Borrelia miyamotoi LB-2001: I871_04195
Help
Entry
I871_04195 CDS
T02797
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
bmo
Borrelia miyamotoi LB-2001
Pathway
bmo03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bmo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
I871_04195
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bmo03400
]
I871_04195
DNA repair and recombination proteins [BR:
bmo03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
I871_04195
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_II
MutS_IV
AAA_27
AAA_29
nSTAND_NTPase5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGT27739
LinkDB
All DBs
Position
842208..844766
Genome browser
AA seq
852 aa
AA seq
DB search
MRQYLNIKNKYKDSILFFRVGSFYEMFFDDAIQGSKLLGLTLTKKEDVPMCGVPCHASKE
YIKRLILLDKKVAICEQGVQTDSKGPLEREVVEVISPGVVVDEDFLQDDVNNYLVAISDY
KDYCSFSYIDLSTSRLGIILYEGNFLEKLRRDIEKYFPREIIVSESFYYQYSDKLVLDRF
LVNKVPNWHLNKEIAIKALKEHFNVISLSSLGFKEDDPYYISSFLIIDYIKNNLKNLLRN
IDTIHINNDSAYMFLDDITQINLELVKNNNDLTASYSLYSVLNDCKTSMGKRLLREYILN
PLLDIVAINNRLDHVEFLNNNINLSMKLRDILGDVWDIERVISRLQMRKYVKKDFLFIRE
ALIAFFSIKGLFEKYFFDYWIFNVNDESDIGEVYSLINISISEEHDELIKHGYDSNIDRL
RELKNNASRYVDDYLNFERSFSKINGLKIKRTNIRGLFFEVTKSYYGQVPSHFIESQTLN
SVKRYKTNKLIELEKDINDAEDSLSALEQEIFDGIALRIIKHSALIKRIAEFYAYIDVIS
NFAYLAKKNEYVRPTLTNNKEIILECARHPVVEHYMRGLDNFTKNSVRIDSDKYFCLITG
PNMAGKSTYLRQTALVVLMGHIGSFVPANKAIIGVTDKIFCRIGASDNISKGESTFLVEM
NETANILRNATQDSLIIMDEVGRGTSTNDGLAIACSIVEYILGHIKSRSLFATHFHELSA
INHSAFVNLSMKIERQGNELIFLREVEEKPSLNSYGIYVAHIAGIPLKVIERANIMLKSL
ANREHLYVAEFFTSAISVTNDSEEEIEKNLCYTSDLNAYLELKDFISKIDINNITPLQAM
SLLKEMVLKIKV
NT seq
2559 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggcaatatttaaatattaaaaacaaatataaagattctattctattttttagggta
ggtagtttttatgaaatgttttttgatgatgctatccagggaagcaagcttttaggttta
actcttactaaaaaagaggatgttcctatgtgtggagtgccttgtcatgcgagtaaagaa
tatataaaaaggttaattttacttgataaaaaggttgcgatttgtgagcaaggagtacaa
acagattctaaggggcctttggaaagagaggttgttgaagttataagccctggagttgtg
gttgatgaagattttttgcaggatgatgttaataattacttggtagctattagtgattat
aaggattactgttcattttcttatatagatttatcaacatctaggcttggaataatcctt
tatgagggtaattttttagaaaaattaaggcgggatattgaaaagtactttccaagagaa
ataatagtttcagagagcttttattatcagtattcagacaagcttgttcttgatcgattt
ttagtcaataaagttccaaattggcatttgaacaaagaaattgctataaaggcattaaaa
gagcattttaatgttatcagtttgagttctcttggattcaaagaagacgatccttattat
atttcgtcttttttaattatagactatataaagaacaacttgaaaaatttattgagaaat
attgatacgattcatattaataatgattctgcatatatgtttcttgatgatattactcaa
ataaatcttgaacttgttaaaaacaataatgatctgactgctagttattctctttattca
gttttaaatgattgcaaaacctcaatgggtaagaggctcttaagagaatatatattaaat
ccgcttctggatattgttgccattaacaatagattagatcatgtagaatttttaaacaac
aatattaatttaagtatgaaattaagagatattcttggtgatgtttgggatattgaaaga
gtaatctcaagacttcaaatgagaaaatatgttaagaaagattttttatttattcgagaa
gctttaattgcatttttttcgataaaggggttatttgaaaagtatttttttgattattgg
atattcaatgttaatgatgaaagtgatataggagaagtttattctttaattaatatttct
atctcagaggaacatgatgaacttattaaacatggatatgattctaatattgatcgttta
agagagctcaaaaataatgcaagcaggtatgttgatgattatcttaattttgagaggagt
tttagtaagattaatggtcttaaaattaagagaactaacattcgaggtttattttttgag
gttactaagagttattatggtcaagttccatctcatttcatagaaagtcaaactttaaat
tctgttaaaagatataaaaccaataagcttattgaacttgaaaaagacattaatgatgct
gaagatagtttatcagctcttgaacaagaaatatttgatgggatagctttaagaattatt
aagcatagtgcacttattaaaagaattgctgaattttatgcatatattgatgtaatttct
aattttgcatatttagctaagaagaatgaatatgtaagacctactctaaccaataacaaa
gaaattattcttgagtgtgccagacatcctgttgttgaacattatatgagaggtttggat
aattttactaaaaattctgtgaggattgacagtgataaatatttttgtttaattactggt
cctaatatggcaggtaagtcaacttatttgcgtcagactgctttagttgttttaatgggg
catattggttcttttgtacccgctaataaggctataatcggggttacagataagattttc
tgtaggatcggagcaagtgataatatttccaaaggggagtctacatttttagtagaaatg
aatgaaacggctaatattttaagaaatgcaacgcaagatagtttgataattatggatgaa
gttggtagaggtactagtactaatgatggacttgctattgcatgttcaattgttgaatat
attttagggcatattaaatccaggagtttatttgcaactcattttcatgaactttcagct
attaatcatagtgcttttgttaatctttcaatgaaaattgaaaggcagggtaatgaactt
atctttttaagagaagttgaagaaaaaccttctcttaattcttatggaatttatgttgct
cacatagctgggatacctttaaaagttattgagagagctaatattatgcttaaaagctta
gcaaatcgagagcacttgtatgtggcagaattttttacttcagctatttctgtgactaat
gatagtgaggaagagatagaaaaaaatttatgttatacatccgatcttaatgcttattta
gaacttaaagattttatttctaaaatagatatcaataatattactcctttgcaagcgatg
agtttactaaaagaaatggttttaaagattaaagtatag
DBGET
integrated database retrieval system
