQNIENLLRDRNTFLTEYLNDEDSKNTENLITSLEFPMIPGTFATAATDWKCEAVGLVT
CLLEIEKSLNIQKDGELQELLHRFKSIVGSNPHTIPNSLARSVINDKLVLRDMCCTNCFA
MSNINITIINNLTICDYCNEPWDQETIELKLIDYLEEFFYALHAQNFRCVYCSHARISYQ
STNCNCGNVYADSLDINTWLYAVEIVRKIAKTNEYHLLSSAIKQFDYLI
NT seq 6810 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagccaaagtataaaggaacaacaatcagaactggctacctatacaacgtagcggta
aataacataacaataaatacatctagcgacacttttaattacaacagcaactcctcctcc
tttgaaaagttacagagtagtcgcaacttcagcgaaataaacaccttttctgcgctcaaa
ctattttttgtatcagaagatggacaggattggtttacaaatttggtccatctaccttat
ttctatgtgggcctcagtaacgataattacctagaccatgtcaaacattttctcgaacaa
aatgttaagggattggttgagaaggtatatagggaggatttgtctcgtcccaaccacatc
aaaaatccaaaactttcaaagcaagctactaagcgaagctttctaaagattagttttgca
accatagacctattgcgccaaggattgcaatacatcagatcaatcaagtctagatacaaa
gactctaacgcttatgacaccagcaaattaaacaataatgcttgcttgcgattttctcat
gtgaaacagcacctaaataacttgtgcaatgaccaatttaatgactttaacccagactgt
ctagcctacatagatgagtgctacgaagcagatgttagatacataactagagtgctgatc
gataagaacattcgttgtgccagttggtataacgtggaaattgcatctacagacaatctg
acactatcacttaatcagattgatcggacaatacttccgccactaaatgttcttgcatgg
gacattgagtgttacaaggcgccattaaagtttcctgatatggaagtggatccgataatc
ttaatatcattcatgtttaatgggcagggctacttgttagttaatcgggagtatgtatct
catgatattgaagatttttcatataaaccaaatcatgacctctctggggcaggaactttt
agagtatttaacgaacccaatgagtatgcaattattagcagattttttgagtgtgttaaa
aatttgggcacacatattttggtcacttacaacggagataactttgacttcccctattta
tatagaagagcccaaattaataacgtgagaaaccccttggcaaacattaaaaacatggaa
aacaagtttacaaggagtgaattccttaatatggattgctataaatgggttgaaagggat
tcatatctgccaaatggttcaagaacacttaaacaagtatgccgcatcaagctaaagtat
aacccagccgaggtggatccagaagaaatgattacattggccataaatgatccacaaact
ttagcaacttacagtgtctcagatgctgtagccacatattatttgtacattaaatttatc
cataattttgtgttggcgctaagttatattatacctttggctgtggaggatgtattgaga
caaggttctggtacactgtgtgaaaatttactaatggcagaggcctatgccaaggaaata
atcttcccaaataaacaccaatcagaatcttctagctattataaagatgaaaacactgga
aaattccatctcatctatgacgattcatacgtgggtggtaaagtagagacactgcgttgc
gggctctatcgcgatgatttacccgagcaatttacaattgaccacaatgcataccagcag
ttgatcgataatatagcagagaccataagccattgggggaagaatctcaatcctcccaag
cattgcagttgctcggttgatacacttgaacacaacgagtcagatttaattgtaggtaag
atggatagaaatttgcactactttacaaacattcgagacatatacgacgaaatacactcc
aaattaactgatttgaagaatgcaaagcagctctattgcctaccaaaagtaatccatttg
gatgtgggagccatgtatccaaatatcatattgacccacaggctacaacctactgctata
gtgaacgaagagttttgcagtaagtgttcgtactattctgaagcacatgagtgccaaaag
cggatgaagtggaagagaaaaattgaaatatcaccaattgatcacagtcacataatgcca
attctaaatgaattaaaaacgcgtgtttataagcctacgcagaggaaattttacaattca
gtcactaatatagcatctgaagatgatatcagtgactttggatctgatagtgatggggaa
aatattaatcttaaaaaaccggaagccaaggttaccagtgtcaaatggaatcagttgagc
gcaaaggagcaaaatacagaactgatgaaagctgtgaaagcatattcattaaaaacaacc
caaaagagcaaattagttaaggaagtagaagtcgaaagcatagtatgccagcgagaaaac
cccttctacgtcaatacggtactaaagtttcgtgatcgtaggtatgtctttaaacgtaat
gttaaacaggcggaaagaattaagcacaacattttacagtcttctgttgtagacatagtt
aagcttaaggagattaacgaatcaatattgataaatgattctttgcaattggcgcacaag
tgtattcttaacagtttttacggctacgtcaaacgtaatgggtctaggtggtttagcatg
gagatgggagcaatagtaacttttactggatctcaaataatcgaatttgctaggaaactg
attgacaagattggtatagcgattgagttggataccgacggtatttggtgtatgctgccc
gaaaaattccctttcatttttaatttgcaatactttgtttgtacctgtggtacaaaccaa
aagttagataaactaacttttgaatatcccactaatatgcttaatttgctgattgacaaa
aactgggcaaacacccagtatttggaatatgatgaattgacagagaaataccgcattgaa
aggcataaccatgtggaatttgagcttgatggaccatggtatggaatgtttttgcctgca
tctgaaaaatcagaagaattactaaagaagcgctatgttgtgtacaatcaccaaaaatgc
attagtgaacttaagggctttgaaataaaacgaaggggggaattacaattaatccagcga
tttcaagaggaaatttttgggaaatttgcattaggaaccactaaacaggaggcgttcagc
cacgctgccgcagtaggtattaggtggagaaggactttggatgacaaggcaaaatgcatt
agcgatgatatggaactgtttgatcttttgatgtctaaaagtgtcattaaaaaatctgtt
cttgagcagcctaatatgaagggatttggtattacaacggcacggcgtttatctgaacta
ttaaacaaccctatgtacattcaggatcgaaacgtttccacacaatttttgatcacaaat
aagccaagcgatgctgataaaacggcgcgtgccattccaattcaactttttctttccgaa
gatactaccaggcatgcttttatttccaaatggctaaaggtctcattatctcaggcatct
caattgaactctagggacattttggattgggattactatcgtcaaaggcttgatatccag
ttgttgaagttgatatgcataccttgcataattcaaggggtgccaaatccaatacctttt
ataaagattccggattggctttaccgcaaagagagatcgctgaacccaagccaggggagg
attactgcattttttgcttctaaacctgcacaattagttgattccaaggatagcaataaa
tgtgcaagtaaaggggatgtaatagatttgacaacacaaatagtcgagtgcgataaagag
gtcctagtcatagactcggacggtgagaaaactccaatagacgttgattctattatatca
caagagataactcgattacgaggtaaatggtcgtttcatattttgaatttgttacggcgc
aaagtgggccgtattgagacagtttccgacaacttgtatacttttttaaaaggagtttca
atggatagtttaacaattgacgatttatatactttatttacagagacttggcacataatt
gacatacaatcaactctaaggcttgggatcttcaaatgtcaaatctctgtgctgaatcac
aataaaatttatcaagtatacatcactgttaagcgatggatttacatcaattttgagggt
gatctgaatgatttgccctatgagattactaaaaacgccaaagttataaaagtgagacac
agccttccaaaatcagctgaaaagaaaaccttattacagcttgaattgtatgaggagaat
gctgtacagtctgtgttcacactgaatgctttgtttcacaacaagataagggggatttac
gaatctaagattccactaatatttgactttatcgttcgtaagggaaatgagatagcagtg
gacaaagataagtttcaaacagctgtgtctgataacgggagcactatgataaatagtttc
aatgagaaatccttagctgggatctcatttgggagtaactcttcaaagtacttaatggat
gcggatattagatatgtatacgtttatcactcttacaccgatggcaatatcacaagattc
tgcgccataatatattcagcgcagaacaagggagaagaagtgtcggcgactgatattatt
tctagtttaattattgttggcggatccaaagagataacccaaaatgtatcatcggaacaa
atggtagaattaatgaagcagtttaaacaggactacgacggtggagacatgctaaaagac
tatgagtatcagccattccctaactgtataaacaatttttctgaagctattaaatttgac
catagatcaccgagcatatcgtgcaaaaatgccattaaatattttacaaactatttgcag
tcgttggttaaccttaaaaaatgcttattcatagttaacacgtcacttgaagacaacaac
ttgttcagttgtgtatatgacaacgtgttaacgatcaataatatgacactgaattttagg
ttaaagatggcgccggacagtacgtttttacaagcaaatgtgagggattcattgtctttg
ctacaggatgattacttcaattttgaggagaaattggcattggcccgcatctctggtctg
ccaattaatatgattataaacgagacaactatcgatgtggccagactgttccttgacata
tcatatgccagatcgctacgttcgtttaatcacatactatggtgtaatgaagatacccaa
tctaccaaagttattgactatgacattattaacaattgtatgcttaaaatgaccaatagt
ggtatttaccgcggttatgtggtcaaaatagagttcgatccctcaataatattccacgct
ataaggcacgctaataagtttgagtcggtagacaagagtaataacctccatcattcatca
aacgagcccttgaagattttggcccaaacactggatggtatattaaaaacactaatgaac
ctatacgaatcaataagctaccgctcatttcaaaacatatttcaaacgttaacaaacatt
cgtgcctggatatctgacagctcgagcattctatatgacccgttgttatatagtcaaatt
gtaatatgttatgaaagttatttgtctcaactgttgctacaattaaaatccaggtttgga
attatgcctatatacgttggttcgagctttgccattctggatactgggcaggtaaacgtt
gaaatgggaagacaagtcattgatttggccatgagaagcataaaatcgttgggaagttgt
tacgaaagcgtcacttttactttgtgtgacgaatacatagcggttatacagcttaacgat
gataattatataagattcaaagaatactccccgcacaacgttaaaaattcggttgaggac
ttaccccttctaaagctttaccccttgcccatacaaggtttttttagggatttaattgac
agtatcgtattgactccacttattaacacgttgaacaattgcggtcagactaaagataag
atgattgagtcggaggaattattatgtacttccattcgagattggtggctcggtgataat
ctgtatcaaaacatagaaaatttgctgcgtgacaggaatacctttcttacagaatatctt
aatgatgaagattctaaaaacactgagaacctcatcacaagtctagaatttccaatgatt
cctggaacatttgcaacagcggccactgactggaaatgtgaagctgtgggcttggttact
tgcttgcttgaaatagagaaatcattaaatatacaaaaagatggggagttacaagagttg
ttacaccgttttaagagcattgttggtagcaaccctcacacgatacctaatagtttggct
cgtagcgtgattaatgacaaacttgtactcagggatatgtgttgcactaattgttttgca
atgtcaaacataaatattaccatcataaataatctaacaatttgtgattattgtaatgaa
ccgtgggaccaggaaaccatcgagctcaagcttatagattatctagaggaatttttttac
gcgcttcatgcgcagaatttcagatgcgtatattgcagccacgcgcgtatctcatatcaa
tctaccaattgcaattgtggaaatgtctatgccgattcattggacattaatacttggctt
tatgctgtggaaattgtgagaaagattgcaaagaccaatgagtaccacctgttgagttcg
gctattaaacagtttgactatctgatctaa

DBGET integrated database retrieval system